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邻苯二酚2,3-双加氧酶在大肠杆菌的表达与定域 被引量:4
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作者 夏东翔 曾仑 +1 位作者 郑兆鑫 汪美先 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1992年第2期177-185,共9页
本文在大肠杆菌/枮草芽孢杆菌间的穿梭质粒pTG 402的基础上构建了几个新的带有显色标志基闲xylE的表达质粒,摸索了该基因所编码的邻苯二酚2,3-双加氧酶(CatO_2ase)的表达条件,分析了该酶一级结构与二级结构的亲水性和疏水性,测定了它在... 本文在大肠杆菌/枮草芽孢杆菌间的穿梭质粒pTG 402的基础上构建了几个新的带有显色标志基闲xylE的表达质粒,摸索了该基因所编码的邻苯二酚2,3-双加氧酶(CatO_2ase)的表达条件,分析了该酶一级结构与二级结构的亲水性和疏水性,测定了它在大肠杆菌中的产量与分布。结果表明,CatO_2ase与各质粒的表达量不等,表达量高低与培养时间、宿主菌及诱导与否等影响因素有关;表达后有部分酶可在胞外测出,但大部分仍定域于膜内,亲、疏水性分析示该酶不具分泌性蛋白的显著特点。因该酶易于检测和定量,可作为一种选择性标记和监测指示系统在基因工程中推广应用,同时亦为用基因工程菌消除芳烃类化合物的污染提供了理论依据。 展开更多
关键词 大肠杆菌 表达 邻菌二酶 双加氧酶
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萘和苯酚降解菌中儿茶酚2,3-双加氧酶基因的类似性分析及杂种酶构建 被引量:1
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作者 赵化冰 杨健 +2 位作者 任何山 李永君 蔡宝立 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期36-41,共6页
从7个萘降解菌株和5个苯酚降解菌株中经PCR扩增得到12个儿茶酚2,3-双加氧酶(C23O)基因,大小均为924bp.根据DNA序列的类似性,可将这12个C23O基因聚类为3组,此结果与分离菌株的样本来源基本一致.这12个基因均编码307个氨基酸残基的儿茶酚2... 从7个萘降解菌株和5个苯酚降解菌株中经PCR扩增得到12个儿茶酚2,3-双加氧酶(C23O)基因,大小均为924bp.根据DNA序列的类似性,可将这12个C23O基因聚类为3组,此结果与分离菌株的样本来源基本一致.这12个基因均编码307个氨基酸残基的儿茶酚2,3-双加氧酶,序列中都含有9个严格保守的氨基酸残基(Gly30、His153、Leu172、His199、His214、His246、Tyr255、Pro259、Glu265),均属于外切双加氧酶的I.2.A亚家族.通过盒式PCR,用各种萘和苯酚降解菌的C23O基因中心区替换恶臭假单胞菌ND6菌株pND6-1质粒中nahH基因的中心区,得到5个杂种C23O基因,这些基因在pET-E.coli BL21(DE3)系统中表达以后,均能检测到C23O活性,其中中心区来自假单胞菌ND24菌株C23O基因的杂种酶C23O-ND24,其比活力高于对照恶臭假单胞菌ND6菌株的野生型C23O. 展开更多
关键词 萘降解菌 苯酚降解菌 儿茶酚2 3-双加氧酶基因 类似性分析 杂种酶
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少动鞘氨醇单胞菌ZX4儿茶酚2,3-双加氧酶基因的克隆与表达 被引量:1
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作者 周德平 吴淑杭 +1 位作者 闵航 姜震方 《上海农业学报》 CSCD 2007年第2期7-10,共4页
应用PCR方法克隆了少动鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas paucimobilis)ZX4菌株的儿茶酚2,3-双加氧酶基因(c230-ZX4)。核苷酸序列测定与分析表明,该基因片段全长924 bp且具有一个完整的阅读框,编码306个氨基酸残基。该基因与已报道的来自菌株S... 应用PCR方法克隆了少动鞘氨醇单胞菌(Sphingomonas paucimobilis)ZX4菌株的儿茶酚2,3-双加氧酶基因(c230-ZX4)。核苷酸序列测定与分析表明,该基因片段全长924 bp且具有一个完整的阅读框,编码306个氨基酸残基。该基因与已报道的来自菌株S.yanoikuyae B1和Sphingomonas sp.KMG425的xylE基因(编码产物均为C230)具有较高的核酸序列同源性,分别为94.37%和94.05%。通过HindⅢ和XhoⅠ两个限制性酶切位点将该基因连接到质粒pET30(a)+上得到重组表达质粒pET-S3,并在E.coli BL21进行了表达,得到了42.3 kD的融合蛋白。酶活测定发现该基因工程菌株的发酵产酶活力明显高于出发菌株。 展开更多
关键词 菲降解 少动鞘氨醇单胞菌 儿茶酚2 3-双加氧酶基因
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Characterization and phylogenetic analysis of a phenanthrene-degrading strain isolated from oil-contaminated soil 被引量:7
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作者 XIAYing MINHang LUZhen-mei YEYang-fang 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2004年第4期589-593,共5页
Bacterium strain EVA17 was isolated from an oil-contaminated soil, and identified as Sphingomonas sp. based on analysis of 16S rDNA sequence,cellular fatty acid composition and physiological-chemical tests. The salicy... Bacterium strain EVA17 was isolated from an oil-contaminated soil, and identified as Sphingomonas sp. based on analysis of 16S rDNA sequence,cellular fatty acid composition and physiological-chemical tests. The salicylate hydroxylase and catechol 2,3-dioxygenase(C23O) were detected in cell-free lysates, suggesting a pathway for phenanthrene catabolism via salicylate and catechol. Alignment showed that both of the C23O and GST genes of the strain EVA17 had high similarity with homologues of strains from genus Sphingomonas. The phylogenetic analysis based on 16S rDNA and C23O gene sequence indicated that EVA17 should be classified into genus Sphingomonas, although the two phylogenetic trees were slightly different from each other. The results of co-amplification and sequence determination indicated that GST gene should be located upstream of the C23O gene. 展开更多
关键词 PHENANTHRENE 16S rDNA glutathione S-transferase catechol 2 3-dioxygenase phylogenetic analysis
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Efficient DIPA-CRISPR-mediated knockout of an eye pigment gene in the white-backed planthopper,Sogatella furcifera
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作者 Meng-Qi Zhang Lang-Lang Gong +10 位作者 Ya-Qin Zhao Yun-Feng Ma Gui-Jun Long Huan Guo Xuan-Zheng Liu J.Joe Hull Youssef Dewer Chao Yang Ning-Ning Zhang Ming He Peng He 《Insect Science》 SCIE CAS CSCD 2024年第4期1015-1025,共11页
Although CRISPR/Cas9 has been widely used in insect gene editing,the need for the microinjection of preblastoderm embryos can preclude the technique being used in insect species with eggs that are small,have hard shel... Although CRISPR/Cas9 has been widely used in insect gene editing,the need for the microinjection of preblastoderm embryos can preclude the technique being used in insect species with eggs that are small,have hard shells,and/or are difficult to collect and maintain outside of their normal environment.Such is the case with Sogatella furcifera,the white-backed planthopper(WBPH),a significant pest of Oryza sativa(rice)that oviposits inside rice stems.Egg extraction from the stem runs the risk of mechanical damage and hatching is heavily influenced by the micro-environment of the rice stem.To bypass these issues,we targeted embryos prior to oviposition via direct parental(DIPA)-CRISPR,in which Cas9 and single-guide RNAs(sgRNAs)for the WBPH eye pigment gene tryptophan 2,3-dioxygenase were injected into the hemocoel of adult females.Females at varying numbers of days posteclosion were evaluated to determine at what stage their oocyte might be most capable of taking up the gene-editing components.An evaluation of the offspring indicated that the highest G0 gene-edited efficacy(56.7%)occurred in females injected 2 d posteclosion,and that those mutations were heritably transmitted to the G1 generation.This study demonstrates the potential utility of DIPA-CRISPR for future gene-editing studies in non-model insect species and can facilitate the development of novel pest management applications. 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 DIPA-CRISPR gene editing tryptophan 2 3-dioxygenase WBPH
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PCR一步法构建融合蛋白基因fpg 被引量:9
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作者 刘和 陈英旭 +1 位作者 张文波 金勇丰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期525-528,共4页
采用一种不需要限制核酸酶和连接酶的新方法———"PCR一步法"将芳香烃化合物降解的关键基因pheB和绿色荧光蛋白编码基因gfp融合,构建得到融合蛋白基因fpg。该方法在一个PCR反应体系中通过3个引物、两个模板扩增得到一个含有... 采用一种不需要限制核酸酶和连接酶的新方法———"PCR一步法"将芳香烃化合物降解的关键基因pheB和绿色荧光蛋白编码基因gfp融合,构建得到融合蛋白基因fpg。该方法在一个PCR反应体系中通过3个引物、两个模板扩增得到一个含有中间柔性肽段 Gly4Ser 的融合基因fpg。研究结果表明,PCR一步法是一种快速方便的构建融合基因的方法。 展开更多
关键词 PCR一步法 邻苯二酚双加氧酶 绿色荧光蛋白 融合基因
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萘降解细菌的分离及其降解和转座基因的分子检测 被引量:5
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作者 蔡宝立 丁蕊 +3 位作者 任河山 雷虹 严冰 赵化冰 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1-6,共6页
用富集培养法,从工业废水和活性污泥中分离到9个高效降解萘的细菌菌株(ND7~ND15).对菌株ND7、ND8、ND9和ND10所进行的16SrDNA序列分析表明,它们都属于假单胞菌属(Pseudomonas).PCR实验结果表明,上述4个菌株都含有蔡降解基因na... 用富集培养法,从工业废水和活性污泥中分离到9个高效降解萘的细菌菌株(ND7~ND15).对菌株ND7、ND8、ND9和ND10所进行的16SrDNA序列分析表明,它们都属于假单胞菌属(Pseudomonas).PCR实验结果表明,上述4个菌株都含有蔡降解基因nahAc、nahG、nahH和catA,ND7和ND8菌株还含有萘降解基因nahU.DNA杂交实验结果表明,上述9个萘降解菌株都含有转座酶基因tnpA1和解体酶基因tnpR.这些结果表明,萘降解细菌的降解基因和转座基因具有高度的保守性.酶学实验证明,ND7、ND8、ND9和ND10菌株都具有儿茶酚1,2-双加氧酶活力和儿萘酚2,3-双加氧酶活力,但在不同菌株中这两种酶的比活力有明显不同. 展开更多
关键词 假单胞菌 萘降解基因 转座酶基因tnpAl 解体酶基因tnpR 儿茶酚1 2-双加氧酶 儿茶酚2 3-双加氧酶
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儿茶酚双加氧酶基因大肠杆菌表达体系研究 被引量:1
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作者 熊爱生 彭日荷 +3 位作者 耿其芳 李贤 范惠琴 姚泉洪 《上海农业学报》 CSCD 2003年第2期1-4,共4页
从恶臭假单孢菌 (Pseudomonassp .S 47)的DNA中扩增得到 92 4bp编码儿茶酚双加氧酶的基因片段 ,将其构建入 pBluescriptSK载体 BamHI和 SacI位点间。测序结果显示与Kim ( 2 0 0 0 )报道一致。将该基因插入带庆大霉素抗性基因启动子和t1t... 从恶臭假单孢菌 (Pseudomonassp .S 47)的DNA中扩增得到 92 4bp编码儿茶酚双加氧酶的基因片段 ,将其构建入 pBluescriptSK载体 BamHI和 SacI位点间。测序结果显示与Kim ( 2 0 0 0 )报道一致。将该基因插入带庆大霉素抗性基因启动子和t1t2终止子载体pG2 5 1、分别带ompA和EAP信号肽、lpp和Gmr 启动子载体 pYF3 95和 pYF5 2 5 4中 ,构建组成型表达载体pG2 5 1,分泌型表达载体 pYFX1,pYFX2。酶活测定结果显示pG2 5 1为 665mu/mL ,pYFX1,pYFX2分别为 1815mu/mL ,10 15mu/mL。SDS PAGE电泳显示表达蛋白产物的分子量约为 3 5kD。分泌型表达载体pYFX1表达量大于 pYFX2 ,组成型表达载体 展开更多
关键词 儿茶酚双加氧酶基因 大肠杆菌 表达体系 基因克隆 基因表达 酶活分析 环境污染
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xylE基因在嗜热脂肪芽孢杆菌中的表达 被引量:3
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作者 何笑松 沈仁权 盛祖嘉 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1990年第1期46-52,共7页
以嗜热脂肪芽孢杆菌CU21的表达型质粒pFDC11为载体,插入来自恶臭假单孢菌的编码邻苯二酚2,3-双加氧酶(CatO_2ase)的xylE基因,构建成重组质粒pFDX1转化入CU21受体,在48℃培养时得到了表达产物,表明常温细菌的xylE基因可以在高温菌启动子... 以嗜热脂肪芽孢杆菌CU21的表达型质粒pFDC11为载体,插入来自恶臭假单孢菌的编码邻苯二酚2,3-双加氧酶(CatO_2ase)的xylE基因,构建成重组质粒pFDX1转化入CU21受体,在48℃培养时得到了表达产物,表明常温细菌的xylE基因可以在高温菌启动子的带动下在高温菌宿主中表达。采用提高培养温度后选择卡那毒素抗性突变的方法,得到了在55℃及6O℃的CatO_2ase表达量明显提高的变异菌株CU21-161。本文同时报道一种用完整细胞悬浮液测定CatO_2ase活力的方法。 展开更多
关键词 xYLE基因 嗜热芽孢杆菌 基因表达
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邻苯二酚-2,3-双加氧酶基因在芘降解菌基因组的整合与表达
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作者 赵亚光 段魏魏 +4 位作者 徐苗 吴盼云 肖璐梅 马腾飞 晁群芳 《环境工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期232-237,共6页
为了构建能够稳定遗传且高效降解多环芳烃的工程菌,利用PCR技术对Pseudomonas songnenensis wp3-1的邻苯二酚-2, 3-双加氧酶(C23O)基因进行克隆,并将其与自杀性载体pUTmini-Tn5连接,得到重组载体pUTmini-Tn5-C23O。在三亲接合作用下,经m... 为了构建能够稳定遗传且高效降解多环芳烃的工程菌,利用PCR技术对Pseudomonas songnenensis wp3-1的邻苯二酚-2, 3-双加氧酶(C23O)基因进行克隆,并将其与自杀性载体pUTmini-Tn5连接,得到重组载体pUTmini-Tn5-C23O。在三亲接合作用下,经mini-Tn5转座子将重组载体pUTmini-Tn5-C23O中的C23O基因整合到菌株Pseudomonas sp. wp4的染色体DNA中,最终得到基因工程菌wp4-C23O。在不同pH、温度下,菌株wp4和工程菌wp4-C23O对浓度为50 mg?L-1的芘进行降解7 d。2株菌降解最适温度为37℃、最适pH为7.5。在此条件下,工程菌wp4-C23O对芘降解率显著高于wp4菌株(P<0.05),降解率提高11.45%。以PAHs降解优势菌株为受体构建工程菌可以去除石油污染土壤中的PAHs。 展开更多
关键词 多环芳烃(PAHs) 邻苯二酚-2 3-双加氧酶(C23O)基因 三亲接合转化 基因工程菌
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