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黄梁木 CesA/Csls 基因家族的鉴定与表达分析
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作者 范梦霞 查霁雯 +2 位作者 覃福宇 陈欣然 赵小兰 《湖北民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第3期307-316,共10页
为探究黄梁木(Neolamarckia cadamba)纤维素合酶(cellulose synthase,CesA)和纤维素合酶样(cellulose-synthase-like,Csl)基因在细胞壁合成中的作用以及CesA/Csls基因对林木生长发育及抗逆的影响,利用生物信息学方法对黄梁木的CesA/Csl... 为探究黄梁木(Neolamarckia cadamba)纤维素合酶(cellulose synthase,CesA)和纤维素合酶样(cellulose-synthase-like,Csl)基因在细胞壁合成中的作用以及CesA/Csls基因对林木生长发育及抗逆的影响,利用生物信息学方法对黄梁木的CesA/Csls基因家族进行鉴定,并对该家族开展详细的生物学分析。结果表明,黄梁木中共有47个CesA/Csls家族成员,基于进化树分析将其分为8个亚家族(CesA、CslA、CslB、CslC、CslD、CslE、CslG和CslJ)。黄梁木CesA/Csls家族在基因结构、染色体分布和定位、系统发育和蛋白质序列方面具有不同的特征,表明它们通过不同的进化过程产生。启动子顺式作用元件分析表明,黄梁木CesA/Csls基因家族的启动子富含光响应、激素响应和逆境响应的元件。基因表达模式分析表明,黄梁木CesA/Csls基因具有不同的组织特异性表达模式。纤维素合酶基因超级家族研究有助于提高生物质能源、农林废弃物利用、动物饲料和工业应用等领域的效率与效果。 展开更多
关键词 黄梁木 cesa/Csls基因家族 生物信息 系统发育分析 表达模式
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甘蔗CesA7基因的生物信息学分析及功能预测
2
作者 匡博文 赵极瀚 +3 位作者 李思程 韦妳 冯梦凡 杨细平 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第7期1337-1347,共11页
纤维素是植物根系的主要成分之一,在植物抗倒伏中起到关键作用。CesA7是控制纤维素合成的重要基因,在甘蔗中的功能未知。以水稻OsCesA7基因为参考序列,在甘蔗割手密(Saccharumspontaneum)、甘蔗杂交栽培品种(Saccharum spp.hybrid)、甘... 纤维素是植物根系的主要成分之一,在植物抗倒伏中起到关键作用。CesA7是控制纤维素合成的重要基因,在甘蔗中的功能未知。以水稻OsCesA7基因为参考序列,在甘蔗割手密(Saccharumspontaneum)、甘蔗杂交栽培品种(Saccharum spp.hybrid)、甘蔗热带种(S.officinarum)3个基因组中进行同源分析及功能预测。基于该基因及其同源基因的进化分析显示杂交栽培品种的CesA7基因和热带种的CesA7基因更为接近,禾本科植物有明显的聚类,但不能区分草本植物和木本植物。甘蔗CesA7基因的启动子区域含有大量的光反应和茉莉酸甲酯元件,说明该基因可能参与植株的光形态建成和甘蔗抗逆反应。启动子和蛋白互作预测表明CesA7基因与MYB转录因子存在互作,说明其在作物生长发育和胁迫响应中起到一定作用。此外,水稻和高粱中CesA蛋白的功能预测显示,其参与调控了纤维素合成和木质素降解过程。通过对7个甘蔗及其近缘属代表种质的苗期根和叶的转录组数据分析,发现CesA7基因在根中表达量远高于叶,推测该基因参与调控甘蔗根系的发育。在甘蔗及近缘属不同种质中对该基因进行SNP变异检测,发现在割手密中核苷酸多态性最高。外显子区域的核苷酸多态性明显高于内含子区域,在基因第4个外显子(2000 bp左右)区域的多态性最高,推测在该位点可能经受平衡选择造成不同等位基因的功能分化。借助多序列比对结合重测序数据分析,本研究挖掘了2个可区分割手密和热带种的潜在分子标记。该研究结果对进一步研究和利用CesA7基因改良甘蔗品种提供理论指导。 展开更多
关键词 甘蔗 纤维素 cesa7基因 进化分析
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芹菜CESA基因鉴定与表达分析
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作者 郭新月 张红梅 +3 位作者 刘洪博 李艳玲 张晴 袁敏 《河北师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第6期611-619,共9页
纤维素是植物细胞壁的主要成分,纤维素合成酶是纤维素合成过程中的重要酶类.通过生物信息学方法对芹菜纤维素合成酶(Apium graveliens cellulose synthases A,AgCESA)基因家族进行了全基因组水平的鉴定,共获得了11个AgCESA基因家族成员... 纤维素是植物细胞壁的主要成分,纤维素合成酶是纤维素合成过程中的重要酶类.通过生物信息学方法对芹菜纤维素合成酶(Apium graveliens cellulose synthases A,AgCESA)基因家族进行了全基因组水平的鉴定,共获得了11个AgCESA基因家族成员,将其分为5组(Ⅰ~Ⅴ);蛋白结构域分析显示所有AgCESA蛋白都具有纤维素合酶结构域和锌指结构域,并且在不同物种中也非常保守;AgCESA基因启动子区域均存在许多与光、激素和逆境响应相关的顺式作用元件,表明该家族基因可能参与植物生长发育和抗逆防御等多种生物学进程;对组织进行表达分析显示AgCESA基因在不同组织中表达水平有明显差异,在茎中表达量最高,叶次之,在根中表达量最低.研究结果明确了芹菜中的CESA编码基因,揭示了AgCESA基因在不同组织中的表达规律,为后续深入研究芹菜AgCESA基因功能奠定了重要的理论基础. 展开更多
关键词 芹菜 cesa基因家族 保守结构域 顺式作用元件 组织表达
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蓖麻CeSA转录因子基因家族的鉴定与表达分析 被引量:1
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作者 王宙 王宏伟 +4 位作者 王亚 杨俊芳 赵宜婷 张宏斌 曹越 《激光生物学报》 CAS 2023年第2期160-169,共10页
纤维素合成酶(CeSA)是能在植物细胞质膜上合成纤维素的蛋白质,具有与叶片形态发育相关的顺式作用元件。在高等植物的生长发育过程中,细胞的伸长受到激素和环境的影响,使得植物生长高度具有差异性。其中细胞壁对细胞伸长起限制作用,而纤... 纤维素合成酶(CeSA)是能在植物细胞质膜上合成纤维素的蛋白质,具有与叶片形态发育相关的顺式作用元件。在高等植物的生长发育过程中,细胞的伸长受到激素和环境的影响,使得植物生长高度具有差异性。其中细胞壁对细胞伸长起限制作用,而纤维素是细胞壁重要的组成成分,对植物的细胞形态有重要的影响。Ce SA是植物生长发育的重要调控因子。本研究通过对蓖麻(Ricinus communis)参考基因组CeSA基因的识别和生物遗传信息学的研究,结合蓖麻基因组数据库,对CeSA家族成员的基因结构、染色体定位、理化性质、二级结构、三级结构、信号肽与亚细胞定位、蛋白跨膜结构域、共线性分析、保守基序、启动子顺势作用元件及系统进化进行了鉴定和表达分析。从蓖麻参考基因组中共鉴定出8个CeSA转录因子,命名为RcCeSA1~RcCeSA8,分布在8条染色体上;8个RcCeSAs蛋白都是亲水性蛋白,不含信号肽,蛋白亚细胞定位以在叶绿体和高尔基体上为主;在二级结构中有70%的α-螺旋和无规则卷曲;RcCeSAs基因保守性分析表明,除Motif1和Motif2外,其他Motif均为RcCeSA家族中较为保守的基序;基因启动子顺式作用元件分析发现,RcCeSA1、RcCeSA4、RcCeSA7转录因子的启动子区域中存在叶片形态发育以及参与防御和应激反应的相关的元件,可能会在逆境条件下快速表达,发挥其潜在功能。系统进化树分析表明,RcCeSA家族与大豆、向日葵的亲缘关系更近。本研究结果探究了蓖麻CeSA相关转录因子调控植物纤维素合成的分子机制功能,为进一步研究叶片形态差异、纤维素含量及纤维素合成相关基因在蓖麻中的表达与建立植物形态对实际生产中的重要作用奠定基础。 展开更多
关键词 蓖麻 Ce SA转录因子 基因家族 植物纤维素合成 生物信息学
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杉木纤维素合成酶基因CesA的克隆及表达分析 被引量:8
5
作者 庞景 童再康 +2 位作者 黄华宏 林二培 刘琼瑶 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期40-46,共7页
通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)结合c DNA末端快速扩增(RACE)技术,从杉木Cunninghamia lanceolata中克隆到2个全长为3 235 bp和3 876 bp的纤维素合成酶基因c DNA序列,被分别命名为Cl Ces A1和Cl Ces A2,Gen Bank登录号分别为JQ84... 通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)结合c DNA末端快速扩增(RACE)技术,从杉木Cunninghamia lanceolata中克隆到2个全长为3 235 bp和3 876 bp的纤维素合成酶基因c DNA序列,被分别命名为Cl Ces A1和Cl Ces A2,Gen Bank登录号分别为JQ844574和JQ844575。相应编码蛋白分别包含992和1 092个氨基酸残基,推测分子量为111 845.3 D和123 105.7 D,等电点为6.04和6.65。氨基酸序列分析发现,它们具有植物纤维素合成酶基因相应的结构特征——锌指结构,2个易变区CSRI和CSRII,2个保守区CRI和CRII,纤维素合成酶底物结合结构域"D,D,D,QVLRW",以及8个跨膜区。荧光定量PCR分析表明:Cl Ces A1和Cl Ces A2基因在茎中表达丰度均为最高,且成熟木质部中表达量均高于皮层中的相应数值;2个基因在根和针叶中的表达量相对较低。以具特殊材质性状的矮生杉木和正常杉木木质部为材料的进一步表达分析发现:Cl Ces A1和Cl Ces A2在正常杉木木质部中的表达量大约是矮生杉木表达量的2~12倍。2个杉木Ces A基因可能在杉木木材形成过程中具有重要作用。 展开更多
关键词 林木育种学 杉木 cesa基因 基因克隆 序列分析 表达分析
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普通烟草CESA基因家族成员的鉴定、亚细胞定位及表达分析 被引量:16
6
作者 徐宗昌 孔英珍 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期512-524,共13页
纤维素合成酶蛋白(cellulose-synthase proteins,CESA)是一类质膜定位蛋白,以蛋白复合体的形式存在于质膜上合成纤维素,在细胞壁建成和植物生长发育过程中起着非常重要的作用。本研究利用CESA蛋白保守域序列PF03552检索普通烟草(Nicotia... 纤维素合成酶蛋白(cellulose-synthase proteins,CESA)是一类质膜定位蛋白,以蛋白复合体的形式存在于质膜上合成纤维素,在细胞壁建成和植物生长发育过程中起着非常重要的作用。本研究利用CESA蛋白保守域序列PF03552检索普通烟草(Nicotiana tabacum L.)蛋白序列,并通过拟南芥(Arabidopsis thaliana)10个CESA蛋白序列在普通烟草基因组数据库中利用TBLASTN程序进行比对,共获得21条NtCESA基因候选序列,对这些序列进行蛋白序列理化性质分析、系统进化树构建、基因结构分析、保守结构域及跨膜区分析和组织表达模式分析,并对NtCESA9和NtCESA14两个蛋白进行了亚细胞定位实验。结果表明:获得的21条NtCESA蛋白序列的理化性质相似;系统进化分析将21个NtCESA基因和10个At CESA基因分成5个分支,每一个分支各成员之间的进化相对保守,基因结构类似,不同分支之间的基因结构差异也较小;NtCESA蛋白结构域相对保守,都含有CESA蛋白典型的N端锌指结构、C端跨膜区和DDD-QXXRW保守功能域;组织表达分析结果表明,大部分NtCESA基因在幼苗和成熟期烟草的根、叶、胚芽和愈伤组织中都有表达,同一个分支中的基因表达模式基本一致,并且NtCESA基因参与初/次生细胞壁纤维素的合成与该基因编码蛋白的跨膜区数目存在关联,表明NtCESA基因家族成员功能上的复杂性;亚细胞定位结果证实NtCESA9和NtCESA14为质膜定位蛋白。本研究为烟草CESA基因家族功能的深入研究奠定了基础。 展开更多
关键词 普通烟草 cesa基因家族 基因表达 亚细胞定位
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外源GA_3对毛竹实生苗茎秆生长及CesA基因表达的影响 被引量:4
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作者 姜勇 胡尚连 +3 位作者 曹颖 卢学琴 黄艳 徐刚 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期744-750,共7页
以毛竹实生苗为试验材料,研究不同浓度外源GA_3(0,0.1,0.5,1μmol·L^(-1))对毛竹生长及CesA基因表达的影响。结果表明,与未经GA_3处理相比,施用外源GA_3后,毛竹实生苗茎节间和纤维细胞显著伸长,初生壁纤维素合成相关基因PeCesA2和P... 以毛竹实生苗为试验材料,研究不同浓度外源GA_3(0,0.1,0.5,1μmol·L^(-1))对毛竹生长及CesA基因表达的影响。结果表明,与未经GA_3处理相比,施用外源GA_3后,毛竹实生苗茎节间和纤维细胞显著伸长,初生壁纤维素合成相关基因PeCesA2和PeCesA6相对表达量明显上调,次生壁相关基因PeCESA4和PeCESA4-1显著下调,傅里叶红外光谱分析(FTIR),发现毛竹茎秆纤维素特征峰强度(1 060,1 160及1 373 cm^(-1))随着GA_3浓度升高而逐渐增强,表明施用外源GA_3能够影响毛竹茎秆CesA基因表达,PeCesA2和PeCesA6的表达与外源GA_3促进纤维细胞伸长的过程存在一定联系。 展开更多
关键词 毛竹实生苗 GA_3 纤维细胞 cesa基因
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干旱和光联合胁迫对长春花CesA基因和Pme基因表达的影响 被引量:2
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作者 姜扬 祖元刚 +2 位作者 刘英 杨玉焕 林健 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期20-22,共3页
以长春花叶片为材料,通过同源序列扩增法,获得与细胞壁合成相关的纤维素合成酶(Cellulose synthase,CesA)基因和与细胞壁重要组成部分果胶的变化密切相关的果胶酯酶(Pectin methylesterase,Pme)基因,利用定量的RT-PCR,对干旱和光联合胁... 以长春花叶片为材料,通过同源序列扩增法,获得与细胞壁合成相关的纤维素合成酶(Cellulose synthase,CesA)基因和与细胞壁重要组成部分果胶的变化密切相关的果胶酯酶(Pectin methylesterase,Pme)基因,利用定量的RT-PCR,对干旱和光联合胁迫下CesA基因和Pme基因的表达情况进行了研究。结果表明:干旱胁迫条件下,CesA基因表达稍有减弱,Pme基因表达稍有增强。光胁迫条件下,CesA基因表达明显弱于正常光条件,呈逐渐减弱趋势,CesA基因表达与光胁迫的关系为负调控;而Pme基因表达则明显强于正常光条件,呈现增强趋势,Pme基因表达与光胁迫的关系为正调控。说明光胁迫是CesA基因和Pme基因表达变化的主要影响因素。在干旱和光联合胁迫下,CesA基因表达整体减弱,Pme基因表达整体较强。 展开更多
关键词 纤维素合成酶(cesa) 果胶酯酶(Pme) 光胁迫 干旱胁迫 联合胁迫
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黄瓜纤维素合成酶CESA家族基因鉴定及非生物胁迫响应分析 被引量:5
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作者 康忱 赵雪芳 +3 位作者 王鹏 李亚栋 田哲娟 吴志明 《中国蔬菜》 北大核心 2022年第3期29-41,共13页
纤维素合成酶(cellulose synthase,CESA)是纤维素合成过程中重要的酶类,在细胞壁建成和植物生长发育过程中起着非常重要的作用。本试验从黄瓜品系9930全基因组数据中鉴定得到35个CESA基因家族成员,系统进化分析将家族成员分成6个group... 纤维素合成酶(cellulose synthase,CESA)是纤维素合成过程中重要的酶类,在细胞壁建成和植物生长发育过程中起着非常重要的作用。本试验从黄瓜品系9930全基因组数据中鉴定得到35个CESA基因家族成员,系统进化分析将家族成员分成6个group。亚细胞结果显示,大部分成员定位于质膜上,少部分定位在高尔基体上。物种间CESA家族基因共线性分析显示,拟南芥和番茄的CESA基因家族与黄瓜CESA基因家族分别有15个和12个同源基因对,西瓜和甜瓜CESA基因家族与黄瓜CESA基因家族分别有19个和20个同源基因对。顺式作用元件分析表明,CsCESA家族基因具有植物激素、非生物胁迫、时空表达和生物进程相关的顺式作用元件。转录组数据和qRT-PCR结果显示,CsCESA家族基因在不同组织中差异表达,并且大部分基因受非生物胁迫和植物激素的诱导表达,其中CsCESA5、CsCESA20和CsCESA28均能响应低温、盐胁迫、ABA和MeJA的诱导,推测这3个基因可能在黄瓜响应非生物胁迫中发挥重要作用。 展开更多
关键词 黄瓜 纤维素合成酶(cesa) 非生物胁迫 表达分析
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小麦CesA基因家族鉴定及特征分析 被引量:4
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作者 吴兴阳 胡义锋 +2 位作者 马东方 刘易科 方正武 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期203-213,共11页
【目的】系统鉴定和分析小麦纤维素合成酶(CesA)基因家族成员,为进一步阐明小麦CesA基因家族的生物学功能奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法在小麦全基因组上系统鉴定小麦CesA (TaCesA)基因家族的成员。对小麦CesA基因的系统发... 【目的】系统鉴定和分析小麦纤维素合成酶(CesA)基因家族成员,为进一步阐明小麦CesA基因家族的生物学功能奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法在小麦全基因组上系统鉴定小麦CesA (TaCesA)基因家族的成员。对小麦CesA基因的系统发育、染色体位置和转录组进行分析。预测TaCesAs基因结构、保守基序、顺式元件、蛋白质特征和亚细胞定位,并对小麦及其亚基因组供体中CesAs同源基因进行比对。【结果】共鉴定出21个TaCesA基因,分为3组(a、b和c)。基因结构分析发现TaCesA含有多个内含子,但部分基因非翻译区(UTR)结构存在缺失。TaCesA基因与其亚基因组供体关系保守。TaCesAs的上游包含45个与生物胁迫/非生物胁迫、生长发育和植物激素相关的元件,预示这些基因可能参与响应小麦的生物学功能。表达谱结果显示:TaCesA基因在缺磷、高温、低温、干旱、条锈病、白粉病和赤霉病等逆境胁迫中均有响应。【结论】小麦CesA基因具有保守的基因结构和蛋白结构,且在小麦抵御非生物和生物胁迫中起着重要作用。 展开更多
关键词 小麦 纤维素合成酶(cesa) 生物信息学分析 基因表达谱
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罗布麻CesA基因家族的生物信息学分析 被引量:6
11
作者 解盛 李国旗 +3 位作者 宋立肖 谢博勋 王雅芳 刘星 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期522-534,共13页
植物体中纤维素是细胞壁形成的主要成分,不仅参与细胞形态的建成,调控细胞发育,还参与细胞内多种细胞信号转导途径,进而影响植物体的生长发育。纤维素合酶是植物体合成纤维素的主要酶类。为了探究CesA基因家族对罗布麻生长发育及纤维素... 植物体中纤维素是细胞壁形成的主要成分,不仅参与细胞形态的建成,调控细胞发育,还参与细胞内多种细胞信号转导途径,进而影响植物体的生长发育。纤维素合酶是植物体合成纤维素的主要酶类。为了探究CesA基因家族对罗布麻生长发育及纤维素合成的调控机理,该文通过生物信息学分析方法,从基因家族鉴定、结构分析、蛋白理化性质与多级结构预测、亚细胞定位、信号肽、进化关系和顺式作用元件等方面,对罗布麻CesA基因家族进行系统鉴定和分子特征分析。结果表明:基于全基因组测序,罗布麻CesA基因家族鉴定含有15个成员,分布在罗布麻11条染色体中的8条上,其编码蛋白的氨基酸数量为730~1158,相对分子质量81280.81~130123.18 kDa,理论等电点6.18~8.83。除了AvCesA3、AvCesA5、AvCesA7、AvCesA10和AvCesA11蛋白为稳定蛋白,其余成员均为不稳定蛋白;除了AvCesA12蛋白为疏水性蛋白,其余成员均为亲水性蛋白。该家族成员包含3~14个外显子,8~15个保守基序。编码蛋白主要分布于质膜与高尔基体上,无信号肽,二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主要构成元件。AvCesA15蛋白的跨膜结构域和三级结构与其他成员存在显著不同。罗布麻CesA基因进化时主要受纯化选择作用。对上游1500 bp区域顺式作用元件分析,结果显示罗布麻CesA基因受到光、温度、水分、氧气等环境因子及生长素、赤霉素、脱落酸、乙烯、水杨酸等植物激素调控。该研究为进一步探究罗布麻CesA基因家族的生物学功能、提高纤维品质与品种改良奠定理论基础。 展开更多
关键词 罗布麻 纤维发育 生物信息学分析 cesa 基因家族 生长发育
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白桦CESA7基因启动子的克隆与表达分析 被引量:3
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作者 朱德财 胡晓晴 +3 位作者 赵桐 田晶 张勇 刘雪梅 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期551-558,共8页
克隆得到了一个白桦纤维素合成酶基因(CESA7)Gen Ban K登录号(EU591531)启动子序列,通过序列分析发现该启动子含有多个不同功能的顺式作用元件,包括光响应元件、激素响应元件、叶片形态发育元件等,推测该启动子在白桦生长发育过程中具... 克隆得到了一个白桦纤维素合成酶基因(CESA7)Gen Ban K登录号(EU591531)启动子序列,通过序列分析发现该启动子含有多个不同功能的顺式作用元件,包括光响应元件、激素响应元件、叶片形态发育元件等,推测该启动子在白桦生长发育过程中具有关键作用。将Bp CESA7启动子克隆至带有GUS报告基因的植物表达载体,命名为pro Bp CESA7-121-GUS,并利用农杆菌介导方法侵染白桦和拟南芥,然后通过GUS组织化学染色观察Bp CESA7基因启动子的组织表达特性。结果在白桦的根、茎、叶和拟南芥的根,叶,萼片、雌蕊中检测到了GUS活性,说明Bp CESA7基因启动子具有启动子活性,并且在白桦的根和叶中染色最深,表明Bp CESA7基因在白桦根和叶中表达量较高,并且其存在组织表达特异性。 展开更多
关键词 白桦 cesa7 启动子 表达 GUS染色
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拟南芥、水稻和毛果杨中CesA基因的进化和表达分析 被引量:5
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作者 朱煜 谭梦月 +3 位作者 邹爱兰 张文举 戚金亮 杨永华 《南京林业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期11-16,共6页
纤维素是植物细胞壁的主要成分,纤维素合成酶是纤维素合成过程中重要的酶类。利用拟南芥(草本植物)、水稻(禾本科作物)、毛果杨(木本植物)3种已知全基因组序列的模式植物,对纤维素合成酶基因(CesA)家族的成员进行系统分析,了解CesA基因... 纤维素是植物细胞壁的主要成分,纤维素合成酶是纤维素合成过程中重要的酶类。利用拟南芥(草本植物)、水稻(禾本科作物)、毛果杨(木本植物)3种已知全基因组序列的模式植物,对纤维素合成酶基因(CesA)家族的成员进行系统分析,了解CesA基因超基因家族的进化关系。研究结果表明,CesA基因在物种分化之前就已经存在,并且在各个物种内部出现了基因扩张,不同物种扩张程度不同,整个基因家族呈负选择压力。为进一步探讨该家族基因的表达调控模式,以水稻为例对该基因家族的启动子元件进行了分析,发现OsCesA基因可能受到多种胁迫和激素信号的调控;而RT-PCR结果表明ABA可以显著下调该类基因的表达。 展开更多
关键词 拟南芥 水稻 毛果杨 纤维素合成酶基因 进化树 基因表达
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白菜CesA基因家族鉴定及表达模式分析 被引量:3
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作者 马宇辰 赵玉梅 +6 位作者 黄丹霖 张梦晴 吴晓宇 王洁 陈雨 黄家保 段巧红 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期2021-2031,共11页
为探究CesA基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制,该文通过生物信息学的方法,以白菜的全基因组序列为研究区域,进行理化特征、基因结构、进化特征、保守基序及结构域、顺式作用元件和组织表达等鉴定分析。结果表明:(1)... 为探究CesA基因家族在白菜生长发育及纤维素合成过程中的作用机制,该文通过生物信息学的方法,以白菜的全基因组序列为研究区域,进行理化特征、基因结构、进化特征、保守基序及结构域、顺式作用元件和组织表达等鉴定分析。结果表明:(1)共鉴定出16个编码纤维素合成酶亚基的CesA基因,该家族成员所编码蛋白的理论等电点为4.76~9.12,相对分子量为17.76~122.67 kD,长度为153~1089 aa。(2)15个基因不均匀地分布于白菜的7条染色体上,Bra036008定位于scaffold上。(3)大部分成员包含4~14个外显子,1~11个保守基序。(4)该家族具有保守的DDD-QXXRW保守功能域。(5)该家族编码蛋白主要分布在质膜上,二级结构以无规则卷曲与α-螺旋为主,多数成员都含有CesA蛋白典型的N端、C端和跨膜区。(6)CesA基因在茎中表达量相对较高,其中Bra011865、Bra023952和Bra029874在茎、叶、花中显著表达。该研究结果为后续深入研究CesA基因功能以及白菜生长发育研究奠定了基础。 展开更多
关键词 纤维素合成酶 白菜 cesa 基因家族 基因表达
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<i>Arabidopsis</i>Transcription Factor WRKY33 Is Involved in Drought by Directly Regulating the Expression of <i>CesA8</i> 被引量:1
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作者 Xinjing Wang Bojing Du +2 位作者 Meng Liu Na Sun Xiaoting Qi 《American Journal of Plant Sciences》 2013年第6期21-27,共7页
Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) WRKY33 is a key transcription factor in pathogen-induced defense signaling, but its function in abiotic stresses remains largely unclear. In this study, we report on the use of a rev... Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) WRKY33 is a key transcription factor in pathogen-induced defense signaling, but its function in abiotic stresses remains largely unclear. In this study, we report on the use of a reverse-genetic approach, as well as a yeast (Saccharomyces cerevisiae) expression system, to determine the role of WRKY33 in drought. A T-DNA insertion deletion mutant of WRKY33 is more sensitive to dehydration. Through genome-wide screening the target genes of WRKY33 in yeast, we identified 23 candidate genes including a drought tolerance gene CesA8. Further results revealed that WRKY33 repressed CesA8 expression through binding to the W-box elements of CesA8 distal promoter region and probably interacting with the transcriptional activator of CesA8, MYB46. These findings revealed the primary molecular mechanism underlying the function of WRKY33 in response to 展开更多
关键词 WRKY33 DROUGHT cesa8 Target Gene Inverse YEAST One-Hybrid ASSAY
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Transcriptome analysis combined with metabolome analysis reveals the significant functions of CesA genes in cotton(Gossypium hirsutum)fiber length development
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作者 ZHENKUI CUI GUIQIN SUN QUANZHI ZHAO 《BIOCELL》 SCIE 2022年第9期2133-2144,共12页
Cotton is widely distributed worldwide,and improving the quality of its fiber is one of the most important tasks in cotton breeding.Cotton fibers are primarily composed of cellulose,which is synthesized by CesA comple... Cotton is widely distributed worldwide,and improving the quality of its fiber is one of the most important tasks in cotton breeding.Cotton fibers are primarily composed of cellulose,which is synthesized by CesA complexes(CSCs).However,the functions of CesA genes in cotton fiber development have not been comprehensively analysed.In this study,the cotton transcriptome and metabolome were used to investigate the function of CesA genes in fiber development.Finally,321 metabolites were obtained,84 of which were associated with the corresponding genes.Interestingly,a target gene named Gh_A08G144300,one of the CesA gene family members,was closely correlated with the development of cotton fibers.The target CesA gene Gh_A08G144300 was analysed to determine its specific function in cotton fiber development.High-level gene expression of Gh_A08G144300 was found at different fiber development stages by RNA-seq analysis,and the silencing of Gh_A08G144300 visibly inhibited the growth of cotton fibers,showing that it is critical for their growth.This study provides an important reference for research on the gene function of Gh_A08G144300 and the regulatory mechanism of fiber development in cotton. 展开更多
关键词 TRANSCRIPTOME METABOLOME cesa Cotton fiber VIGS
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康得新获得CESA 2016“最佳制造商技术奖”
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《数字印刷》 CSCD 北大核心 2016年第6期72-72,共1页
5月11~13日,备受关注的2016年亚洲消费电子产品展览会(CESA 2016)在上海新国际博览中心举办。康得新凭借独创的"超低电阻高透ITO膜"技术,获得CESA 2016"最佳制造商技术奖"。作为美国国际消费电子产品展览会(CES)的亚洲姊妹版,C... 5月11~13日,备受关注的2016年亚洲消费电子产品展览会(CESA 2016)在上海新国际博览中心举办。康得新凭借独创的"超低电阻高透ITO膜"技术,获得CESA 2016"最佳制造商技术奖"。作为美国国际消费电子产品展览会(CES)的亚洲姊妹版,CESA是全球顶尖消费电子科技产品的盛会。 展开更多
关键词 消费电子产品 低电阻 cesa 2016 独创技术 智能显示 领导者地位 电磁脉冲 中国力量 屏蔽膜 其在
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腰麻液中配麻黄素行CESA在剖宫产术中的应用
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作者 杜玉玲 《齐齐哈尔医学院学报》 2007年第8期948-948,共1页
关键词 剖宫产术中 cesa 硬膜外麻醉阻滞 麻黄素 腰麻 腰硬联合麻醉 血压下降 产科病人
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椰子CESA基因家族鉴定及生物信息学分析
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作者 孙熹微 杨耀东 +2 位作者 弓淑芳 王永 肖勇 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第13期4212-4221,共10页
中国加工椰糠与椰壳纤维所需的椰衣、椰壳主要从国外进口,国内原材料供给不足,市场潜力巨大,因此培育椰子高品质深加工新品种具有重要意义。本研究利用已发表的椰子基因组数据,共鉴定出10个椰子CESA基因家族成员并对其进行了基因结构分... 中国加工椰糠与椰壳纤维所需的椰衣、椰壳主要从国外进口,国内原材料供给不足,市场潜力巨大,因此培育椰子高品质深加工新品种具有重要意义。本研究利用已发表的椰子基因组数据,共鉴定出10个椰子CESA基因家族成员并对其进行了基因结构分析、蛋白理化性质分析、亚细胞定位预测、蛋白质保守结构域预测、超二级结构预测分析、三级结构同源建模、蛋白跨膜螺旋预测、系统进化树构建及表达谱分析。蛋白理化性质与亚细胞定位分析显示,椰子CESA成员蛋白多为酸性蛋白,且主要定位于细胞质膜上。进化分析显示,椰子CESA基因家族成员可分为5组,组内基因同源性较高,组间差异较小,所有家族成员均含有N端锌指结构域和纤维素合酶结构域,基因结构相似。聚类及表达谱分析显示,CoCESA3、CoCESA4、CoCESA6、CoCESA8与已报道的拟南芥、水稻初生细胞壁合成相关CESA基因聚类在一起,并在成熟叶片、幼叶、胚、胚乳和愈伤组织中都有较高的表达量,其可能参与了初生细胞壁合成且在整个植物生长发育过程中发挥作用。本研究鉴定了10个椰子CESA基因家族成员并对其进行了生物信息学分析,为椰子CESA基因家族功能的进一步研究提供基础,并为高质量深加工椰子新品种的分子育种提供候选基因。 展开更多
关键词 椰子(Cocos nucifera L.) cesa基因家族 生物信息学
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珙桐种子败育相关基因CesA的克隆及表达分析 被引量:9
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作者 熊亚丽 曹福祥 +2 位作者 刘志明 董旭杰 李萌 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1481-1490,共10页
严重的种子败育是影响珙桐自然繁殖的重要原因之一,调控种子败育的分子机制及关键基因目前尚不清楚。根据本研究小组前期获得的珙桐种子转录组数据,筛选到22个转录本,分属14个纤维素合酶Ces A编码基因,所有转录本在败育种子中均呈现上... 严重的种子败育是影响珙桐自然繁殖的重要原因之一,调控种子败育的分子机制及关键基因目前尚不清楚。根据本研究小组前期获得的珙桐种子转录组数据,筛选到22个转录本,分属14个纤维素合酶Ces A编码基因,所有转录本在败育种子中均呈现上调表达趋势。分析珙桐种子中的纤维素含量发现,正常种子在发育过程中纤维素含量持续升高,而在败育种子中纤维素含量显著高于正常种子。挑选4个在败育种子中显著上调的Ces A基因进行q PCR分析,结果表明它们表达模式相似,在败育种子中表达量均显著高于正常种子,且在正常种子发育后期上调表达。挑选其中表达差异最显著的c43681.graph_c0进行克隆获得882 bp片段。经序列比对,其编码产物包含292个氨基酸,与拟南芥纤维素合酶Ces A4同源性最高。分析c43681.graph_c0在珙桐不同组织中的表达量发现,该基因在茎中表达量较低,而在果肉中表达量较高,在败育种子中表达量显著高于其它组织。本研究筛选到的c43681.graph_c0可能是一个在珙桐生殖器官中调控纤维素合成的关键基因。 展开更多
关键词 珙桐 cesa基因 种子败育 发育 表达模式
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