真核生物启动子TATA-box·GC-box和CAAT-box的分析

下载了已经通过试验证实的2541条真核生物启动子序列，运用生物信息学方法分析了TAT—box、GC—box和CAAT—box的数量及其在启动子中的分布情况。结果表明，有23．85％真核生物启动子序列中至少有1个TAT—box，且TATA—box主要分布在转录起始位点前24～36bp的区域内；有47．30％真核生物启动子序列中至少有1个GC—box，且GC—box在转录起始位点前23～128bp的区域内分布比较集中；有42．35％真核生物启动子序列中至少有1个CAAT—box，且CAAT—box在转录起始位点前51～159bp的区域内分布比较集中。这说明TAT-box在真核生物启动子中的位置比较固定，对基因转录的正确起始可能起着重要的作用；而GC—box和CAAT-box分布区域较广，数量也明显多于TAT—box。

美洲黑杨PdZFR基因的克隆和分析

根据美洲黑杨PdZFR部分cDNA序列,采用拟基因组文库步行法和RACE克隆了该基因全长cDNA及基因组DNA,并对该基因的启动子、转录起始位点、内含子分布、剪切方式、编码的氨基酸序列和该基因在染色体上的分布位置进行了分析。组织或器官特异表达分析表明:该基因与植物发育相关。

人δ珠蛋白基因启动子区CAAT盒C→T突变对其转录的影响

目的研究人δ珠蛋白基因启动子区-64位C→T点突变对其转录调控的影响。方法将人δ基因启动子区-64位C突变为T后,克隆于去除强启动子CMV的真核基因表达载体pcDNA3.1穴-雪/Myc-HisA中,分别将含野生型CAAT盒和突变型CAAT盒的人δ基因转染鼠红白血病(MEL)细胞,经DMSO诱导细胞分化,利用半定量RT-PCR技术检测人δ基因转录的变化。结果δ基因启动子区CAAT盒C→T点突变后,含突变型CAAT盒的人δ基因的转录水平是含野生型CAAT盒的2.2倍。结论在mRNA水平直接证实δ基因启动子区CAAT盒的缺陷是影响其转录的重要原因。