期刊文献+
共找到508篇文章
< 1 2 26 >
每页显示 20 50 100
利用CRISPR-Cas9基因编辑技术敲除HOXA5基因对急性髓系白血病细胞增殖的影响 被引量:1
1
作者 满建呈 成娟 赵丽 《中国实验血液学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第1期52-56,共5页
目的:通过CRISPR-Cas9基因编辑技术构建稳定敲除HOXA5基因的急性髓系白血病(AML)细胞株,明确HOXA5基因敲除对AML细胞增殖的影响,初步探索HOXA5基因在AML发病中的作用。方法:通过荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western blot技术分别检测血液系... 目的:通过CRISPR-Cas9基因编辑技术构建稳定敲除HOXA5基因的急性髓系白血病(AML)细胞株,明确HOXA5基因敲除对AML细胞增殖的影响,初步探索HOXA5基因在AML发病中的作用。方法:通过荧光定量PCR(qRT-PCR)和Western blot技术分别检测血液系统非肿瘤患者与初诊AML患者骨髓单个核细胞(BMMC)中HOXA5的表达;应用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建稳定敲除HOXA5基因的AML细胞株KO-HOXA5-THP-1,通过qRT-PCR和Western blot检测KO-HOXA5-THP-1细胞中HOXA5的表达,并采用CCK-8实验检测细胞增殖情况。结果:与血液系统非肿瘤患者相比,初诊AML患者骨髓单个核细胞中HOXA5基因及蛋白水平均显著升高(P<0.05)。应用CRISPR-Cas9基因编辑技术能够获得稳定敲除HOXA5基因的细胞株,而且敲除HOXA5基因后的THP-1细胞株的增殖能力显著下降(P<0.05)。结论:HOXA5在AML细胞中高表达,敲除HOXA5能够显著影响AML细胞的增殖能力,这为急性髓系白血病的精准治疗提供了一个新的潜在治疗靶点。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 HOXA5基因 crispr-cas9
下载PDF
CRISPR-Cas系统在病原核酸检测中的研究进展
2
作者 杜瑶 高宏丹 +4 位作者 刘家坤 刘孝荣 邢志浩 张涛 马东礼 《合成生物学》 CSCD 北大核心 2024年第1期202-216,共15页
CRISPR-Cas系统作为原核生物获得性免疫系统,由簇状规则间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)和CRISPR相关蛋白(CRISPR-associated proteins,Cas)构成,因其识别和切割特定DNA或RNA序... CRISPR-Cas系统作为原核生物获得性免疫系统,由簇状规则间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)和CRISPR相关蛋白(CRISPR-associated proteins,Cas)构成,因其识别和切割特定DNA或RNA序列,而成为分子诊断领域研究的热点。研究人员利用Cas蛋白(Cas12、Cas13、Cas14、Cas3等)结合信号放大和转化技术(荧光法、电位法、比色法、侧向流动技术等),开发了许多高灵敏度、高特异性、低成本的诊断平台,为病原核酸检测提供了新途径。本文介绍了CRISPR-Cas系统的生物学机制及分类,总结现有的基于Cas蛋白反式切割活性开发的病原核酸检测技术,描述其特点、功能和应用场景,并对该系统的未来应用前景进行展望,期望CRISPR-Cas系统成为包括核酸检测在内的多靶标的理想检测平台。 展开更多
关键词 crispr-cas系统 Cas12和Cas13 病原体 核酸检测 生物传感
下载PDF
小白链霉菌中CRISPR-Cas9基因敲除系统的构建与优化
3
作者 开朗 杨昊 +1 位作者 朱道君 陈旭升 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第14期10-17,共8页
小白链霉菌(Streptomyces albulus)是工业上生产ε-聚赖氨酸的主要菌株。为提高S.albulus的ε-聚赖氨酸合成能力,基于诱变和抗性筛选的传统育种方法被普遍应用。然而,由于传统育种存在“疲劳效应”,当前S.albulus的育种陷入了瓶颈。为... 小白链霉菌(Streptomyces albulus)是工业上生产ε-聚赖氨酸的主要菌株。为提高S.albulus的ε-聚赖氨酸合成能力,基于诱变和抗性筛选的传统育种方法被普遍应用。然而,由于传统育种存在“疲劳效应”,当前S.albulus的育种陷入了瓶颈。为利用代谢工程方法进一步提高S.albulus的ε-聚赖氨酸合成能力,亟需建立基于CRISPR-Cas9的基因编辑方法。为此,该文以S.albulus GS114为研究对象,以ε-聚赖氨酸合成酶基因pls为靶基因,构建了CRISPR-Cas9基因敲除系统,成功敲除了pls,编辑效率为100%。为进一步提高获得的敲除株数量,对S.albulus GS114结合转移条件进行了系统优化,获得的最优结合转移条件为:供受体比例1∶1,镁离子浓度30 mmol/L,55℃热激孢子10 min,培养20 h后覆盖抗生素。在最优转移条件下,结合转移效率达到2.5×10^(-8),较优化前提高了78%。该研究结果一方面为后续S.albulus的代谢工程改造提供了重要工具,另一方面为其他工业链霉菌构建CRISPR-Cas系统提供了重要参考。 展开更多
关键词 放线菌 小白链霉菌 crispr-cas9系统 基因敲除
下载PDF
基于CRISPR-Cas9系统构建LEU1基因缺失酿酒酵母用于酿造低醉酒度米酒
4
作者 王泽翔 何娇娇 +1 位作者 梁思宇 周世水 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第4期62-67,共6页
为探究酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)异丙基苹果酸合成酶基因LEU1的缺失对酿造米酒生成高级醇的影响,该研究构建重组质粒p414-Cas9-BleoR和p426-gRNA.LEU1-kanMX后电转化酿酒酵母XF0,利用成簇规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋... 为探究酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)异丙基苹果酸合成酶基因LEU1的缺失对酿造米酒生成高级醇的影响,该研究构建重组质粒p414-Cas9-BleoR和p426-gRNA.LEU1-kanMX后电转化酿酒酵母XF0,利用成簇规则间隔的短回文重复序列及其相关蛋白9(CRISPR-Cas9)系统构建LEU1基因缺失的酿酒酵母XF0-L。将出发菌株XF0和重组菌株XF0-L进行培养基模拟发酵和米酒发酵,测定发酵酒的理化指标和高级醇含量。结果表明,菌株XF0-L与XF0模拟发酵酒的理化指标无显著差异(P>0.05),说明LEU1基因的缺失对酿酒酵母发酵性能无影响。相较于出发菌株XF0,重组菌株XF0-L模拟发酵酒中正丙醇(26.27 mg/L)和异丁醇含量(88.64 mg/L)分别提高21.96%和85.25%,异戊醇含量(141.82 mg/L)、异戊醇/正丙醇(5.39)、异戊醇/异丁醇(1.60)分别降低15.53%、30.99%、54.42%;相较于出发菌株XF0,重组菌株XF0-L发酵米酒中正丙醇(268.67 mg/L)和异丁醇含量(992.33 mg/L)分别提高14.17%、52.90%,异戊醇含量(1016.33 mg/L)、异戊醇/正丙醇(3.78)、异戊醇/异丁醇(1.02)分别降低13.58%、24.40%、43.65%,说明重组菌株XF0-L能够显著降低发酵酒中的异戊醇/正丙醇、异戊醇/异丁醇从而降低醉酒度(P<0.05)。 展开更多
关键词 酿酒酵母 crispr-cas9 LEU1基因 高级醇 低醉酒度米酒
下载PDF
基于CRISPR-Cas系统的分子诊断应用研究进展
5
作者 黄佳 房师松 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第6期989-992,1001,共5页
CRISPR-Cas系统是细菌抵御噬菌体入侵的适应性免疫系统,按照其效应蛋白的不同分为两大类。其在特异性识别切割目标序列的基础上,还附带有切割周围单链DNA和RNA分子的反式切割特性,这种特异的识别机制为分子诊断带来了新机会,本文简单介... CRISPR-Cas系统是细菌抵御噬菌体入侵的适应性免疫系统,按照其效应蛋白的不同分为两大类。其在特异性识别切割目标序列的基础上,还附带有切割周围单链DNA和RNA分子的反式切割特性,这种特异的识别机制为分子诊断带来了新机会,本文简单介绍了CRISPR-Cas的机制和类型,重点关注已经用于分子诊断的CRISPR-Cas系统,列举了其应用和相关研究进展。 展开更多
关键词 crispr-cas Cas蛋白 分子诊断
下载PDF
Generation of double knockout cattle via CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein(RNP)electroporation
6
作者 Gyeong-Min Gim Kyeong-Hyeon Eom +10 位作者 Dong-Hyeok Kwon Dae-Jin Jung Dae-Hyun Kim Jun-Koo Yi Jae-Jung Ha Ji-Hyun Lee Seong-Beom Lee Woo-Jae Son Soo-Young Yum Won-Wu Lee Goo Jang 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2024年第1期456-462,共7页
Background Genome editing has been considered as powerful tool in agricultural fields.However,genome editing progress in cattle has not been fast as in other mammal species,for some disadvantages including long gestat... Background Genome editing has been considered as powerful tool in agricultural fields.However,genome editing progress in cattle has not been fast as in other mammal species,for some disadvantages including long gestational periods,single pregnancy,and high raising cost.Furthermore,technically demanding methods such as microinjection and somatic cell nuclear transfer(SCNT)are needed for gene editing in cattle.In this point of view,electroporation in embryos has been risen as an alternative.Results First,editing efficiency of our electroporation methods were tested for embryos.Presence of mutation on embryo was confirmed by T7E1 assay.With first combination,mutation rates for MSTN and PRNP were 57.6%±13.7%and 54.6%±13.5%,respectively.In case of MSTN/BLG,mutation rates were 83.9%±23.6%for MSTN,84.5%±18.0%for BLG.Afterwards,the double-KO embryos were transferred to surrogates and mutation rate was identified in resultant calves by targeted deep sequencing.Thirteen recipients were transferred for MSTN/PRNP,4 calves were delivered,and one calf underwent an induction for double KO.Ten surrogates were given double-KO embryos for MSTN/BLG,and four of the six calves that were born had mutations in both genes.Conclusions These data demonstrated that production of genome edited cattle via electroporation of RNP could be effectively applied.Finally,MSTN and PRNP from beef cattle and MSTN and BLG from dairy cattle have been born and they will be valuable resources for future precision breeding. 展开更多
关键词 BETA-LACTOGLOBULIN CATTLE crispr-cas9 ELECTROPORATION KNOCKOUT MSTN PRNP
下载PDF
CRISPR-Cas9基因编辑技术及其在家禽中的研究进展
7
作者 肖怡梦 杨雯 +1 位作者 程依依 罗刚 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期38-47,共10页
CRISPR-Cas系统是细菌或古细菌内抵御病毒再次入侵的一种适应性免疫系统,能够对靶向核酸进行切割。基于Cas9蛋白及其突变体的特性,科学家开发出多样化的基因编辑工具,能够对细胞内的基因进行敲除或敲入等基因编辑操作,实现生物的遗传变... CRISPR-Cas系统是细菌或古细菌内抵御病毒再次入侵的一种适应性免疫系统,能够对靶向核酸进行切割。基于Cas9蛋白及其突变体的特性,科学家开发出多样化的基因编辑工具,能够对细胞内的基因进行敲除或敲入等基因编辑操作,实现生物的遗传变异;或对DNA或RNA进行表观修饰,调控基因的表达,已广泛地应用于生命科学的研究。禽类是农业中的重要物种,为人类提供优质的蛋白质。在禽类的基因组编辑和修饰中,CRISPR-Cas9技术仍处于研究状态,且只在鸡和鹌鹑两种家禽上取得实质性进展。本文从CRISPR-Cas9系统的组成成分、传递方法、优化策略介绍了CRISPR-Cas9基因编辑技术及其在家禽生产和疾病防控中的应用,为进一步开发适用于家禽体系的CRISPR-Cas9提供理论基础。 展开更多
关键词 家禽 crispr-cas9 育种 诊断
下载PDF
利用CRISPR-Cas系统研究食源性致病菌的基因编辑与调控
8
作者 张昕哲 甄珍 《科技通报》 2024年第5期27-33,共7页
本文基于CRISPR-Cas系统,构建了食源性致病菌基因检测模型。利用基因编码测度技术对Cas蛋白基因中的向导RNA序列进行识别,提取其中的主要基因特征并进行分类。在此基础上,分别使用基因表达与分子诊断技术,根据序列特征,对基因表达数据... 本文基于CRISPR-Cas系统,构建了食源性致病菌基因检测模型。利用基因编码测度技术对Cas蛋白基因中的向导RNA序列进行识别,提取其中的主要基因特征并进行分类。在此基础上,分别使用基因表达与分子诊断技术,根据序列特征,对基因表达数据的差异性与菌属分布概率进行分析。结果表明:通过设计特异性识别的向导RNA和基因差异表达的分析,实现对目标基因和致病菌的检测。这种方法为食源性致病菌的基因检测提供了一种精确、可靠且高效的工具。 展开更多
关键词 crispr-cas系统 食源性致病菌 基因编辑
下载PDF
CRISPR-Cas技术在医疗领域的应用研究
9
作者 许灏 《中国科技期刊数据库 医药》 2024年第7期0030-0033,共4页
CRISPR-Cas技术作为一种有效的基因编辑手段,在医疗领域具有很大的潜力。它可以通过直接影响相关基因的表达,调控细胞生命活动,为一些目前缺乏有效治疗手段的疾病提供了全新的治疗思路。然而,CRISPR-Cas技术也存在潜在风险和局限性,逐... CRISPR-Cas技术作为一种有效的基因编辑手段,在医疗领域具有很大的潜力。它可以通过直接影响相关基因的表达,调控细胞生命活动,为一些目前缺乏有效治疗手段的疾病提供了全新的治疗思路。然而,CRISPR-Cas技术也存在潜在风险和局限性,逐渐成为其临床应用不可忽视的问题。本篇综述将主要介绍CRISPR-Cas技术在医疗领域上作用机理和应用前景,同时评估其局限性和可行的解决方案。 展开更多
关键词 crispr-cas 基因编辑 疾病治疗
下载PDF
CRISPR-Cas13a检测在肺结核诊断中的价值 被引量:1
10
作者 张治国 尚媛媛 +5 位作者 张旭霞 刘荣梅 马丽萍 秦林 孔忠顺 任卫聪 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 2023年第6期589-593,共5页
目的:评价应用CRISPR-Cas13a检测临床样本对肺结核的诊断价值。方法:采用回顾性研究方法,收集首都医科大学附属北京胸科医院2022年9月至2022年12月收治住院的102例经GeneXpert MTB/RIF检测(简称“Xpert检测”)确诊的肺结核患者的支气管... 目的:评价应用CRISPR-Cas13a检测临床样本对肺结核的诊断价值。方法:采用回顾性研究方法,收集首都医科大学附属北京胸科医院2022年9月至2022年12月收治住院的102例经GeneXpert MTB/RIF检测(简称“Xpert检测”)确诊的肺结核患者的支气管肺泡灌洗液标本,作为结核病组;收集同期收治入院的100例非结核病患者(包括肺癌,细菌性肺炎,支气管扩张,慢性阻塞性肺疾病)的支气管肺泡灌洗液标本,作为非结核病组。所有患者的支气管肺泡灌洗液标本均进行涂片抗酸杆菌染色镜检、培养、Xpert检测及CRISPR-Cas13a检测。以Xpert检测结果为参照,评价CRISPR-Cas13a检测支气管肺泡灌洗液对肺结核的诊断价值。结果:结核病组102份标本中,CRISPR-Cas13a检测阳性为99份(97.1%),涂片阳性40份(39.2%),培养阳性68份(66.7%)。CRISPR-Cas13a检测阳性率明显高于涂片和培养法,差异有统计学意义(涂片:χ^(2)=58.141,P<0.001;培养:χ^(2)=30.250,P<0.001)。与传统检测方法相比,CRISPR-Cas13a比涂片和培养法多检测出28份标本。Xpert检测结核病组阳性率为100.0%;Xpert检测非结核病组阴性率为100.0%。以Xpert检测结果作为参照,CRISPR-Cas13a检测肺结核的敏感度为97.1%(99/102)、特异度为96.0%(96/100),准确度为96.5%(195/202),阳性预测值为96.1%(99/103),阴性预测值为97.0%(96/99)。结论:CRISPR-Cas13a检测与传统方法相比简单、快捷,检测支气管肺泡灌洗液对肺结核的诊断具有较高敏感度及特异度,具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 重复序列 核酸 结核 支气管肺泡灌洗液 crispr-cas系统
下载PDF
T7E1检测CRISPR-Cas9基因编辑效果实验设计
11
作者 王宏刚 魏远 +1 位作者 李艳君 朱玉山 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2023年第5期38-41,共4页
CRISPR-Cas9是一种现代生命科学研究中普遍使用的新型基因编辑技术。为了升级课程内容体系,使实验教学贴近科研实际,提升实验课程教学质量,设计了T7核酸内切酶1(T7E1)检测CRISPR-Cas9基因编辑效果实验。以CRISPR-Cas9基因编辑技术对mfn... CRISPR-Cas9是一种现代生命科学研究中普遍使用的新型基因编辑技术。为了升级课程内容体系,使实验教学贴近科研实际,提升实验课程教学质量,设计了T7核酸内切酶1(T7E1)检测CRISPR-Cas9基因编辑效果实验。以CRISPR-Cas9基因编辑技术对mfn1编辑过的HeLa细胞为实验材料,提取基因组DNA,PCR扩增mfn1基因片段,切胶回收后,变性,退火,使用T7E1对编辑效果进行检测。经1%琼脂糖凝胶电泳,可观察到T7E1将略大于500 bp的mfn1基因片段切成两条大小约为250 bp的DNA片段,表明CRISPR-Cas9成功地对mfn1进行了编辑。 展开更多
关键词 T7核酸内切酶1 crispr-cas9 实验教学 科研反哺教学
下载PDF
基因编辑工具CRISPR-Cas9与CRISPR-Cas12a的比较与应用
12
作者 王炀坤 纪世新 +2 位作者 苏莹莹 孙英旗 宋相伟 《长春师范大学学报》 2023年第12期107-112,共6页
基因编辑技术的突飞猛进,使得生物体的遗传与改造技术具有空前的深度与广度。基因编辑技术中的CRISPR-Cas系统由于其在检测、诊断方面的高灵活性、敏感性和特异性而为人们所熟知。CRISPR-Cas系统中的Class2是由单个多域蛋白组成的效应模... 基因编辑技术的突飞猛进,使得生物体的遗传与改造技术具有空前的深度与广度。基因编辑技术中的CRISPR-Cas系统由于其在检测、诊断方面的高灵活性、敏感性和特异性而为人们所熟知。CRISPR-Cas系统中的Class2是由单个多域蛋白组成的效应模块,Class2中的CRISPR-Cas9和CRISPR-Cas12a是广泛应用的基因编辑工具。对CRISPR-Cas9和CRISPR-Cas12a的作用机制和应用领域进行比较,以便更好应用该项技术。 展开更多
关键词 crispr-cas9 crispr-cas12a 作用机制
下载PDF
CRISPR-Cas技术在病原体核酸检测中的研究进展 被引量:1
13
作者 张咪咪(综述) 刘家云(审校) 《国际检验医学杂志》 CAS 2023年第10期1259-1265,共7页
规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)及其相关蛋白(Cas)简称CRISPR-Cas,是原核生物的一种适应性免疫系统,因其强大的基因编辑功能及核酸切割活性成为近年来的研究热点。感染性疾病的传统检测方法虽然特异度高,但存在灵敏度不够高、操... 规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)及其相关蛋白(Cas)简称CRISPR-Cas,是原核生物的一种适应性免疫系统,因其强大的基因编辑功能及核酸切割活性成为近年来的研究热点。感染性疾病的传统检测方法虽然特异度高,但存在灵敏度不够高、操作复杂、检测周期长等不足。随着CRISPR-Cas系统的发现及深入研究,目前依赖特异性识别靶标后所激发的Cas蛋白“附带切割”活性,已经开发出多项基于CRISPR-Cas的核酸检测方法,它们高效、简便、快速的优点弥补了传统诊断方法的不足。该文对CRISPR-Cas技术及其在感染性疾病核酸检测中的现状进行综述,旨在为开发更多基于CRISPR-Cas技术的检测新方法提供新思路。 展开更多
关键词 crispr-cas系统 Cas蛋白 附带切割 感染性疾病 核酸检测
下载PDF
基于RPA/CRISPR-Cas12a技术的单核细胞增生李斯特菌快速检测方法建立
14
作者 陈大伟 李兵兵 +3 位作者 魏明月 李双姝 杨鹏飞 刘靓 《肉类研究》 2023年第9期46-51,共6页
建立基于RPA/CRISPR-Cas12a技术单核细胞增生李斯特菌的快速检测方法。选取单增李斯特菌溶菌素毒力基因hly(GeneID:987033),设计重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)引物结合CRISPR-Cas12a蛋白研制两步法单增... 建立基于RPA/CRISPR-Cas12a技术单核细胞增生李斯特菌的快速检测方法。选取单增李斯特菌溶菌素毒力基因hly(GeneID:987033),设计重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)引物结合CRISPR-Cas12a蛋白研制两步法单增李斯特菌快速检测试剂盒,并对其灵敏度、特异性以及反应速率进行分析。结果表明:该法检测速率快,30 min内可检出单核细胞增生李斯特菌,同时具有较高的灵敏度,20μL体系可检测到最低0.0015 ng靶标核酸。将该试剂盒进一步用于检测人工模拟污染食品三文鱼肉片,检测限可达10 CFU/mL。本方法检测30份实际样本,结果均与荧光定量聚合酶链式反应法阳性检出率一致。RPA/CRISPR-Cas12a技术是快速检测食源性单增李斯特菌的可行方法。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 重组酶聚合酶扩增 crispr-cas12a 快速检测
下载PDF
Crispr-Cas12a在成人弥漫性胶质瘤异柠檬酸脱氢酶2基因突变检测中的应用
15
作者 冯哲斌 张宇 +4 位作者 孔东生 武其嘉 王俊祥 余新光 冯世宇 《中国临床神经外科杂志》 2023年第8期517-521,共5页
目的探讨Crispr-Cas12a方法对成人弥漫性胶质瘤异柠檬酸脱氢酶2(IDH2)基因R172K单核苷酸多态性的检测效能。方法选择2019年1月至2022年9月手术切除的初治成人弥漫性胶质瘤组织样本112例,利用Crispr-Cas12a方法和直接测序法检测样本IDH2-... 目的探讨Crispr-Cas12a方法对成人弥漫性胶质瘤异柠檬酸脱氢酶2(IDH2)基因R172K单核苷酸多态性的检测效能。方法选择2019年1月至2022年9月手术切除的初治成人弥漫性胶质瘤组织样本112例,利用Crispr-Cas12a方法和直接测序法检测样本IDH2-R172K位点突变情况,以直接测序法为金标准。结果112例中,9例IDH2-R172K突变型,103例IDH2-R172K野生型。ROC曲线分析显示,曲线下面积为0.967,约登指数为0.892,最佳截断值为590。以590作为IDH2-R172K突变型和野生型样本的阈值,Crispr-Cas12a法的灵敏性为96.3%(95%CI 81.7%~99.3%),特异性为92.9%(95%CI 89.5%~95.3%)。Crispr-Cas12a法与直接测序法一致性检验Kappa值为0.658,一致性较好。结论Crispr-Cas12a方法能快速、准确地检测成人弥漫性胶质瘤组织样IDH2-R172K突变情况,可作为术中快速检测IDH2-R172K突变的方法。 展开更多
关键词 成人弥漫性胶质瘤 异柠檬酸脱氢酶2 基因突变 crispr-cas12a 基因直接测序
下载PDF
利用CRISPR-Cas9技术编辑Badh2基因创制优质香型籼稻三系不育系 被引量:2
16
作者 韦新宇 曾跃辉 +5 位作者 杨旺兴 肖长春 候新坡 黄建鸿 邹文广 许旭明 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期2144-2159,共16页
稻米香味是水稻的重要食味品质之一,其主要受第8染色体上编码甜菜碱脱氢酶基因Badh2控制,该基因突变可导致香味物质2-乙酰-1-吡咯啉(2-AP)的含量增加从而促进香味的产生。本研究以三明市农业科学研究院自主选育的优质籼型杂交稻保持系明... 稻米香味是水稻的重要食味品质之一,其主要受第8染色体上编码甜菜碱脱氢酶基因Badh2控制,该基因突变可导致香味物质2-乙酰-1-吡咯啉(2-AP)的含量增加从而促进香味的产生。本研究以三明市农业科学研究院自主选育的优质籼型杂交稻保持系明太B为受体,利用CRISPR-Cas9技术对其Badh2基因进行编辑和敲除。获得2个T0代转基因纯合突变体植株并对其衍生的48个T1代单株进行鉴定和分析,获得1个不含转基因载体骨架且在第2外显子插入单个碱基T的纯合突变体株系明太B-badh2。利用半定量PCR和qRT-PCR技术以及气相色谱质谱联用仪(GC-MS)检测Badh2基因相对表达量和2-AP含量;同时采用农业行业标准(NY/T1433-2014)推荐的48对水稻SSR引物进行指纹图谱分析。结果表明,该株系Badh2基因RNA表达水平显著下调;籽粒中香味物质2-AP的含量显著增加;指纹图谱分析发现,仅1对引物Rm571在野生型和突变体之间鉴定到等位变异,两组材料遗传差异较小。此外,本研究还对野生型和突变体T2代植株表型性状、稻米蒸煮食味品质和外观品质指标进行了考察和测定分析。结果表明,所有指标在两组材料间均无显著差异。进一步采用测交和回交转育方法并结合Badh2位点测序分析,成功选育获得了其对应的纯合香型三系不育系明太A-badh2。通过与恢复系明恢703、明恢3009测配,其组合产量与国家审定品种明太优703、明太优3009相近且表现出较强的超标优势。此外,通过与香型恢复系明恢1831测配后发现其组合籽粒中香味物质2-AP含量极显著高于对照组合明太A/明恢1831。因此,利用CRISPR-Cas9基因编辑技术,可对水稻香味基因Badh2进行精准定向编辑和敲除,实现对水稻香味性状的改良,为创制香型籼稻不育系提供理论指导,从而加快香型杂交稻育种进程。 展开更多
关键词 水稻 crispr-cas9 基因编辑 香味 Badh2 2-乙酰-1-吡咯啉(2-AP)
下载PDF
基于小分子化学反应工具构建CRISPR-Cas9功能调控体系的研究进展
17
作者 孔好 徐菲洋 +1 位作者 王依香 张艳 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2023年第3期109-118,共10页
CRISPR技术是目前基因编辑领域的一大研究热点,已在疾病治疗、作物改良等领域得到广泛的应用,CRISPR-Cas9系统是其中研究最为深入的一种类型.如何降低Cas9/sgRNA复合物在细胞内作用的脱靶性是CRISPR-Cas9技术发展面临的主要挑战之一.利... CRISPR技术是目前基因编辑领域的一大研究热点,已在疾病治疗、作物改良等领域得到广泛的应用,CRISPR-Cas9系统是其中研究最为深入的一种类型.如何降低Cas9/sgRNA复合物在细胞内作用的脱靶性是CRISPR-Cas9技术发展面临的主要挑战之一.利用光或活性小分子诱发的小分子化学反应工具构建CRISPRCas9功能调控体系,通过对sgRNA,Cas9或Cas9/sgRNA复合物的功能进行调控,可以在细胞乃至活体水平上一定程度实现对CRISPR-Cas9作用的时间或空间特异性的操纵,大大降低非特异性基因编辑作用发生的概率,同时小分子对原体系的干扰较小,因此小分子化学反应逐渐成为操纵CRISPR-Cas9体系的一种重要的研究工具.本文总结和介绍了小分子反应工具用于CRISPR-Cas9功能调控系统构建的主要研究进展,并对其未来的发展进行了展望. 展开更多
关键词 基因编辑 crispr-cas9 脱靶作用 小分子化学反应 功能调控体系
下载PDF
CRISPR-Cas9基因编辑技术对细胞内源蛋白进行荧光标记的实验操作 被引量:1
18
作者 吴仲胜 高誉 +2 位作者 杜勇涛 党颂 何康敏 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期165-175,共11页
CRISPR-Cas9是目前广泛应用的基因编辑技术,可对目的基因进行高效精准编辑,快速实现目的基因的敲除或敲入。Cas9蛋白在sgRNA引导下对靶序列进行剪切并造成DNA双链断裂,在与剪切位点两端同源的DNA模板序列存在时,可通过同源重组修复方式... CRISPR-Cas9是目前广泛应用的基因编辑技术,可对目的基因进行高效精准编辑,快速实现目的基因的敲除或敲入。Cas9蛋白在sgRNA引导下对靶序列进行剪切并造成DNA双链断裂,在与剪切位点两端同源的DNA模板序列存在时,可通过同源重组修复方式引入外源序列,实现荧光蛋白或其他标签在基因组上的精准敲入,进而实现对内源蛋白进行荧光标签的融合标记。通过基因编辑技术对内源目的蛋白进行标记,可避免由于过表达造成蛋白质定位、动力学或功能等的潜在影响,可显著提升细胞成像实验的稳定性和可重复性。本文重点介绍了利用CRISPR-Cas9基因编辑系统对目的蛋白进行荧光蛋白或自标记蛋白标签标记的方法与操作流程,为构建内源蛋白荧光标记的哺乳动物细胞系提供参考。 展开更多
关键词 crispr-cas9基因编辑 活细胞 内源蛋白 荧光蛋白 自标记蛋白标签
下载PDF
基于CRISPR-Cas9技术构建TET2基因敲除的鸡胚成纤维细胞系
19
作者 王强州 潘诗雨 +4 位作者 方梦雅 李微 王佳兴 刘茵茵 陈世豪 《中国农业科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期227-233,共7页
为研究甲基胞嘧啶双加氧酶2(tet methylcytosine dioxygenase 2,TET2)及其介导的羟甲基化修饰在调控天然免疫反应中的作用,利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建TET2基因敲除的鸡胚成纤维细胞系。针对鸡TET2 mRNA的2种剪接变体的共有CDS序... 为研究甲基胞嘧啶双加氧酶2(tet methylcytosine dioxygenase 2,TET2)及其介导的羟甲基化修饰在调控天然免疫反应中的作用,利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建TET2基因敲除的鸡胚成纤维细胞系。针对鸡TET2 mRNA的2种剪接变体的共有CDS序列设计4组sgRNA,构建sgRNA表达质粒,连同Cas9-T2A-GFP质粒共转染DF-1细胞,筛选高切割效率的sgRNA;将转染该sgRNA的DF-1细胞,进行流式细胞分选,获取表达绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)的细胞,再通过有限稀释法筛选单克隆细胞,并用DNA测序进行鉴定。单克隆敲除细胞扩大培养后,Western blot和Dot blot检测TET2蛋白的表达水平和羟甲基化(5hmC)水平。DNA测序结果表明,TET2-gRNA-2靶位点附近分别发生2和28 bp的缺失突变,引起TET2蛋白移码突变,将该细胞株命名为DT-6。DT-6细胞传代15次以上,细胞形态稳定。Western blot结果显示,与DF-1细胞相比,DT-6细胞几乎不表达TET2蛋白。Dot blot结果显示,与DF-1细胞相比,DT-6细胞全基因组羟甲基化水平显著降低。利用CRISPR-Cas9技术成功构建了敲除TET2基因的鸡胚成纤维细胞系,为研究鸡TET2及其介导羟甲基化修饰参与调控天然免疫反应的途径和分子机制奠定基础。 展开更多
关键词 TET2 crispr-cas9 TET2基因敲除 鸡胚成纤维细胞
下载PDF
CRISPR-Cas基因编辑技术在微生物组工程中的应用 被引量:1
20
作者 胡玉灿 曹朝辉 +3 位作者 郑灵刚 沈俊涛 赵维 戴磊 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2023年第3期57-69,共13页
微生物组工程是对复杂微生物群落进行改造,在基因组、代谢组及群落生态结构等多个层次上实现微生物组的精准调控.成簇规律间隔短回文序列(CRISPR)及其相关蛋白(CRISPR-Cas)系统是近期发展迅速的高效基因编辑工具.本文回顾了微生物组工... 微生物组工程是对复杂微生物群落进行改造,在基因组、代谢组及群落生态结构等多个层次上实现微生物组的精准调控.成簇规律间隔短回文序列(CRISPR)及其相关蛋白(CRISPR-Cas)系统是近期发展迅速的高效基因编辑工具.本文回顾了微生物组工程领域CRISPR-Cas系统的重要研究工作,重点关注CRISPR-Cas系统在微生物组的基因编辑和生态调控方面的应用.针对CRISPR-Cas系统在微生物组工程领域的应用挑战,本文从外源DNA递送方式和基因表达调控元件两个方面总结了微生物组工程的关键辅助方法与发展趋势,展望了微生物组工程领域所面临的挑战与机遇. 展开更多
关键词 成簇规律间隔短回文序列(CRISPR)及其相关蛋白(crispr-cas)系统 微生物组工程 基因编辑技术 递送方法 基因表达调控元件
下载PDF
上一页 1 2 26 下一页 到第
使用帮助 返回顶部