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题名谷子CO家族基因的全基因组鉴定与分析
被引量:2
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作者
穆彩琴
屈聪玲
张瑞娟
李燕
杨致荣
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机构
山西农业大学文理学院
山西农业大学研究生院
山西农业大学生命科学学院
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出处
《山西农业科学》
2016年第9期1243-1246,1253,共5页
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基金
山西省回国留学人员科研资助项目(2015-067)
山西省留学回国人员科技活动择优资助项目(2014-11)
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文摘
抽穗开花是高等植物从营养生长向生殖生长转变的过程,该过程受到众多基因的调控。CONSTANS(CO)是光周期开花途径中的一个关键基因,是生物节律钟基因和开花基因之间的关键枢纽。利用生物信息学的方法,从谷子基因组中鉴定了34个CO基因;与拟南芥CO家族的17个成员进行同源比对,发现Seita.7G007800与Seita.9G020100相似性最高;在此基础上,分析了谷子CO基因的启动子,发现启动子有光响应元件Sp1、脱落酸响应元件ABRE以及赤霉素响应元件P-box等;RNA-Seq转录组测序发现,这些CO基因在叶片中表达量存在显著差异,其中,Seita.4G192300基因表达量最高,而Seita.1G304900,Seita.3G080700和Seita.4G001600这3个基因在叶片中不表达。这些结果不仅为深入研究CO基因与抽穗开花的关系提供依据,而且为后续谷子抽穗开花途径的研究奠定理论基础。
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关键词
谷子
全基因组
constans
光周期途径
抽穗
开花
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Keywords
f oxtail millet
genome-wide
consta ns
photoperiod pathway
heading
flowering
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分类号
S515
[农业科学—作物学]
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