ctsd、ctsl基因的多态性与“雪龙”黑牛胴体性状相关性研究

为了提高雪龙黑牛的胴体性状,进行新品种选育,以组织蛋白酶D、L(Cathepsin D,Cathepsin L)基因为候选基因,利用PCR-RFLP方法对114头雪龙黑牛F1代商品牛进行多态性检测,应用SAS9.2软件采用最小二乘拟合线性模型进行分析,结果表明,ctsd、c581t位点与雪龙黑牛的经济性状无明显的相关性,ctsl基因Xma I位点与雪龙黑牛的三角牛腩厚显著相关,且AB型个体三角牛腩厚与AA和BB型个体三角牛腩厚差异显著。

RNA干扰CTSL表达抑制卵巢癌细胞的侵袭和转移

目的:构建组织蛋白酶L基因(cathepsin L,CTSL)RNAi的真核表达载体,探讨干扰CTSL基因表达对卵巢癌细胞侵袭和转移的影响。方法:设计并合成4对CTSL小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA),转染卵巢癌A2780细胞,RT-PCR检测各转染细胞CTSL的表达,筛选沉默效果最好的siRNA序列。设计并合成CTSL-shRNA序列,与psilence4.1-CMV-neo载体连接,构建psilence4.1-CTSL表达载体。psilence4.1-CTSL转染A2780细胞,获得稳定转染克隆A2780-CTSL。RT-PCR和Western blotting验证CTSL基因干扰效果,MTT法和集落形成实验检测A2780细胞的增殖,流式细胞术检测A2780细胞周期,Transwell侵袭小室实验检测A2780细胞体外侵袭和迁移能力。结果:筛选出干扰效果最好的siRNA-CTSL-1202序列,并成功构建相应的CTSL-shRNA表达载体psilence4.1-CTSL。稳定转染psilence4.1-CTSL能沉默A2780细胞中CTSL的表达。沉默CTSL基因后可抑制A2780细胞的侵袭和转移,但不影响A2780细胞的增殖、细胞周期和黏附活性。结论:成功构建CTSL基因siRNA的真核表达载体,RNA干扰CTSL基因表达可抑制卵巢癌细胞的侵袭和转移。

自噬基因CTSL表达与胶质母细胞瘤患者预后相关

本研究旨在探讨自噬基因CTSL对胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后影响。利用癌症基因组图谱(TCGA)、人类自噬数据库(HADB)、中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库、基因表达谱分析(GEPIA)获取数据信息,通过筛选差异表达基因及单因素和多因素COX分析确定GBM的独立预后危险因素,同时通过基因本体论(GO)、基因组百科全书途径(KEGG)、临床病理相关性、基因集富集分析(GSEA)、自噬基因网络分析CTSL的相关作用机制。结果显示:(1)富集分析显示胶质母细胞瘤中差异自噬基因(ARG)与自噬体的形成、细胞凋亡、血管生成、细胞化疗等相关;(2)GBM中CTSL的mRNA水平明显高于正常组织样本;(3)多因素COX回归分析显示自噬基因CTSL的高表达为GBM预后的独立危险因素,STUPP治疗(术后替莫唑胺[Tmz]同步放化疗+Tmz辅助化疗)为独立保护因素;(4)自噬基因CTSL在非GCIMP(CpG岛甲基化)型、间质型、IDH野生型、1p/19q无缺失型胶质母细胞瘤及化疗后表达量更高。综上所述,本研究分析了自噬基因在GBM中的作用,并表明自噬基因CTSL的过表达预示胶质母细胞瘤患者不良预后,显示自噬基因CTSL有作为有效靶标的潜质。

大白猪群中CTSL基因多态性与生长性状的关联分析

组织蛋白酶L(CTSL)基因属于组织蛋白酶(cathepsin)家族成员之一,该基因在调控肉质嫩度上发挥着重要作用,可以作为猪生长和胴体性状的候选基因。实验采用PCR-RFLP技术在大白猪群体中对CTSL基因第5外显子g.143 C>T单核苷酸多态性位点进行检测,分析该位点与生长及胴体性状的关联性。结果表明:在大白猪群体中共有3种基因型,分别是TT、TC和CC基因型,CC基因型个体达100 kg体重日龄天数显著小于TT基因型个体(P<0.05),但其他性状关联分析结果未达到显著水平。

山羊组织蛋白酶L基因克隆、序列分析及组织表达研究

试验旨在克隆山羊组织蛋白酶L(cathepsin L,CTSL)基因,并进一步探讨该基因结构与功能的关系,揭示其组织表达规律。本研究以天府肉羊为试验材料,运用同源序列克隆技术,对山羊CTSL基因进行克隆,并对其进行生物信息学分析及组织表达研究。结果表明,山羊CTSL基因编码区(CDS区)长1005bp,共编码334个氨基酸;山羊CTSL氨基酸与绵羊的同源性最高(99.10%),其次是牛(96.71%)、猪(90.12%)、人(76.95%)、大鼠(76.12%)、小鼠(75.82%)、青鳉鱼(66.17%)和斑马鱼(61.42%);经预测山羊CTSL可能含有1个Inhibitor_129结构域和1个Pept_C1结构域;山羊CTSL基因在11个组织中均有表达,但在肺脏和肾脏中的表达量显著高于在心肌、肝脏、脾脏、胸肌、腹肌、腿肌、膈肌、眼肌和比目鱼肌中的表达量(P<0.05)。

马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)Pm-CTSL基因的克隆及表达分析

组织蛋白酶L (cathepsin L, CTSL)是无脊椎动物体内非特异性免疫的重要组成部分。为了研究马氏珠母贝CTSL (Pm-CTSL)的功能,本实验利用RACE技术克隆获得了Pm-CTSL基因,并对其结构和组织表达模式进行了分析。结果表明,Pm-CTSL基因c DNA序列全长为1 237 bp,其中开放式阅读框957 bp,5'UTR69 bp,3'UTR 211 bp,共编码氨基酸318个。结构域分析发现Pm-CTSL具有CTSL两个典型的结构域Inhibitor_I29和Pept_C1。Pm-CTSL也具有信号肽、保守序列ERFNVN和GNFD、两个潜在的N-糖基化位点和催化活性位点三联体残基(Cys, His和Asn)。多序列比对结果表明Pm-CTSL与太平洋牡蛎的同源性最高,为42%;系统进化分析发现,Pm-CTSL与虾夷扇贝等贝类聚为一支。实时荧光定量分析发现,Pm-CTSL在肝胰腺中显著高表达(p<0.05),表明Pm-CTSL可能参与马氏珠母贝的免疫应答。本研究为进一步探讨CTSL在马氏珠母贝非特异性免疫应答中的作用提供了基础资料。