CTHRC1基因在胃癌中的表达及其与预后和免疫细胞浸润的相关性分析

目的 通过生物信息学方法研究胶原三股螺旋重复蛋白1(CTHRC1)基因在胃癌组织与正常组织中的表达差异,并分析其与胃癌患者预后和免疫细胞浸润水平的关系。方法 通过GEPIA、UALCAN数据库探讨CTHRC1基因在胃癌组织中的表达水平及其与胃癌患者病理分期的关系;Kaplan-Meier Plotter数据库分析CTHRC1基因表达水平与胃癌患者预后的关系;STRING数据库分析CTHRC1相关蛋白网络并用Metascape数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;TIMER数据库分析CTHRC1基因表达与胃癌微环境中不同类型免疫细胞的相关性。结果 CTHRC1基因在多种癌症中呈现高表达,在胃癌组织中的表达水平显著高于正常组织,与胃癌病理分期密切相关(P <0.05);CTHRC1基因高表达与胃癌患者不良预后成显著相关性(P <0.05)。蛋白质互作网络分析揭示了CTHRC1与DVL1、DVL2、DVL3、FZD3、FZD5、FZD6、ROR2等蛋白具有明显相互作用,富集分析结果显示上述蛋白与Wnt/PCP信号通路相关。CTHRC1基因表达与胃癌微环境中B细胞的浸润水平成负相关,与CD8^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞的浸润水平成正相关(P <0.05)。结论 CTHRC1基因在胃癌组织中高表达,与胃癌的发生、发展及预后密切相关,其影响胃癌发生、发展的分子机制可能与调节Wnt/PCP信号通路及影响免疫细胞浸润水平相关。

EBV相关胃癌组织CTHRC1基因启动子区甲基化研究

目的分析比较EB病毒(EBV)相关胃癌(EBVaGC)与EBV阴性胃癌(EBVnGC)组织中胶原三股螺旋重复蛋白1(CTHRC1)基因的甲基化状态,探讨EBV感染对CTHRC1基因甲基化的影响。方法采用甲基化特异性PCR检测49例EBVaGC和50例EBVnGC组织中CTHRC1基因启动子区域CpG岛甲基化状态,分析两种胃癌组织中CTHRC1基因甲基化状态及与临床病理特征的关系。结果 EBVaGC组织CTHRC1基因的甲基化状态明显高于EBVnG组织(χ2=14.278,P<0.01)。胃癌组织CTHRC1基因甲基化率与病人性别、年龄、肿瘤大小、肿瘤浸润程度、肿瘤组织分化程度以及有无淋巴结转移均无关(P>0.05)。结论 EBV感染可使EBVaGC组织中CTHRC1基因甲基化率明显升高。