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金花茶体细胞胚胎Cn-SERK基因的克隆及其生物信息学分析 被引量:1
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作者 翁浩 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2013年第9期1699-1707,共9页
以金花茶体细胞胚胎为材料,采用RT-PCR和RACE技术,获得了含有完整开放阅读框的金花茶CnSERK基因cDNA全长序列和DNA全长序列。Cn-SERK基因编码1个含有624个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示该蛋白质为亲水、且具有信号肽的跨膜蛋白,... 以金花茶体细胞胚胎为材料,采用RT-PCR和RACE技术,获得了含有完整开放阅读框的金花茶CnSERK基因cDNA全长序列和DNA全长序列。Cn-SERK基因编码1个含有624个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示该蛋白质为亲水、且具有信号肽的跨膜蛋白,定位于内质网的可能性最高。二级结构主要有α螺旋和无规则卷曲构成,存在1个蛋白激酶位点。此蛋白可能发生磷酸化的位点有25个。内含子分析结果表明,CnSERK基因由11个外显子和10个内含子组成,内含子的剪切位点符合真核生物GT-AG规则。系统进化树分析结果表明,金花茶Cn-SERK蛋白与毛果杨(Populus trichocarpa)的SERK亲缘关系较近。 展开更多
关键词 金花茶 体细胞胚胎 Cn—SERK 基因克隆 生物信息学
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