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C12ORF66对MYCN扩增的高危神经母细胞瘤细胞的活性调控
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作者 贾安娜 战世佳 +4 位作者 张璇 郭金鑫 于永波 郭永丽 常艳 《基础医学与临床》 2024年第3期288-294,共7页
目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-... 目的探究12号染色体开放阅读框66(C12ORF66)对MYCN扩增神经母细胞瘤(NB)细胞系活性的调控效应。方法通过R2数据库GSE16476和GSE49710数据集,分析MYCN扩增和MYCN非扩增NB细胞中C12ORF66表达量,以及C12ORF66表达量与患儿预后的相关性。RT-qRCR检测正常组织永生化细胞系、MYCN扩增及MYCN非扩增细胞系中C12ORF66 mRNA表达差异。构建瞬时敲低和稳定敲低C12ORF66的MYCN扩增细胞株,对照组和敲低组细胞进行实时无标记动态细胞分析(RTCA)、集落形成能力检测及Ki67免疫荧光染色。结果R2数据库分析显示MYCN扩增NB患儿样本中C12ORF66表达显著高于MYCN非扩增NB患儿样本,并且C12ORF66表达与患儿预后负相关(P<0.05)。细胞实验表明,与MYCN非扩增细胞系CHLA-255和SH-SY5Y相比,C12ORF66在MYCN扩增细胞系BE(2)-C和SK-N-BE(2)中表达显著升高(P<0.001)。瞬时或稳定敲低C12ORF66,MYCN扩增NB细胞增殖显著减缓(P<0.001),集落形成能力显著降低(P<0.001),Ki67阳性细胞比例显著减少(P<0.05)。结论C12ORF66在MYCN扩增NB患儿样本和细胞系中高表达,且与患儿预后负相关,敲低C12ORF66显著抑制NB细胞活性。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框66 SK-N-BE(2)细胞 MYCN扩增 细胞增殖
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钙黏蛋白家族成员3及11号染色体开放阅读框30基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效的研究
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作者 吴彩云 凌娟 王晓丽 《安徽医药》 CAS 2024年第6期1226-1231,共6页
目的探讨钙黏蛋白家族成员3(CDHR3)及11号染色体开放阅读框30(C11orf30,EMSY)基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效。方法前瞻性选取2020年5月至2021年10月于泰州市第二人民医院就诊的支气管哮喘病儿132例作为易感组。均... 目的探讨钙黏蛋白家族成员3(CDHR3)及11号染色体开放阅读框30(C11orf30,EMSY)基因多态性与支气管哮喘病儿易感性及糖皮质激素疗效。方法前瞻性选取2020年5月至2021年10月于泰州市第二人民医院就诊的支气管哮喘病儿132例作为易感组。均接受糖皮质激素吸入治疗,并根据疗效分为疗效良好组和疗效不良组。选取同期体检的48例儿童作为对照组,采用倾向性匹配方法对易感组和对照组性别、年龄等基线资料进行匹配;采用PCR检测CDHR3及EMSY基因的单核苷酸多态性,计算其基因型频率和等位基因频率,基因位点的多态性与儿童支气管哮喘易感风险间的关系采用多因素logistic回归分析。对比疗效良好组和疗效不良组不同基因型分布。结果易感组和对照组经倾向性评分匹配后有36组配对成功(每组36例),匹配后基线资料对比差异无统计学意义(P>0.05)。匹配后易感组和对照组CDHR3基因rs6967330位点、EMSY基因rs12278256位点基因型频率及A等位基因频率比较差异有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析显示:EMSY基因rs12278256位点AA基因型[OR=9.91,95%CI:(1.02,96.65)]、CDHR3基因rs6967330位点AA基因型[OR=10.09,95%CI:(1.08,94.02)]是支气管哮喘易感的危险因素(均P<0.05)。治疗12周后,24例(66.67%)为疗效良好组,其余12例(33.33%)归为疗效不佳组,两组CDHR3基因rs6967330位点基因型分布对比差异无统计学意义(P>0.05);两组EMSY基因rs12278256位点基因型分布对比差异有统计学意义(P<0.05),其中疗效良好组AA基因型分布频率[37.50%(9/24)]明显高于疗效不良组[0(0/12)](P<0.05)。结论CDHR3基因rs3847076位点以及EMSY基因rs12278256位点与儿童支气管哮喘易感有关,EMSY基因rs12278256位点与糖皮质激素治疗疗效相关。 展开更多
关键词 哮喘 钙黏蛋白家族成员3 11号染色体开放阅读框30 基因多态性 糖皮质激素 倾向性评分匹配
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基于生物信息数据分析C12ORF49在乳腺癌中的表达及其意义
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作者 马强 李慧娟 吕运成 《华夏医学》 CAS 2024年第2期103-110,共8页
目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同... 目的通过在线数据库分析12号染色体开放阅读框49(C12ORF49)在乳腺癌中的表达情况、临床意义及互作蛋白功能,为乳腺癌防治和预后预测提供新思路。方法使用Oncomine数据库及人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析C12ORF49基因和蛋白在乳腺癌不同组织中的表达差异性,然后应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析C12ORF49表达水平与不同病理特征乳腺癌患者预后的相关性,最后利用STRING数据库绘制C12ORF49互相作用蛋白网络图,并通过KOBAS生物分析平台进行KEGG功能富集分析。结果乳腺癌中C12ORF49的表达高于正常组织,乳腺癌C12ORF49 mRNA高表达患者的总生存时间(OS)及无远处转移生存时间(DMFS)更短,差异有统计学意义(P<0.05);C12ORF49可预测luminal B型乳腺癌患者的不良DMFS预后(P<0.05);C12ORF49对乳腺癌不良DMFS预后的影响可能独立于乳腺癌受体表达状态。C12ORF49可能通过NF-κB信号通路、TCR信号通路、血小板激活等生理过程(P<0.01,Corrected-P<0.01),促进乳腺癌进展。结论C12ORF49在乳腺癌组织中表达上调,其高表达水平对预测乳腺癌患者不良预后有重要意义,需进一步深入研究。 展开更多
关键词 12号染色体开放阅读框49 乳腺癌 生物信息学
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LINE-1 ORF-1p过表达对肝癌细胞株SMMC7721增殖和锚定非依赖性生长的影响 被引量:5
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作者 高旭东 陆荫英 +4 位作者 冯帆 王春平 王鈜 常秀娟 杨永平 《实用肝脏病杂志》 CAS 2011年第5期323-326,共4页
目的研究逆转座子L1编码蛋白ORF-1p的表达对肝癌细胞株SMMC7721细胞增殖的影响。方法利用带Flag标签的L1 ORF1表达载体,转染SMMC7721细胞;采用Western blot法检测反转座子L1 ORF1编码蛋白ORF-1p的表达;采用软琼脂成集落实验和相关报告... 目的研究逆转座子L1编码蛋白ORF-1p的表达对肝癌细胞株SMMC7721细胞增殖的影响。方法利用带Flag标签的L1 ORF1表达载体,转染SMMC7721细胞;采用Western blot法检测反转座子L1 ORF1编码蛋白ORF-1p的表达;采用软琼脂成集落实验和相关报告基因检测ORF-1p表达对肝癌细胞p53、p15和p21活性的影响。结果在SMMC7721细胞中,Flag-ORF-1p表达能够显著促进该细胞的增殖(P<0.05),增强该细胞的锚定非依赖性生长(P<0.05),降低p53、p15和p21报告基因的活性。结论 L1基因编码蛋白ORF-1p能够促进肝癌细胞的生长、浸润以及肿瘤的形成。 展开更多
关键词 肝癌细胞株SMMC7721 逆转座子L1 开放读码框-1p 蛋白质转移吸印技术
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19号染色体开放阅读框5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的关系 被引量:2
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作者 李胜龙 闫炳文 +3 位作者 王春敬 王明宇 乔鹏飞 王夫景 《癌症进展》 2020年第16期1664-1667,共4页
目的探讨19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)蛋白在结直肠癌组织中的表达情况,分析C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的关系。方法收集141例结直肠癌患者的结直肠癌组织和癌旁正常组织,分别采用免疫组织化学染色方法和实时定量聚... 目的探讨19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)蛋白在结直肠癌组织中的表达情况,分析C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的关系。方法收集141例结直肠癌患者的结直肠癌组织和癌旁正常组织,分别采用免疫组织化学染色方法和实时定量聚合酶链反应(PCR)检测两种组织中C19ORF5蛋白和mRNA表达情况,在电镜下观察组织的超微结构,分析C19ORF5蛋白对自噬活性的调节作用,比较不同临床特征结直肠癌患者结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的表达情况。结果结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的染色强度明显高于癌旁正常组织,Ⅰ/Ⅱ期结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的染色强度明显高于Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌组织,Ⅰ/Ⅱ期结直肠癌组织的自噬活性较高,Ⅲ/Ⅳ期结直肠癌组织的自噬活性较低。结直肠癌组织中C19ORF5 mRNA的表达水平明显高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P﹤0.01)。TNM分期为Ⅰ~Ⅱ期、癌胚抗原(CEA)升高、无肝转移结直肠癌患者结直肠癌组织中C19ORF5蛋白的高表达率分别高于TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期、CEA正常、有肝转移的患者,差异均有统计学意义(P﹤0.05)。结论在结直肠癌组织中,高表达的C19ORF5蛋白可增加肿瘤细胞的自噬活性,增加基因的稳定性,降低肿瘤的恶性程度。C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌的恶性程度呈负相关,C19ORF5可能是一种重要的抑癌基因。 展开更多
关键词 结直肠癌 19号染色体开放阅读框5 自噬
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Pathogenesis and clinical features of severe hepatitis E virus infection
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作者 László Orosz Károly Péter Sárvári +2 位作者 Áron Dernovics András Rosztóczy Klára Megyeri 《World Journal of Virology》 2024年第2期19-33,共15页
The hepatitis E virus(HEV),a member of the Hepeviridae family,is a small,non-enveloped icosahedral virus divided into eight distinct genotypes(HEV-1 to HEV-8).Only genotypes 1 to 4 are known to cause diseases in human... The hepatitis E virus(HEV),a member of the Hepeviridae family,is a small,non-enveloped icosahedral virus divided into eight distinct genotypes(HEV-1 to HEV-8).Only genotypes 1 to 4 are known to cause diseases in humans.Genotypes 1 and 2 commonly spread via fecal-oral transmission,often through the consum-ption of contaminated water.Genotypes 3 and 4 are known to infect pigs,deer,and wild boars,often transferring to humans through inadequately cooked meat.Acute hepatitis caused by HEV in healthy individuals is mostly asymptomatic or associated with minor symptoms,such as jaundice.However,in immunosup-pressed individuals,the disease can progress to chronic hepatitis and even escalate to cirrhosis.For pregnant women,an HEV infection can cause fulminant liver failure,with a potential mortality rate of 25%.Mortality rates also rise amongst cirrhotic patients when they contract an acute HEV infection,which can even trigger acute-on-chronic liver failure if layered onto pre-existing chronic liver disease.As the prevalence of HEV infection continues to rise worldwide,highlighting the particular risks associated with severe HEV infection is of major medical interest.This text offers a brief summary of the characteristics of hepatitis developed by patient groups at an elevated risk of severe HEV infection. 展开更多
关键词 Hepatitis E virus CIRRHOSIS Acute-on-chronic liver failure PREGNANCY Immune dysfunction open reading frames 1-4
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Mutational analysis of hepatitis E virus ORF1 'Y-domain' : Effects on RNA replication and virion infectivity 被引量:1
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作者 Mohammad Khalid Parvez 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2017年第4期590-602,共13页
AIMTo investigate the role of non-structural open reading frame 1 &#x0201c;Y-domain&#x0201d; sequences in the hepatitis E virus (HEV) life cycle.METHODSSequences of human HEV Y-domain (amino acid sequences 216... AIMTo investigate the role of non-structural open reading frame 1 &#x0201c;Y-domain&#x0201d; sequences in the hepatitis E virus (HEV) life cycle.METHODSSequences of human HEV Y-domain (amino acid sequences 216-442) and closely-related viruses were analyzed in silico. Site-directed mutagenesis of the Y-domain (HEV SAR55) was carried out and studied in the replicon-baculovirus-hepatoma cell model. In vitro transcribed mRNA (pSK-GFP) constructs were transfected into S10-3 cells and viral RNA replicating GFP-positive cells were scored by flow cytometry. Mutant virions&#x02019; infectivity was assayed on na&#x000ef;ve HepG2/C3A cells.RESULTSIn silico analysis identified a potential palmitoylation-site (C<sub>336</sub>C<sub>337</sub>) and an &#x003b1;-helix segment (L<sub>410</sub>Y<sub>411</sub>S<sub>412</sub>W<sub>413</sub>L<sub>414</sub>F<sub>415</sub>E<sub>416</sub>) in the HEV Y-domain. Molecular characterization of C<sub>336</sub>A, C<sub>337</sub>A and W<sub>413</sub>A mutants of the three universally conserved residues showed non-viability. Further, of the 10 consecutive saturation mutants covering the entire Y-domain nucleotide sequences (nts 650-1339), three constructs (nts 788-994) severely affected virus replication. This revealed the indispensability of the internal sequences but not of the up- or downstream sequences at the transcriptional level. Interestingly, the three mutated residues corresponded to the downstream codons that tolerated saturation mutation, indicating their post-translational functional/structural essentiality. In addition, RNA secondary structure prediction revealed formation of stable hairpins (nts 788-994) where saturation mutation drastically inhibited virion infectivity.CONCLUSIONThis is the first demonstration of the critical role of Y-domain sequences in HEV life cycle, which may involve gene regulation and/or membrane binding in intracellular replication complexes. 展开更多
关键词 Hepatitis E virus open reading frame 1 Y-domain PALMITOYLATION ;1 -HELIX
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Expression of p27Kip1, A Cell Cycle Repressor Protein with Dual Roles for Both Cancer Prevention and Promotion, Is Regulated Primarily at the Level of Unusual p27Kip1 mRNA—A Short Concept Proposal 被引量:2
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作者 Isao Eto 《American Journal of Molecular Biology》 2018年第3期186-193,共8页
The p27Kip1 is a cell cycle repressor protein that regulates primarily the cell cycle transition from G1 to S phase and hence the DNA replication is in the S phase and cell division in the M phase. Expression of p27Ki... The p27Kip1 is a cell cycle repressor protein that regulates primarily the cell cycle transition from G1 to S phase and hence the DNA replication is in the S phase and cell division in the M phase. Expression of p27Kip1 protein has dual roles for both cancer prevention and promotion. For example, numerous nutritional and chemopreventive anti-cancer agents specifically increase the expression of p27Kip1 protein without directly affecting the expression of any other cell cycle regulatory proteins. On the other hand, pro-cancer agents (like glucose, insulin and other growth factors frequently seen in obesity and/or diabetes) specifically decrease the expression of p27Kip1 protein without directly affecting the expression of any other cell cycle regulatory proteins. Unlike expression of any other cell cycle regulatory proteins, expression of p27Kip1 protein is very unusual. The mRNA of p27Kip1 has a very long and unusual 5’-untranslated region (from -575 to -1 in human). It appears that the 5’-untranslated region of p27Kip1 mRNA forms two alternative secondary structures. One increases the expression of p27Kip1 protein when anti-cancer agents are added and another decrease the expression of p27K1p1 when pro-cancer agents are added. For this short concept proposal, Dr. Albert Einstein’s “visualized thought experiments (German: Gedanken experiment)” were used as a fundamental tool for understanding how either anti- or pro-cancer agents bring the primary structure of the 5’-untranslated region of p27Kip1 mRNA into two alternative secondary structures, thereby either increasing or decreasing, respectively, the translation initiation of p27Kip1 protein. 展开更多
关键词 P27KIP1 Cell Cycle Repressor Protein CANCER Prevention Anti-Cancer AGENTS CANCER PROMOTION Pro-Cancer AGENTS P27KIP1 MRNA 5-Prime-Untranslated Region Translation Initiation 5-Prime Cap Upstream open reading frame Internal Ribosome Entry Site
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C19ORF12对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药敏感性的影响及其机制
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作者 杨颖 赵伟 吕丹 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期687-693,共7页
目的:探讨19号染色体开放读码框12(C19ORF12)对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药物敏感性的影响,并阐明其作用机制。方法:将胃癌MKN45细胞分为对照组和C19ORF12组。CCK-8法检测2组胃癌MKN45细胞的增殖活性,克隆形成实验检测2组胃癌MKN45细胞... 目的:探讨19号染色体开放读码框12(C19ORF12)对胃癌MKN45细胞增殖和化疗药物敏感性的影响,并阐明其作用机制。方法:将胃癌MKN45细胞分为对照组和C19ORF12组。CCK-8法检测2组胃癌MKN45细胞的增殖活性,克隆形成实验检测2组胃癌MKN45细胞克隆形成数,CCK-8法检测加入化疗药物阿霉素或过氧化氢(H2O2)后2各组胃癌MKN45细胞存活率,流式细胞术检测2组胃癌MKN45细胞凋亡率,激光共聚焦显微镜技术检测C19ORF12在胃癌MKN45细胞中的亚细胞定位,GEPIA分析癌症基因组图谱(TCGA)中C19ORF12 mRNA在正常胃组织和胃癌组织中的表达差异,KM-plot回顾性分析不同表达水平C19ORF12对胃癌患者预后的影响。结果:与对照组比较,C19ORF12组胃癌MKN45细胞增殖活性明显升高(P<0.05),克隆形成数升高(P<0.01)。阿霉素或H2O2作用后,与对照组比较,C19ORF12组胃癌MKN45细胞存活率升高(P<0.05或P<0.01),细胞凋亡率降低(P<0.01)。激光共聚焦显微镜下,C19ORF12主要定位于胃癌MKN45细胞的线粒体中。与正常胃组织比较,胃癌组织中C19ORF12 mRNA表达水平明显升高(P<0.01)。与低表达C19ORF12的胃癌患者比较,高表达C19ORF12的胃癌患者总体生存期明显缩短(P<0.01)。结论:C19ORF12能够促进胃癌细胞的增殖,并且降低胃癌细胞对化疗药物的敏感性。C19ORF12可以作为肿瘤治疗的潜在靶标。 展开更多
关键词 C19ORF12 胃肿瘤 细胞增殖 阿霉素 化疗药敏感性 活性氧
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Higher Concentrations of Glucose or Insulin Increase the Risk of Various Types of Cancer in Obesity or Type 2 Diabetes by Decreasing the Expression of p27Kip1, a Cell Cycle Repressor Protein 被引量:1
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作者 Isao Eto 《American Journal of Molecular Biology》 2020年第1期1-11,共11页
Research Aims: Obesity and type 2 diabetes are known to be associated with increased risk of various types of cancer. However, the molecular biological mechanism of how the risk of cancer is increased in obesity or ty... Research Aims: Obesity and type 2 diabetes are known to be associated with increased risk of various types of cancer. However, the molecular biological mechanism of how the risk of cancer is increased in obesity or type 2 diabetes is not known. The aim this research is to investigate if the decreased expression of p27Kip1, a cell cycle repressor protein, plays a central role in this mechanism. Research Methods, Previous Studies and Theoretical Backgrounds: It is well known that the expression of p27Kip1 is increased by numerous nutritional or chemopreventive anti-cancer agents. But it has never been known that the expression of p27Kip1 could be decreased, rather than increased, and the risk of cancer could be increased, rather than decreased. This problem was solved recently and this new analytical method was used in this study. Results: 1) The expression of p27Kip1 was indeed significantly decreased in human obese type 2 diabetic individuals relative to the lean normal controls. 2) The expression of p27Kip1 was also significantly decreased in genetically obese rodents relative to the lean normal controls. Additionally, in obese rodents, the concentrations of glucose or insulin were significantly increased relative to the lean normal controls. 3) Using human cells cultured in vitro it was found that the increased concentrations of glucose or insulin decrease the expression of p27Kip1. Conclusions: These results suggest that higher concentrations of glucose or insulin increase the risk of various types of cancer in obesity or type 2 diabetes by decreasing the expression of p27Kip1. 展开更多
关键词 OBESITY Type 2 Diabetes CANCER P27KIP1 MRNA Translation Initiation 5’-Untranslated Region (5’UTR) 5’-End Cap of P27KIP1 MRNA Upstream open reading frame (uORF) Internal RIBOSOME Entry Site (IRES)
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基于高通量数据分析DNA甲基化和拷贝数畸变对C1orf26基因表达的影响
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作者 赵小芳 杜欣娜 《吉林医学》 CAS 2020年第6期1289-1291,共3页
目的:揭示乳腺癌中1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)DNA甲基化和拷贝数畸变对表达的影响。方法:利用癌症多组学和临床数据库LinkedOmics分析DNA甲基化和拷贝数畸变对乳腺癌组织中C1orf26基因表达的... 目的:揭示乳腺癌中1号染色体开放阅读框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26,C1orf26)DNA甲基化和拷贝数畸变对表达的影响。方法:利用癌症多组学和临床数据库LinkedOmics分析DNA甲基化和拷贝数畸变对乳腺癌组织中C1orf26基因表达的影响。结果:C1orf26 mRNA水平与其基因拷贝数变化拷贝数畸变正相关(P<0.01),而与其DNA甲基化水平负相关(P<0.01);且LinkedOmics分析结果显示乳腺癌中C1orf26 mRNA水平分别受到组织学类型、肿瘤纯度和患者种族影响(P<0.05、P<0.01、P<0.01)。结论:C1orf26基因拷贝数畸变和DNA甲基化水平影响其表达,C1orf26可作为乳腺癌预后的潜在标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 1号染色体开放阅读框26 基因变化 预后
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ORF1编码的四种非结构蛋白可用于戊型肝炎病毒的基因分型
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作者 胡玲玲 王跃荣 郑海音 《智慧健康》 2018年第19期16-18,共3页
目的探讨人类戊型肝炎病毒(HEV)开放阅读框(ORF)1编码的四种非结构蛋白的基因序列能否用于其基因组的分型。方法从Gen Bank中查找并下载能感染人类测序完整的全基因组的HEV基因组及蛋白序列共35株,用Clustal W程序对35株HEV的ORF1编码... 目的探讨人类戊型肝炎病毒(HEV)开放阅读框(ORF)1编码的四种非结构蛋白的基因序列能否用于其基因组的分型。方法从Gen Bank中查找并下载能感染人类测序完整的全基因组的HEV基因组及蛋白序列共35株,用Clustal W程序对35株HEV的ORF1编码区序列进行多序列比对,并用treev32绘制基因进化树,研究其进化关系。结果 HEV的基因组全长为7.5kb;而RNA依赖的RNA聚合酶只有1460bp,其他的基因序列则更短,木瓜样半胱氨酸蛋白酶为479bp、解旋酶为734bp,多聚脯氨酸铰链只有200bp。这四种蛋白的多序列比对和进化分析结果与Gen Bank中的分型结果相符。结论 HEV ORF1编码表达的木瓜样半胱氨酸蛋白酶、多聚脯氨酸铰链、解旋酶和RNA依赖的RNA聚合酶的基因序列更短,且可作为HEV的分型依据,从而为HEV的分型找到了一种更简便、快捷的方法。 展开更多
关键词 戊型肝炎病毒 基因型 开放阅读框1 进化分析
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36型人腺病毒E4ORF1真核表达载体的构建及其促进前脂肪细胞3T3-L1对葡萄糖利用的作用初探
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作者 王冰丽 陈哲 +3 位作者 艾柯代姆·阿卜杜克热木 刘迪晖 赵炳尧 关亚群 《新疆医科大学学报》 CAS 2022年第5期469-478,共10页
目的通过构建早期基因4开放读码框1(E4ORF1)真核表达载体,探讨E4ORF1蛋白调节前脂肪细胞3T3-L1(小鼠胚胎成纤维细胞)利用葡萄糖的作用。方法通过分子克隆技术构建pcDNA3.1-E4ORF1重组质粒,并进行DNA测序鉴定。将前脂肪细胞3T3-L1分为对... 目的通过构建早期基因4开放读码框1(E4ORF1)真核表达载体,探讨E4ORF1蛋白调节前脂肪细胞3T3-L1(小鼠胚胎成纤维细胞)利用葡萄糖的作用。方法通过分子克隆技术构建pcDNA3.1-E4ORF1重组质粒,并进行DNA测序鉴定。将前脂肪细胞3T3-L1分为对照组和E4ORF1转染组,检测两组细胞第0、1、2、3天培养基中葡萄糖浓度,利用RT-qPCR和Western-Blot检测两组细胞第0、1、2、3、4天E4ORF1、己糖激酶2(HK2)、糖原合酶1(GYS1)mRNA和蛋白质的表达情况。油红O染色观察两组细胞第0、1、2、3、4天分化及脂质积累情况,检测过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、CCAAT增强子结合蛋白a(C/EBPa)、脂肪酸结合蛋白4(FABP4)、脂肪酸合成酶(FASN)、乙酰辅酶A羧化酶(ACC)mRNA和蛋白质的表达情况。结果成功构建N端带FLAG(DYKDDDDK肽)标签的真核表达载体pcDNA3.1-E4ORF1。与对照组相比,E4ORF1转染组细胞培养基中葡萄糖浓度随培养时间延长下降更快,差异有统计学意义(P<0.01)。RT-qPCR和Western-Blot结果显示,与对照组相比,转染组E4ORF1的mRNA和蛋白表达水平均显著增高,差异有统计学意义(P<0.05)。E4ORF1转染组的糖酵解关键酶基因HK2和糖原合酶基因GYS1 mRNA和蛋白质的表达均显著上升(P均<0.05)。油红O染色显示两组细胞均无成脂分化现象,脂肪细胞分化标志基因PPARγ、C/EBPa、FABP4、FASN、ACC的mRNA和蛋白表达水平均无显著变化(P>0.05)。结论成功构建pcDNA3.1-E4ORF1真核表达载体;在前脂肪细胞3T3-L1中,E4ORF1可能通过促进HK2和GYS1的表达,参与细胞对葡萄糖的分解和糖原合成过程,对前脂肪细胞的分化无影响。 展开更多
关键词 36型人腺病毒 早期基因4开放读码框1 己糖激酶 前脂肪细胞3T3-L1 糖代谢
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PAQosome各亚基的基本功能研究概况
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作者 石榴 韩铭 +3 位作者 袁晓雪 叶峰 成军 蔺淑梅 《医学综述》 CAS 2023年第18期3549-3554,共6页
PAQosome可协助热激蛋白90组装大量的大型多亚基蛋白复合物,并参与蛋白质合成、核糖体生物发生、转录、剪接等基本细胞功能。目前,PAQosome各亚基作用的相关研究主要集中在肿瘤方面,其在多数肿瘤中上调,且与肿瘤的发生、发展、预后密切... PAQosome可协助热激蛋白90组装大量的大型多亚基蛋白复合物,并参与蛋白质合成、核糖体生物发生、转录、剪接等基本细胞功能。目前,PAQosome各亚基作用的相关研究主要集中在肿瘤方面,其在多数肿瘤中上调,且与肿瘤的发生、发展、预后密切相关。此外,其还与阿尔茨海默病的发生、淋巴细胞和生殖细胞的发育、纤维化的形成有关,而上述功能的实现依赖于PAQosome各亚基的功能差异。因此,深入认识PAQosome各亚基的基本功能有助于进一步指导后续PAQosome在非肿瘤疾病中功能的研究。 展开更多
关键词 PAQosome 前折叠亚单位 p53和DNA损伤调控分子1 非常规预折叠RNA聚合酶Ⅱ亚基5相互作用体 伴侣样普遍表达的预折叠蛋白 天冬酰胺合成酶结构域1上游开放读码框
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病毒中具有抗肿瘤作用的编码蛋白 被引量:2
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作者 陈春燕 刘炯 汪芳裕 《医学研究生学报》 CAS 2011年第10期112-116,共5页
溶瘤病毒可以选择性地诱导肿瘤细胞死亡,除病毒的大量复制、突破细胞膜而直接破坏肿瘤细胞以外,病毒产生的某些特殊蛋白也具有一定的抗肿瘤活性,如腺病毒编码的E4orf4、自主性细小病毒NS1、鸡贫血病毒编码的凋亡素(apoptin)等。不同的... 溶瘤病毒可以选择性地诱导肿瘤细胞死亡,除病毒的大量复制、突破细胞膜而直接破坏肿瘤细胞以外,病毒产生的某些特殊蛋白也具有一定的抗肿瘤活性,如腺病毒编码的E4orf4、自主性细小病毒NS1、鸡贫血病毒编码的凋亡素(apoptin)等。不同的病毒编码蛋白所具有的抗肿瘤作用机制不尽相同。进一步了解具有抗肿瘤活性的病毒蛋白的作用机制及特点有助于开发新的抗肿瘤药物。文中就病毒编码蛋白的抗肿瘤作用机制、特点及相关进展作一综述。 展开更多
关键词 E4orf4 NS1 凋亡素 肿瘤 病毒
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髓源性生长因子的研究进展 被引量:1
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作者 韦利穆 王灿 +1 位作者 董小英 富路 《心血管病学进展》 CAS 2018年第6期956-959,共4页
近年来,以细胞为基础治疗急性心肌梗死得到了广泛关注,研究表明以骨髓来源细胞进行治疗能够取得很好的疗效。对急性心肌梗死患者的骨髓细胞进行分析发现,由骨髓来源的单核细胞和巨噬细胞分泌的蛋白质在骨髓细胞治疗急性心肌梗死中起到... 近年来,以细胞为基础治疗急性心肌梗死得到了广泛关注,研究表明以骨髓来源细胞进行治疗能够取得很好的疗效。对急性心肌梗死患者的骨髓细胞进行分析发现,由骨髓来源的单核细胞和巨噬细胞分泌的蛋白质在骨髓细胞治疗急性心肌梗死中起到重要作用,这种蛋白质被命名为髓源性生长因子。研究发现髓源性生长因子具有增强血管内皮细胞增殖,促进血管生成,保护心肌细胞的作用,现主要对髓源性生长因子的研究进展进行阐述。 展开更多
关键词 髓源性生长因子 19号染色体开放阅读框10
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C5orf34在非小细胞肺癌中的表达及预后分析
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作者 徐克明 冉安鹏 何丹 《新疆医科大学学报》 CAS 2020年第12期1561-1566,共6页
目的探讨5号染色体开放阅读框架34(chromosome 5 open reading frame 34,C5orf34)基因在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达情况及对手术患者预后的影响。方法对135例接受手术治疗的非小细胞肺癌患者的肿瘤及正常... 目的探讨5号染色体开放阅读框架34(chromosome 5 open reading frame 34,C5orf34)基因在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达情况及对手术患者预后的影响。方法对135例接受手术治疗的非小细胞肺癌患者的肿瘤及正常组织行免疫组织化学染色,通过Hscore评分标准对C5orf34基因表达进行分界,分析C5orf34基因的表达对癌组织的组织学分级、肿瘤大小和T分期的关系以及对术后患者无病生存期(disease-free survival,DFS)的影响。结果癌组织中的C5orf34基因表达显著高于正常肺组织(P<0.001);病理分期Ⅱ-Ⅲ期以及T2~T4的患者中C5orf34的阳性率显著高于病理分期I期以及T1的患者(P=0.012,0.002,0.012);C5orf34阳性患者的DFS显著低于C5orf34阴性患者(P=0.003),是影响DFS的重要因素。结论C5orf34是影响非小细胞肺癌无瘤生存预后的重要因素,尤其是在进展期肺癌中C5orf34阳性的患者更容易复发和转移;C5orf34可作为预测进展期非小细胞肺癌预后新指标。 展开更多
关键词 C5orf34 非小细胞肺癌 预后
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副血链球菌fap1-orf4基因座位编码的GTF和ORF4的功能与相互作用的研究
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作者 李一荣 胡丽华 +1 位作者 黄翔 吴辉 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期771-776,共6页
目的研究副血链球菌(Streptococcus parasanguis)fap1-orf4基因座位编码的葡糖基转移酶(GTF)和开放阅读框架(ORF)4是否参与菌毛相关蛋白1(Fap1)的糖基化与成熟以及两种蛋白质之间的相互作用。方法采用基因置换技术构建副血链球... 目的研究副血链球菌(Streptococcus parasanguis)fap1-orf4基因座位编码的葡糖基转移酶(GTF)和开放阅读框架(ORF)4是否参与菌毛相关蛋白1(Fap1)的糖基化与成熟以及两种蛋白质之间的相互作用。方法采用基因置换技术构建副血链球菌gtf和orf4突变株,并利用互补分析和Western blot检测副血链球菌Fap1的表达水平,用以评价GTF和ORF4在Fap1的糖基化和成熟的作用,另外采用酵母双杂交技术、GST pull down技术检测GTF和ORF4两种蛋白质的相互作用。结果(1)副血链球菌gtf和orf4的突变株呈现相同表型,成熟的相对分子质量(MT)约220×10^3的Fap1被高相对分子质量不成熟的Fap1(MT约360×10^3)所取代。互补分析显示pVPT-GFP-gtf和pVPT-GFP-orf4能使突变株恢复表达成熟的Fap1l;(2)酵母双杂交技术的划线试验显示共转化子AH109/pAD-gtf+pBD-orf4和AH109/pAD-orf4+pBD-gtf均能在营养缺陷的选择性培养基SD-LTHA上生长,而共转化子AH109/pAD+pBD-orf4、AH109/pAD+pBD-gtf.AH109/pBD+pAD-orf4、AH109/pBD+pAD-gtf不能在营养缺陷的培养基上生长;酵母双杂交技术的X-α-gal试验显示共转化子AH109/pAD+pBD-orf4和AH109/pAD-orf4+pBD-gtf呈现蓝色。(3)GST pull down技术进一步证实GTF和ORF4两种蛋白质之间存在直接的相互作用。结论副血链球菌fap1—orf4基因座位编码的GTF和ORF4之间存在相互作用.GTF和ORF4组成复合物是Fap1成熟与糖基化所必需的。 展开更多
关键词 副血链球菌 糖基化 葡糖基转移酶 开放阅读框架4 菌毛相关蛋白1
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19号染色体开放阅读框5调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系 被引量:1
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作者 闫炳文 李胜龙 +2 位作者 王春敬 乔鹏飞 王夫景 《中国医师进修杂志》 2020年第5期439-443,共5页
目的观察19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系。方法选取哈尔滨医科大学附属第二医院2015—2017年141例结直肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织,采用免疫组织化学法和实时定量聚合酶... 目的观察19号染色体开放阅读框5(C19ORF5)调节自噬活性与结直肠癌恶性程度和紫杉醇化疗敏感性的关系。方法选取哈尔滨医科大学附属第二医院2015—2017年141例结直肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织,采用免疫组织化学法和实时定量聚合酶链反应法检测C19ORF5蛋白和mRNA的表达情况,探讨C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌恶性程度的相关性。141例患者均行术后化疗,91例采用常规化疗方案(卡培他滨联合奥沙利铂,常规化疗组),50例采用常规方案联合紫杉醇化疗(紫杉醇组),两组均治疗6个疗程。结果癌组织在透射电镜下可见自噬体,C19ORF5蛋白为淡黄色至棕褐色颗粒,表达于细胞质;癌组织C19ORF5蛋白染色强度明显强于正常组织,且Ⅱ期染色强度明显高于Ⅳ期。Ⅰ~Ⅱ期患者C19ORF5蛋白高表达率明显高于Ⅲ~Ⅳ期患者[83.3%(25/30)比17.1%(19/111)],差异有统计学意义(P<0.01)。癌组织C19ORF5 mRNA表达水平明显高于正常组织(1.17±0.45比0.82±0.29),差异有统计学意义(P<0.05)。癌组织C19ORF5蛋白表达水平与肿瘤分期、癌胚抗原和肝转移有关(P<0.01或<0.05),癌组织C19ORF5蛋白表达水平与淋巴结转移无关(P>0.05)。常规化疗组91例患者中,有效70例(76.9%),无效21例(23.1%);紫杉醇组50例患者中,有效42例(84.0%),无效8例(16.0%),两组有效率比较差异无统计学意义(P>0.05)。在常规化疗组中,有效患者和无效患者化疗前癌组织与化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异均无统计学意义(P>0.05);有效患者与无效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。在紫杉醇组中,有效患者化疗前癌组织C19ORF5蛋白表达水平明显高于化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平(0.9±0.3比0.5±0.2),有效患者化疗后血清C19ORF5蛋白表达水平明显低于无效患者(0.5±0.2比0.8±0.2),差异有统计学意义(P<0.05)。结论C19ORF5蛋白的高表达可以提高结直肠癌组织的自噬活性;C19ORF5蛋白调节自噬活性与结直肠癌的恶性程度呈负相关;C19ORF5蛋白可能通过增强自噬活性提高紫杉醇化疗的敏感性。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 自噬 药物疗法 19号染色体开放阅读框5 紫杉醇
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Association of HLA-DQB1 coding region with unexplained recurrent spontaneous abortion 被引量:8
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作者 汪希鹏 林其德 +2 位作者 陆佩华 马政文 赵爱民 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2004年第4期492-497,共6页
Background DNA analysis has shown a lack of significant compatibility between couples affected by unexplained recurrent spontaneous abortion (URSA) compared with normal fertile couples, 8 although one study that ma... Background DNA analysis has shown a lack of significant compatibility between couples affected by unexplained recurrent spontaneous abortion (URSA) compared with normal fertile couples, 8 although one study that made use of a PCR-sequence-specific oligonucleotide (SSO) method did observe evidence of significant compatibility in the HLA-DQA1 and DQB1 alleles between patients and aborted fetuses. 9 This study was designed to investigate whether URSA were associated with particular DQ alleles or promoter alleles.Methods Thirty-two patients with URSA and 54 women who had had at least one successful pregnancy were included in this study. HLA-DQ genotyping was performed by the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. The HLA-DQB1 promoter was detected by the SSO and sequence-specific primer (SSP) methods. The DQA1, DQB1, and DQB1 promoter (QBP) gene frequencies in the patients were compared with the gene frequencies in normal controls. The data were analyzed statistically with the χ 2 and Fisher’s exact tests.Results The results showed that the frequency of DQB1 *0604/0605 was significantly higher and the frequency of DQB1 *0501/0502 was significantly lower in the patient group as compared with the normal controls. In addition, the frequencies of the DQA1 *01-DQB1 *0604/0605 and QBP6.2-DQB1 *0604/0605 haplotypes were overrepresented in the patients relative to the controls. Our results did not show any differences between URSA patients and the controls with regard to DQA1 and QBP allele frequencies. Conclusions Our data suggest that URSA is associated with the HLA-DQB1 coding region, and is not associated with its upstream regulatory region. The DQB1 *0604/0605, DQA1 *01-DQB1 *0604/0605, and QBP6.2-DQB1 *0604/0605 haplotypes may confer susceptibility to URSA, while the DQB1 *0501/0502 allele may protect women from URSA. 展开更多
关键词 ABORTION spontaneous · HLA-DQB1 · open reading frames · promoter region (genetics)
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