COL9A1基因多态性与儿童大骨节病的关联分析

目的探讨COL9A1(IX型胶原α1链)基因多态性在儿童大骨节病(Kashin-beck disease,KBD)发病中的作用。方法 2015年6至8月西安交大医学部公共卫生学院地病所在陕西省麟游县和永寿县大骨节病区收集35例KBD患儿(病例组)和84例健康儿童(对照组)全血,并提取全血基因组DNA,应用Sequenom ass ARRAY RS1000分型技术对COL9A1上15个SNPs基因多态性位点进行基因分型,比较病例组与对照组等位基因和基因型的分布差异。结果关联分析发现rs6910140位点突变型等位基因C的频率在病例组为17.1%(12/70),明显低于对照组的38.1%(64/168)(χ2=11.5,P<0.05);而在位点rs1135056中,突变型等位基因C的频率在病例组为32.9%(23/70),明显高于对照组的17.3%(29/168)(χ2=7.03,P<0.05)。两位点的基因型频率分布在两组儿童中也均存在显著性差异(χ2值分别为12.32和10.79,均P<0.05)。结论 COL9A1基因多态性与儿童KBD的易患性有关,在rs6910140基因上个体携带等位基因C可能与KBD易患性的降低有关,在基因rs1135056上个体携带等位基因C可能与KBD易患性的增加有关。

COL9A1基因在单纯性马蹄内翻足中的表达及其多态性分析

目的 COL9A1基因是位于单纯性马蹄内翻足(ICTEV)易感区域(6q12-13)的已知基因。本研究探讨COL9A1基因在ICTEV患者中的表达及其单核苷酸多态(SNP)位点在ICTEV和正常人中的分布情况。方法应用免疫组化方法检测25例ICTEV患儿及5例正常对照组肌肉及肌腱组织中COL9A1的表达;应用限制性片段长度多态性技术结合测序法,分析118例ICTEV患者及100名正常人COL9A1基因的2个SNP位点基因型。结果 88%(22/25)的ICTEV患者COL9A1蛋白表达阳性,明显高于正常对照组。位于COL9A1基因编码区的SNP位点rs1135056的基因型频率和等位基因频率在两组人群中的分布差异有统计学意义(P<0.05):ICTEV组G等位基因频率高于对照组;与对照组相比,AA基因型频率降低,AG、GG基因型频率增高。结论 COL9A1基因在ICTEV中高表达,rs1135056多态位点G等位基因和ICTEV的发生相关。

单纯性马蹄内翻足易感基因位点筛查

目的将人类单纯性马蹄内翻足(ICTEV)易感基因初步定位,为进一步对其克隆提供基础依据。方法选取与肢体发育、关节翻转及与软骨发育相关的基因作为候选基因,在基因内或其附近选取微卫星标记,应用PCR-短串联重复序列(STR)方法扩增微卫星片段,对84个ICTEV核心家系的252名成员进行基因型分析,并进行遗传连锁不平衡检验(TDT)。结果IX型胶原COL9A1基因(6q12-13区域)内及其附近的2个位点-D6S348及509-8B2经TDT检验表明,此2个位点与ICTEV有相关性(分别χ2=42.15,χ2=31.18,P<0.05);其他位点经TDT检验,不存在连锁不平衡(均P>0.05)。结论COL9A1基因可能是ICTEV的候选基因,从而将ICTEV易感基因初步定位于COL9A1基因所在的染色体区域6q12-13。