高龄结肠癌病人中CDH13的表达变化与临床及预后相关性研究

目的探讨高龄结肠癌病人中CDH13的表达与临床病理特征及预后的关系。方法2018年1月~2021年5月收治的高龄结肠癌手术病人63例,按照CDH13表达高低分为两组,通过生物信息学方法分析CDH13在结肠癌中表达情况,免疫组化检测癌组织CDH13表达情况,χ^(2)检验分析与临床病理参数间关系,Kaplan-Meier法进行生存曲线分析。结果通过TCGA数据库信息表明,CDH13蛋白在结肠癌组织中表达降低(P=1.07e-15);在两组病人中CDH13低表达在淋巴结转移分期(P<0.01)、TNM分期(P=0.022)、Dukes分期(P<0.01)之间差异有统计学意义。病人的性别占比、肿瘤位置、手术方式、病理类型、是否化疗等临床资料比较,CDH13表达差异无统计学意义;Kaplan-Meier生存曲线分析发现,CDH13低表达病人生存率低于高病人,差异有统计学意义(χ^(2)=4.927,P=0.026)。结论在高龄结肠癌病人中,CDH13展现出了抑癌基因的功能,其表达的高低与结肠癌TNM分期、Dukes分期及淋巴结转移相关,CDH13的表达高低影响着高龄病人的预后。

血清中CDH13基因启动子甲基化对非肌层浸润性膀胱癌患者术后复发的预测作用

目的探索血清中CDH13基因启动子甲基化对非肌层浸润性膀胱癌术后复发的预测作用。方法应用甲基化特异性PCR检测接受经尿道膀胱肿瘤切除术(TURBT)治疗的98例非肌层浸润性膀胱癌患者血清CDH13甲基化状态,并对患者临床病理资料以及术后复发情况进行统计学分析。结果在52例(53.1%)患者血清中检测到CDH13甲基化,并且与肿瘤的大小、分级及数目密切相关。在随访过程中有41例(41.8%)患者出现肿瘤复发,Kaplan-Meier分析和log-rank检验发现存在血清CDH13甲基化的患者的无复发生存率比无血清CDH13甲基化的患者低,差异有统计学意义(P<0.001)。Cox回归分析表明血清CDH13甲基化是非肌层浸润性膀胱癌行TURBT治疗后复发的独立危险因素。结论血清CDH13甲基化是非肌层浸润性膀胱癌行TURBT治疗后复发的预测指标。

巢式甲基化特异性PCR检测肝细胞癌患者血清中RASSF1A和CDH13基因启动子区甲基化

为了检测肝细胞癌患者血清中RASSF1A和CDH13基因启动子的甲基化状态,收集肝细胞癌患者及健康对照者的血清标本,采用巢式甲基化特异性PCR(nMSP)法检测RASSF1A和CDH13基因启动子区甲基化状态.结果肝细胞癌患者血清样品中RASSF1A和CDH13基因启动子区甲基化率为53.12%和31.25%,68.75%的患者血清可以检测到异常甲基化,正常对照血清中未检测到RASSF1A和CDH13基因启动子区甲基化,RASSF1A和CDH13基因甲基化与患者的临床病理资料无明显相关性(P>0.05);表明nMSP法检测血清中RASSF1A和CDH13基因启动子区甲基化具有较高的敏感性,可为肝细胞癌的筛查、早期诊断和预后判断提供有价值的信息.

非小细胞肺癌患者血清CDH13基因甲基化检测及意义

肺癌是全世界范围内首位肿瘤死因。由启动子异常甲基化造成的特定基因的沉默在肺癌发病机制中起重要作用。钙黏附素（cadherin）是调整上皮表型和肿瘤侵袭力的细胞黏附分子[1]。CDH13是cadherin家族的成员之一，是一个候选抑癌基因，在人类多种肿瘤中因启动子甲基化而沉默。

改良多重实时荧光定量PCR法测定抑癌基因MGMT、p16、CDH13和RASSF1A甲基化在肺癌早期诊断中的作用

目的:建立改良多重实时荧光定量PCR法,检测抑癌基因MGMR、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化,探讨其在肺癌早期诊断中的应用。方法:选取30例病理确诊为肺癌的患者作为肺癌组,30例病理确诊为良性病变的患者作为对照组。建立改良实时荧光定量PCR体系。检测受试者血清MGMT、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化,对比两组基因甲基化阳性率,计算四项基因甲基化单独及联合用于肺癌早期诊断的敏感度和特异度。结果:肺癌组受试者血清MGMT、p16、CDH13和RASSF1A显著高于对照组(P<0.05);MGMT、p16、CDH13和RASSF1A四项基因甲基化联合检测用于肺癌早期诊断的敏感度和特异度显著高于单项指标检测(P<0.05)。结论:建立了多重实时荧光定量PCR法用于MGMT、p16、CDH13和RASSF1A基因甲基化检测,联合检测用于肺癌早期诊断具有较高的敏感度和特异度。

CDH13基因变异与非小细胞肺癌的相关性

目的探讨CDH13基因变异与非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer，NSCLC）的相关性．方法采用TaqMan探针基因分型方法对NSCLC患者（n＝115）及健康体检人群（n＝110）CDH13基因rs11646213及rs71954092个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNPs）位点进行基因分型，评估上述2个SNPs与NSCLC发生发展的相关性．结果CDH13基因SNP-rs16146213基因型和等位基因频率在病例组和对照组中的分布均存具有统计学意义（＜0.05）（OR＝0.464，95%CI：0.273～0.789）．SNP-rs7195409基因型和等位基因频率在不同临床分期中的分布均有统计学意义（＜0.05）（OR＝0.491，95%CI：0.243～0.991）．结论CDH13基因SNP-rs11646213与NSCLC的发生相关性，G等位基因对NSCLC的发生可能具有保护性作用．CDH13基因SNP-rs7195409与NSCLC的恶性程度有关，G等位基因可能在NSCLC的发展中起到保护性作用．

5-氮-2’脱氧胞苷诱导肺癌细胞系CDH13基因去甲基化及其表达

目的观察去甲基化制剂5-氮-2’脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycytidine,5-Aza-dC)对人肺癌细胞系A549和LTEP-a2中CDH13基因启动子区甲基化状态及表达的影响,探讨肺癌细胞CDH13基因失活的机制及去甲基化制剂对CDH13基因表达的调控作用。方法 5-Aza-dC处理体外培养的肺癌细胞A549、LTEP-a2及正常肺细胞系HFL1后,用甲基化特异性PCR(MSP)法检测处理前后细胞中CDH13基因的甲基化状态,半定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测用药前后细胞中CDH13 mRNA表达的变化。结果正常肺细胞中未见CDH13启动子甲基化,肺癌细胞A549、LTEP-a2均发现CDH13启动子甲基化现象;应用5-Aza-dC能使CDH13基因启动子区CpG岛发生去甲基化。肺癌细胞A549、LTEP-a2均可见CDH13 mRNA表达,但与正常肺细胞比较表达较弱,经药物处理癌细胞后其CDH13 mRNA的表达较前明显增强。结论启动子区异常甲基化是肺癌细胞CDH13基因失活的主要原因之一,去甲基化制剂5-Aza-dC能完全逆转CDH13基因甲基化状态,从而调控CDH13基因表达。

中国荷斯坦牛金黄色葡萄球菌诱导型乳房炎CDH13基因甲基化分析

为探索钙黏蛋白13基因(cadherin 13,CDH13)甲基化在奶牛金黄色葡萄球菌乳房炎中的调控机制,本试验在已建立的金黄色葡萄球菌诱导型荷斯坦牛乳房炎模型的基础上利用重亚硫酸盐测序技术(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测正常乳腺组织和乳房炎乳腺组织候选基因CDH13的甲基化程度,并分析其甲基化程度与基因表达水平的关系。结果显示,除金黄色葡萄球菌致病组(试验组)第12个CpG岛外,其余所有CpG岛均呈现不同程度的甲基化:-259处甲基化水平最高(50%~60%),-144、-135和-126处甲基化均较低,为5%左右。试验组和对照组总体甲基化率分别为10.13%±1.81%和14.43%±0.55%,不同位点和总体甲基化率无显著差异(P>0.05)。与正常乳腺组织相比,乳房炎感染组乳腺组织CDH13基因表达上调,CDH13基因-162和-93两个CpG岛甲基化水平与其基因表达呈显著负相关(P<0.05)。本试验结果表明,CDH13基因甲基化影响其基因表达,从而影响乳房炎的发生,为进一步探索其在金黄色葡萄球菌致病型乳房炎中的发病机制提供了参考依据。

CDH13基因启动子区域突变和甲基化与肺癌的关系研究进展

随着社会经济的增长,医学水平和生活水平的提高,人们对于健康的意识逐渐增强,恶性肿瘤通常发现较晚,后果严重,患者及家属对其发生发展存在着众多质疑。因此,针对性的研究尤为重要。近年来研究表明,CDH13(基因T钙黏蛋白)基因启动子区域突变和甲基化对肺癌的发生有一定影响。现就CDH13基因启动子区域突变和甲基化与肺癌的关系做一综述。

CDH13表达下调对膀胱癌细胞迁移和侵袭及PI3K/Akt表达的影响

目的研究膀胱癌5637细胞中CDH13表达下调后对细胞迁移、侵袭和PI3K/Akt表达的影响以及它们间的关系。方法应用RNA干扰技术抑制人膀胱癌5637细胞株中CDH13的表达,划痕实验检测细胞迁移能力,Transwell小室法检测细胞侵袭能力,Western blot检测CDH13、PI3K及Akt的表达水平。结果膀胱癌5637细胞中CDH13表达下调后细胞迁移和侵袭能力增强,PI3K及Akt的表达增加。结论膀胱癌细胞中CDH13表达下调可能通过激活PI3K/Akt通路促进肿瘤细胞的迁移和侵袭。

肺癌患者CDH13基因启动子甲基化状态研究

目的应用甲基化特异性PCR(MSP)方法检测非小细胞肺癌(NSCLC)CDH13基因启动子甲基化情况。方法留取44例非小细胞肺癌患者手术标本及12例非肺癌患者正常肺组织,MSP分析CDH13基因启动子甲基化情况。结果 44例非小细胞肺癌中CDH13基因启动子甲基化阳性率为54.5%(24/44),12例正常肺组织中未检测到此基因的甲基化(0/12)。CDH13基因甲基化与患者性别及吸烟与否无关;肿瘤分期越晚甲基化的发生率越高。结论原发性非小细胞肺癌中存在着较高比例的CDH13启动子甲基化,提示CDH13在非小细胞肺癌的发生中起着重要作用。

CDH13基因在食管癌细胞株EC1和EC109中的甲基化研究

目的:探讨食管癌细胞中CDH13基因启动子区甲基化状态,以及5-杂氮-2′-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)作用对CDH13基因甲基化状态及其表达的影响。方法:5-Aza-CdR处理前后分别采用甲基化特异性PCR(MSP)检测食管癌细胞EC1和EC109中CDH13基因启动子区甲基化状态,Western blot检测CDH13蛋白表达水平的变化。结果:CDH13基因在EC1中呈半甲基化,在EC109中呈完全甲基化。5-Aza-CdR可逆转食管癌细胞中CDH13基因甲基化,恢复其蛋白的表达。结论:CDH13基因异常甲基化可能是其在食管癌中失活的重要方式,应用5-Aza-CdR可逆转甲基化状态,并恢复CDH13表达。

文昌鸡中脂联素受体CDH13基因的表达

以文昌鸡为实验材料,利用RT-qPCR的方法检测在文昌鸡不同组织及腹部脂肪组织生长发育过程中CDH13的表达情况,为鸡CDH13基因的功能研究奠定基础。研究结果显示,CDH13基因在心脏、回肠、脂肪组织、小脑及肌胃中表达量较高,脂联素表达情况与之相似;CDH13基因在文昌鸡腹部脂肪组织生长发育过程中均稳定高表达,并育肥4周龄时,表达量达到最高。

胸腺上皮肿瘤中CDH13基因启动子区甲基化检测的临床意义

目的观察胸腺上皮肿瘤(TETs)组织中CDH13基因启动子区甲基化情况,探索CDH13基因启动子甲基化与TETs肿瘤发生进展之间的关系。方法收集胸腺上皮肿瘤组织,采用巢式甲基化特异性聚合酶链式反应(MSP)技术检测CDH13基因启动子区甲基化状态,并分析其与临床病理之间的联系。结果 CDH13基因启动子区甲基化总检出率为37.8%;CDH13基因启动子区甲基化情况与患者性别、年龄以及是否合并重症肌无力无关(P>0.05);按照世界卫生组织(WHO)组织学分型,分化越差的TETs组织中CDH13基因启动子区甲基化发生率越高,大多数甲基化阳性结果均来自于B2/B3/C组,A/AB/B1组仅有少量甲基化阳性结果(P=0.002);按照Masaoka病理分期,Ⅰ+Ⅱ期肿瘤中CDH13基因启动子甲基化率明显低于Ⅲ+Ⅳ期(P=0.001)。结论 CDH13基因启动子区的异常甲基化与TETs肿瘤的病理分期和组织学分型密切相关。

慢性髓系白血病患者CD34^+ CD38^-细胞水平JunB和CDH13基因启动子区域的甲基化状态研究

慢性髓系白血病(CML)是骨髓造血干细胞恶性增殖的克隆性疾病,在CML患者细胞水平由于JunB和CDH13基因启动子区甲基化而使这2个抑癌基因的表达受损。为了探讨正常人和CML患者CD34+ CD38-细胞水平JunB和CDH13(cadhe rin-13)基因启动子区域甲基化状态及表达水平的差异,应用流式细胞仪分选出CD34+ CD38-细胞,采用甲基化特异性聚合酶链反应(MS-PCR)检测5例正常人和8例CML患者骨髓CD34+ CD38-细胞JunB和CDH13基因启动子区域甲基化状态,用实时定量PCR(RT-PCR)检测JunB和CDH13基因的表达情况。结果表明:JUNB和CDH13基因在正常人骨髓CD34+ CD38-细胞中呈完全性非甲基化状态,CML患者骨髓CD34+ CD38-细胞中JunB和CDH13基因启动子区甲基化比例分别为87.5%(7/8)和50%(4/8),明显高于正常人(p<0.05)。CML患者骨髓CD34+ CD38-细胞中JunB和CDH13基因mRNA相对表达水平与正常人的相比明显降低(2-??CT分别为1/5.21和1/10.63)。结论:在CML患者骨髓CD34+ CD38-细胞中JunB和CDH13基因启动子区域都发生了高度的甲基化,它们的mRNA表达水平也明显降低,JunB和CDH13基因启动子区域甲基化在CML的发病机制中起到一定的作用,甲基化检测对CML的靶向治疗及新的治疗方法具有重要意义。

CDH13基因在乳腺癌细胞株MCF-7中表达及甲基化调控

目的探讨5-氮杂-2'脱氧胞嘧啶(5-aza-2'-deoxycytidine,5-Aza-CdR)诱导CDH13阴性人乳腺癌细胞株MCF-7中CDH13基因去甲基化后恢复表达情况及其功能状态。方法 5-Aza-CdR作用乳腺癌细胞株MCF-7后,MTT法及FCM法检测对细胞增殖和周期的影响。RT-PCR检测5-Aza-CdR对CDH13阴性人乳腺癌细胞MCF-7中CDH13表达的影响。结果 5-Aza-CdR能明显抑制MCF-7细胞生长,细胞周期阻滞在G0/G1期,恢复CDH13在MCF-7细胞株中表达。结论 CDH13启动子甲基化导致细胞株MCF-7中CDH13表达沉默,5-Aza-CdR能重新激活CDH13阴性乳腺癌细胞株MCF-7细胞中CDH13表达,抑制MCF-7细胞增殖,这可能是其引起乳腺癌细胞株MCF-7生物学行为改变的机制之一。

LncRNA H19通过海绵miR-675和上调CDH13的表达促进肺癌的增殖、侵袭和上皮-间质转化

目的探讨LncRNA H19对肺癌SPC-A1细胞增殖、侵袭和上皮-间质转化(EMT)的影响及其作用机制。方法实时荧光定量PCR检测LncRNA H19、miR-675和CDH13在SPC-A1细胞、BEAS-2B细胞中的差异表达;siRNA H19转染SPC-A1细胞,通过MTT、Transwell及Western blot检测SPC-A1细胞的增殖、侵袭和EMT能力。miRanda软件和双荧光素酶报告基因实验分析LncRNA H19和miR-675之间的作用靶点和相关性。miR-675 inhibitor转染SPC-A1细胞,检测SPC-A1细胞的增殖、侵袭和EMT能力。检测上调LncRNA H19通过miR-675对SPC-A1细胞增殖、侵袭和EMT的影响。TargetScan软件和双荧光素酶报告基因实验分析miR-675和CDH13之间的作用靶点和相关性。siRNA CDH13转染SPC-A1细胞,检测SPC-A1细胞的增殖、侵袭和EMT能力。RT-qPCR和Western blot检测LncRNA H19通过miR-675对CDH13表达的影响。结果与BEAS-2B细胞相比,SPC-A1细胞中LncRNA H19和CDH13表达上调,miR-675表达下调(P<0.05)。siRNA H19转染SPC-A1细胞明显抑制了细胞的增殖、侵袭与EMT;LncRNA H19靶向且负调控miR-675;上调LncRNA H19通过miR-675表达促进SPC-A1细胞恶性发展。miR-675靶向且负调控CDH13。siRNA CDH13转染SPC-A1细胞明显抑制了细胞的增殖、侵袭与EMT。LncRNA H19通过miR-675上调CDH13表达。结论LncRNA H19通过海绵miR-675和上调CDH13表达促进了SPC-A1细胞增殖、侵袭和EMT。

CDH13基因在肾透明细胞癌中的高表达及其临床意义

目的探讨CDH13基因在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及临床价值。方法利用TCGA、GEO、CPTAC、HPA、UALCAN、cBioPortal和Metascape数据库分析并探究CDH13基因在ccRCC中的差异表达、预后价值、基因组变异和富集通路。运用qRT-PCR、Western blot和免疫组织化学染色法进一步检测40对ccRCC组织和癌旁组织中CDH13基因的表达水平。结果与正常组织相比,ccRCC组织中CDH13基因的mRNA和蛋白质表达水平明显升高(P<0.05),并且与患者的临床病理特征密切相关。生存分析显示CDH13基因的高水平表达与ccRCC患者较高的总体存活率及无进展生存率显著相关,并且是ccRCC患者预后的独立预测因素(P<0.05)。此外,约4%的ccRCC患者中存在CDH13基因组变异,并且该基因的变异与患者预后相关(P<0.05)。富集分析结果表明,CDH13相关基因主要涉及血管发育、内皮发育、细胞迁移及细胞粘附等生物过程。基于40对临床样本的研究进一步验证了CDH13基因在ccRCC组织中高水平表达。结论作为ccRCC潜在的生物标志物及治疗靶点,CDH13基因在ccRCC组织中呈现高水平表达,并且与ccRCC患者临床病理特征及预后相关。

急性髓系白血病病人CDH13基因甲基化状态检测及其临床意义

目的:检测急性髓系白血病(AML)病人CDH13基因甲基化状态,探讨其与病人临床特征及预后的相关性。方法:用甲基化特异性PCR法分别检测34例AML病人(AML组)和22例非恶性肿瘤的缺铁性贫血病人(对照组)骨髓标本中CDH13基因启动子甲基化状态,用半定量反转录PCR法检测2组标本中CDH13 mRNA相对含量。AML组病人随访2年,统计总体生存时间。结果:AML组标本CDH13基因甲基化阳性率为61.76%,高于对照组的27.27%(P<0.05);AML组CDH13mRNA相对含量为0.355±0.109,明显低于对照组的0.745±0.271(P<0.01)。不同性别、年龄以及临床分型AML病人的CDH13基因甲基化差异均无统计学意义(P>0.05)。Kaplan-Meier生存曲线分析显示,CDH13基因甲基化阳性的AML病人总体生存时间为(12.4±3.3)个月,明显短于甲基化阴性病人的(18.6±4.1)个月(P<0.01)。结论:AML病人中存在CDH13基因甲基化现象,检测CDH13基因表达水平有助于判断AML病人预后。

CDH13基因在转移性肾透明细胞癌中的研究

目的:探索CDH13在转移性肾透明细胞癌(KIRC)中的异常表达及其分子机制,并分析CDH13作为KIRC预后标志物的价值。方法:分别使用TCGA和GEO数据库比较CDH13在KIRC和正常组织中的转录水平,通过实时荧光定量PCR进行验证。利用UALCAN网站分析KIRC中CDH13的蛋白表达水平和启动子区甲基化修饰水平,使用SMART网站分析不同临床分期KIRC中CDH13甲基化水平,并用MethSurv网页分析其与预后的关联。结果:与正常组织比较,CDH13 mRNA在KIRC中显著表达上调(P<0.05);但在有淋巴结、远处器官转移及Ⅲ~Ⅳ期患者中表达水平较低。CDH13的蛋白水平在转移性KIRC中,随着肿瘤的分级而不断降低。KIRC组织中CDH13启动子区甲基化水平高于正常对照样本,且肿瘤分期、分级越高,CDH13甲基化水平越高。甲基转移酶抑制剂5-aza-dC可明显恢复CDH13在KIRC细胞中的表达水平。此外,CDH13的启动子区不同cg位点的甲基化水平与患者预后密切相关,高甲基化水平越高的患者预后越差。结论:CDH13在转移性KIRC中转录和表达水平失活,并提示患者的不良预后。