实时荧光定量检测中国实验用小型猪肝脏CYP3A29 mRNA表达水平

CYP3A29是猪肝脏最重要的药物代谢关键酶。研究中国实验用小型猪肝脏CYP3A29mRNA的表达特性对于评估其是否适宜于作为人CYP3A4介导的药理学研究动物模型具有一定意义。以β-actin作校正,利用TaqMan定量技术对巴马香猪、贵州小型香猪肝脏CYP3A29mRNA表达水平进行检测,并以荣昌猪作为对照。结果表明,巴马香猪、贵州小型香猪、荣昌猪肝脏CYP3A29mRNA表达水平与报道的人肝脏CYP3A4相近;三品系(种)猪间肝脏CYP3A29mRNA表达水平较为接近,但品系(种)内个体间变异较大。提示巴马香猪、贵州小型香猪作为药物评价的实验动物具有一定可行性。

CYP3A29稳定表达HepG_2细胞株的建立及其硝苯地平代谢活性鉴定

目的建立稳定表达Bama小型猪CYP3A29的HepG2细胞株。方法通过总RNA提取、经RT-PCR得到Bama小型猪CYP3A29的基因,并将此基因克隆至亚克隆载体PMD18-T上得到重组质粒pMD-3A29;以测序正确的重组质粒pMD-3A29为模板,采用PCR扩增CYP3A29基因并在其3′添加组氨酸标签,扩增产物经BamHI/XhoI双酶切,将带有组氨酸标签的CYP3A29基因定向克隆至pcDNA3.1(+)中,并测序验证;将测序正确的CYP3A29基因通过脂质体转染至HepG2细胞,G418筛选10代,经RT-PCR及Western-blot分析及探针药物硝苯地平对重组细胞进行活性鉴定。结果与HepG2相比,HepG2-CYP3A29细胞株具有极显著的硝苯地平氧化活性。结论成功建立了稳定表达CYP3A29的HepG2细胞株,可用于相关药物代谢研究。

小型猪肝脏细胞色素P450基因CYP3A29克隆与序列分析

设计引物通过RT-PCR扩增巴马香猪和贵州小型猪香猪药物代谢关键P450基因CYP3A29基因的全长编码区,纯化并克隆入pMD 18-T载体,通过序列测定和比对分析其序列变异情况。17头小型猪共发现CYP3A29基因的5个单核苷酸变异位点,均表现为同义替换,对编码的氨基酸序列无影响;猪CYP3A29的单核苷酸变异和品系相关,在不同品系中可表现出品系特有的单核苷酸变异;贵州小型香猪G3 a2902发现1个可变剪接,缺失89 bp并产生移码,改变编码蛋白。本研究克隆的巴马香猪和贵州小型香猪CYP3A29基因及其序列变异情况,可为其作为药物代谢模型的应用提供技术资料。

重组肝CYP3A4与CYP3A29细胞微粒体药物代谢动力学比较

目的比较巴马小型猪CYP3A29和人CYP3A4稳定表达重组肝癌细胞株微粒体的药物代谢特征,在分子水平为巴马小型猪作为临床前药物代谢实验动物提供科学依据。方法以CYP3A特异性代谢底物硝苯地平、睾酮及其抑制药酮康唑为探针药物,将探针药物与重组CYP3A4、CYP3A29细胞微粒体在优化的微粒体浓度、药物浓度、孵育时间等条件下进行体外孵育,高效液相色谱法检测其药物代谢(抑制)动力学参数,并将二者进行比较分析。结果巴马小型猪CYP3A29与CYP3A4在硝苯地平和睾酮代谢差异无统计学意义(P>0.05)。酮康唑的抑制活性为:当代谢底物为硝苯地平时,酮康唑对CYP3A29和CYP3A4的半数抑制浓度分别为0.090,0.132μmol·L-1(P<0.05);当代谢底物为睾酮时,酮康唑对CYP3A29和CYP3A4的半数抑制浓度分别为0.056,0.032μmol·L-1(P<0.05)。结论重组CYP3A29与CYP3A4细胞微粒体对硝苯地平和睾酮活性差异不显著;酮康唑对重组CYP3A29与CYP3A4细胞微粒体硝苯地平和睾酮代谢活性有差异。

巴马香猪CYP3A29mRNA组织分布的TaqManRT-PCR分析

为探讨巴马香猪CYP3A29 mRNA的组织分布特征,全面比较其与人CYP3A4 mRNA组织分布规律,利用TaqMan RT-PCR技术对巴马香猪主要组织CYP3A29 mRNA进行定量。结果表明,巴马香猪CYP3A29 mRNA的组织分布特征与报道的人CYP3A4相似,且均以肝脏最高,从转录水平提示巴马香猪及其肝脏均可以用作人CYP3A4的药物代谢研究模型。

巴马香猪CYP3A29 mRNA表达的TaqMan定量方法学建立

目的建立巴马香猪CYP3A29 mRNA表达的TaqMan定量方法。方法通过RT-PCR、TA克隆等技术制备CYP3A29-pMD18-T和β-actin-pMD18-T实时荧光定量标准品,并以CYP3A29-pMD18-T标准品为模板,对不同浓度Mg2+与探针组合的TaqMan反应体系进行筛选,TaqMan PCR方法,并对其有效性及重复性进行评价。结果筛选到的TaqMan PCR方法为:PCR总体积10μL,其中含1×Buffer、5.5 mmol/L Mg2+、0.8 mmol/L dNTPmix、0.3μmol/L上下游引物、0.2 U/μL rTaq、0.1μmol/L探针、1μL模板,热循环条件为94℃5 min→40cycles(94℃15 s→60℃45 s→读板)。结论建立了有效测定巴马香猪CYP3A29 mRNA拷贝数浓度的TaqMan PCR方法,通过该方法分别定量CYP3A29和β-actin mRNA的拷贝数浓度,即可求出CYP3A29 mRNA的表达水平。

稳定表达猪CYP3A29基因的PAM细胞系构建及鉴定

为获得稳定表达CYP3A29基因的猪肺泡巨噬细胞系,利用RT-PCR方法获取猪CYP3A29基因序列后与克隆载体PMD18-T相连,得到PMD18-T-CYP3A29重组质粒并测序验证,利用Xho I和Not I双酶切重组质粒及pcDNA3.1(+)/zeo,回收后连接,构建重组真核表达载体pcDNA3.1(+)/zeo-CYP3A29,双酶切及测序验证其正确性,并以脂质体2000将其转染至猪肺泡巨噬细胞系3D4/21,经Zeocin抗性筛选,借助RT-PCR及Wesrern-blot鉴定该基因的表达情况。结果表明,成功获得表达CYP3A29的细胞株,且连续培养10代后,RT-PCR及Wesrern-blot仍能检测到该基因表达。说明,稳定表达CYP3A29基因的猪肺泡巨噬细胞系构建成功,该细胞系的成功构建为进一步研究分析猪CYP3A29基因的功能提供了可能。

利福平给药不改变从江香猪CYP3A29 mRNA的表达水平

从江香猪是全国稀有的微型猪种,具备开发药物代谢模型的良好基础.本文旨在研究利福平对从江香猪肝脏、十二指肠、皮肤、肾脏、胃、心脏、肺、大脑和脊髓CYP3A29 mRNA表达的影响,以期从基因转录的诱导层面评估从江香猪用作药物代谢模型的可行性.结果表明,利福平给药不改变从江香猪各组织CYP3A29 mRNA的表达,从诱导层面评估从江香猪用作药物代谢模型尚需增加其他诱导剂试验.

香猪CYP3A29基因3′-UTR结构变异及其与肌肉雄激素水平的关联分析

【目的】探究猪特有的细胞色素P450超家族3A亚族成员29(cytochrome P4503A 29,CYP3A29)基因3′-UTR区核苷酸结构变异(structural variation,SV)对该基因表达的影响,解析该结构变异与香猪肉质性状形成的关系。【方法】以香猪、大白猪为研究对象,应用UCSC、miRBase、PITA、RBPsuite等软件预测CYP 3 A 29基因3′-UTR区结构变异区间所包含的重复元件、miRNA和RBP结合位点;采用PCR方法对结构变异位点进行基因分型;计算群体基因型频率、基因频率及Hardy-Weinberg平衡状态;采用实时荧光定量PCR检测该变异对CYP 3 A 29基因表达的影响;利用ELISA法检测香猪肌肉组织中CYP3A29蛋白含量和雄激素(T、DHT)水平,并使用SPSS 17.0软件对T、DHT含量与不同基因型进行Pearson相关性分析。【结果】生物信息学分析显示,CYP 3 A 29基因3′-UTR的结构变异区全长303 bp,该变异区存在1个长为241 bp的短散在元件(short interspersed element,SINE),属于Pre0_SStRNA家族,位于Chr3:6819917―6820161,含有33个miRNAs和13个RBPs结合位点。基因分型显示,该结构变异在香猪、大白猪群体中呈现出丰富的多态性,表现为II基因型(插入型)、ID基因型(杂合型)、DD基因型(双缺失)。基因型群体分布频率显示,香猪中的D等位基因频率高于大白猪,该结构变异在香猪中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),在大白猪中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。实时荧光定量PCR和ELISA结果显示,CYP 3 A 29基因ID基因型个体mRNA表达量和蛋白含量均显著高于II和DD基因型(P<0.05)。相关性分析结果显示,香猪不同基因型个体CYP3A29基因含量与肌肉组织中T浓度呈显著相关(P<0.05),与DHT浓度不相关(P>0.05)。香猪ID基因型个体T浓度显著高于DD和II基因型(P<0.05),DD基因型个体DHT浓度显著高于ID和II基因型(P<0.05)。【结论】CYP 3 A 29基因3′-UTR区长度为303 bp的结构变异在香猪群体中具有多态性,以缺失型D等位基因为主,即该结构变异在香猪中缺失SINE元件,导致CYP 3 A 29基因表达上调,进而影响香猪肌肉组织中T浓度。CYP 3 A 29基因3′-UTR结构变异与香猪肉质性状具有相关性。

地塞米松对从江香猪细胞色素氧化酶P450 3A29 mRNA表达的影响

从江香猪是全国稀有的微型猪种,其细胞色素氧化酶P450 基因纯合度较高,遗传稳定,具备开发药物代谢动物模型的良好基础。本研究旨在应用实时荧光定量方法研究从江香猪细胞色素氧化酶P4503A29 mRNA 的组织分布及地塞米松对其表达的影响,并比较与人细胞色素氧化酶P450 3A4 的相似性。结果表明,从江香猪细胞色素氧化酶P450 3A29 mRNA 的组织分布特征及地塞米松对其诱导作用总体上与人体相似,从江香猪可用于人细胞色素氧化酶P450 3A4 的诱导研究。