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Multiple fault diagnosis of down-hole conditions of sucker-rod pumping wells based on Freeman chain code and DCA 被引量:13
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作者 LI Kun GAO Xian-wen +2 位作者 YANG Wei-bing DAI Ying-long TIAN Zhong-da 《Petroleum Science》 SCIE CAS CSCD 2013年第3期347-360,共14页
It is important to achieve continuous, stable and efficient pumping well operation in actual oilfield operation. Down-hole pumping well working conditions can be monitored in real-time and a reasonable production sche... It is important to achieve continuous, stable and efficient pumping well operation in actual oilfield operation. Down-hole pumping well working conditions can be monitored in real-time and a reasonable production scheme can be designed when computer diagnosis is used. However, it is difficult to make a comprehensive analysis to supply efficient technical guidance for operation of the pumping well with multiple faults of down-hole conditions, which cannot be effectively dealt with by the common methods. To solve this problem, a method based on designated component analysis (DCA) is used in this paper. Freeman chain code is used to represent the down-hole dynamometer card whose important characteristics are extracted to construct a designated mode set. A control chart is used as a basis for fault detection. The upper and lower control lines on the control chart are determined from standard samples in normal working conditions. In an incompletely orthogonal mode, the designated mode set could be divided into some subsets in which the modes are completely orthogonal. The observed data is projected into each designated mode to realize fault detection according to the upper and lower control lines. The examples show that the proposed method can effectively diagnose multiple faults of down-hole conditions. 展开更多
关键词 Sucker-rod pumping wells multiple faults designated component analysis control chart Freeman chain code dynamometer card
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Face Recognition Using Chain Codes
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作者 Nazmeen B. Boodoo-Jahangeer Sunilduth Baichoo 《Journal of Signal and Information Processing》 2013年第3期154-157,共4页
Face recognition is an active area of biometrics. This study investigates the use of Chain Codes as features for recognition purpose. Firstly a segmentation method, based on skin color model was applied, followed by c... Face recognition is an active area of biometrics. This study investigates the use of Chain Codes as features for recognition purpose. Firstly a segmentation method, based on skin color model was applied, followed by contour detection, then the chain codes of the contours were determined. The first difference of chain codes were calculated since the latter is invariant to rotation. The features were calculated and stored in a matrix. Experiments were performed using the University of Essex Face database, and results show a recognition rate of 95% with this method, when compared with Principal Components Analysis (PCA) giving 87.5% recognition rate. 展开更多
关键词 FACE RECOGNITION BIOMETRICS chain codeS PCA
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REVERSE DESIGN APPROACH FOR MECHANISM TRAJECTORY BASED ON CODE-CHAINS MATCHING 被引量:2
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作者 ZHANG Shuyou YI Guodong XU Xiaofeng 《Chinese Journal of Mechanical Engineering》 SCIE EI CAS CSCD 2007年第3期86-90,共5页
Aiming at the problem of reverse-design of mechanism, a method based on the matching of trajectory code-chains is presented. The motion trajectory of mechanism is described with code-chain, which is normalized to simp... Aiming at the problem of reverse-design of mechanism, a method based on the matching of trajectory code-chains is presented. The motion trajectory of mechanism is described with code-chain, which is normalized to simplify the operation of geometric transformation. The geometric transforma-tion formulas of scale, mirror and rotation for trajectory code-chain are defined, and the reverse de-sign for mechanism trajectory is realized through the analysis and solution of similarity matching between the desired trajectory and the predefined trajectory. The algorithm program and prototype system of reverse design for mechanism trajectory are developed. Application samples show that the method can break the restriction of trajectory patterns in matching, meet the demand of partial match-ing, and overcome the influence of geometric transformation of trajectory on the reverse design for mechanism. 展开更多
关键词 TRAJECTORY code-chain Similarity matching Reverse-design
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Self-Dual Permutation Codes over Finite Chain Rings 被引量:1
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作者 YUAN Yuan ZHANG Huanguo 《Wuhan University Journal of Natural Sciences》 CAS 2007年第6期992-996,共5页
Permutation codes over finite chain rings are introduced; by using the character of the finite chain rings and the knowledge of representation of group, some conditions for existence or non-existence of self-dual perm... Permutation codes over finite chain rings are introduced; by using the character of the finite chain rings and the knowledge of representation of group, some conditions for existence or non-existence of self-dual permutation codes over finite chain rings are obtained. Specially, when the group is a direct product of a 2-group and a T-group, and the group action is transitive, the sufficient and necessary condition of the existence of permutation codes is given. 展开更多
关键词 finite chain ring group code permutation code self-dual code
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缺血性脑卒中患者血清差异基因的筛选及生物信息学研究及验证
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作者 王洋 汪露 李辉 《新疆医科大学学报》 CAS 2024年第6期817-823,共7页
目的研究缺血性脑卒中患者血清差异基因的筛选及生物信息学。方法以2023年3月-2024年3月在新疆医科大学第二附属医院神经内科确诊的80例缺血性脑卒中患者为病例组,选择同期80例健康体检者为对照组。分别挑选两组各10例受试者的外周血清... 目的研究缺血性脑卒中患者血清差异基因的筛选及生物信息学。方法以2023年3月-2024年3月在新疆医科大学第二附属医院神经内科确诊的80例缺血性脑卒中患者为病例组,选择同期80例健康体检者为对照组。分别挑选两组各10例受试者的外周血清采用芯片差异性基因鉴定法筛选缺血性脑卒中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),并采用KEGG通路富集和基因本体论(GO)分析鉴定差异表达基因发挥的生物学功能。挑选2个上调和2个下调的lncR-NAs,在两组患者外周血中采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测表达量,采用受试者工作特征曲线(Receiver operating characteristic,ROC)计算差异性表达lncRNAs诊断缺血性脑卒中的曲线下面积(Area under the curve,AUC)。结果共检测到34个高表达和16个低表达的lncR-NAs。KEGG通道分析显示,差异表达的lncRNAs涉及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、类风湿性关节炎、细胞因子与细胞因子受体相互作用,病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用、癌症的转录失调、沙门氏菌感染、白细胞介素(IL)-17信号通路、趋化因子信号通路。GO分析显示,差异表达的lncRNAs涉及白细胞黏附调控、细胞黏附调节、白细胞与其他细胞黏附、细胞趋化性、T细胞活化、骨髓细胞分化、止血和凝血。qRT-PCR检测显示,与对照组比较,病例组患者A1BG-AS1和BRWD1-AS2表达量升高,BVES-AS1和C10ORF71-AS1表达量降低,差异有统计学意义(P<0.05)。ROC分析显示,A1BG-AS1、BRWD1-AS2、BVES-AS1和C10ORF71-AS1表达量诊断缺血性脑卒中的AUC分别为0.803、0.856、0.897和0.798(P<0.001)。结论缺血性脑卒中患者外周血中A1BG-AS1、BRWD1-AS2、BVES-AS1和C10ORF71-AS1基因差异性表达,可以辅助缺血性脑卒中的疾病诊断。 展开更多
关键词 缺血性脑卒中 微阵列芯片 高通量测序 长链非编码RNA
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血清FGL1、LncSChLAP1对晚期非小细胞肺癌免疫治疗效果及预后评估的价值
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作者 夏宁 周泽军 +2 位作者 方申存 王尊乔 潘宴青 《疑难病杂志》 CAS 2024年第3期346-351,共6页
目的分析血清纤维蛋白样因子1(FGL1)、长链非编码RNA SChLAP1(LncSChLAP1)评估接受免疫治疗的晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者疗效及预后的价值。方法选取2019年4月—2022年12月南京市胸科医院呼吸内科诊治晚期NSCLC患者98例为NSCLC组,均... 目的分析血清纤维蛋白样因子1(FGL1)、长链非编码RNA SChLAP1(LncSChLAP1)评估接受免疫治疗的晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者疗效及预后的价值。方法选取2019年4月—2022年12月南京市胸科医院呼吸内科诊治晚期NSCLC患者98例为NSCLC组,均接受免疫检查点抑制剂治疗,根据疗效分为有效亚组74例和无效亚组24例,以同期医院健康体检者50例为健康对照组。酶联免疫吸附实验检测NSCLC患者血清FGL1水平,实时荧光定量PCR检测血清LncSChLAP1水平;多因素Logistic回归分析影响晚期NSCLC患者化疗疗效的因素;受试者工作特征曲线分析血清FGL1、LncSChLAP1对晚期NSCLC患者免疫治疗疗效的预测价值;Kaplan-Meier曲线分析血清FGL1、LncSChLAP1对晚期NSCLC患者生存预后的影响。结果血清FGL1、LncSChLAP1水平比较,NSCLC组高于健康对照组(t/P=57.365/<0.001、28.443/<0.001)。无效亚组TNM分期Ⅳ期比例、血清FGL1、LncSChLAP1水平高于有效亚组(χ^(2)/P=15.375/<0.001,t/P=35.077/<0.001、35.127/<0.001)。血清FGL1、LncSChLAP1高是影响晚期NSCLC患者免疫治疗疗效的独立危险因素[OR(95%CI)=1.327(1.104~1.596)、1.415(1.094~1.829)];血清FGL1、LncSChLAP1及两项联合的AUC分别为0.856、0.792、0.905,两者联合优于各自单独预测效能(Z/P=4.258/0.007、5.119/<0.001)。FGL1高、低表达组1年总体生存率分别为22.92%(11/48)、60.00%(30/50),LncSChLAP1高、低表达组1年总体生存率分别为27.66%(13/47)、54.90%(28/51),FGL1高表达组、LncSChLAP1高表达组晚期NSCLC患者1年累积生存率分别低于FGL1低表达组、LncSChLAP1低表达组(χ^(2)/P=14.180/<0.001、17.553/<0.001)。结论晚期NSCLC患者血清FGL1、LncSChLAP1升高,是新的评估晚期NSCLC患者免疫治疗疗效及生存预后的血清标志物。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 纤维蛋白样因子1 长链非编码RNA SChLAP1 免疫治疗 疗效 预后
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NEAT1、miR-27a-3p在阿尔茨海默病患者血清和脑脊液中的表达关系
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作者 何丽杰 张春艳 王静 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期207-212,共6页
目的:探究长链非编码RNA核富含丰富的转录本1(long chain non-coding RNA nuclear-enriched abundant transcript 1, LncRNA NEAT1)、miR-27a-3p在阿尔茨海默病(Alzheimer disease, AD)患者血清和脑脊液中的表达关系及意义。方法:选择2... 目的:探究长链非编码RNA核富含丰富的转录本1(long chain non-coding RNA nuclear-enriched abundant transcript 1, LncRNA NEAT1)、miR-27a-3p在阿尔茨海默病(Alzheimer disease, AD)患者血清和脑脊液中的表达关系及意义。方法:选择2019年10月至2021年9月天津市第五中心医院神经内科收治的AD患者66例作为病例组,根据临床痴呆评定量表(clinical dementia rating, CDR)评分分为轻度组(≤1分,n=41)与中重度组(>1分,n=25);另取同期门诊其他就诊患者血清和脑脊液标本66例志愿者作为对照组。收集所有受试者的一般资料并评估认知程度,采用实时荧光定量PCR检测血清和脑脊液miR-27a-3p、NEAT1表达水平,酶联免疫吸附试验检测脑脊液β-淀粉样前体蛋白裂解酶1(β-site amyloid precursor protein cleaving enzyme 1,BACE1)、β淀粉样蛋白(amyloid β,Aβ)40和Aβ42水平,采用Spearman法分析血清miR-27a-3p、NEAT1水平与简易精神状态检测量表的相关性,采用Pearson法分析血清miR-27a-3p、NEAT1水平与Aβ沉积平均标准摄取值比率(standardized uptake value ratio, SUVR)及脑脊液miR-27a-3p、NEAT1、BACE1、Aβ42、Aβ40水平的相关性。结果:MMSE评分[21 (17,25),9(7,11)vs. 27 (21,34)]、MoCA评分[17 (12,21),10 (7,13)vs. 27 (21,31)]、血清miR-27a-3p水平(0.55±0.13,0.46±0.06 vs. 0.97±0.22)、脑脊液miR-27a-3p(0.48±0.10,0.35±0.10 vs. 1.03±0.31)、Aβ42水平[(303.55±36.77) ng/L,(231.45±34.14) ng/L vs.(499.99±53.63) ng/L]及Aβ42/Aβ40比值(0.030±0.008, 0.022±0.007 vs. 0.048±0.010)轻度组、中重度组AD患者均低于对照组(P均<0.05),且中重度组AD患者较轻度组低(P均<0.05);血清NEAT1水平(2.31±0.64,3.13±0.76 vs. 1.05±0.20)、SUVR(1.50±0.29,1.76±0.52 vs. 0.74±0.15)及脑脊液NEAT1(3.51±1.24,4.30±1.65 vs. 1.01±0.23)、BACE1水平[(55.78±5.98)μg/L,(72.32±16.08)μg/L vs.(21.39±3.73)μg/L]轻度组、中重度组AD患者均高于对照组(P均<0.05),且中重度组AD患者较轻度组高(P均<0.05)。AD患者血清NEAT1水平与SUVR及脑脊液NEAT1、BACE1呈正相关(r=0.350,0.606,0.341,P<0.05),与MMSE评分、MoCA评分呈负相关(r=-0.473,-0.482,P均<0.05);血清miR-27a-3p水平与脑脊液miR-27a-3p水平、MMSE评分、MoCA评分呈正相关(r=0.695,0.424,0.412,P<0.05),与SUVR及脑脊液BACE1水平呈负相关(r=-0.521、-0.447,P均<0.05)。结论:NEAT1、miR-27a-3p在AD患者血清及脑脊液中表达趋势具有一致性,NEAT1水平均升高,miR-27a-3p水平均降低,二者水平呈负相关,与AD患者脑中Aβ沉积程度有关,并参与AD的病情进展。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 长链非编码RNA核富含丰富的转录本1 miR-27a-3p Β淀粉样蛋白 相关性
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急性缺血性脑卒中患者血清长链非编码RNA母系表达基因3和Zeste同源物增强子-2表达与神经功能损伤的相关性分析
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作者 李晨曦 白如玉 《心脑血管病防治》 2024年第3期27-31,共5页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)与Zeste同源物增强子-2(EZH2)在急性缺血性脑卒中(AIS)患者血清中的表达水平及其与神经功能损伤之间的关系。方法选取延安市人民医院2021年1月至2022年11月收治的92例AIS患者为脑卒中... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因3(MEG3)与Zeste同源物增强子-2(EZH2)在急性缺血性脑卒中(AIS)患者血清中的表达水平及其与神经功能损伤之间的关系。方法选取延安市人民医院2021年1月至2022年11月收治的92例AIS患者为脑卒中组,92例健康体检者为对照组,根据NIHSS评分将脑卒中组患者分为致残性损伤组19例,非致残性损伤组73例。采用实时荧光定量聚合酶链式反应、酶联免疫吸附法分别检测血清lncRNAMEG3、EZH2水平。采用Spearman相关分析法进行AIS患者血清lncRNAMEG3、EZH2表达水平与美国国立卫生研究院卒中量表(NIHSS)评分之间的相关性分析;采用多因素Logistic回归分析AIS患者合并神经功能致残性损伤的影响因素,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA MEG3、EZH2水平对AIS患者合并神经功能致残性损伤的诊断价值。结果脑卒中组患者血清lncRNA MEG3、EZH2表达水平均高于对照组(t=11.817、11.542,P<0.05)。Spearman相关分析显示,AIS患者血清lncRNA MEG3、EZH2水平与NIHSS评分均呈正相关(r=0.540、0.603,P<0.01)。致残性损伤组体质量指数、吸烟史占比、甘油三酯、总胆固醇、同型半胱氨酸、发病-到院时间(ODT)、lncRNAMEG3、EZH2水平均高于非致残性损伤组(t/χ2=2.103、5.050、9.121、5.585、2.276、5.448、4.638、4.682,P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,甘油三酯、总胆固醇、lncRNA MEG3、EZH2以及ODT均是AIS患者合并神经功能致残性损伤的影响因素(OR=4.853、4.277、2.674、3.052、3.901,P<0.05)。lncRNA MEG3、EZH2联合诊断AIS患者合并神经功能致残性损伤的曲线下面积(AUC)大于lncRNAMEG3以及EZH2单独诊断的AUC(Z=2.626、2.954,P<0.01),敏感度、特异度分别为94.74%、82.15%。结论AIS患者血清lncRNA MEG3、EZH2水平均上升,与AIS患者神经功能损伤程度均正相关,可用作AIS患者合并神经功能致残性损伤的诊断指标,且联合诊断效果更好。 展开更多
关键词 急性缺血性脑卒中 神经功能损伤 长链非编码RNA母系表达基因3 Zeste同源物增强子-2
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长链非编码RNA-P21在过氧化氢诱导的人晶状体上皮细胞损伤中的表达
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作者 董晓鸣 刘雨轩 +2 位作者 纪力旸 王静 张劲松 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期232-239,共8页
目的检测过氧化氢诱导的人晶状体上皮细胞HLE-B3生物活性及长链非编码RNA-p21(lncRNA-p21)的表达变化。方法将HLE-B3细胞分为正常对照组和过氧化氢组,分别用正常培养液和含200μmol/L过氧化氢的培养液培养24 h。采用MTS比色法检测细胞活... 目的检测过氧化氢诱导的人晶状体上皮细胞HLE-B3生物活性及长链非编码RNA-p21(lncRNA-p21)的表达变化。方法将HLE-B3细胞分为正常对照组和过氧化氢组,分别用正常培养液和含200μmol/L过氧化氢的培养液培养24 h。采用MTS比色法检测细胞活力;采用活性氧试剂盒检测细胞活性氧簇(ROS)的水平;采用流式细胞术检测细胞凋亡情况;采用Caspase-3活性试剂盒法检测细胞Caspase-3活性;采用Western Blot方法检测细胞凋亡相关Bax,Bcl-2蛋白表达;采用流式细胞术检测细胞周期分布;采用EDU增殖试剂盒检测细胞增殖能力;采用实时荧光定量PCR法检测细胞中lncRNA-p21的表达;采用荧光原位杂交实验法检测细胞中lncRNA-p21的定位。结果过氧化氢组细胞ROS水平为4.65±0.38,明显高于正常对照组的1.00±0.01,差异具有统计学意义(t=16.66,P<0.05)。与正常对照组相比,过氧化氢组细胞凋亡率显著上升,Caspase-3活性增强,凋亡蛋白Bax相对表达量明显升高,差异均有统计学意义(t=20.69、39.80、12.73,均P<0.05)。与正常对照组相比,过氧化氢组G2期细胞比例明显增多,差异有统计学意义(t=23.10,P<0.05)。过氧化氢组EDU阳性细胞比例为(25.41±6.99)%,明显低于正常对照组的(50.58±9.15)%,差异具有统计学意义(t=6.559,P<0.05)。过氧化氢组lncRNA-p21相对表达量为2.36±0.29,明显高于正常对照组的1.02±0.02,差异具有统计学意义(t=7.893,P<0.05)。荧光原位杂交实验结果显示,lncRNA-p21定位于细胞质中。结论过氧化氢诱导的氧化应激模型中晶状体上皮细胞增殖能力显著降低、凋亡水平显著上升,ROS和lncRNA-p21表达水平升高。lncRNA-p21可能参与晶状体上皮细胞的氧化应激损伤过程。 展开更多
关键词 晶状体上皮细胞 长链非编码RNA-p21 增殖 凋亡 氧化应激
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间充质干细胞对糖尿病肾病小鼠lncRNA的干预及肾脏保护的可能机制
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作者 凡洋 李亚玲 +1 位作者 雷蕾 白彝华 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2024年第7期1625-1632,共8页
目的 筛选糖尿病肾病(DN)小鼠模型中异常表达的长链非编码RNA(lncRNA),探索与间充质干细胞(MSC)干预可能的lncRNA是否对小鼠肾脏起保护作用及可能机制。方法 利用基因表达综合数据库(GEO)来源的转录组测序(RNAseq)数据,对DN小鼠RNAseq... 目的 筛选糖尿病肾病(DN)小鼠模型中异常表达的长链非编码RNA(lncRNA),探索与间充质干细胞(MSC)干预可能的lncRNA是否对小鼠肾脏起保护作用及可能机制。方法 利用基因表达综合数据库(GEO)来源的转录组测序(RNAseq)数据,对DN小鼠RNAseq数据与正常小鼠进行筛选,得到与DN相关的lncRNA并进行验证,得到上调前3名的lncRNA,选取变化最显著的lncRNA进行下一步实验。分离培养小鼠肾小管上皮细胞(mRTECs)及骨髓间充质干细胞(BMSC),分组培养mRTECs[对照组、高糖(HG)组、HG+BMSC组],四甲基偶氮唑蓝(MTT)检测各组mRTECs细胞增殖率,荧光定量PCR法检测各组mRTECs中胶原蛋白(collagen)Ⅰ、α-平滑肌肌动蛋白(SMA)、波形蛋白(vimentin)、E-钙黏蛋白(cadherin) mRNA表达。采用siRNA敲减mRTECs中lncRNA的表达,构建正确的pcDNA3.1(+)质粒扩大培养。分组培养mRTECs(对照组、NC组、lncRNA组;si-NC组、si-lncRNA组、HG组、HG+si-lncRNA组;HG+BMSC组、HG+BMSC+lncRNA组),Western印迹检测各组细胞中collagenⅠ、α-SMA、vimentin、E-cadherin蛋白表达。结果 上调前3位的lncRNA为lncRNA NONMMUG023935、lncRNA NONMMUG030287、lncRNA NONMMUG004302。mRTECS经HG处理后,细胞增殖率、collagenⅠ、α-SMA和vimentin及lncRNA NONMMUG023935、lncRNA NONMMUG030287、lncRNA NONMMUG004302表达显著上升,E-cadherin表达显著下降(P<0.05)。而加入BMSC的mRTECs经HG处理后,上述指标的结果相反(P<0.05)。根据上述3个lncRNA表达变化绝对值最大选取lncRNA NONMMUG023935进行后续实验。转染si-lncRNA-NONMMUG023935后,相对应的lncRNA-NONMMUG023935表达显著降低(P<0.01)。lncRNA NONMMUG023935过表达可促进对mRTECs的损伤(P<0.05),BMSC可通过下调lncRNA NONMMUG023935表达从而抑制对HG诱导的mRTECs的损伤(P<0.05)。结论 MSC可下调DN肾小管上皮细胞中lncRNA NONMMUG023935的表达,从而改善肾脏纤维化,这可能是MSC延缓DN进展的机制之一。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 间充质干细胞 长链非编码RNA 上皮-间充质转化
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生物信息学方法筛选结肠癌相关lncRNA-miRNA网络及其细胞水平的功能验证
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作者 潘希望 邱模竞 +4 位作者 郑林林 杨新博 徐晨 李太原 胡家萍 《南昌大学学报(医学版)》 2024年第1期6-13,共8页
目的筛选结肠癌差异表达的lncRNA和miRNA,探讨其与结肠癌预后的关系及相关生物学功能。方法从TCGA数据库收集结肠癌患者的lncRNA和miRNA表达谱数据及临床资料,利用R软件筛选差异表达的lncRNA和miRNA;单因素Cox回归分析与预后显著相关的... 目的筛选结肠癌差异表达的lncRNA和miRNA,探讨其与结肠癌预后的关系及相关生物学功能。方法从TCGA数据库收集结肠癌患者的lncRNA和miRNA表达谱数据及临床资料,利用R软件筛选差异表达的lncRNA和miRNA;单因素Cox回归分析与预后显著相关的差异表达lncRNA和miRNA;miRNet数据库构建预后相关的lncRNA-miRNA网络,利用mirPath v.3软件对其进行功能富集分析;R软件构建预后风险模型并对其进行验证。采用CCK-8实验、划痕实验、流式细胞术及qPCR评估敲减TSPEAR-AS2对人结肠癌HCT116细胞增殖、迁移、凋亡及下游miRNA表达的影响。结果筛选出结肠癌组织中1823个差异表达的lncRNA和524个差异表达的miRNA;发现158个lncRNA和31个miRNA与结肠癌的预后相关;构建由8个lncRNA和14个miRNA组成的lncRNA-miRNA网络;GO和KEGG富集分析显示,lncRNA-miRNA网络主要参与肿瘤相关的生物学功能及通路;鉴定出11个能有效评价结肠癌预后特征的关键基因,由这11个关键基因构建的预后风险模型中高风险组生存时间显著短于低风险组(P<0.001),预测1、3和5年生存的AUC分别为0.70、0.74和0.71。敲减TSPEAR-AS2可抑制HCT116细胞增殖、迁移、促进细胞凋亡,并下调hsa-mir-4731-5p和hsa-mir-342-3p的表达。结论成功筛选结肠癌相关lncRNA-miRNA网络,并由此构建的预后风险模型具有良好的预测效能。TSPEAR-AS2参与调控结肠癌细胞的增殖、迁移、凋亡以及下游miRNA表达。 展开更多
关键词 结肠癌 长链非编码RNA 微小RNA 生物信息学 预后模型 TSPEAR-AS2
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从LncRNA探讨糖尿病及并发症发病机制与中医药干预研究进展
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作者 周吉 周伟秀 +3 位作者 祝然然 王子晨(综述) 阴永辉 王海燕(审校) 《疑难病杂志》 CAS 2024年第3期375-379,共5页
糖尿病是临床常见的慢性代谢性疾病,长链非编码RNA(LncRNA)在糖尿病及其并发症发生发展中发挥了重要作用,是目前研究的热点机制之一。文章对多种LncRNA通过介导炎性反应、氧化应激、自噬、纤维化、内质网应激、细胞增殖及凋亡、铁死亡... 糖尿病是临床常见的慢性代谢性疾病,长链非编码RNA(LncRNA)在糖尿病及其并发症发生发展中发挥了重要作用,是目前研究的热点机制之一。文章对多种LncRNA通过介导炎性反应、氧化应激、自噬、纤维化、内质网应激、细胞增殖及凋亡、铁死亡等病理过程影响糖尿病及其并发症进展进行综述,总结目前单味中药及中成药通过调控LncRNA改善糖尿病及其并发症的研究进展,以期为中药新药研发提供新的作用靶点,为糖尿病及并发症防治提供思路。 展开更多
关键词 糖尿病 糖尿病并发症 长链非编码RNA 中医药 机制 研究进展
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LncRNA HAGLR靶向miR-625-5p对脂多糖诱导的视网膜色素上皮细胞凋亡和炎症因子表达的影响
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作者 李晶 曾卫娟 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2024年第3期178-182,共5页
目的 探讨长链非编码RNA HAGLR(LncRNA HAGLR)是否可通过靶向调控微小RNA-625-5p(miR-625-5p)表达而影响脂多糖(LPS)诱导的视网膜色素上皮(RPE)细胞凋亡、炎症因子表达,为揭示视网膜病变机制奠定实验基础。方法 将LPS诱导人视网膜色素... 目的 探讨长链非编码RNA HAGLR(LncRNA HAGLR)是否可通过靶向调控微小RNA-625-5p(miR-625-5p)表达而影响脂多糖(LPS)诱导的视网膜色素上皮(RPE)细胞凋亡、炎症因子表达,为揭示视网膜病变机制奠定实验基础。方法 将LPS诱导人视网膜色素上皮细胞(ARPE-19)设为LPS组,正常培养的ARPE-19细胞设为Con组。实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测LncRNA HAGLR、miR-625-5p表达水平。根据转染物不同分为LPS+sh-NC组、LPS+sh-HAGLR组、LPS+miR-NC组、LPS+miR-625-5p组、LPS+sh-HAGLR+anti-miR-NC组、LPS+sh-HAGLR+anti-miR-625-5p组。采用流式细胞术检测细胞凋亡率;ELISA法检测白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)水平;验证LncRNA HAGLR、miR-625-5p靶向关系;Western blot检测活化的半胱氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶3(cleaved-Caspase 3)、cleaved-Caspase 9蛋白水平。结果 与Con组比较,LPS组LncRNA HAGLR表达水平升高,miR-625-5p表达水平降低(均为P<0.05),细胞凋亡率,cleaved-Caspase 3、cleaved-Caspase 9蛋白水平,IL-6、IL-1β水平均升高(均为P<0.05)。与LPS+sh-NC组比较,LPS+sh-HAGLR组细胞凋亡率,cleaved-Caspase 3、cleaved-Caspase 9蛋白水平,IL-6、IL-1β水平均降低(均为P<0.05);LncRNA HAGLR可负向调控miR-625-5p表达水平(P<0.05)。与LPS+miR-NC组比较,LPS+miR-625-5p组miR-625-5p表达水平升高,细胞凋亡率,cleaved-Caspase 3、cleaved-Caspase 9蛋白水平,IL-6、IL-1β水平均降低(均为P<0.05)。与LPS+sh-HAGLR+anti-miR-NC组比较,LPS+sh-HAGLR+anti-miR-625-5p组miR-625-5p表达水平降低,细胞凋亡率,cleaved-Caspase 3、cleaved-Caspase 9蛋白水平,IL-6、IL-1β水平均升高(均为P<0.05)。结论 干扰LncRNA HAGLR表达可通过靶向调控miR-625-5p表达抑制细胞凋亡、炎症因子表达,以减轻LPS诱导的ARPE-19细胞损伤。 展开更多
关键词 长链非编码RNA HAGLR 微小RNA-625-5p 脂多糖 视网膜色素上皮细胞 细胞凋亡 炎症
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缺氧缺血性脑病新生儿血清长链非编码RNA H19和神经轴突导向因子1水平变化及临床意义
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作者 张冉 袁迅玲 李佳强 《中国医药》 2024年第4期535-539,共5页
目的 探究缺氧缺血性脑病(HIE)新生儿血清长链非编码RNA H19(lncRNA H19)、神经轴突导向因子1(NT-1)水平及临床意义。方法 选取2019年2月至2021年2月哈尔滨医科大学附属第一医院收治的102例HIE患儿(HIE组)。根据HIE严重程度,分为轻度组... 目的 探究缺氧缺血性脑病(HIE)新生儿血清长链非编码RNA H19(lncRNA H19)、神经轴突导向因子1(NT-1)水平及临床意义。方法 选取2019年2月至2021年2月哈尔滨医科大学附属第一医院收治的102例HIE患儿(HIE组)。根据HIE严重程度,分为轻度组(30例)、中度组(41例)和重度组(31例)。根据HIE患儿预后情况,分为预后良好组(76例)和预后不良组(26例)。以同期新生儿外科手术治疗的脐茸、脐尿管瘘患儿作为对照组,共60例。检测新生儿血清lncRNA H19、NT-1水平。采用多因素Logistic回归模型分析影响HIE患儿预后的因素;受试者工作特征(ROC)曲线分析各指标对HIE患儿预后的评估价值。结果 HIE组血清lncRNA H19、NT-1水平均低于对照组[(1.17±0.24)比(2.35±0.53)、(312±71)ng/L比(514±61)ng/L](均P<0.001)。轻度组、中度组及重度组血清lncRNA H19、NT-1水平均呈依次降低趋势(均P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,血清lncRNA H19、NT-1是HIE患儿不良预后的危险因素(均P<0.001)。ROC曲线分析结果显示,lncRNA H19、NT-1联合检测的曲线下面积大于lncRNA H19、NT-1单独检测(Z=4.912,4.763,均P<0.001)。结论 HIE患儿血清lncRNA H19、NT-1水平降低,与HIE病情程度有关,二者联合对HIE患儿不良预后具有较高的预测价值。 展开更多
关键词 缺氧缺血性脑病 新生儿 长链非编码RNA H19 神经轴突导向因子1
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长链非编码RNA IGF2BP2-AS1通过调控miR-375表达对喉癌细胞迁移及增殖的影响
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作者 王挺 张杨 +2 位作者 郭洁 范崇盛 刘亚芳 《国际医药卫生导报》 2024年第6期968-973,共6页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(IGF2BP2)-AS1通过调控微RNA-375(miR-375)表达对喉癌细胞迁移和增殖的影响。方法研究时间为2022年1月至2023年11月,研究地点为郑州大学附属洛阳中心医院中心实验室,研究... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(IGF2BP2)-AS1通过调控微RNA-375(miR-375)表达对喉癌细胞迁移和增殖的影响。方法研究时间为2022年1月至2023年11月,研究地点为郑州大学附属洛阳中心医院中心实验室,研究类型为基础研究。实时荧光定量PCR(qPCR)检测喉癌细胞系AMC-NH-8、TU159、TU138、TU686和支气管上皮细胞系16HBE中IGF2BP2-AS1的表达。以TU686细胞为研究对象,将TU686细胞分为si-NC组和si-IGF2BP2-AS1组,采用IGF2BP2-AS1小干扰RNA下调IGF2BP2-AS1表达水平。划痕愈合实验和CCK-8法分析敲降IGF2BP2-AS1对TU686细胞迁移及增殖的影响。双荧光素酶报告基因实验验证IGF2BP2-AS1与miR-375的靶向关系。qPCR检测敲降IGF2BP2-AS1对miR-375表达的影响。Western blotting检测细胞中迁移蛋白N-钙黏着蛋白(N-Cadherin)、叉头框蛋白C2(FOXC2)和增殖蛋白CDK2、细胞周期蛋白A(Cyclin A)的表达。统计学方法采用单因素方差分析、t检验。结果与16HBE细胞相比,IGF2BP2-AS1在喉癌细胞系中均高表达(F=37.42,P<0.01)。si-IGF2BP2-AS1组TU686细胞划痕愈合率低于si-NC组[(28.16±6.13)%比(65.08±3.82)%],差异有统计学意义(t=5.11,P<0.01)。在铺板后第2、3、4、5天,si-IGF2BP2-AS1组TU686细胞增殖能力均低于si-NC组(t=3.83、3.17、3.02、6.31,均P<0.01)。IGF2BP2-AS1-Wt中,miR-375组相对荧光素酶活性低于miR-NC组(t=8.95,P<0.01)。si-IGF2BP2-AS1组TU686细胞中miR-375表达高于si-NC组[(4.95±0.49)比(1.02±0.40)],差异有统计学意义(t=6.23,P<0.01)。敲降IGF2BP2-AS1后TU686细胞中迁移蛋白N-Cadherin、FOXC2表达与增殖蛋白CDK2、Cyclin A表达均低于si-NC组。结论IGF2BP2-AS1在喉癌细胞系中呈高表达,敲降IGF2BP2-AS1通过调控miR-375表达抑制喉癌TU686细胞的迁移及增殖能力。 展开更多
关键词 喉癌 长链非编码RNA IGF2BP2-AS1 miR-375 迁移 增殖
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LncRNA MIAT、LASP1蛋白在甲状腺癌组织中的表达及与预后的相关性
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作者 何倩影 刘洋 李红强 《实用癌症杂志》 2024年第2期216-218,232,共4页
目的探讨长链非编码RNA心肌梗死相关转录本(LncRNA MIAT)、LIM和SH3蛋白1(LASP1)蛋白在甲状腺癌组织内的表达水平及与预后的关系。方法选取63例甲状腺癌患者,收集其癌组织、癌旁正常组织,测定LncRNA MIAT、LASP1蛋白表达水平,并进行对... 目的探讨长链非编码RNA心肌梗死相关转录本(LncRNA MIAT)、LIM和SH3蛋白1(LASP1)蛋白在甲状腺癌组织内的表达水平及与预后的关系。方法选取63例甲状腺癌患者,收集其癌组织、癌旁正常组织,测定LncRNA MIAT、LASP1蛋白表达水平,并进行对比分析;同时分析LncRNA MIAT、LASP1蛋白表达与甲状腺癌患者临床病理特征的关系;另随访3年,分析LncRNA MIAT、LASP1蛋白表达与甲状腺癌患者预后的关系。结果癌组织LncRNA MIAT相对表达量与LASP1蛋白阳性表达率均高于癌旁正常组织,有统计学差异(P<0.05)。LncRNA MIAT、LASP1蛋白表达与甲状腺癌患者的淋巴结转移、临床分期有关,有统计学差异(P<0.05);LncRNA MIAT高表达、LASP1蛋白阳性表达患者的3年生存率低于LncRNA MIAT低表达、LASP1蛋白阴性表达患者,有统计学差异(P<0.05)。结论LncRNA MIAT、LASP1蛋白在甲状腺癌组织中表现为高水平,其表达水平与患者临床分期、淋巴结转移有关,且表达水平越高,患者预后越差。 展开更多
关键词 甲状腺癌 长链非编码RNA心肌梗死相关转录本 LIM和SH3蛋白1 预后 生存率 临床分期
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血清IGF-1、lncRNA TCL6在重度子痫前期孕妇中的表达及其对不良妊娠结局的预测价值
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作者 张英杰 李亚光 周巾 《检验医学与临床》 CAS 2024年第10期1381-1386,共6页
目的探讨血清胰岛素样生长因子-1(IGF-1)、长链非编码RNA T细胞白血病/淋巴瘤基因6(lncRNA TCL6)在重度子痫前期(SPE)孕妇中的表达及对不良妊娠结局的预测价值。方法选取2021年1月至2023年1月该院收治的124例SPE患者为SPE组,另选取同期... 目的探讨血清胰岛素样生长因子-1(IGF-1)、长链非编码RNA T细胞白血病/淋巴瘤基因6(lncRNA TCL6)在重度子痫前期(SPE)孕妇中的表达及对不良妊娠结局的预测价值。方法选取2021年1月至2023年1月该院收治的124例SPE患者为SPE组,另选取同期100例健康孕妇为对照组,根据是否发生不良妊娠结局将SPE患者分为结局不良亚组47例和结局良好亚组77例。采用酶联免疫吸附试验与实时荧光定量聚合酶链反应分别检测血清IGF-1和lncRNA TCL6水平。采用多因素Logistic回归分析SPE孕妇不良妊娠结局的影响因素,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清IGF-1、lncRNA TCL6水平对SPE孕妇不良妊娠结局的预测价值。结果与对照组比较,SPE组血清IGF-1水平降低,lncRNA TCL6水平升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。与结局良好亚组比较,结局不良亚组血清IGF-1水平降低,24 h尿蛋白定量及lncRNA TCL6水平升高,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,24 h尿蛋白定量升高(OR=1.155,95%CI:1.031~1.294)和lncRNA TCL6(OR=1.206,95%CI:1.110~1.310)水平升高为SPE孕妇不良妊娠结局的独立危险因素(P<0.05),IGF-1(OR=0.922,95%CI:0.883~0.964)水平升高为SPE孕妇不良妊娠结局独立保护因素(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,血清IGF-1、lncRNA TCL6水平联合检测预测SPE孕妇不良妊娠结局的曲线下面积为0.888(95%CI:0.819~0.937),大于血清IGF-1、lncRNA TCL6水平单独预测的AUC[0.813(95%CI:0.733~0.878)、0.803(95%CI:0.722~0.869)],差异有统计学意义(P<0.05)。结论血清IGF-1和lncRNA TCL6在SPE孕妇不良妊娠结局预测中具有潜在价值,二者联合检测对SPE孕妇不良妊娠结局的预测价值较高。 展开更多
关键词 重度子痫前期 胰岛素样生长因子-1 长链非编码RNA T细胞白血病/淋巴瘤基因6 不良妊娠结局 危险因素
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重型颅脑损伤病人血清微小RNA-542-3p、长链非编码RNA牛磺酸上调基因1表达及其与预后的关系
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作者 秦飞 李帆 《临床外科杂志》 2024年第5期472-475,共4页
目的探讨微小RNA-542-3p(miR-542-3p)、长链非编码RNA牛磺酸上调基因1(lncRNA TUG1)在重型颅脑损伤(STBI)病人血清中的表达及与病人预后的关系。方法2020年1月~2022年7月收治的128例STBI病人为重型组,130例轻、中型TBI病人为对照组,检... 目的探讨微小RNA-542-3p(miR-542-3p)、长链非编码RNA牛磺酸上调基因1(lncRNA TUG1)在重型颅脑损伤(STBI)病人血清中的表达及与病人预后的关系。方法2020年1月~2022年7月收治的128例STBI病人为重型组,130例轻、中型TBI病人为对照组,检测病人血清miR-542-3p、lncRNA TUG1表达量,采用Pearson法分析二者相关性。Logistic回归分析血清miR-542-3p、lncRNA TUG1对STBI病人预后不良的影响,并以受试者工作特征(ROC)曲线分析二者对STBI病人预后的预测效能。结果重型组病人血清miR-542-3p与lncRNA TUG1表达量分别低于和高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。STBI病人血清miR-542-3p与lncRNA TUG1表达量呈负相关(r=-0.595,P<0.001)。预后不良组血清lncRNA TUG1与miR-542-3p水平分别高于和低于预后良好组,差异有统计学意义(P<0.05)。高lncRNA TUG1水平是STBI病人预后不良的危险因素(P<0.05),高miR-542-3p水平是保护因素(P<0.05)。血清miR-542-3p、lncRNA TUG1联合预测STBI病人预后的曲线下面积(AUC)(0.939)高于单独预测的AUC(Z=2.410,P=0.016;Z=3.339,P<0.001)。结论STBI病人血清miR-542-3p表达下调,lncRNA TUG1表达上调,二者均可用于STBI病人预后预测,且二者联合的预测价值更高。 展开更多
关键词 重型颅脑损伤 微小RNA-542-3p 长链非编码RNA牛磺酸上调基因1 预后
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血清lncRNA ANRIL、miR-423-5p与支气管哮喘患儿气道炎症、重塑的关系及其预测价值分析
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作者 张陆强 王丽雅 樊利春 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第3期308-313,共6页
目的分析血清长链非编码RNA(lncRNA)ANRIL、微小RNA(miR)-423-5p与支气管哮喘患儿气道炎症、重塑的关系及其预测价值。方法选取2020年6月至2022年12月海口市妇幼保健院收治的98例支气管哮喘患儿,其中46例急性发作期患儿作为发作期组,52... 目的分析血清长链非编码RNA(lncRNA)ANRIL、微小RNA(miR)-423-5p与支气管哮喘患儿气道炎症、重塑的关系及其预测价值。方法选取2020年6月至2022年12月海口市妇幼保健院收治的98例支气管哮喘患儿,其中46例急性发作期患儿作为发作期组,52例临床缓解期患儿作为缓解期组;另选取同期于该院体检健康的50例儿童作为健康组。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测血清lncRNA ANRIL、miR-423-5p相对表达量。采用酶联免疫吸附试验法检测血清炎症因子指标[白细胞介素13(IL-13)、转化生长因子-β1(TGF-β1)、血管内皮生长因子(VEGF)];测量气道重塑指标[支气管厚度(T/D)、管壁面积/支气管道总横截面积(WA)]与肺功能指标[第一秒用力呼气量(FEV 1)、最高呼吸气流(PEF)、最大呼气中期流量(MMEF)];采用Pearson法分析血清lncRNA ANRIL、miR-423-5p表达与气道炎症、重塑指标的相关性;受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA ANRIL、miR-423-5p诊断支气管哮喘的预测价值。结果缓解期组与发作期组血清lncRNA ANRIL相对表达量高于健康组,血清miR-423-5p相对表达量低于健康组,差异有统计学意义(P<0.05);发作期组血清lncRNA ANRIL相对表达量高于缓解期组,血清miR-423-5p相对表达量低于缓解期组,差异有统计学意义(P<0.05)。发作期组与缓解期组血清VEGF、IL-13、TGF-β1水平高于健康组,差异有统计学意义(P<0.05);发作期组血清VEGF、IL-13、TGF-β1水平高于缓解期组,差异有统计学意义(P<0.05)。缓解期组与发作期组T/D、WA高于健康组,FEV 1、PEF、MMEF水平低于健康组,差异有统计学意义(P<0.05);发作期组T/D、WA高于缓解期组,FEV 1、PEF、MMEF水平低于缓解期组,差异有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,血清lncRNA ANRIL表达与气道炎症、重塑指标呈正相关,与肺功能指标呈负相关(P<0.05);miR-423-5p表达与气道炎症、重塑指标呈负相关,与肺功能指标呈正相关(P<0.05)。ROC曲线分析显示,lncRNA ANRIL、miR-423-5p单独及联合检测的曲线下面积分别为0.772、0.707、0.865,其中联合检测诊断支气管哮喘的预测价值较高。结论血清lncRNA ANRIL相对表达量在支气管哮喘患儿中上升、miR-423-5p下降,促进气道炎症、重塑,肺功能下降,对支气管哮喘患儿具有较高的诊断效能。 展开更多
关键词 支气管哮喘 长链非编码RNA ANRIL 微小RNA-423-5p 气道炎症 气道重塑
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长链非编码LncHECW1-IT1对滑膜间充质干细胞成软骨分化的调控机制
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作者 王彬 范世珍 +2 位作者 郭艳玲 赵硕 林松青 《中国实验诊断学》 2024年第2期191-200,共10页
目的 本文旨在探讨长链非编码RNAHECW1-IT1对滑膜间充质干细胞(SMSCs)成软骨分化的调控机制。方法 选取广州中医药大学深圳医院骨伤科关节镜手术或是关节置换手术患者的膝关节内滑膜,分离培养及诱导软骨分化,利用各种实验室方法,检测滑... 目的 本文旨在探讨长链非编码RNAHECW1-IT1对滑膜间充质干细胞(SMSCs)成软骨分化的调控机制。方法 选取广州中医药大学深圳医院骨伤科关节镜手术或是关节置换手术患者的膝关节内滑膜,分离培养及诱导软骨分化,利用各种实验室方法,检测滑膜间充质干细胞成软骨分化的情况及分化过程中信号通路的表达。结果 从供体的滑膜组织中分离出SMSCs,并通过流式细胞术、RT-qPCR和WB鉴定出SMSCs;通过阿利新蓝染色分析了SMSCs的高软骨分化能力;采用高通量RNA测序技术分析了软骨分化诱导后lncRNA和mRNA的不同表达水平,最终共发现121个lncRNA和2539个mRNA,对所有DEmRNAs进行了GO富集和KEGG通路分析,我们发现MAPK和Wnt信号通路在软骨分化过程中显著富集。通过构建竞争的内源性RNA网络,鉴定发现LncHECW1-IT1和ATF2在SMSCs软骨分化中的重要作用,是治疗及干预骨关节炎的调节因子和重要靶点。结论 LncHECW1-IT1通过上调ATF2的表达来促进人SMSCs的软骨生成分化,LncHECW1-IT1-ATF2轴是调控SMSCs成软骨分化的新机制。 展开更多
关键词 骨关节炎 长链非编码RNAHECW1-IT1 软骨细胞分化 滑膜间充质干细胞 ATF2
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