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基于线粒体16S rDNA和COΙ基因探讨中国近海黄姑鱼类的分子系统进化关系 被引量:9
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作者 辛俭 张玉荣 +3 位作者 徐冬冬 楼宝 詹炜 毛国民 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期307-313,共7页
为探讨中国近海黄姑鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增了黄姑鱼(Nibea albifora)、浅色黄姑鱼(N.coibor)、日本黄姑鱼(N.japonica)和状黄姑鱼(N.miichthioides)等4种黄姑鱼类的16S rDNA和COΙ基因片段并进行了序列测定,计算其种间及种内... 为探讨中国近海黄姑鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增了黄姑鱼(Nibea albifora)、浅色黄姑鱼(N.coibor)、日本黄姑鱼(N.japonica)和状黄姑鱼(N.miichthioides)等4种黄姑鱼类的16S rDNA和COΙ基因片段并进行了序列测定,计算其种间及种内遗传距离并结合来自GenBank的13种石首鱼科鱼类的相应基因片段序列构建分子系统树。结果表明:(1)利用16S rDNA片段可以对4种黄姑鱼类进行分子鉴定;但是基于COΙ基因片段计算的日本黄姑鱼和状黄姑鱼的种间遗传距离为0.002—0.005,尚未达到种间分化水平,应用该基因片段进行这两种鱼的分子鉴定值得商榷;(2)分子系统树显示日本黄姑鱼和状黄姑鱼与黄姑鱼和浅色黄姑鱼处于不同的系统发育阶元,日本黄姑鱼和状黄姑鱼与白姑鱼属鱼类聚为同一类群,支持形态学上将日本黄姑鱼和状黄姑鱼划归为白姑鱼属的分类学观点。 展开更多
关键词 黄姑鱼属 16S rDNA COI 分子鉴定 系统进化
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我国旋毛虫地理株遗传变异与系统发生关系的研究 被引量:3
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作者 刘莉娜 崔晶 +4 位作者 姜鹏 王蕾 李灵招 张玺 王中全 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期958-960,共3页
目的通过分析旋毛虫线粒体基因分子标记,研究我国旋毛虫地理株间的遗传变异与系统发生关系。方法应用旋毛虫线粒体核糖体小亚基DNA(mitochondrial small subunit ribosomal DNA,mtSSU)和线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因(mitochondria cytoch... 目的通过分析旋毛虫线粒体基因分子标记,研究我国旋毛虫地理株间的遗传变异与系统发生关系。方法应用旋毛虫线粒体核糖体小亚基DNA(mitochondrial small subunit ribosomal DNA,mtSSU)和线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因(mitochondria cytochrome coxidase,COΙ)为分子标记,分别对我国7个旋毛虫地理株扩增后进行双向测序,利用DNAMAN软件将测序结果和GenBank中相应序列进行比对研究,并使用MEGA4.0程序包构建系统进化树。结果 PCR对7个旋毛虫地理株分别扩增出了649bp(mtSSU)和419bp(COΙ)的DNA片段,7个地理株的DNA片段与GenBank中T.spiralis的相应片段相比存在一定差异,其中mtSSU基因有4个变异位点(248、293、537和539位),而COI基因仅存在2个变异(273和382位),所有变异均为T-C或C-T的转换;进化树显示南阳株和云南株位于比较近的分枝,而西安株、广西株及西藏株亲缘关系较近。结论我国7个旋毛虫地理株的遗传变异较小,亲缘关系较近。 展开更多
关键词 旋毛虫 遗传变异 系统发生关系 mtSSU COI
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First record of Liposcelis entomophila(Enderlein)(Psocodea: Liposcelididae) from Sri Lanka based on morphological and molecular data
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作者 Jixiang Cui Yun Su +1 位作者 Hu Li Zhihong Li 《Zoological Systematics》 CSCD 2019年第4期304-315,共12页
The booklice genus,Liposcelis(Psocodea:Liposcelididae),owns some stored product pests and have economic importance.In this study,6 booklice specimens from Sri Lanka were collected and identified based on morphological... The booklice genus,Liposcelis(Psocodea:Liposcelididae),owns some stored product pests and have economic importance.In this study,6 booklice specimens from Sri Lanka were collected and identified based on morphological and molecular data.According to the morphological and phylogenetic analyses,the samples were identified as Liposcelis entomophila.The mitochondrial gene cytochrome c oxidase I(COI)and second internal transcribed spacer(ITS2)were sequenced for phylogenetic work.The phylogenetic trees show that the samples assemble with L.entomophila together and could be distinguished with other Liposcelis spp.apparently.The genus Liposcelis and the species L.entomophila are firstly reported in Sri Lanka. 展开更多
关键词 Booklice MORPHOLOGICAL CHARACTERISTICS coι ITS2
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