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可变数目串联重复序列分析与多位点序列分析在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用
被引量:
1
1
作者
周鑫
侯学霞
+3 位作者
耿震
张琳
郝琴
赵素莲
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
CSCD
2013年第2期98-102,共5页
目的评价多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和多位点序列分析(MLSA)两种方法在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用。方法采用MLVA和MLSA两种方法对31株伯氏疏螺旋体分型结果进行比较分析。结果 31株伯氏疏螺旋体用MLVA方法分成4簇,24个...
目的评价多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和多位点序列分析(MLSA)两种方法在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用。方法采用MLVA和MLSA两种方法对31株伯氏疏螺旋体分型结果进行比较分析。结果 31株伯氏疏螺旋体用MLVA方法分成4簇,24个基因型,其中21个独立基因型,成簇率达24/31,MLVA的分辨率达到0.969;MLSA可将31株伯氏疏螺旋体分成4簇,每株都可独立分析,但有3个节点步长值(Bootstrap value)<50%。结论 MLVA和MLSA两种方法均适合于伯氏疏螺旋体的分型研究,对于部分分型有异议的菌株,将MLVA与MLSA联合可有效进行伯氏疏螺旋体的分型鉴定。
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关键词
多位点序列分析
多位点可变数目串联重复序列分析
伯氏疏螺旋体
基因分型
原文传递
题名
可变数目串联重复序列分析与多位点序列分析在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用
被引量:
1
1
作者
周鑫
侯学霞
耿震
张琳
郝琴
赵素莲
机构
山西医科大学微生物与免疫教研室
中国疾病预防控制中心传染病预防控制所莱姆病室
出处
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
CSCD
2013年第2期98-102,共5页
基金
国家自然科学基金(31100105)
国家科技重大专项课题(2013ZX10004-001)~~
文摘
目的评价多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和多位点序列分析(MLSA)两种方法在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用。方法采用MLVA和MLSA两种方法对31株伯氏疏螺旋体分型结果进行比较分析。结果 31株伯氏疏螺旋体用MLVA方法分成4簇,24个基因型,其中21个独立基因型,成簇率达24/31,MLVA的分辨率达到0.969;MLSA可将31株伯氏疏螺旋体分成4簇,每株都可独立分析,但有3个节点步长值(Bootstrap value)<50%。结论 MLVA和MLSA两种方法均适合于伯氏疏螺旋体的分型研究,对于部分分型有异议的菌株,将MLVA与MLSA联合可有效进行伯氏疏螺旋体的分型鉴定。
关键词
多位点序列分析
多位点可变数目串联重复序列分析
伯氏疏螺旋体
基因分型
Keywords
Multi-locus sequence analysis
Multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis
borrelia burgdorferi sensulato
Genotyping
分类号
R377 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
可变数目串联重复序列分析与多位点序列分析在伯氏疏螺旋体分型研究中的应用
周鑫
侯学霞
耿震
张琳
郝琴
赵素莲
《中国媒介生物学及控制杂志》
CAS
CSCD
2013
1
原文传递
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