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Cluster Viz:集成于Cytoscape的聚类可视化插件
被引量:
2
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作者
蔡娟
王建新
+1 位作者
李敏
陈钢
《生物信息学》
2011年第3期185-188,共4页
生物网络中的聚类分析是功能模块识别及蛋白质功能预测的重要方法,聚类结果的可视化对于快速有效地分析生物网络结构也具有重要作用。通过分析生物网络显示和分析平台Cytoscape的架构,设计了一个使用方便的聚类分析和显示插件ClusterVi...
生物网络中的聚类分析是功能模块识别及蛋白质功能预测的重要方法,聚类结果的可视化对于快速有效地分析生物网络结构也具有重要作用。通过分析生物网络显示和分析平台Cytoscape的架构,设计了一个使用方便的聚类分析和显示插件ClusterViz。这是一个可扩展的聚类算法的集成平台,可以不断增加其中的聚类算法,并对不同算法的结果进行比较分析,目前已实现了三种典型的算法实例。该插件能够成为蛋白质相互作用网络机理研究的一个有效工具。
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关键词
蛋白质相互作用网络
功能模块
聚类算法
可视化
clusterviz
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职称材料
题名
Cluster Viz:集成于Cytoscape的聚类可视化插件
被引量:
2
1
作者
蔡娟
王建新
李敏
陈钢
机构
中南大学信息科学与工程学院
出处
《生物信息学》
2011年第3期185-188,共4页
基金
国家自然科学基金(61003124)
教育部博士点专项基金(新教师基金)(20090162120073)
+1 种基金
中南大学自由探索计划资助(201012200124)
湖南省研究生科研创新项目(CX2009B040)
文摘
生物网络中的聚类分析是功能模块识别及蛋白质功能预测的重要方法,聚类结果的可视化对于快速有效地分析生物网络结构也具有重要作用。通过分析生物网络显示和分析平台Cytoscape的架构,设计了一个使用方便的聚类分析和显示插件ClusterViz。这是一个可扩展的聚类算法的集成平台,可以不断增加其中的聚类算法,并对不同算法的结果进行比较分析,目前已实现了三种典型的算法实例。该插件能够成为蛋白质相互作用网络机理研究的一个有效工具。
关键词
蛋白质相互作用网络
功能模块
聚类算法
可视化
clusterviz
Keywords
protein interaction network
functional module
clustering algorithm
visualization
clusterviz
分类号
Q518.2 [生物学—生物化学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Cluster Viz:集成于Cytoscape的聚类可视化插件
蔡娟
王建新
李敏
陈钢
《生物信息学》
2011
2
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