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基于COMSTAT软件对微生物被膜进行定量分析的方法与意义
被引量:
1
1
作者
陈璐
王博
+1 位作者
姚蜜蜜
蔡中华
《现代生物医学进展》
CAS
2014年第7期1201-1206,共6页
目的:微生物被膜是一种具有协调性、功能性和高度结构性的膜状复合物,它可以为微生物提供良好的生存环境,免受外界因素的干扰。研究发现,具有产生微生物被膜能力的细菌治病性明显增强,而现今缺乏一种分析微生物被膜的有效手段。本文探...
目的:微生物被膜是一种具有协调性、功能性和高度结构性的膜状复合物,它可以为微生物提供良好的生存环境,免受外界因素的干扰。研究发现,具有产生微生物被膜能力的细菌治病性明显增强,而现今缺乏一种分析微生物被膜的有效手段。本文探讨利用COMSTAT软件对微生物被膜进行定量分析的方法和意义,为对微生物被膜定性定量分析提供支持手段,从而为研究微生物被膜致病性提供方法理论基础。方法:以葡萄球菌为研究模型,利用激光扫描共聚焦显微镜成像技术,结合COMSTAT微生物被膜分析软件对微生物被膜的单位面积生物量、基质覆盖率、平均厚度、粗糙系数等方面进行定量分析,研究了该葡萄球菌的生物被膜生长变化过程,并考察了抗生素对其生物被膜的抑制作用。结果:在葡萄球菌生物被膜生长过程中,生物量、平均厚度以及平均扩散距离等结构指标数值都有明显增加,而粗糙度和表面积与生物量比值呈现降低趋势,表明了微生物被膜由发生向成熟的转化过程。与此同时,经10μg/mL和100μg/mL的卡那霉素处理得到的葡萄球菌微生物被膜生长受到明显抑制,且随着卡那霉素的浓度增加,抑制效果随之增加。结论:本文运用COMSTAT软件的分析方法首次从生物量、平均厚度等结构指标数值的角度描述了葡萄球菌生物被膜,从而有效评价微生物被膜发生、发展、成熟以及崩解的生长过程。该技术在研究微生物被膜形成的理论机制方面存在潜在价值,可以为研究微生物被膜治病性提供理论基础,具有理论指导意义。
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关键词
comstat
软件
微生物被膜
定量分析
葡萄球菌
原文传递
不同培养基质上阪崎克罗诺杆菌生物膜的比较
2
作者
游雪娇
赵智颖
+2 位作者
马连营
彭斐元
李良秋
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第20期132-136,共5页
为了比较阪崎克罗诺杆菌在玻璃、聚丙烯及不锈钢表面形成的生物膜,将培养48 h的阪崎克罗诺杆菌生物膜经荧光染料SYTO 9/PI标记后,用激光共聚焦扫描显微镜(confocal laser scanning microscope,CLSM)联合COMSTAT软件定性定量地分析生物...
为了比较阪崎克罗诺杆菌在玻璃、聚丙烯及不锈钢表面形成的生物膜,将培养48 h的阪崎克罗诺杆菌生物膜经荧光染料SYTO 9/PI标记后,用激光共聚焦扫描显微镜(confocal laser scanning microscope,CLSM)联合COMSTAT软件定性定量地分析生物膜结构。结果表明:阪崎克罗诺杆菌在3种材料表面形成的生物膜的总生物量、平均厚度及平均扩散距离依次是不锈钢>聚丙烯>玻璃,粗糙系数及表面积与生物量比值则为不锈钢<聚丙烯<玻璃,生物膜的菌体活死比例是玻璃高于聚丙烯、不锈钢。另外,标准菌株ATCC 29544生物膜的总生物量、菌体活死比例、平均厚度及平均扩散距离均高于分离株Ⅰ、Ⅱ,粗糙系数及表面积与生物量比值均低于分离株。可见,阪崎克罗诺杆菌在不锈钢表面的成膜性强于玻璃与聚丙烯,标准菌株ATCC 29544的成膜能力高于2株食品分离菌株。
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关键词
阪崎克罗诺杆菌
生物膜
CLSM-
comstat
玻璃
聚丙烯
不锈钢
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职称材料
阪崎克罗诺杆菌生物膜结构的定量分析
3
作者
游雪娇
赵智颖
+2 位作者
马连营
彭斐元
李良秋
《生物技术进展》
2016年第6期449-454,J0004,共7页
为了建立阪崎克罗诺杆菌的孔板置片成膜模型,将不同培养时间(6 h、12 h、24 h、36 h、48 h、60 h和72 h)的生物膜经荧光染料标记后,运用激光共聚焦扫描显微镜(confocal laser scanning microscope,CLSM)联合COMSTAT定量分析生物膜...
为了建立阪崎克罗诺杆菌的孔板置片成膜模型,将不同培养时间(6 h、12 h、24 h、36 h、48 h、60 h和72 h)的生物膜经荧光染料标记后,运用激光共聚焦扫描显微镜(confocal laser scanning microscope,CLSM)联合COMSTAT定量分析生物膜形成过程的结构变化,同时用结晶紫(crystal violet,CV)染色法分析生物量。结果显示:随着培养时间延长,A570先升后降,在60 h有最大值;总生物量、平均厚度及平均扩散距离也先升后降,在60 h有最高值,活死比例、粗糙系数及表面积与生物量比值先降后升,最低值分别在60 h、48 h与60 h;胞外多糖先增后减。阪崎克罗诺杆菌生物膜形成包括:粘附阶段(0~12 h)、发展阶段(12~48 h)、成熟阶段(48~60 h)及解聚再定植阶段(〉60 h)。CLSM-COMSTAT法在定性观察生物膜结构的同时,还可定量分析结构参数,且该法得到的总生物量变化趋势与CV染色法一致,说明CLSMCOMSTAT法可作为分析阪崎克罗诺杆菌生物膜的常规方法。
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关键词
阪崎克罗诺杆菌
生物膜
激光共聚焦扫描显微镜
comstat
定量分析
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职称材料
烟曲霉生物被膜体外flow chamber模型成膜能力研究
4
作者
李冰
陈一强
+4 位作者
孔晋亮
王可
蔡双启
罗劲
董必英
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第19期4328-4331,共4页
目的比较烟曲霉生物被膜(BF)在体外流动与静止模型中的成膜能力,获取较佳的体外研究模型,为烟曲霉今后的体外研究提供技术方法支持。方法分别建立烟曲霉生物被膜体外流动模型和静止模型,在生物被膜形成的不同阶段行FITC-Canavalia ensif...
目的比较烟曲霉生物被膜(BF)在体外流动与静止模型中的成膜能力,获取较佳的体外研究模型,为烟曲霉今后的体外研究提供技术方法支持。方法分别建立烟曲霉生物被膜体外流动模型和静止模型,在生物被膜形成的不同阶段行FITC-Canavalia ensiformis(FITC-ConA)胞外基质(ECM)染色,激光扫描共聚焦显微镜(CLSM)观察烟曲霉生物被膜三维(3D)形态,COMSTAT软件定量分析3D图像堆,比较两种培养状态下生物被膜的生物量、平均厚度等生长指标。结果在静止模型和流动模型中,BF的生物量、平均厚度、基质覆盖率、平均扩散距离均随着培养时间的延长而升高,粗糙系数、表面积与生物量比随着培养时间的延长而降低;相同时间点下,静止模型组形成的BF的生物量、平均厚度、基质覆盖率、平均扩散距离较流动模型组的高,差异有统计学意义(P<0.05);静止模型组粗糙系数和表面积与生物量比较流动模型组的低,前者差异有统计学意义(P<0.05),后者差异无统计学意义。结论烟曲霉在流动模型中亦可形成稳定的生物被膜,但静止模型可分泌更多的ECM,形成更厚的生物被膜,更利于研究者对体外烟曲霉BF进行研究。
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关键词
烟曲霉
生物被膜
流动模型
静止模型
comstat
原文传递
题名
基于COMSTAT软件对微生物被膜进行定量分析的方法与意义
被引量:
1
1
作者
陈璐
王博
姚蜜蜜
蔡中华
机构
清华大学生命科学学院
清华大学深圳研究生院海洋科学与技术学部
出处
《现代生物医学进展》
CAS
2014年第7期1201-1206,共6页
基金
国家973前期专项(2012CB426504)
国家自然科学基金项目(41106087)
+2 种基金
国家海洋公益性项目(201205020-09
20130502)
广东省自然科学基金项目(S2012010010855)
文摘
目的:微生物被膜是一种具有协调性、功能性和高度结构性的膜状复合物,它可以为微生物提供良好的生存环境,免受外界因素的干扰。研究发现,具有产生微生物被膜能力的细菌治病性明显增强,而现今缺乏一种分析微生物被膜的有效手段。本文探讨利用COMSTAT软件对微生物被膜进行定量分析的方法和意义,为对微生物被膜定性定量分析提供支持手段,从而为研究微生物被膜致病性提供方法理论基础。方法:以葡萄球菌为研究模型,利用激光扫描共聚焦显微镜成像技术,结合COMSTAT微生物被膜分析软件对微生物被膜的单位面积生物量、基质覆盖率、平均厚度、粗糙系数等方面进行定量分析,研究了该葡萄球菌的生物被膜生长变化过程,并考察了抗生素对其生物被膜的抑制作用。结果:在葡萄球菌生物被膜生长过程中,生物量、平均厚度以及平均扩散距离等结构指标数值都有明显增加,而粗糙度和表面积与生物量比值呈现降低趋势,表明了微生物被膜由发生向成熟的转化过程。与此同时,经10μg/mL和100μg/mL的卡那霉素处理得到的葡萄球菌微生物被膜生长受到明显抑制,且随着卡那霉素的浓度增加,抑制效果随之增加。结论:本文运用COMSTAT软件的分析方法首次从生物量、平均厚度等结构指标数值的角度描述了葡萄球菌生物被膜,从而有效评价微生物被膜发生、发展、成熟以及崩解的生长过程。该技术在研究微生物被膜形成的理论机制方面存在潜在价值,可以为研究微生物被膜治病性提供理论基础,具有理论指导意义。
关键词
comstat
软件
微生物被膜
定量分析
葡萄球菌
Keywords
comstat
software
Microbial biofilm
Quantitative analysis
Staphylococcus sp.
分类号
Q93-31 [生物学—微生物学]
原文传递
题名
不同培养基质上阪崎克罗诺杆菌生物膜的比较
2
作者
游雪娇
赵智颖
马连营
彭斐元
李良秋
机构
广东省微生物研究所省部共建华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室
出处
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第20期132-136,共5页
基金
广东省科学院分析测试基金项目(Sf201502)
文摘
为了比较阪崎克罗诺杆菌在玻璃、聚丙烯及不锈钢表面形成的生物膜,将培养48 h的阪崎克罗诺杆菌生物膜经荧光染料SYTO 9/PI标记后,用激光共聚焦扫描显微镜(confocal laser scanning microscope,CLSM)联合COMSTAT软件定性定量地分析生物膜结构。结果表明:阪崎克罗诺杆菌在3种材料表面形成的生物膜的总生物量、平均厚度及平均扩散距离依次是不锈钢>聚丙烯>玻璃,粗糙系数及表面积与生物量比值则为不锈钢<聚丙烯<玻璃,生物膜的菌体活死比例是玻璃高于聚丙烯、不锈钢。另外,标准菌株ATCC 29544生物膜的总生物量、菌体活死比例、平均厚度及平均扩散距离均高于分离株Ⅰ、Ⅱ,粗糙系数及表面积与生物量比值均低于分离株。可见,阪崎克罗诺杆菌在不锈钢表面的成膜性强于玻璃与聚丙烯,标准菌株ATCC 29544的成膜能力高于2株食品分离菌株。
关键词
阪崎克罗诺杆菌
生物膜
CLSM-
comstat
玻璃
聚丙烯
不锈钢
Keywords
Cronobacter sakazakii
biofihn
CLSM-
comstat
glass
polypropylene
stainless steel
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
下载PDF
职称材料
题名
阪崎克罗诺杆菌生物膜结构的定量分析
3
作者
游雪娇
赵智颖
马连营
彭斐元
李良秋
机构
广东省微生物研究所
广东省菌种保藏与应用重点实验室
出处
《生物技术进展》
2016年第6期449-454,J0004,共7页
基金
广东省科学院分析测试基金项目(Sf201502)资助
文摘
为了建立阪崎克罗诺杆菌的孔板置片成膜模型,将不同培养时间(6 h、12 h、24 h、36 h、48 h、60 h和72 h)的生物膜经荧光染料标记后,运用激光共聚焦扫描显微镜(confocal laser scanning microscope,CLSM)联合COMSTAT定量分析生物膜形成过程的结构变化,同时用结晶紫(crystal violet,CV)染色法分析生物量。结果显示:随着培养时间延长,A570先升后降,在60 h有最大值;总生物量、平均厚度及平均扩散距离也先升后降,在60 h有最高值,活死比例、粗糙系数及表面积与生物量比值先降后升,最低值分别在60 h、48 h与60 h;胞外多糖先增后减。阪崎克罗诺杆菌生物膜形成包括:粘附阶段(0~12 h)、发展阶段(12~48 h)、成熟阶段(48~60 h)及解聚再定植阶段(〉60 h)。CLSM-COMSTAT法在定性观察生物膜结构的同时,还可定量分析结构参数,且该法得到的总生物量变化趋势与CV染色法一致,说明CLSMCOMSTAT法可作为分析阪崎克罗诺杆菌生物膜的常规方法。
关键词
阪崎克罗诺杆菌
生物膜
激光共聚焦扫描显微镜
comstat
定量分析
Keywords
Cronobacter sakazakii
biofilm
confocal laser scanning microscope
comstat
quantitative analysis
分类号
Q93 [生物学—微生物学]
下载PDF
职称材料
题名
烟曲霉生物被膜体外flow chamber模型成膜能力研究
4
作者
李冰
陈一强
孔晋亮
王可
蔡双启
罗劲
董必英
机构
广西医科大学第一附属医院呼吸疾病研究所
出处
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第19期4328-4331,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(81260002)
文摘
目的比较烟曲霉生物被膜(BF)在体外流动与静止模型中的成膜能力,获取较佳的体外研究模型,为烟曲霉今后的体外研究提供技术方法支持。方法分别建立烟曲霉生物被膜体外流动模型和静止模型,在生物被膜形成的不同阶段行FITC-Canavalia ensiformis(FITC-ConA)胞外基质(ECM)染色,激光扫描共聚焦显微镜(CLSM)观察烟曲霉生物被膜三维(3D)形态,COMSTAT软件定量分析3D图像堆,比较两种培养状态下生物被膜的生物量、平均厚度等生长指标。结果在静止模型和流动模型中,BF的生物量、平均厚度、基质覆盖率、平均扩散距离均随着培养时间的延长而升高,粗糙系数、表面积与生物量比随着培养时间的延长而降低;相同时间点下,静止模型组形成的BF的生物量、平均厚度、基质覆盖率、平均扩散距离较流动模型组的高,差异有统计学意义(P<0.05);静止模型组粗糙系数和表面积与生物量比较流动模型组的低,前者差异有统计学意义(P<0.05),后者差异无统计学意义。结论烟曲霉在流动模型中亦可形成稳定的生物被膜,但静止模型可分泌更多的ECM,形成更厚的生物被膜,更利于研究者对体外烟曲霉BF进行研究。
关键词
烟曲霉
生物被膜
流动模型
静止模型
comstat
Keywords
Aspergillus fumigates
Biofilm
Flow chamber system
Static system
comstat
分类号
R379 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于COMSTAT软件对微生物被膜进行定量分析的方法与意义
陈璐
王博
姚蜜蜜
蔡中华
《现代生物医学进展》
CAS
2014
1
原文传递
2
不同培养基质上阪崎克罗诺杆菌生物膜的比较
游雪娇
赵智颖
马连营
彭斐元
李良秋
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
下载PDF
职称材料
3
阪崎克罗诺杆菌生物膜结构的定量分析
游雪娇
赵智颖
马连营
彭斐元
李良秋
《生物技术进展》
2016
0
下载PDF
职称材料
4
烟曲霉生物被膜体外flow chamber模型成膜能力研究
李冰
陈一强
孔晋亮
王可
蔡双启
罗劲
董必英
《中华医院感染学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
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