基于叶绿体DNA序列的Ceratotropis亚属遗传进化研究

作为Ceratotropis亚属起源中心之一，中国有丰富的Ceratotropis亚属种质资源，但种间遗传进化研究相受落后。为探索该亚属各种间的亲缘关系及遗传演化规律，对Ceratotropis亚属18个种及亚种共110份材料的叶绿倒基因组2个内含子（rpll6、rpsl6）和3个基因（psbA-trnH、rpoB-trnC和trnL-trnF）的间隔区序列进行了研究。结果摹明，各序列的信息位点百分率在3．63％～24．28％之间，其中rpsl6最高，rpoB．trnC最低。序列拼接的Kimura进化距声分析发现，各种间进化距离介于0～0．057之间，矿minima复合体（矿minima、V.riukinensis和V.nakashime）和psubramaniana的进化距离最大。基于单个序列，利用MEGA5．1和PAUP4．0软件构建的邻接树和最大简约树的结芽均将Ceratotropis亚属18个种及亚种划分为2个大支，其中第Ⅰ类包含9个种和亚种，为3个组似ngulares、Ceratotropis和Aconitifoliae）的混合体，第Ⅱ类也包含9个种和亚种，全部属于Angulares组。系统发育树的分化同质性检验表明其拓扑一致性较高（P=0．87）。psbA-trnH等5个序列的分子系统进化研究对阐明Ceratotropis亚属种问著缘关系和系统演化具有重要的理论和现实意义。

Ceratotropis亚属基于SSR标记和ITS序列的分类与进化分析

利用SSR分子标记和ITS序列分析研究Ceratotropis亚属已鉴定的93份种质以及Vigna亚属的2份地方种和Glycine属的1份野生种,共8个种及亚种的96份材料的遗传差异。初步筛选出分布于11个连锁群（linkage group,LG）的74对小豆引物及14对黒吉豆引物和第9连锁群的5对绿豆引物,得到分辨力强的27对引物,平均PIC值为0.4914;UPGMA聚类分析,在DICE系数0.021处,将95份参试材料（除HAI_103）划分为两大类,第I类包括Ceratotropis组所有种质和3个＂过渡＂种质;第Ⅱ类包括Angulares组所有种质,且小豆引物通用性最高,23对小豆引物的转移能力达88%以上。对参试材料中的28份典型种质进行ITS测序分析,比较序列间Kimura进化距离发现,V.minima和V.umbellata种间距离最小（0-0.005）,V.radiata种内分化程度最高;利用MEGA4.0构建最大简约树（maximum parsimony,MP）和邻接树（neighbor-joining,NJ）,将参试种质划分为3大类,这与形态学和SSR标记分类一致。