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辣椒CaTPS11基因克隆及非生物胁迫下的表达
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作者 马艳 苟秉调 +5 位作者 赵淑芳 魏敏 段盼盼 匡小妍 张涛 魏兵强 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第6期1060-1069,共10页
本研究以强丰101辣椒品种为材料,分析辣椒CaTPS11基因编码蛋白质的理化性质、蛋白质氨基酸序列及组织特异性表达,利用荧光定量PCR技术分析CaTPS11基因在低温、激素处理过程中的表达量变化。结果表明,CaTPS11基因全长2 805 bp,编码921个... 本研究以强丰101辣椒品种为材料,分析辣椒CaTPS11基因编码蛋白质的理化性质、蛋白质氨基酸序列及组织特异性表达,利用荧光定量PCR技术分析CaTPS11基因在低温、激素处理过程中的表达量变化。结果表明,CaTPS11基因全长2 805 bp,编码921个氨基酸。与辣椒基因组数据库参考序列比对,CaTPS11基因存在5个单碱基差异和2处内含子保留剪切,启动子区存在植物激素、低温、光等多种响应元件。CaTPS11蛋白相对分子量为1.033 9×10~5,理论等电点8.33;无跨膜结构和信号肽,具有TPS蛋白家族的典型结构域。亚细胞定位分析结果表明CaTPS11蛋白定位于细胞质和叶绿体中。CaTPS11蛋白氨基酸序列与龙葵、马铃薯TPS蛋白氨基酸序列同源关系最近且进化高度保守。CaTPS11基因在成熟果胎座中的表达量最高,为成熟果果肉的26倍。IAA处理抑制CaTPS11基因的表达,低温胁迫、ABA、GA、MeJA处理均诱导该基因的表达。MeJA处理6 h,辣椒CaTPS11基因表达量达到最大,约为对照的9倍。CaTPS11基因存在时空表达差异,推测该基因通过内含子保留的可变剪切模式和MeJA信号通路正向响应非生物胁迫的方式提高自身表达,以应对逆境胁迫。 展开更多
关键词 辣椒 catpS11基因 非生物胁迫 基因表达
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Framework for a Computer-Aided Treatment Prediction (CATP) System for Breast Cancer
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作者 Emad Abd Al Rahman Nur Intan Raihana Ruhaiyem +1 位作者 Majed Bouchahma Kamarul Imran Musa 《Intelligent Automation & Soft Computing》 SCIE 2023年第6期3007-3028,共22页
This study offers a framework for a breast cancer computer-aided treat-ment prediction(CATP)system.The rising death rate among women due to breast cancer is a worldwide health concern that can only be addressed by ear... This study offers a framework for a breast cancer computer-aided treat-ment prediction(CATP)system.The rising death rate among women due to breast cancer is a worldwide health concern that can only be addressed by early diagno-sis and frequent screening.Mammography has been the most utilized breast ima-ging technique to date.Radiologists have begun to use computer-aided detection and diagnosis(CAD)systems to improve the accuracy of breast cancer diagnosis by minimizing human errors.Despite the progress of artificial intelligence(AI)in the medical field,this study indicates that systems that can anticipate a treatment plan once a patient has been diagnosed with cancer are few and not widely used.Having such a system will assist clinicians in determining the optimal treatment plan and avoid exposing a patient to unnecessary hazardous treatment that wastes a significant amount of money.To develop the prediction model,data from 336,525 patients from the SEER dataset were split into training(80%),and testing(20%)sets.Decision Trees,Random Forest,XGBoost,and CatBoost are utilized with feature importance to build the treatment prediction model.The best overall Area Under the Curve(AUC)achieved was 0.91 using Random Forest on the SEER dataset. 展开更多
关键词 BREASTCANCER MACHINELEARNING featureimportance FEATURESELECTION treatment prediction SEER dataset computer-aided treatment prediction(catp) clinical decision support system
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辣椒CaTPS8基因克隆与表达分析 被引量:3
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作者 赵淑芳 苟秉调 +5 位作者 魏敏 段盼盼 王永富 杨楠 张高原 魏兵强 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1568-1578,共11页
海藻糖-6-磷酸合酶(Trehalose-6-phosphate synthase,TPS)在植物非生物胁迫响应中起着重要的调控作用。以辣椒品种‘强丰101’为材料,对CaTPS8基因进行克隆和表达分析。结果表明,该基因CDS的完整开放阅读框为2553 bp,编码850个氨基酸。... 海藻糖-6-磷酸合酶(Trehalose-6-phosphate synthase,TPS)在植物非生物胁迫响应中起着重要的调控作用。以辣椒品种‘强丰101’为材料,对CaTPS8基因进行克隆和表达分析。结果表明,该基因CDS的完整开放阅读框为2553 bp,编码850个氨基酸。生物信息学分析发现,CaTPS8蛋白的分子质量为96 ku,理论等电点为5.65,不稳定系数为48.09,推测为不稳定蛋白。蛋白结构预测显示CaTPS8蛋白包含Glyco_transf_20和GT20_TPS两个保守结构域,属于亲水性蛋白,没有跨膜结构和信号肽序列。二级、三级结构预测表明该蛋白的结构主要为α-螺旋和无规则卷曲。系统进化关系分析表明,CaTPS8蛋白与马铃薯和番茄的同源性最高,其相似度分别为87.78%和86.92%,与高粱的同源序列相似度最低,为64.76%。实时荧光定量PCR分析表明,CaTPS8基因在辣椒花中表达量最高。同时,CaTPS8基因的表达受到低温的诱导,在处理3 h时相对表达量最高,约为对照的25倍。此外,IAA、ABA、SA、GA 3和MeJA处理能够抑制CaTPS8基因的表达。研究结果为进一步阐明CaTPS8基因响应辣椒非生物胁迫的分子机理奠定基础。 展开更多
关键词 辣椒 catpS8 基因克隆 表达分析 生物信息学
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碱溶性银耳粗多糖的提取及其清除自由基作用的研究 被引量:42
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作者 吴琼 郑成 +2 位作者 宁正祥 刘本国 董华强 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第6期153-155,共3页
本实验研究了碱溶性银耳粗多糖(crude alkai-soluble tremella polysaccharide,CATP)的提取及其清除自由基的作用。利用响应面软件进行实验设计,确定最佳提取方案为:提取时间3.56h,NaOH浓度0.76mol/L,液固比81.89。同时考察了碱溶性银... 本实验研究了碱溶性银耳粗多糖(crude alkai-soluble tremella polysaccharide,CATP)的提取及其清除自由基的作用。利用响应面软件进行实验设计,确定最佳提取方案为:提取时间3.56h,NaOH浓度0.76mol/L,液固比81.89。同时考察了碱溶性银耳粗多糖和水溶性银耳粗多糖(tremella polysaccharide,TP)对DPPH(二苯代苦肼基自由基)、羟基自由基、超氧自由基的清除作用。结果表明,碱溶性银耳粗多糖具有良好的抗氧化能力,并且随着多糖浓度的增高抗氧化性增强。 展开更多
关键词 银耳 碱溶性粗多糖 提取 自由基
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基于Web的产品工艺分工规划研究 被引量:2
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作者 黄劲东 彭文利 +1 位作者 杨海成 莫蓉 《机械设计》 CSCD 北大核心 2007年第4期45-47,共3页
针对制造企业联盟的产品工艺分工问题,研究并开发了基于Web的产品工艺分工规划系统。阐述了工艺分工的设计方法,提出了逻辑制造单元、逻辑加工路线等新概念,并对产品工艺分工系统的体系结构与功能组成,以及基于网络化制造资源的零件与... 针对制造企业联盟的产品工艺分工问题,研究并开发了基于Web的产品工艺分工规划系统。阐述了工艺分工的设计方法,提出了逻辑制造单元、逻辑加工路线等新概念,并对产品工艺分工系统的体系结构与功能组成,以及基于网络化制造资源的零件与逻辑制造单元建模方法、基于知识的逻辑加工路线设计及可执行加工路线生成方法进行了详细讨论。 展开更多
关键词 工艺分工 计算机辅助工艺规划 逻辑加工路线 可执行加工路线 逻辑制造单元 物理制造单元
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精养鲤池塘的浮游植物及鲢鳙鱼产潜力的初步研究 被引量:1
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作者 刘国才 《华北农学报》 CSCD 北大核心 1994年第3期122-126,共5页
通辽地区精养鲤池塘浮游植物生物量为23.6~53.8mg/L,以绿藻门绿球藻目中的栅藻、绿球藻、小球藻、空星藻属等常见种类数量最多,占总生物量的43%;隐藻门、裸藻门中的一些种类亦具一定数量,占浮游植物总生物量的37... 通辽地区精养鲤池塘浮游植物生物量为23.6~53.8mg/L,以绿藻门绿球藻目中的栅藻、绿球藻、小球藻、空星藻属等常见种类数量最多,占总生物量的43%;隐藻门、裸藻门中的一些种类亦具一定数量,占浮游植物总生物量的37%。浮游植物的初级生产量的均值为402.6kg/hm2·d,每年可提供1553.4kg/hm2的鲢鳙产量。 展开更多
关键词 池塘 浮游植物 鱼产潜力 鲢鱼 鳙鱼
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入世对中国大豆的影响 被引量:4
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作者 刘晓雪 《国际贸易问题》 CSSCI 北大核心 2002年第1期8-12,共5页
通过介绍中国大豆的生产、消费和进出口贸易情况,分析了影响国内生产的因素;然后运用中国农业与贸易政策模拟模型(CATP)测算了入世对中国大豆市场的影响,最后得出结论并提出对策。
关键词 入世 中国 大豆 中国农业与贸易政策模拟模型 catp 线性方程
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