基于COX I基因的太平洋西岸文昌鱼地理种群分析

文昌鱼是进化发育研究的重要模式动物,目前实验材料均采自野外。因此,对其进行正确的物种鉴定和地理种群的遗传分化分析十分必要。该研究扩增并测定了COXⅠ基因部分序列,结合NCBI数据库中的COXΙ序列信息,对太平洋西岸文昌鱼的种类和地理种群分化情况进行了分析。结果表明,马来文昌鱼(Branchiostoma malayanum)、白氏文昌鱼(B.belcheri)和日本文昌鱼(B.japonicum)这3个种之间的遗传差异很大,再次证实3个物种的有效性,同时提出应当审慎对待NCBI数据库中文昌鱼的种名标注;太平洋西岸文昌鱼属Branchiostoma的3种文昌鱼群体遗传多样性均处于较高水平,同一物种的不同地理种群间没有出现明显的遗传分化,反映了海洋动物的基因交流较容易,不同海域隔离较弱。

竞争风险下Fine-Gray模型与Cox模型的比较与评价

在生存分析中经常会遇到存在竞争风险的情形,在存在竞争风险情形下,比较Cox模型与Fine-Gray模型估计的分析效果。本文介绍了在存在竞争风险情形下的Fine-Gray模型,举例说明了Fine-Gray模型风险集的定义以及权重计算方法,并利用Cox模型与Fine-Gray模型对实际存在竞争风险的数据集进行了实例分析,结果表明,Fine-Gray模型与Cox模型分析结果不同,尤其是Cox模型会高估事件的累计发生率。因此,在生存分析中存在竞争风险时,选择Fine-Gray模型进行建模是更适合的。

lincRNA Cox2通过miR-129-5p/AMPK调控BCG感染的巨噬细胞糖酵解进程

[目的]探究lincRNA Cox2对BCG(Bacillus Calmette-Guérin)感染的RAW264.7巨噬细胞糖酵解进程的调控作用,阐明Mtb与巨噬细胞之间的相互作用,为结核病的诊断和治疗提供新的靶点。[方法]利用小干扰RNA敲减lincRNA Cox2的表达,以及使用miR-129-5p mimics过表达载体,结合BCG感染,通过实时荧光定量PCR检测lincRNA Cox2、miR-129-5p和促炎因子IL-1β、TNF-α、IL-6的表达量;乳酸含量检测试剂盒检测乳酸(LD)的分泌情况;平板涂布法检测巨噬细胞菌载量情况;双荧光素酶报告基因系统验证lincRNA Cox2与miR-129-5p以及miR-129-5p与AMPK的互作关系;蛋白免疫印迹检测AMPK(AMP依赖蛋白激酶)及糖酵解途径中关键基因HK1(己糖激酶1)、PKM2(丙酮酸激酶2)和LDHA(乳酸脱氢酶)的表达变化。[结果]BCG感染12 h能够极显著上调RAW264.7巨噬细胞中lincRNA Cox2的表达(P=0.000013),与BCG组相比,siRNA+BCG组中AMPK(P=0.000771)、HK1(P=0.00323)、PKM2(P=0.000135)和LDHA(P=0.002532)的表达量以及乳酸的分泌量(P=0.020802)发生显著上调,而促炎因子IL-1β(P=0.000451)、TNF-α(P=0.000147)、IL-6(P=0.0001)的表达发生显著下调,菌载量试验表明siRNA+BCG组中的巨噬细胞菌载量显著下调(P=0.000127)。双荧光素酶报告基因系统表明lincRNA Cox2和miR-129-5p存在相互作用关系并以AMPK为靶基因。BCG感染RAW264.7巨噬细胞12 h后极显著下调miR-129-5p的表达(P=0.000156),与BCG组相比,miR-129-5p mimics+BCG组中AMPK(P=0.000262)、HK1(P=0.019524)、PKM2(P=0.001658)和LDHA(P=0.000887)表达量以及乳酸分泌量(P=0.044952)发生显著下调。[结论]lincRNA Cox2通过海绵吸附miR-129-5p并靶向AMPK,促进BCG感染的RAW264.7巨噬细胞糖酵解进程。

基于COX健康行为互动模式的护理在结肠癌PICC置管患者中的应用效果

目的探讨基于COX健康行为互动模式的护理在结肠癌经外周静脉穿刺的中心静脉导管(peripherally inserted central venous catheter,PICC)置管患者中的应用效果。方法采用方便抽样法,选取2021年1月—2022年12月无锡市某三级医院收治的110例结肠癌PICC置管患者作为研究对象,采用随机数字表法将其分为对照组与观察组,每组55例。对照组给予常规护理,观察组在此基础上给予基于COX健康行为互动模式的护理干预,两组均持续干预3个月。比较两组干预前、干预后的PICC自我管理能力评分,统计两组的PICC置管并发症发生率。结果干预后,观察组的PICC自我管理能力评分显著高于对照组(P<0.05);观察组的PICC置管并发症发生率为5.45%,显著低于对照组的20.00%(P<0.05)。结论对结肠癌PICC置管患者给予基于COX健康行为互动模式的护理,有助于提高患者化疗间歇期的PICC自我管理能力,减少PICC置管并发症的发生。

基于贝叶斯Cox风险比例回归的兰州市HIV感染者/AIDS患者死亡影响因素分析

[目的]了解兰州市HIV/AIDS报告病例相关特征的构成情况,分析艾滋病相关死亡的影响因素。[方法]通过收集兰州市2011-2019年HIV/AIDS报告病例信息,采用生存分析方法,构建贝叶斯Cox风险比例回归模型分析影响死亡的相关因素。[结果]本研究共选取2312例HIV/AIDS患者,其中艾滋病相关死亡45例。多因素回归结果显示,患者年龄越大,死亡风险越高;确诊时为AIDS患者的死亡风险是HIV感染者的13.91倍;与未接受CD4检测的患者相比,接受CD4检测的患者的死亡风险降低;进行抗病毒治疗者的死亡风险是未进行抗病毒治疗者的0.22倍。[结论]确诊时年龄、病程阶段、是否接受抗病毒治疗是兰州市HIV/AIDS患者艾滋病相关死亡的影响因素,因此要加强艾滋病相关人群健康教育,提倡早发现、早诊断、早治疗,扩大艾滋病检测与治疗的覆盖面,延长艾滋病患者的生存时间。

糖尿病肾脏疾病预后影响因素的COX比例风险回归模型分析

目的基于COX比例风险回归模型分析糖尿病肾脏疾病(diabetic kidney disease,DKD)预后的影响因素,为临床早期评估和防治DKD提供科学的依据。方法收集多中心(河南中医药大学第一附属医院、河南中医药大学第三附属医院、河南省中医院及郑州市人民医院)2010—2021年就诊治疗的DKD患者资料,包括一般资料、实验室指标、中医辨证分型及中医药治疗,以肾小球滤过率(eGFR)下降≥50%、血肌酐(Scr)翻倍、DKD 5期、死亡为结局指标,随访其发生时间及情况,利用COX比例风险回归模型分析筛选DKD预后影响因素。结果本研究最终纳入1947例患者,随访时间为4.65(4.557~4.746)年,发生复合终点事件305例(15.67%)。单因素COX回归分析结果表明,不同年龄、DKD病程≥4年、饮酒史、吸烟史、高血压、冠心病、脑血管病、糖尿病足、糖尿病眼病、糖化血红蛋白(HbA1c)、血尿酸(SUA)、Scr、24 h尿蛋白定量(24 h-UTP)、eGFR、湿热血瘀证、脾肾气虚兼湿聚血瘀证、脾肾阳虚兼血瘀证、中药熏洗、服用中药患者DKD预后情况比较,差异有统计学意义(P<0.05)。多因素COX回归分析结果表明,年龄[HR(95%CI)=2.52(1.92,3.30)]、DKD病程[HR(95%CI)=1.62(1.09,2.42)]、吸烟史[HR(95%CI)=1.61(1.13,2.29)]、饮酒史[HR(95%CI)=1.41(1.01,1.95)]、脑血管病[HR(95%CI)=1.33(1.01,1.75)]、糖尿病眼病[HR(95%CI)=1.43(1.13,1.82)]、SUA[HR(95%CI)=1.72(1.26,2.33)]、24 h-UTP[HR(95%CI)=1.48(1.14,1.91)]、脾肾气虚兼湿聚血瘀证[HR(95%CI)=2.22(1.44,3.43)]与DKD发生终点事件的风险关系密切(P<0.05),服用中药[HR(95%CI)=2.57(2.00,3.31)]能够减少终点事件的发生(P<0.05)。结论年龄、DKD病程、吸烟史、饮酒史、脑血管病、糖尿病眼病、SUA、24 h-UTP、脾肾气虚兼湿聚血瘀证是影响DKD患者预后的危险因素,而服用中药治疗为其保护因素。

安徽省石台县日本血吸虫rDNA-ITS2和mtDNA-COX1遗传多态性研究

目的:研究安徽石台县日本血吸虫的核糖体DNA第二内转录间隔区(rDNA-ITS2)基因和线粒体细胞色素C氧化亚基1基因(mtDNA-COX1)的遗传变异。方法:收集两种不同来源的阳性钉螺(石台和南京),逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(20±2)尾蚴,35天后解剖小鼠,收集血吸虫成虫,PCR-RFLP扩增成虫的rDNA-ITS2和mtDNA-COX1基因,限制性核酸内切酶Taq I水解,观察结果;同时收集小鼠的肝脏和血液,HE染色观察肝脏肉芽肿的大小,ELISA检测小鼠血清中的谷丙转氨酶(ALT)。结果:石台组和南京组均获得500 bp的ITS2序列和1400 bp的mtDNA-COX1序列;两组的ITS2序列经Taq I酶切后,得到一样的片段;而mtDNA-COX1序列经Taq I酶切后,两组结果不同,石台组在1000 bp检测到1条清晰的条带,而南京组在此处无任何条带;两组小鼠的肝脏纤维化病理结果与谷氨酸转氨酶测定结果均无明显差异。结论:石台组和南京组的日本血吸虫虽然在致病性方面具有相似性,但在mtDNA-COX1基因序列存在差异,本研究为今后日本血吸虫的种群遗传结构研究提供科学依据。

基于Cox健康行为互动模式的护理措施在宫颈癌患者护理中的应用

目的探讨基于Cox健康行为互动模式的护理措施在宫颈癌患者护理中的应用效果。方法选择2022年3月至2023年3月新乡医学院第一附属医院收治的96例宫颈癌术后患者作为研究对象,按随机数表法将患者分为对照组和观察组各48例。对照组患者术后采用常规护理,观察组患者在对照组护理的基础上给予基于Cox健康行为互动模式的护理措施,两组患者均接受护理至出院,出院后均随访3周。护理结束后出院时,比较两组患者的术后恢复情况(手术切口愈合时间、留置导尿管时间、住院时间)以及护理前、护理后T淋巴细胞亚群中CD3^(+)、CD4^(+)、CD4^(+)/CD8^(+)水平;随访3周回院复查时,比较两组患者的生活质量量表(SF-36)评分;护理结束后出院时,比较两组患者对护理工作的满意度。结果观察组患者的手术切口愈合时间、住院时间、留置导尿管时间分别为(7.60±1.39)d、(1.50±0.24)周、(17.78±2.11)d,明显短于对照组的(10.55±1.51)d、(2.54±0.30)周、(20.10±2.32)d,差异均有统计学意义(P<0.05);观察组患者护理后的CD3^(+)、CD4^(+)及CD4^(+)/CD8^(+)水平分别为(70.64±11.67)%、(39.91±5.23)%、1.50±0.27,明显高于对照组的(66.25±11.32)%、(35.21±5.08)%、1.24±0.18,差异均有统计学意义(P<0.05);随访3周回院复查时,观察组患者的家庭生活、精神活力、社交能力、心理承受评分分别为(36.14±1.58)分、(36.02±1.57)分、(37.10±2.55)分、(36.26±2.31)分,明显高于对照组的(32.31±1.62)分、(30.15±1.63)分、(32.19±2.40)分、(33.11±2.14)分,差异均有统计学意义(P<0.05);观察组患者对护理工作的满意度为95.83%,明显高于对照组的83.33%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论基于Cox健康行为互动模式的护理措施在宫颈癌患者术后护理中的应用效果良好,能促进患者术后恢复,提高免疫功能和生活质量。

COX1基因多态性与血小板聚集功能在缺血性脑卒中复发患者中的交互作用

目的 探讨COX1基因多态性与血小板聚集功能的交互作用对缺血性脑卒中复发患者的影响。方法 选择2020年7月—2023年7月缺血性脑卒中复发患者70例为观察组,另选择同期体检的70例健康者为对照组。比较两组的一般资料并分析COX1基因多态性。检测并比较两组患者COX1基因多态性位点基因型及等位基因频率分布。比较观察组不同基因型血小板聚集率水平及与缺血性脑卒中复发易感性的关系及交互作用。结果 两组的血小板计数、COX1、血小板聚集率差异具有统计学意义(P<0.05)。两组COX1基因(rs1330344位点)CC基因频率、CT基因频率、TT基因频率及基因型C分布和基因型T分布差异具有统计学意义(P<0.05)。COX1(rs1330344位点)CC型基因携带者缺血性脑卒中复发的风险是未携带者的1.872倍。观察组COX1(rs1330344位点)基因型CC患者血小板聚集率>基因型CT患者>基因型TT患者(P<0.05),差异具有统计学意义。COX1(rs1330344位点)基因型与患者血小板聚集率显著相关。糖尿病史、高血压史、TG、HCY、COX1(rs1330344位点)基因型、血小板聚集率均为缺血性脑卒中复发的独立危险因素(P<0.05)。COX1(rs1330344位点)基因型CC与血小板聚集率在患者缺血性脑卒中复发易感性中呈正向交互作用(3.266<1.736×2.114,为次相乘模型)。结论 COX1(rs1330344位点)基因型CC和血小板聚集率在患者缺血性脑卒中复发易感性中呈正向交互作用且易感性显著增加,临床上可据此制定早期预防措施。

Cox健康行为互动模式对盆底功能障碍女性盆底康复的影响

女性盆底功能障碍(female pelvic floor dys function,FPFD)是盆底支持组织因损伤或衰老导致的以压力性尿失禁、盆腔脏器脱垂及性功能障碍等症状为主的疾病,由于症状部位隐私,患者羞耻感强,心理负担重,严重影响了患者社交活动、运动锻炼、性生活和日常生活质量[1].盆底肌肉康复训练是FPFD的主要治疗方式之一[2],其中Kegel训练是盆底肌肉康复训练的基础,但研究发现Kegel训练的依从性仅35%[3].因此,如何提高患者盆底肌肉训练的依从性显得非常重要.

基于NF-κB iNOS-COX-2信号通路探究瑞芬太尼对脑缺血再灌注损伤大鼠神经功能的作用机制

目的研究基于核转录因子(NF)-κB-一氧化氮合酶(iNOS)-环氧合酶(COX)-2信号通路探究瑞芬太尼对脑缺血再灌注损伤大鼠神经功能的作用机制。方法选取清洁及健康雄性大鼠32只,8只为空白组,剩余24只建立脑缺血再灌注损伤模型,分为模型组、低、高剂量瑞芬太尼组各8只。采用Longa 5级神经功能缺损评分,评估神经功能损伤评分;酶联免疫吸附试验检测iNOS;采用色谱柱检测脑组织单胺类神经递质含量甲肾上腺素(NE)、多巴胺(DA)、5-羟色胺(HT);采用Western印迹检测NF-κB、iNOS、COX-2。结果与模型组相比,低、高剂量瑞芬太尼组神经功能损伤明显降低,神经递质NE、DA含量明显降低,5-HT明显升高,NO水平明显降低,iNOS、COX-2、NF-κB蛋白表达明显降低(均P<0.05)。结论瑞芬太尼通过调控NF-κB-iNOS-COX-2信号通路蛋白水平,改善大鼠脑缺血再灌注损伤的神经功能。

苗药吉祥草含药血清对气道平滑肌细胞增殖及IL-1β/COX-2信号通路的作用机制

目的 探究苗药吉祥草血清对气道平滑肌细胞增殖及白细胞介素(IL)-1β/环氧合酶(COX)-2信号通路的作用机制。方法 制备苗药吉祥草含药血清,分离并鉴定气道平滑肌细胞,把细胞分为空白组、低剂量组、中剂量组和高剂量组。CCK-8检测细胞的增殖能力;流式细胞仪检测细胞的凋亡情况;酶联免疫吸附试验(ELISA)检测细胞培养上清液中IL-1β和COX-2的含量;Western印迹检测细胞中IL-1β和COX-2蛋白表达。结果 鉴定发现本实验所分离培养的细胞为ASMCs。与空白组相比,低剂量组、中剂量组和高剂量组细胞在48和72 h时ASMCs细胞增殖能力、IL-1β和COX-2明显降低,凋亡率显著增加,且呈剂量依赖性(P<0.05)。结论 苗药吉祥草血清可抑制气道平滑肌细胞增殖,促进其凋亡;对细胞中炎性因子IL-1β和COX-2表达也能进行有效的抑制。

COX6B2在胃癌组织中高表达并影响患者的远期预后:基于抑制p53信号调控胃癌细胞的增殖及细胞周期

目的分析COX6B2在胃癌组织中的表达对患者远期预后的影响及其作用机制。方法基于公共数据库、患者病历资料分析COX6B2在胃癌和癌旁组织中表达量及其对患者预后的影响;富集分析COX6B2在胃癌中可能发挥的作用;应用慢病毒转染技术干预COX6B2的表达;通过CCK-8、流式细胞术及免疫印迹实验验证其生物学功能。结果TCGA数据库、免疫组化、免疫印迹和荧光定量PCR检测显示,COX6B2在胃癌组织中高表达(P<0.05);Kaplan-Meier plotter数据库和K-M曲线显示,COX6B2高表达组生存期短(P<0.05);统计分析发现COX6B2在胃癌组织高表达与临床病理分期、CEA及CA19-9密切相关(P<0.05),COX6B2高表达、CEA≥5μg/L及CA19-9≥37 kU/L均是影响患者术后5年生存率的独立危险因素(P<0.05)且COX6B2表达量对患者远期预后有一定预判价值(P<0.05);GO及KEGG富集结果显示,COX6B2主要参与细胞周期的调控等;CCK-8和流式检测显示,上调COX6B2促进细胞增殖,通过增加G1/S期细胞比例调控细胞周期(P<0.05)。免疫印迹结果显示,COX6B2抑制胃癌细胞中p53和p21的表达(P<0.05)。结论COX6B2在胃癌组织中高表达且影响患者远期预后,其可能通过调控细胞周期而影响胃癌恶性增殖的过程。

Cox迷宫Ⅲ联合心脏瓣膜手术后急性肾损伤风险预测模型的构建与评价

目的:探讨Cox迷宫Ⅲ联合心脏瓣膜手术后发生急性肾损伤(AKI)的危险因素,建立AKI风险发生的列线图预测模型,并验证其效能。方法:回顾性分析2015年10月至2023年6月在东部战区总医院行Cox迷宫Ⅲ联合心脏瓣膜手术的160例合并心房颤动的心脏瓣膜病患者的临床资料。经单因素及多因素logistic回归分析明确术后发生AKI的独立危险因素,建立列线图预测模型,并通过受试者工作特征(ROC)曲线、校准曲线及决策曲线分析(DCA)验证其效能。结果:160例患者中,82例(51.3%)出现AKI,其中10例(6.3%)需行连续性肾脏替代治疗。多因素Logistic回归分析显示,年龄、糖尿病、术前1周使用造影剂、术前纽约心脏病协会(NYHA)心功能分级≥3级、围手术期血浆输注、术后乳酸峰值是Cox迷宫Ⅲ联合心脏瓣膜手术后发生AKI的独立危险因素。列线图预测模型的ROC曲线下面积(AUC)为0.847(95%CI:0.788~0.906),敏感度为70.73%,特异性为84.62%。校准曲线具有较高的拟合度,DCA提示该模型对临床决策具有重要意义。结论:Cox迷宫Ⅲ联合心脏瓣膜手术后AKI的发生率较高,高龄、合并糖尿病、术前1周使用造影剂、术前NYHA心功能分级≥3级、围手术期血浆输注、术后高乳酸血症的患者术后更易发生AKI。该研究构建的列线图预测模型预测能力良好,有助于术后AKI的早期预测及干预。

Cumulative effects of excess high-normal alanine aminotransferase levels in relation to new-onset metabolic dysfunction-associated fatty liver disease in China

BACKGROUND Within the normal range,elevated alanine aminotransferase(ALT)levels are associated with an increased risk of metabolic dysfunction-associated fatty liver disease(MAFLD).AIM To investigate the associations between repeated high-normal ALT measurements and the risk of new-onset MAFLD prospectively.METHODS A cohort of 3553 participants followed for four consecutive health examinations over 4 years was selected.The incidence rate,cumulative times,and equally and unequally weighted cumulative effects of excess high-normal ALT levels(ehALT)were measured.Cox proportional hazards regression was used to analyse the association between the cumulative effects of ehALT and the risk of new-onset MAFLD.RESULTS A total of 83.13%of participants with MAFLD had normal ALT levels.The incidence rate of MAFLD showed a linear increasing trend in the cumulative ehALT group.Compared with those in the low-normal ALT group,the multivariate adjusted hazard ratios of the equally and unequally weighted cumulative effects of ehALT were 1.651[95%confidence interval(CI):1.199-2.273]and 1.535(95%CI:1.119-2.106)in the third quartile and 1.616(95%CI:1.162-2.246)and 1.580(95%CI:1.155-2.162)in the fourth quartile,respectively.CONCLUSION Most participants with MAFLD had normal ALT levels.Long-term high-normal ALT levels were associated with a cumulative increased risk of new-onset MAFLD.

西藏中部地区散养牦牛和绵羊细粒棘球绦虫cox1和nad1的多态性

目的分析西藏中部地区散养牦牛和绵羊细粒棘球绦虫cox1、nad1的基因多态性。方法采集西藏中部地区45份散养牦牛和绵羊细粒棘球蚴包囊,提取包囊生发层DNA,根据细粒棘球蚴线粒体cox1、nad1基因序列设计扩增的引物序列,用PCR技术扩增线粒体cox1、nad1基因片段,将扩增产物做琼脂糖凝胶电泳并测序;利用MEGA11.0软件做cox1、nad1序列特征与同源性比对,并构建系统进化树;运用DnaSP 5.0软件计算序列单倍型数量(H),分析核苷酸多样性(Pi)、单倍体型多样性(Hd)特性;利用Network软件为cox1、nad1基因的所有单倍体构建单倍体网络图,判断西藏中部地区散养牦牛和绵羊的主要单倍型。结果(1)cox1、nad1序列长度分别为925、839bp。(2)在cox1序列中,A、T、G、C碱基的平均含量分别为32.6%、33.1%、17.4%、16.9%;而nad1序列中,A、T、G、C碱基的平均含量为19.5%、47.6%、25.5%、7.4%;同源性分析结果显示,cox1序列之间的同源性为99.6%~100.0%,nad1序列之间的同源性为98.1%~100.0%;西藏中部地区散养牦牛和绵羊细粒棘球绦虫基因型为G1、G3、G6。(3)cox1、nad1单倍型个数分别为19个、7个,Hd、Pi分别为0.89600、0.56000和0.36500、0.00060。(4)单倍型网络图显示,Hc-2、Hc-12、Hn-1为西藏中部地区散养牦牛和绵羊的主要单倍型。结论西藏中部地区散养牦牛和绵羊细粒棘球绦虫基因型为G1、G3、G6,G1是主要基因型。上述结论为探明西藏中部地区细粒棘球蚴的分型和病原体遗传演化的情况提供了参考依据。

基于线粒体cox1、nad1和rrn L基因探讨马圆线科线虫间的亲缘关系

为探讨马圆线科线虫(圆线亚科和盅口亚科)间的亲缘关系,对长伞杯冠线虫(Cylicostephanus longibursatum)、冠状冠环线虫(Coronocyclus coronatus)、细口杯环线虫(Cylicocyclus leptostomus)、拉氏杯口线虫(Poteriostomum ratzii)、麦氏副杯口线虫(Parapoteriostomum mettami)和无齿圆形线虫(Strongylus edentatus)6种线虫的线粒体cox1、nad1和rrnL基因进行扩增,与同科相关线虫进行比较分析。然后以线粒体cox1、nad1和rrnL串联序列为标记基因,采用贝叶斯法(Bayesian inference,BI)构建进化树来探讨圆线科线虫间的亲缘关系。结果显示,研究中6种线虫的cox1序列长度均为1578 bp,nad1的序列长度除无齿圆形线虫为879 bp外,其余均为873 bp,rrnL序列长度均不同,大小为959~980 bp。6种线虫的cox1、nad1和rrnL的AT含量分别为67.55%~69.71%、71.36%~73.83%和80.88%~82.59%。圆线科线虫间cox1、nad1和rrnL基因的相似性分别为83.4%~97.9%、79.0%~98.4%和78.8%~98.9%。值得注意的是,圆线亚科的三齿属线虫与盅口亚科的相似性总体要高于同亚科的圆线属。进化分析显示,三齿属并没有与同亚科的圆线属形成独立分支,而是与盅口亚科线虫聚集在一起。在盅口亚科分支中,并非每一属单独形成一独立分支,冠环属和杯冠属最为明显,为复系。基于马圆线虫线粒体cox1、nad1和rrnL的序列和进化分析表明,三齿属线虫与盅口亚科的关系较圆线亚科更近,支持三齿属应隶属于盅口亚科这一假说。

黑熊源蛔虫的分子鉴定及其线粒体pcox1、pnad5基因的系统发育分析

为鉴定黑熊源蛔虫的种类及分析其系统的发育特征,本实验对长沙生态动物园黑熊肠道内分离的6株蛔虫采用PCR扩增其线粒体部分cox1基因(pcox1)和部分nad5基因(pnad5)并测序,采用DNAStar 5.0软件分析这两种基因与GenBank中不同蛔虫相应基因序列的同源性;利用Dna SP 5.0软件分析pcox1和pnad5基因的单倍型数量、核苷酸多样性以及序列之间的核苷酸差异;并采用MEGA7软件构建二者的进化树分析黑熊源蛔虫的遗传进化关系。PCR结果显示,6株黑熊源蛔虫pcox1、pnad5基因分别为408 bp和528 bp,两种基因序列之间的同源性分别为99.30%~100%和99.20~100%,与Gen Bank中转移贝蛔虫相应基因序列的同源性分别为96.80%~99.80%和95.10%~95.30%。DnaSP 5.0软件分析结果显示,黑熊源蛔虫pcox1基因共检测到5个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.933±0.015和0.00675,核苷酸差异平均值为2.733;pnad5基因共检测到6个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为1.000±0.00926和0.00756,平均核苷酸差异为4.000。基于pcox1和pnad5基因构建的系统进化树显示,6株黑熊源蛔虫均与转移贝蛔虫聚为同一分支;与贝氏西蛔虫聚为一大支,与其他蛔虫遗传距离较远。上述结果表明6株黑熊源蛔虫均为转移贝蛔虫,且他们的遗传变异程度均较低,pcox1基因和pnad5基因均可作为转移贝蛔虫分类鉴定的分子标记。本研究首次对黑熊源蛔虫进行分子鉴定并分析其的遗传进化关系,为转移贝蛔虫的分类鉴定以及野生黑熊蛔虫病的防治提供参考。

基于随机森林生存模型的AMI患者PCI术后的不良事件风险分析

目的:综合分析经皮冠状动脉介入术(percutaneous coronary intervention,PCI)后的急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)患者预后影响因素,并构建预测模型和预后评分体系,为临床血管个性化治疗提供参考。方法:本研究回顾性收集从2018年1月至2022年6月所有在江西省南昌大学第二附属医院行PCI术的AMI患者,随访结局是术后首次发生主要心血管不良事件(major adverse cardiovascular events,MACE)。采用十倍交叉验证的Lasso回归确定纳入模型的变量,构建随机生存森林(random survival forest,RSF)模型和Cox比例风险模型,采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)下面积(area under curve,AUC)和校准曲线评估模型性能。根据RSF模型拟合结果绘制风险计算器。结果:研究最终共纳入3 880例AMI患者,其中术后1年内发生主要心血管不良事件473例(12.2%)。Lasso回归筛选出性别、急性心肌梗死类型、高血压等15个变量。多因素Cox回归结果显示,糖尿病、左室射血分数较低(30%~40%)、血管狭窄程度是术后MACE发生的影响因素。验证集中,RSF和Cox模型的AUC分别为0.774(95%CI=0.761~0.787)和0.597(95%CI=0.581~0.613)。绘制的校准曲线提示,该模型在预测1年MACE风险方面具有较高的准确性,构建的RSF评分最佳截断点(Score=133)也能准确区分MACE累计发病风险(P<0.001)。结论:构建的RSF模型及评分综合上述因素,能有效预测术后MACE发病风险并进行风险分层,帮助临床心血管医生制定个性化治疗方案。

基于线粒体COX1和ND1基因顺序的黄河上游大鼻吻鮈遗传多样性分析

为探究黄河上游大鼻吻鮈(Rhinogobio nasutus)群体遗传多样性和遗传分化现状,本研究以永宁、平罗、磴口3个不同地理群体145尾大鼻吻鮈为研究对象,利用线粒体DNA COX1和ND1基因序列进行了遗传多样性分析。结果显示:COX1和ND1基因序列长度分别为1 466 bp、975 bp, A+T含量(57.25%,56.81%)均高于G+C(42.75%,43.19%)含量,具有明显的碱基组成偏向性;3个群体145尾样本中分别界定了11个和9个单倍型,均存在共享单倍型现象。在COX1和ND1基因序列中3个群体的平均单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(π)及平均核苷酸差异(K)分别为0.745 3、0.001 3、1.841和0.364、0.000 48、0.472,3个群体遗传多样性呈现出磴口群体最高、平罗群体次之、永宁群体最小的特征。基于COX1和ND1的遗传变异分析(AMOVA),表明3个群体中遗传变异均主要来自群体内,且COX1基因序列中磴口群体与永宁群体之间存在显著性明显的遗传分化。基于线粒体COX1和ND1基因单倍型序列,采用邻近法(Neighbor Joining, NJ)构建系统进化树与单倍型网络结过具有一致性,表明3个群体之间无明显的谱系分化,结构比较单一,未发现形成单独分支的群体。中性检验结果显示,大鼻吻鮈进化历程符合中性进化假设,且可能存在群体扩张。因此,为了有效地保护大鼻吻鮈野生资源,建议将大鼻吻鮈从整体上进行就地保护。