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基于COI基因的浙江省内黄缘闭壳龟遗传多样性研究
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作者 陈敏 秦媛 +3 位作者 林业宏 任思齐 叶嘉政 郑善坚 《野生动物学报》 北大核心 2024年第2期367-377,共11页
为了解浙江省内不同黄缘闭壳龟(Cuora flavomarginata)群体的种质资源现状,基于线粒体DNA COI序列对来自浙江省内野外和养殖场的8个黄缘闭壳龟群体的遗传多样性和遗传结构进行比较分析。结果表明:黄缘闭壳龟线粒体COI基因序列长度为1040... 为了解浙江省内不同黄缘闭壳龟(Cuora flavomarginata)群体的种质资源现状,基于线粒体DNA COI序列对来自浙江省内野外和养殖场的8个黄缘闭壳龟群体的遗传多样性和遗传结构进行比较分析。结果表明:黄缘闭壳龟线粒体COI基因序列长度为1040 bp,A=27.4%、T=30.5%、C=24.6%、G=17.5%,有较强的AT偏好性;共定义9个单倍型,单倍型多样性(Hd)为(0.79900±0.21000),核苷酸多样性(Pi)为(0.00209±0.00147),呈“高Hd低Pi”遗传分布;不同黄缘闭壳龟群体间的遗传距离为0~0.003,群体内部的遗传距离为0~0.004,其中磐安后阁村(YS)群体内部的遗传距离最大,为0.004;单倍型系统发育树并未呈现明显的谱系结构;群体间遗传分化指数(FST)为-0.34752~0.82222,8个群体的遗传分化不显著(p>0.05);中性检验(Tajima’s D=-0.36627,Fu’s FS=-0.605)与核苷酸错配分布均表明,浙江省内黄缘闭壳龟群体并未经历种群扩张事件,同时,由Mantel检验可知,遗传距离与地理距离没有显著的相关性(R=0.2938,p>0.05);AMOVA分子方差结果显示,群体内的遗传变异高于群体间(85.06%>14.94%)。研究表明,浙江省内黄缘闭壳龟群体之间为高单倍型多样性和低核苷酸多样性的遗传特征,并且存在一定水平的遗传分化,群体内存在明显的基因交流,根据COI基因分析显示,在磐安县获得的野生黄缘闭壳龟个体确定为黄缘闭壳龟浙江种,同时也发现存在浙江种与安徽种的杂交种,建议将分化程度不同的黄缘闭壳龟群体划分为不同单元保护。研究结果为浙江省内黄缘闭壳龟种质资源开发利用和合理制定保护措施提供了基础依据。 展开更多
关键词 黄缘闭壳龟 coi 遗传多样性 遗传结构 浙江省
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烟青虫不同地理种群的mtDNA COI基因序列分析及其系统发育
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作者 梁辉 杨东升 《四川农业科技》 2024年第1期52-58,共7页
烟青虫是一种世界性的农业害虫,对烟草种植危害严重,在我国四川、贵州、华中等多个烟草产区造成了巨大损失,损失量达到15%。烟青虫在亚洲、非洲和澳洲分布广泛,本研究对分布在不同地理种群的烟青虫进行mtDNA COI基因序列分析,同时研究... 烟青虫是一种世界性的农业害虫,对烟草种植危害严重,在我国四川、贵州、华中等多个烟草产区造成了巨大损失,损失量达到15%。烟青虫在亚洲、非洲和澳洲分布广泛,本研究对分布在不同地理种群的烟青虫进行mtDNA COI基因序列分析,同时研究其系统发育关系,为研究四川省烟青虫防治提供借鉴。结果表明,昆明和玉溪为同一个类群;昭通和珠海为同一个类群;韩国、宿迁、妙峰山为同一个类群;进化关系为((((昆明+玉溪)(昭通+珠海))+(大理+丽江))+(印度+(妙峰山+(韩国+宿迁))))。研究结果揭示了10个来自不同地区烟青虫的COI基因序列特征以及发育关系,为研究凉山州烟青虫的防治和系统发育提供了基础分子数据。 展开更多
关键词 烟青虫 烟草 coi 系统发育
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An Adaptive Hate Speech Detection Approach Using Neutrosophic Neural Networks for Social Media Forensics
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作者 Yasmine M.Ibrahim Reem Essameldin Saad M.Darwish 《Computers, Materials & Continua》 SCIE EI 2024年第4期243-262,共20页
Detecting hate speech automatically in social media forensics has emerged as a highly challenging task due tothe complex nature of language used in such platforms. Currently, several methods exist for classifying hate... Detecting hate speech automatically in social media forensics has emerged as a highly challenging task due tothe complex nature of language used in such platforms. Currently, several methods exist for classifying hatespeech, but they still suffer from ambiguity when differentiating between hateful and offensive content and theyalso lack accuracy. The work suggested in this paper uses a combination of the Whale Optimization Algorithm(WOA) and Particle Swarm Optimization (PSO) to adjust the weights of two Multi-Layer Perceptron (MLPs)for neutrosophic sets classification. During the training process of the MLP, the WOA is employed to exploreand determine the optimal set of weights. The PSO algorithm adjusts the weights to optimize the performanceof the MLP as fine-tuning. Additionally, in this approach, two separate MLP models are employed. One MLPis dedicated to predicting degrees of truth membership, while the other MLP focuses on predicting degrees offalse membership. The difference between these memberships quantifies uncertainty, indicating the degree ofindeterminacy in predictions. The experimental results indicate the superior performance of our model comparedto previous work when evaluated on the Davidson dataset. 展开更多
关键词 Hate speech detection whale optimization neutrosophic sets social media forensics
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基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI的贵州东方蜜蜂群体遗传分析
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作者 周文才 李应 +7 位作者 姚丹 万炜 詹洪平 黎华君 贺兴江 冉曜琦 于瀛龙 韦小平 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1819-1828,共10页
【目的】明确贵州省东方蜜蜂群体的遗传结构和遗传多样性,掌握其遗传现状,为贵州省东方蜜蜂的遗传资源评价及保护利用提供参考依据。【方法】基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段对贵州省内19个采样点的1282群东方蜜蜂进行遗传分析,计... 【目的】明确贵州省东方蜜蜂群体的遗传结构和遗传多样性,掌握其遗传现状,为贵州省东方蜜蜂的遗传资源评价及保护利用提供参考依据。【方法】基于线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段对贵州省内19个采样点的1282群东方蜜蜂进行遗传分析,计算单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异数(K)和核苷酸多样性(π)等遗传多样性指数,采用中性检验(Tajima's D和Fu's Fs)评估群体扩张情况,通过计算遗传分化系数(Fst)、构建系统发育进化树和分子方差分析评估其遗传分化,并开展环境因子相关分析以明确遗传分化的作用因子。【结果】贵州东方蜜蜂在线粒体tRNA^(leu)~COII片段上的Hd介于0.5421~0.9167,π介于0.00174~0.00527,K介于0.611~1.854,其中台江、雷山、麻江、罗甸、紫云、晴隆和威宁等7个采样点发生过群体扩张;在线粒体COI片段上的Hd介于0.5710~0.9109,π介于0.00109~0.00261,K介于0.874~2.084,其中松桃、江口、印江、台江、石阡、雷山、罗甸、紫云、黔西、晴隆和威宁等11个采样点发生过群体扩张。贵州东、西部东方蜜蜂群体间存在中度遗传分化(在tRNA^(leu)~COII片段上的Fst=0.04±0.02,在COI片段上的Fst=0.07±0.04),贵州西部东方蜜蜂群体内也存在中度遗传分化(在tRNA^(leu)~COII片段上的Fst=0.04±0.02,在COI片段上的Fst=0.07±0.03)。相关分析结果显示,贵州西部东方蜜蜂组群的遗传分化程度与海拔呈弱相关,但与温度、湿度等环境因子呈显著正相关。【结论】贵州省东方蜜蜂在线粒体tRNA^(leu)~COII和COI片段上的遗传多样性处于较高水平,主要归功于蜂群数量大和饲养方式较原始;贵州东方蜜蜂整体上呈现中度遗传分化,且西部东方蜜蜂组群内部的遗传分化程度较东部东方蜜蜂组群更高,主要与温度和湿度等环境因子密切相关,是其为适应所处环境而进化产生,而非海拔因素造成。 展开更多
关键词 东方蜜蜂 tRNA^(leu)~coiI片段 coi片段 遗传多样性 遗传分化 环境因子
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基于线粒体COI序列的江淮下游湖泊鲢群体遗传多样性和遗传结构分析 被引量:1
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作者 李大命 杨子萍 +5 位作者 刘燕山 谷先坤 殷稼雯 蔡永久 唐晟凯 张彤晴 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2023年第4期3-11,共9页
本研究采用线粒体COI序列为分子标记,探究了长江、淮河下游8个湖泊鲢(Hypophthalmichthys molitrix)群体的遗传多样性和遗传结构。通过PCR和测序技术,获得鲢COI基因序列片段。分析结果显示:COI序列片段长度为630 bp,243条COI序列共检出2... 本研究采用线粒体COI序列为分子标记,探究了长江、淮河下游8个湖泊鲢(Hypophthalmichthys molitrix)群体的遗传多样性和遗传结构。通过PCR和测序技术,获得鲢COI基因序列片段。分析结果显示:COI序列片段长度为630 bp,243条COI序列共检出23个变异位点,定义14种单倍型,平均单倍型多样性(H_(d))和核苷酸多样性(P_(i))分别为0.692和0.00512。8个群体的单倍型多样性为0.508~0.803,核苷酸多样性为0.00241~0.00694,表明鲢群体的遗传多样性有较大差异。分子方差分析结果显示,遗传变异主要来自于群体内,遗传分化指数(F_(ST))为0.0083,表明群体间没有显著遗传分化。系统发育树和网络结构图显示,单倍型分化为2个分支,但群体没有形成特定的地理遗传结构。中性检验结果和歧点分布曲线表明,鲢群体没有显著偏离中性选择,群体大小保持相对稳定。 展开更多
关键词 鲢(Hypophthalmichthys molitrix) coi基因 遗传多样性 遗传结构
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基于COI和Cytb基因序列的太湖河蚬遗传多样性分析
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作者 李大命 刘洋 +5 位作者 刘燕山 唐晟凯 谷先坤 殷稼雯 蒋琦辰 张彤晴 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期69-73,共5页
以线粒体COI和Cytb基因部分序列作为分子标记,对太湖河蚬(Corbicula fluminea)群体的遗传多样性进行分析。结果显示:COI和Cytb序列片段长度分别为614 bp和621 bp,两基因片段的碱基AT含量明显大于GC含量,碱基组成具有偏好性。COI序列有1... 以线粒体COI和Cytb基因部分序列作为分子标记,对太湖河蚬(Corbicula fluminea)群体的遗传多样性进行分析。结果显示:COI和Cytb序列片段长度分别为614 bp和621 bp,两基因片段的碱基AT含量明显大于GC含量,碱基组成具有偏好性。COI序列有19个变异位点,定义14种单倍型,平均单倍型和核苷酸多样性分别为0.851±0.04和0.007 45±0.000 81,平均核苷酸差异数为4.572,单倍型之间的遗传距离为0.002至0.020;Cytb序列有19个变异位点,定义17种单倍型,平均单倍型和核苷酸多样性分别为0.896±0.028和0.005 10±0.000 51,平均核苷酸差异数为3.167,单倍型之间的遗传距离为0.002至0.013,河蚬的遗传多样性具有高单倍性多样性和高核苷酸多样性特征。中性检验结果和歧点分布图分析表明,太湖河蚬种群进化过程中保持相对稳定,未经历显著的种群扩张过程。 展开更多
关键词 河蚬 遗传多样性 CYTB基因 coi基因 种群历史
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基于COI基因解析我国茶网蝽种群遗传多样性和遗传结构
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作者 陈世春 江宏燕 +2 位作者 廖姝然 陈亭旭 王晓庆 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期795-805,共11页
茶网蝽(Stephanitis chinensis)是我国西南茶区的重要害虫,近年有入侵成灾事件发生。为解析茶网蝽的生态适应机制和成灾规律,测定了茶网蝽12个种群共240头成虫COI基因序列,利用Dna SP 6.12.03、Arlequin3.5.2.2、MEGA 7.0.26等软件进行... 茶网蝽(Stephanitis chinensis)是我国西南茶区的重要害虫,近年有入侵成灾事件发生。为解析茶网蝽的生态适应机制和成灾规律,测定了茶网蝽12个种群共240头成虫COI基因序列,利用Dna SP 6.12.03、Arlequin3.5.2.2、MEGA 7.0.26等软件进行了遗传分化程度、基因流(N_(m))以及分子变异情况的分析。结果显示,茶网蝽12个地理种群的240条COI基因序列共包含75个变异位点和38个单倍型,其中仅Hap13是共享单倍型。茶网蝽总群体的单倍型多样性指数(H_d)为0.82779,地理种群的H_d在0.00~0.85,总群体的遗传分化固定系数(F_(ST))为0.86426,N_(m)为0.03987,表明我国茶网蝽群体遗传分化程度较高,基因交流较小。重庆城口、重庆巫溪、湖北恩施、湖北十堰、陕西汉中等5个种群相互之间遗传分化程度较低,基因交流频繁(F_(ST)<0.06,N_(m)>4.50),其他种群对之间分化程度较高,基因交流较少(F_(ST)>0.25,N_(m)<1.00)。分子变异分析(AMOVA)支持遗传分化主要来自于不同地理种群之间(86.43%)。Tajima’s D和Fu’s F_(s)中性检验支持重庆巴南、湖北恩施种群以及大巴山脉周边群体发生过种群扩张事件。本研究分析推测我国茶网蝽兼具入侵种群扩张成灾和原始种群扩张成灾的风险,建议有茶网蝽发生的茶区和大巴山脉周边茶园加强对该害虫的监测工作。 展开更多
关键词 茶网蝽 地理种群 coi基因 遗传多样性 遗传结构
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渤海湾7种虾虎鱼科鱼类COI基因序列特征及分子分类研究
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作者 房恩军 郭彪 +3 位作者 郑德斌 张雪 王硕 王宇 《天津农业科学》 CAS 2023年第9期32-37,共6页
为获得渤海湾天津海域常见虾虎鱼线粒体条形码序列及系统分类信息,采集渤海湾7种虾虎鱼样本,通过形态初步鉴定物种,并提取DNA进行线粒体COI基因部分序列扩增测序,用系统进化分析及分子鉴定软件MEGA对渤海湾常见12种虾虎鱼COI基因部分片... 为获得渤海湾天津海域常见虾虎鱼线粒体条形码序列及系统分类信息,采集渤海湾7种虾虎鱼样本,通过形态初步鉴定物种,并提取DNA进行线粒体COI基因部分序列扩增测序,用系统进化分析及分子鉴定软件MEGA对渤海湾常见12种虾虎鱼COI基因部分片断进行序列特征分析及分子分类分析。扩增得到7种虾虎鱼COI基因片断,分析得到其平均GC含量低于AT含量,碱基在密码子位置分布中具有偏向性,且GC含量最高为第2位碱基,与多种鱼类COI基因碱基特点相似。基因密码子碱基变异率为19.4%,转换颠换比为1.3。遗传距离分析及系统进化树分析理清了渤海湾天津海域12种主要虾虎鱼的系统分类及进化关系。遗传距离显示,矛尾刺虾虎鱼(Amblychaeturichthys hexanema)和斑尾复虾虎鱼(Synechogobius ommaturus)为同种鱼。虾虎鱼COI编码基因密码子高变异率可能与其良好的环境适应性有关。 展开更多
关键词 渤海湾虾虎鱼 线粒体细胞色素c氧化酶亚基(coi) 系统进化
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基于线粒体COI基因的DNA条形码在光唇鱼属鱼类系统分类中的应用
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作者 李强 黄文炜 +6 位作者 彭苏汉 周江伟 詹华伟 张钰莹 蓝昭军 李文俊 桂林 《安徽农学通报》 2023年第16期51-55,共5页
本文基于COI基因序列对光唇鱼属13种鱼类进行分子鉴定及系统进化研究。结果表明,光唇鱼属各物种间遗传距离,除了北江光唇鱼(A.beijiangensis)与窄条光唇鱼(A.stenotaeniatus)之间的遗传距离(0.0157)外,其余物种间遗传距离都大于0.0200... 本文基于COI基因序列对光唇鱼属13种鱼类进行分子鉴定及系统进化研究。结果表明,光唇鱼属各物种间遗传距离,除了北江光唇鱼(A.beijiangensis)与窄条光唇鱼(A.stenotaeniatus)之间的遗传距离(0.0157)外,其余物种间遗传距离都大于0.0200。在分子系统发育树上,北江光唇鱼与窄条光唇鱼形成一个分支,且因其种间遗传距离达不到种的划分水平,结合已有的资料判断两者可能为同一物种;吉首光唇鱼(A.jishouensis)在分子系统发育树上与侧条光唇鱼(A.parallens)和半刺光唇鱼(A.hemispinus)聚为姐妹分支,且与两者的种间遗传距离都明显大于0.0200,吉首光唇鱼应为一个有效种;半刺光唇鱼和带半刺光唇鱼(A.cinctus)在系统树上各自分布在2个独立的分支上,且两者间遗传距离比各自与同分支上的物种间遗传距离大,故判断它们的差异已达到种的水平。本研究结果表明线粒体COI基因序列能有效地对光唇鱼属鱼类进行物种鉴定,并可用于探讨光唇鱼属的系统发育研究。 展开更多
关键词 DNA条形码 coi基因 光唇鱼属 系统发育
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CVIP-Net: A Convolutional Neural Network-Based Model for Forensic Radiology Image Classification
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作者 Syeda Naila Batool Ghulam Gilanie 《Computers, Materials & Continua》 SCIE EI 2023年第1期1319-1332,共14页
Automated and autonomous decisions of image classification systems have essential applicability in this modern age even.Image-based decisions are commonly taken through explicit or auto-feature engineering of images.I... Automated and autonomous decisions of image classification systems have essential applicability in this modern age even.Image-based decisions are commonly taken through explicit or auto-feature engineering of images.In forensic radiology,auto decisions based on images significantly affect the automation of various tasks.This study aims to assist forensic radiology in its biological profile estimation when only bones are left.A benchmarked dataset Radiology Society of North America(RSNA)has been used for research and experiments.Additionally,a locally developed dataset has also been used for research and experiments to cross-validate the results.A Convolutional Neural Network(CNN)-based model named computer vision and image processing-net(CVIP-Net)has been proposed to learn and classify image features.Experiments have also been performed on state-of-the-art pertained models,which are alex_net,inceptionv_3,google_net,Residual Network(resnet)_50,and Visual Geometry Group(VGG)-19.Experiments proved that the proposed CNN model is more accurate than other models when panoramic dental x-ray images are used to identify age and gender.The specially designed CNN-based achieved results in terms of standard evaluation measures including accuracy(98.90%),specificity(97.99%),sensitivity(99.34%),and Area under the Curve(AUC)-value(0.99)on the locally developed dataset to detect age.The classification rates of the proposed model for gender estimation were 99.57%,97.67%,98.99%,and 0.98,achieved in terms of accuracy,specificity,sensitivity,and AUC-value,respectively,on the local dataset.The classification rates of the proposed model for age estimation were 96.80%,96.80%,97.03%,and 0.99 achieved in terms of accuracy,specificity,sensitivity,and AUC-value,respectively,on the RSNA dataset. 展开更多
关键词 Bones forensic analysis forensic radiology biology profile estimation age&gender estimation using dental x-ray images
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基于线粒体COI基因对棘胸蛙养殖群体的遗传多样性分析
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作者 张燕萍 章海鑫 +2 位作者 习宏斌 吴子君 廖再生 《江西水产科技》 2023年第4期1-5,共5页
为研究江西省棘胸蛙的遗传多样性,利用线粒体COI分子标记对采自江西省内峡江、靖安、金溪、明月山、于都5个棘胸蛙养殖群体144个样本进行遗传多样性分析。结果显示:144条棘胸蛙线粒体COI长度为990bp,共检测出变异位点270个,包括简约信... 为研究江西省棘胸蛙的遗传多样性,利用线粒体COI分子标记对采自江西省内峡江、靖安、金溪、明月山、于都5个棘胸蛙养殖群体144个样本进行遗传多样性分析。结果显示:144条棘胸蛙线粒体COI长度为990bp,共检测出变异位点270个,包括简约信息位点250个,单突变位点20个,2个缺失和插入;共检测到35个不同的单倍型,单倍型多样性为0.927;核苷酸多样性为0.0405,平均核苷酸差异数(K)为40.018。养殖群体除峡江和于都群体的遗传多样性较高,其余3个群体均较低;群体内发生了极大的分化,群体变异主要来源于群体内(78.08%)。 展开更多
关键词 棘胸蛙 coi 养殖群体 遗传多样性
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基于线粒体COI和D-loop序列的黑龙江流域蛇[鱼句]种群遗传结构分析 被引量:1
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作者 胡宗云 杨培民 +1 位作者 宋红梅 牟希东 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2023年第2期12-20,共9页
以线粒体COI和D-loop序列为分子标记,基于88个样本研究了黑龙江流域3个蛇[鱼句](Saurogobio dabryi)种群的遗传多样性和遗传结构。结果表明,比对剪切后的COI和D-loop序列长度分别为582~583 b、834~583 b,基于COI序列总体的单倍型多样性(... 以线粒体COI和D-loop序列为分子标记,基于88个样本研究了黑龙江流域3个蛇[鱼句](Saurogobio dabryi)种群的遗传多样性和遗传结构。结果表明,比对剪切后的COI和D-loop序列长度分别为582~583 b、834~583 b,基于COI序列总体的单倍型多样性(0.377 3)略低于基于D-loop序列的单倍型多样性(0.577 0),但基于两个序列总体的核苷酸多样性指数相等,且仅有0.000 9。群体间遗传距离分别为0.000 9(COI)和0.000 9~0.001 0(D-loop),群体间遗传分化指数分别为-0.004 9~0.007 6(COI)和-0.002 8~0.011 4(D-loop),遗传分化均不显著(P>0.05)。分子方差分析(AMOVA)显示,群体内遗传变异占总变异的100.02%(COI)和99.49%(D-loop),总的遗传变异主要源自群体内。单倍型系统发育树和TCS网络图表明,所有的单倍型随机地聚集在一起,没有形成明显的地理格局。中性检验和核苷酸错配分析显示,3个蛇[鱼句]群体历史上发生过种群扩张事件。综上,3个蛇[鱼句]群体遗传多样性水平相对较低,群体间没有显著的遗传分化,可以将3个群体视为一个遗传管理单元。这些发现将丰富蛇[鱼句]现有的遗传信息,并为制定黑龙江流域蛇[鱼句]资源保护策略提供参考。 展开更多
关键词 蛇[鱼句](Saurogobio dabryi) coi D-LOOP 遗传多样性 遗传结构
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基于线粒体COI基因的云南西花蓟马种群遗传多样性研究
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作者 姜宁 夏振远 +6 位作者 谢永辉 卢灿华 蔺忠龙 马俊红 郭建 王晓萌 盖晓彤 《中国烟草学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期66-75,共10页
【背景和目的】西花蓟马传播的番茄斑萎病毒属病毒可侵染烟草,为揭示云南西花蓟马传播扩散趋势。【方法】以线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)COI基因为分子标记,检测23个不同云南西花蓟马地理种群的遗传多样性、遗传分化、分子变异... 【背景和目的】西花蓟马传播的番茄斑萎病毒属病毒可侵染烟草,为揭示云南西花蓟马传播扩散趋势。【方法】以线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)COI基因为分子标记,检测23个不同云南西花蓟马地理种群的遗传多样性、遗传分化、分子变异和种群动态。【结果】基于mtDNA COI基因分析,共检测到10种单倍型,总群体的单倍型多样度(Hd)较高,为0.60700;总群体遗传分化指数(Fst)和基因流(Nm)分别为0.48031和4.46,表明云南西花蓟马各地理种群间基因交流水平较高;单倍型中介网络图没有明显分支;种群间分子变异主要来自种群内部;总群体中性检验Taijima’s D达到极显著水平,Fu’s Fs达到显著水平,且错配分布曲线中,除主峰外其余峰不明显,说明云南西花蓟马种群近期或正经历明显的种群扩张。【结论】云南西花蓟马种群遗传多样性丰富,近期种群或正经历明显扩张,应积极监测并采取有效的防控措施,保障农业生产健康发展。 展开更多
关键词 西花蓟马 种群遗传学 种群动态 mtDNA coi基因 地理种群
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大黄鱼野生和养殖群体的COI序列变异分析
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作者 雷凤玲 陈敏芳 +3 位作者 蒙扬鑫 牛素芳 吴仁协 潘滢 《广西科学》 CAS 北大核心 2023年第4期794-803,共10页
为阐明大黄鱼Larimichthys crocea野生和养殖群体的遗传变异特性,本研究采用COI基因序列对徐闻东岸野生群体(XWD)、硇洲岛野生群体(NZD)、闽粤东野生群体(MYD)、象山养殖群体(XSYZ)和宁德养殖群体(NDYZ)等5个大黄鱼群体的遗传多样性水... 为阐明大黄鱼Larimichthys crocea野生和养殖群体的遗传变异特性,本研究采用COI基因序列对徐闻东岸野生群体(XWD)、硇洲岛野生群体(NZD)、闽粤东野生群体(MYD)、象山养殖群体(XSYZ)和宁德养殖群体(NDYZ)等5个大黄鱼群体的遗传多样性水平、单倍型分布、遗传分化、历史动态等进行比较分析。结果显示,3个野生群体的遗传多样性水平(h=0.757 6-0.877 5、π=0.002 6-0.003 1)明显高于2个养殖群体(h=0.194 7-0.495 2、π=0.000 8-0.001 0),二者的单倍型分布频率差异明显;XSYZ与NDYZ、MYD群体间存在显著的遗传分化(F_(st)=0.128 5、0.086 0,P<0.05),NDYZ与3个野生群体间具有遗传同质性(F_(st)=-0.010 6-0.000 2,P>0.05)。历史动态分析支持野生大黄鱼经历了晚更新世的群体数量扩张,但不支持养殖大黄鱼发生群体扩张。研究表明群体间遗传多样性的差异反映了不同进化力量在大黄鱼野生和养殖群体遗传中的作用机制。养殖实践和人工选育对东海区大黄鱼群体间的遗传分化起到了重要作用,而群体扩张、养殖逃逸、人工放流以及物种的扩散能力等因素可能促使粤西海域和东海区大黄鱼群体间具有遗传同质性。本研究揭示了粤西海域和东海区大黄鱼群体种质资源状况以及野生群体与养殖群体间的遗传特性差异,可为大黄鱼种质资源保护和利用提供科学依据。 展开更多
关键词 大黄鱼 coi基因 序列变异 遗传分化 种质资源
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基于COI基因分析叶尔羌河5种鲤科鱼类遗传多样性
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作者 张小雨 靳文慧 +1 位作者 王佳 王玉涛 《安徽农业科学》 CAS 2023年第16期86-89,共4页
[目的]探讨线粒体COI基因对叶尔羌河鱼类资源鉴定及遗传多样性分析的适应性。[方法]分析叶尔羌河5种鲤科的50条COI基因片段序列,并结合GenBank比对筛选出的12条高同源序列基于邻接法构建系统进化树。[结果]5种鱼类COI基因同源序列的长度... [目的]探讨线粒体COI基因对叶尔羌河鱼类资源鉴定及遗传多样性分析的适应性。[方法]分析叶尔羌河5种鲤科的50条COI基因片段序列,并结合GenBank比对筛选出的12条高同源序列基于邻接法构建系统进化树。[结果]5种鱼类COI基因同源序列的长度675 bp,碱基组成展现出显著A/T的偏倚性,转换/颠换的比值(R值)为3.2;核苷酸变异位点有146个,定义了10个单倍型;除塔里木裂腹鱼和宽口裂腹鱼物种间的遗传距离(0.002 4),其余物种间的遗传距离均符合2%阈值或10倍原则;系统进化树中,除塔里木裂腹鱼和宽口裂腹鱼外,斑重唇鱼、鲫鱼和鲤鱼均形成独立分支,推测两者亲缘关系较近或物种间未达到分化程度。[结论]COI基因适用于叶尔羌河除裂腹鱼属外鱼类的物种鉴定及多样性分析。 展开更多
关键词 coi基因 鲤科鱼类 遗传多样性 叶尔羌河
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Research on Metaverse Security and Forensics
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作者 Guangjun Liang Jianfang Xin +3 位作者 Qun Wang Xueli Ni Xiangmin Guo Pu Chen 《Computers, Materials & Continua》 SCIE EI 2023年第10期799-825,共27页
As a subversive concept,the metaverse has recently attracted widespread attention around the world and has set off a wave of enthusiasm in academic,industrial,and investment circles.However,while the metaverse brings ... As a subversive concept,the metaverse has recently attracted widespread attention around the world and has set off a wave of enthusiasm in academic,industrial,and investment circles.However,while the metaverse brings unprecedented opportunities for transformation to human society,it also contains related risks.Metaverse is a digital living space with information infrastructure,interoperability system,content production system,and value settlement system as the underlying structure in which the inner core is to connect real residents through applications and identities.Through social incentives and governance rules,the metaverse reflects the digital migration of human society.This article will conduct an in-depth analysis of the metaverse from the perspective of electronic data forensics.First,from the perspective of Internet development,the background and development process of the metaverse is discussed.By systematically elaborating on the concept and connotation of the metaverse,this paper summarizes the different views of current practitioners,experts,and scholars on the metaverse.Secondly,from the perspective of metaverse security,the social risk and crime risks of the metaverse are discussed.Then the importance of metaverse forensics is raised.Third,from the perspective of blockchain,smart wearable devices,and virtual reality devices,the objects and characteristics of metaverse forensics have been studied in depth.Taking smart wearable devices as an example,this paper gives the relevant experimental process of smart bracelet forensics.Finally,many challenges faced by metaverse forensics are summarized by us which provide readers with some exploratory guidance. 展开更多
关键词 Metaverse forensicS blockchain smart wear virtual reality
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Forensic Study on Objective Evaluation of Visual Acuity of Ametropia with the Event-related Potential P3
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作者 Fu-quan JIA Fang-liang LUO +3 位作者 Yan-he XIONG Long-long CHENG Zhi-qiang DANG Ji-hui LIU 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2023年第3期609-614,共6页
Objective In this study,we aimed to assess the characteristics of the P3 component from an event-related potential(ERP)that was induced by visual acuity(VA)processing.Furthermore,we sought to provide electrophysiologi... Objective In this study,we aimed to assess the characteristics of the P3 component from an event-related potential(ERP)that was induced by visual acuity(VA)processing.Furthermore,we sought to provide electrophysiological evidence for the objective evaluation of VA.Methods We recruited 32 participants with myopia-related ametropia.They reported no other ocular diseases and had an uncorrected VA of 4.0 in both eyes.We used the block letter“E”at different visual angles and orientations as the graphic stimuli.The oddball paradigm,consisting of 4 modules,was used for ERP analysis.The standard stimuli of each module were identical,with a visual angle of 1°15′.The visual angles of the target stimuli were 1°15′,55′,24′,and 15′.The VA test was performed on each eye separately for all participants,and all characteristics of the P3 component were analyzed.Results There was no significant difference in the P3 peak letencies between the target stimulation angle 1°15′group and the 55′group,or between the target stimulation angle 24′group and the 15′group.There was a significant difference in the P3 peak letencies between the target stimulation angle 1°15′group and the 24′group as well as the 15′group.There was a significant difference in the P3 peak letencies between the target stimulation angle 55′group and the 24′group as well as the 15′group.No significant differences were observed in the P3 amplitude between modules.Conclusion In the oddball paradigm,P3 elicitation indicated a cognitive response to the target stimuli.These data showed that the characteristics of P3 can be used as an objective evaluation of VA. 展开更多
关键词 event-related potential P3 visual acuity forensic medicine AMPLITUDE
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基于线粒体COI及16S rRNA基因序列的笠贝科系统进化研究
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作者 顾忠旗 苗菁 +2 位作者 马颜雯 黄继 叶莹莹 《浙江海洋大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第3期205-211,254,共8页
采集了中国东南沿海地区笠贝科3属7种笠贝样品:陆川小笠贝、北戴河小笠贝Nipponacmea sp.、黑新笠贝、鸡爪拟帽贝、琉球拟帽贝,通过PCR扩增笠贝的COI及16S rRNA基因片段并测序,另外从GenBank中下载了笠贝科11种笠贝的COI和16S rRNA基因... 采集了中国东南沿海地区笠贝科3属7种笠贝样品:陆川小笠贝、北戴河小笠贝Nipponacmea sp.、黑新笠贝、鸡爪拟帽贝、琉球拟帽贝,通过PCR扩增笠贝的COI及16S rRNA基因片段并测序,另外从GenBank中下载了笠贝科11种笠贝的COI和16S rRNA基因,计算了所有18种笠贝的碱基含量和遗传距离,并分别构建了基于COI和16S rRNA系统进化树。结果表明:COI基因片段长度为550 bp,16S rRNA基因片段长度为449 bp,T碱基含量最高,C碱基含量最少,COI基因的遗传距离为0.004~0.470,16S rRNA的遗传距离为0.013~0.575,系统发育分析表明,3个属的进化关系为Nipponacmea与Lottia互为姐妹群,其次为Patelloida。每个属都形成独立分支,参与分析的其他属的进化地位也与早期研究相接近,但本研究中,COI和16S rRNA的系统发育树也呈现出略微差异,如笠贝科的Yayoiacmea与Tectura聚集在一起形成了姐妹群,Patelloida内物种的位置也产生了小范围的变化。 展开更多
关键词 笠贝科 coi 16S rRNA 系统进化
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Comparison Study and Forensic Analysis between Experiment and Coupled Dynamics Simulation for Submerged Floating Tunnel Segment with Free Ends under Wave Excitations
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作者 Woo Chul Chung Chungkuk Jin +1 位作者 Moo Hyun Kim Ju-young Hwang 《Computer Modeling in Engineering & Sciences》 SCIE EI 2023年第10期155-174,共20页
This paper presents dynamic-behavior comparisons and related forensic analyses of a submerged floating tunnel(SFT)between numerical simulation and physical experiment under regular and irregular waves.The experiments ... This paper presents dynamic-behavior comparisons and related forensic analyses of a submerged floating tunnel(SFT)between numerical simulation and physical experiment under regular and irregular waves.The experiments are conducted in the 3Dwave tank with 1:33.3 scale,and the corresponding coupled time-domain simulation tool is devised for comparison.The entire SFT systemconsists of a long concrete tunnel and 12 tubular aluminummooring lines.Two numerical simulation models,the Cummins equation with 3D potential theory including second-order wave-body interaction effects and the much simpler Morison-equation-based formula with the lumped-massbased line model,are designed and compared.Forensic analyses for mooring-line adjustments in the simulation are carried out in view of the best representation of the physical system.After that,the measured pre-tension distribution and systemstiffness of twelvemooring lines arewell reproduced in the numericalmodel.Subsequently,the dynamic responses and mooring tensions of the SFT are compared under regular and irregular waves.The measured and simulated results coincide reasonably well for both regular-and irregular-wave conditions. 展开更多
关键词 Submerged floating tunnel comparative study forensic analysis mooring-line modeling dynamic response mooring tension
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Hyper-Tuned Convolutional Neural Networks for Authorship Verification in Digital Forensic Investigations
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作者 Asif Rahim Yanru Zhong +2 位作者 Tariq Ahmad Sadique Ahmad Mohammed A.ElAffendi 《Computers, Materials & Continua》 SCIE EI 2023年第8期1947-1976,共30页
Authorship verification is a crucial task in digital forensic investigations,where it is often necessary to determine whether a specific individual wrote a particular piece of text.Convolutional Neural Networks(CNNs)h... Authorship verification is a crucial task in digital forensic investigations,where it is often necessary to determine whether a specific individual wrote a particular piece of text.Convolutional Neural Networks(CNNs)have shown promise in solving this problem,but their performance highly depends on the choice of hyperparameters.In this paper,we explore the effectiveness of hyperparameter tuning in improving the performance of CNNs for authorship verification.We conduct experiments using a Hyper Tuned CNN model with three popular optimization algorithms:Adaptive Moment Estimation(ADAM),StochasticGradientDescent(SGD),andRoot Mean Squared Propagation(RMSPROP).The model is trained and tested on a dataset of text samples collected from various authors,and the performance is evaluated using accuracy,precision,recall,and F1 score.We compare the performance of the three optimization algorithms and demonstrate the effectiveness of hyperparameter tuning in improving the accuracy of the CNN model.Our results show that the Hyper Tuned CNN model with ADAM Optimizer achieves the highest accuracy of up to 90%.Furthermore,we demonstrate that hyperparameter tuning can help achieve significant performance improvements,even using a relatively simple model architecture like CNNs.Our findings suggest that the choice of the optimization algorithm is a crucial factor in the performance of CNNs for authorship verification and that hyperparameter tuning can be an effective way to optimize this choice.Overall,this paper demonstrates the effectiveness of hyperparameter tuning in improving the performance of CNNs for authorship verification in digital forensic investigations.Our findings have important implications for developing accurate and reliable authorship verification systems,which are crucial for various applications in digital forensics,such as identifying the author of anonymous threatening messages or detecting cases of plagiarism. 展开更多
关键词 Convolutional Neural Network(CNN) hyper-tuning authorship verification digital forensics
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