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Comamonas kerstersii细菌致病性的基因组分析
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作者 王慧 明德松 王明席 《华侨大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第3期394-416,共23页
为了更好地管理Comamonas kerstersii(C.kerstersii)感染,通过分析C.kerstersii菌株121606基因组中的毒力因子基因(VFGs)来了解其毒力和致病性。对已经完成测序的C.kerstersii 121606基因组,通过BLAST搜索VFDB数据库来预测其VFGs。结果... 为了更好地管理Comamonas kerstersii(C.kerstersii)感染,通过分析C.kerstersii菌株121606基因组中的毒力因子基因(VFGs)来了解其毒力和致病性。对已经完成测序的C.kerstersii 121606基因组,通过BLAST搜索VFDB数据库来预测其VFGs。结果表明:C.kerstersii含有大量VFGs,其中一些与其在人体内的生存和生长,以及在胃肠道和肺部的致病性有关。基因组分析表明:C.kerstersii可能是一种细胞内病原体。C.kerstersii所携带的VFGs有助于解释其在文献中所报道的胃肠道感染和临床工作中所遇到的肺部感染中的毒力和致病性,这些数据也为新型抗生素和疫苗开发提供了理想的靶点,以用于治疗C.kerstersii感染。 展开更多
关键词 comamonas kerstersii 毒力因子基因 致病性 细胞内病原体 胃肠道感染 肺部感染
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一株多药耐药Comamonas kerstersii细菌的基因组分析
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作者 王慧 明德松 王明席 《华侨大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第1期35-46,共12页
从1名尿路感染患者中分离出了1株多药耐药的Comamonas kerstersii(C.kerstersii)菌株121606,对其进行了抗微生物药敏试验(AST)和全基因组测序;然后将其与7个具有代表性的Comamonas菌株和Acidovorax菌种进行基因组比较分析,包括使用Ortho... 从1名尿路感染患者中分离出了1株多药耐药的Comamonas kerstersii(C.kerstersii)菌株121606,对其进行了抗微生物药敏试验(AST)和全基因组测序;然后将其与7个具有代表性的Comamonas菌株和Acidovorax菌种进行基因组比较分析,包括使用OrthoANI分析平均核苷酸同一性(ANI),以及通过snpTree网络服务器进行单核苷酸多态性(SNP)分析。最后,使用RAST服务器进行基因组序列,使用OrthoVenn软件对同源簇进行功能注释,通过CARD数据库对抗生素耐药基因(ARGs)进行预测,并利用CRISPR识别工具预测CRISPR,以及利用PHAST软件预测前噬菌体。结果表明:C.kerstersii 121606是一种多药耐药细菌,其遗传成分与其他7个Comamonas和Acidovorax菌种相似;其基因组中存在的ARGs有助于解释其多药耐药机制。这些发现为研究新型抗生素来控制多药耐药C.kerstersii感染提供了有价值的见解。 展开更多
关键词 comamonas kerstersii 多药耐药性 比较基因组分析 抗生素耐药性基因 CRISPR 前噬菌体
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产胞外乳糖酶耐冷菌株Comamonas sp.的筛选鉴定及酶学性质研究 被引量:2
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作者 林国秀 李珍 +3 位作者 罗盛莲 游霞 丁聪聪 张杰 《工业微生物》 CAS CSCD 2013年第2期38-44,共7页
利用含有X-gal的琼脂平板和摇瓶发酵法,从若尔盖高原土壤中筛选产β-半乳糖苷酶低温菌株。经过菌落形态及16S rDNA序列分析,初步鉴定该菌株为Comamonas sp.菌株特性以及粗酶性质研究表明:该菌株于250 mL锥形瓶中装液量为40 mL,温度为15... 利用含有X-gal的琼脂平板和摇瓶发酵法,从若尔盖高原土壤中筛选产β-半乳糖苷酶低温菌株。经过菌落形态及16S rDNA序列分析,初步鉴定该菌株为Comamonas sp.菌株特性以及粗酶性质研究表明:该菌株于250 mL锥形瓶中装液量为40 mL,温度为15℃,初始pH值为5.5的条件下培养48h后菌体量达到最大值;所产胞外β-半乳糖苷酶的反应最适pH值为7.0,最适温度为40℃,具有一定的热稳定性;金属离子Mg^(2+)对该酶酶活具有明显的促进作用,而Cu^(2+)、Ca^(2+)、Cd^(2+)、Zn^(2+)对其酶活具有强烈的抑制作用,其中Cu^(2+)能完全抑制其活性。 展开更多
关键词 comamonas SP 胞外酶 乳糖酶 筛选 酶学性质
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Comamonas testosteroni-associated peritonitis in a pediatric peritoneal dialysis patient 被引量:1
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作者 Mattia Parolin Maura Baraldi +2 位作者 Elena Valentini Luisa Murer Enrico Vidal 《World Journal of Nephrology》 2016年第2期220-223,共4页
Comamonas testosteroni(C. testosteroni) has been rarely observed as an infectious agent in clinical practice. Few reports described its potential pathogenicity in bloodstream and abdominal infections. Here, we report ... Comamonas testosteroni(C. testosteroni) has been rarely observed as an infectious agent in clinical practice. Few reports described its potential pathogenicity in bloodstream and abdominal infections. Here, we report our experience in the treatment of a C. testosteroni-associated peritonitis in a four-year-old girl receiving chronic peritoneal dialysis(PD). The organism was shown to be highly susceptible to appropriate antibiotic therapy. Infection responded promptly and the patient was managed conservatively without withdrawal from PD. 展开更多
关键词 comamonas PERITONITIS Peritoneal dialysis COMORBIDITY CHILDREN
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Maternal peripartum bacteremia caused by intrauterine infection with Comamonas kerstersii:A case report
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作者 Hai Qu Yi-Hong Zhao +2 位作者 Wen-Mei Zhu Lu Liu Ming Zhu 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2022年第21期7585-7591,共7页
BACKGROUND Comamonas kerstersii(C.kerstersii)infections have considered as non-pathogenic to humans,however due to new techniques such as matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry(MA... BACKGROUND Comamonas kerstersii(C.kerstersii)infections have considered as non-pathogenic to humans,however due to new techniques such as matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry(MALDI-TOF-MS),more cases have been identified.CASE SUMMARY This is the first report of a maternal patient with a C.kerstersii bacteremia following caesarean section.Due to the severity of the patient’s condition;high fever and rapidly progressing organ damage,the patient was transferred to the intensive care unit.C.kerstersii was detected by metagenomic next-generation sequencing testing.Based on the drug sensitivity test,appropriate antibiotic treatment was given and the patient recovered fully.CONCLUSION This case report confirms that the detection via MALDI-TOF-MS and metagenomic next-generation sequencing testing provides a reliable basis for the diagnosis of this rare bacterial infection. 展开更多
关键词 comamonas kerstersii BACTEREMIA Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry Metagenomic next-generation sequencing testing Caesarean section Case report
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Comparing Polyethersulfone and Polyurethane-immobilized Cells of Comamonas testosteroni QYY in Treatment of an Accidental Dye Wastewater 被引量:1
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作者 GENG Zhi YU Yang +6 位作者 ZHU Suiyi YU Hongbin LIU Jiancong BIAN Dejun YANG Xia HUO Hongliang HUO Mingxin 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2017年第1期36-43,共8页
Well-channeled porous polyethersulfone(PES) beads were synthesized and used for the immobilization of Comamonas testosteroni QYY cells for an aerobic reactor to remove quinoline, phenol, and other refractory com- po... Well-channeled porous polyethersulfone(PES) beads were synthesized and used for the immobilization of Comamonas testosteroni QYY cells for an aerobic reactor to remove quinoline, phenol, and other refractory com- pounds in accidentally-released dye wastewater supplemented with domestic wastewater. The pore size in PES beads mainly depended on the dripping time through the Water vapor cylinder. When the cylinder was 2.5 m in length, the pore size in the obtained beads was enlarged to 3 ~m, which provided an ideal surface for cells to pass through and grow inside. The reactor with the immobilized C. testosteroni QYY on PES beads resisted organic loading shock and enhanced total organic carbon(TOC) removal, which had 100% removal efficiencies of both quinoline and phenol when the volume ratio of the accidental wastewater to domestic wastewater was increased from 1:2 to 1:1, as compared with the 100% and 34.7% removal efficiencies by the reactor with immobilized C. testosteroni QYY on polyttrethane(PU) cube or the 82% and 2.4% removal efficiencies by the reactor with only the suspended C. testosteroni QYY cells, respectively. The PES beads had a specific surface area of 1843 cm2/cm3, which had immobilized (0.0244-0.003) g of C, testosteroni QYY cell dry mass/cm3, compared with the specific surface area of 564 cm2/cm3 of the PU cube with (0.0184-0.002) g of cell dry mass/cm3. The kinetic study revealed that the quinoline and phenol degradation followed zero-order reactions for all the three reactors. The PES reactor demonstrated the highest quinoline and phenol removal efficiencies. The immobilized C. testosteroni QYY on the low-cost inert PES beads demonstrated good shock resistance and was able to completely remove the toxic compounds, including phenyl carbamate, 2-nitrotoluene, and dioctyl phthalate. Therefore, the beads were ideal for large-scale accidental wastewater treatment. 展开更多
关键词 Accidental dye wastewater comamonas testosteroni QYY Immobilization Porous polyether sulfone bead Biodegradation
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3,5-二硝基苯甲酸降解菌A3的分离及降解特性 被引量:6
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作者 李蒙英 张迹 +2 位作者 陆鹏 许敬亮 李顺鹏 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第1期106-110,共5页
从硝基苯类化合物废水处理系统中分离到一株3,5-二硝基苯甲酸降解菌株A3,经形态特征、生理生化以及16S rDNA序列分析,初步鉴定为睾丸酮丛毛单胞菌(Comamonas testosteroni).该菌能以200mg/L3,5-二硝基苯甲酸为唯一碳源,12h的降... 从硝基苯类化合物废水处理系统中分离到一株3,5-二硝基苯甲酸降解菌株A3,经形态特征、生理生化以及16S rDNA序列分析,初步鉴定为睾丸酮丛毛单胞菌(Comamonas testosteroni).该菌能以200mg/L3,5-二硝基苯甲酸为唯一碳源,12h的降解率可达95%以上,24h可溶性有机碳(DOC)由72.5mg/L降至10.2mg/L。表明3,5-二硝基苯甲酸被降解矿化而不是被转化成其他有机物.当A3以200mg/L3,5-二硝基苯甲酸为唯一碳、氮源时,将底物转化为一种黄色代谢产物,该产物不易进一步降解.A3降解3,5-二硝基苯甲酸的适宜温度为20-30℃。最适pH值为5-9. 展开更多
关键词 3 5-硝基苯甲酸 睾丸酮丛毛单胞菌(comamonas testosteroni) 生物降解 矿化
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丛毛单胞菌CNB-1合成PHA及相关基因的研究 被引量:1
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作者 应娇妍 杨苏声 +1 位作者 刘双江 姜成英 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期616-621,共6页
分析了丛毛单胞菌(Comamonas sp.)CNB-1菌株在不同条件下合成聚羟基烷酸(polyhydroxyalkanoic acids,PHAs)的组分和含量,同时克隆了与PHA合成相关的基因。结果表明,该菌可以多种短链有机酸及醇类为碳源合成PHA多聚物或共聚物,以戊酸和1... 分析了丛毛单胞菌(Comamonas sp.)CNB-1菌株在不同条件下合成聚羟基烷酸(polyhydroxyalkanoic acids,PHAs)的组分和含量,同时克隆了与PHA合成相关的基因。结果表明,该菌可以多种短链有机酸及醇类为碳源合成PHA多聚物或共聚物,以戊酸和1,4-丁二醇为底物时,可达菌体干重的57%;同时发现小分子醇类的存在能显著促进PHA的合成,推测与醇类氧化过程中提供了更多的还原力有关。为了克隆相关基因,利用已知phaC的保守区简并引物筛选基因组文库,将得到的阳性克隆质粒测序,发现phaC、phaA、phaB组成一个基因簇phaC-A-B。将phaC、phaA、phaB连接到pET载体在E.coli中共表达,重组E.coli菌株能合成PHA;将这3个基因单独连接到pET载体,在E.coli中表达后检测到相应酶活,分别约为原始菌株的4.1、71和2882倍。 展开更多
关键词 丛毛单胞菌(comamonas) 聚羟基烷酸(PHA) 生物塑料 高分子聚酯
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睾酮丛毛单胞菌JA1菌株羟基化烟酸产生6-羟基烟酸的发酵产酶条件研究 被引量:1
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作者 杨瑶 袁生 戴亦军 《工业微生物》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期55-59,共5页
睾酮丛毛单胞菌Comamonas testosteroni JA1是一株具有氰基吡啶羟基化酶活性的菌株,研究表明它还具有很高的烟酸羟基化酶的活性,是未报道过的具有烟酸羟基化酶活性的新菌种。该菌最适生长和产酶的碳源为1%葡萄糖、氮源为1%蛋白胨、诱导... 睾酮丛毛单胞菌Comamonas testosteroni JA1是一株具有氰基吡啶羟基化酶活性的菌株,研究表明它还具有很高的烟酸羟基化酶的活性,是未报道过的具有烟酸羟基化酶活性的新菌种。该菌最适生长和产酶的碳源为1%葡萄糖、氮源为1%蛋白胨、诱导物为1%烟酸,此外,它的发酵条件优越,在温度25~37℃、初始pH6.5~7.0、装液量(100mL锥形瓶)10mL^40mL范围内,产酶能力均保持很高水平,很具有工业化生产应用的前景。 展开更多
关键词 烟酸 6-羟基烟酸 羟基化 生物转化 comamonas testosteroni
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Fatal Delftia acidovorans infection in an immunocompetent patient with empyema 被引量:2
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作者 Sadia Khan Sujatha Sistla +1 位作者 Rahul Dhodapkar Subhash Chandra Parija 《Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine》 SCIE CAS 2012年第11期923-924,共2页
Delftia acidovorans(earlier known as Comamonas acidovorans) is an aerobic,non-fermentative, Cram negative rod,classified in the Pseudomonas rRNA homology Group 111.Reports of isolation of the organism from serious inf... Delftia acidovorans(earlier known as Comamonas acidovorans) is an aerobic,non-fermentative, Cram negative rod,classified in the Pseudomonas rRNA homology Group 111.Reports of isolation of the organism from serious infections like central venoug catheter associated bacleremia. corneal ulcers,otitis media exist.The microbiologists can identify this organism based on an orange indole reaction.This reaction demonstrates the organism's ability to produce anthranilic acid from tryptophan on addition of Kovac's reagent;which gives the media its characteristic "pumpkin orange" colour.Here we report the isolation of this organism from the Endotracheal tube aspirate of a 4 year old child.With the increasing use of invasive devices,it has become important to recognize these non fermentative gram negative bacilli as emerging source of infection even in immunocompetent individuals. 展开更多
关键词 Delftia acidovorans comamonas acidovorans ORANGE INDOLE
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纯种氨氧化菌短程反硝化特性 被引量:8
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作者 周莉 李正魁 +1 位作者 王易超 范念文 《环境工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期1219-1224,共6页
以Comamonas aquatica LNL3为研究对象,根据其既能短程硝化又能短程反硝化的特性,采用好氧方式富集和固定化菌种,再以厌氧方式驯化,得到具有高效短程反硝化特性的纯种氨氧化菌。采用扫描电镜对固定化前后的载体进行表征,且用正交试验考... 以Comamonas aquatica LNL3为研究对象,根据其既能短程硝化又能短程反硝化的特性,采用好氧方式富集和固定化菌种,再以厌氧方式驯化,得到具有高效短程反硝化特性的纯种氨氧化菌。采用扫描电镜对固定化前后的载体进行表征,且用正交试验考察了不同环境因子(温度、pH、碳氮比、溶解氧)对Comamonas aquatica LNL3短程反硝化的影响。结果表明,所用载体与Comamonas aquatica LNL3有良好的亲和性,适于微生物的固定化;环境因子对Comamonas aquatica LNL3短程反硝化影响大小顺序为:温度>pH>DO>C/N;在环境条件改变过程中当温度为35℃,pH=8,C/N=3,DO=2.5 mg/L时,Comamonas aquatica LNL3短程反硝化速率达到最大,为32.63 mg/(L.h);研究结果还表明,Comamonas aquatica LNL3具有好氧反硝化特性,适宜处理低碳氮比废水。 展开更多
关键词 comamonas aquatica LNL3 短程反硝化 好氧反硝化 低碳氮比
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不适宜生长条件对混菌降解苯胺的影响 被引量:4
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作者 赵芝清 杨玉飞 杜祥君 《环境工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期1681-1686,共6页
分别从台州和衢州某化工厂的好氧池中分离筛选得到2株苯胺降解菌TZl和JH1,经16SrDNA测序鉴定为Comamonassp.TZ1和Pseudomonassp.JH1,均具有较强的苯胺降解能力,培养24h后,可使初始浓度为800mg/L的苯胺去除率达到96.4%~98.4... 分别从台州和衢州某化工厂的好氧池中分离筛选得到2株苯胺降解菌TZl和JH1,经16SrDNA测序鉴定为Comamonassp.TZ1和Pseudomonassp.JH1,均具有较强的苯胺降解能力,培养24h后,可使初始浓度为800mg/L的苯胺去除率达到96.4%~98.4%。在此基础上,按体积比l:1将2株菌液进行混合构建了混合菌体系,进而对比考察了苯胺初始浓度、pH、盐度和重金属等环境因子对单一菌和混合菌生长量及降解苯胺效果的影响,重点探讨混合菌对不适宜生长环境的适应性及其对苯胺的降解特性。通过单一菌和混合菌对比实验发现,在适宜苯胺初始浓度、pH和盐度条件下,混合菌的生长量略高于单一菌;在不适宜生长的高浓度苯胺、pH和盐度条件下,混合菌也表现出了更强的适应性和苯胺矿化能力。Zn2+和Cr6+耐受实验则表明,对于Cr6+混合菌表现出了更强的耐受能力,而对于zn2+并没有表现出更强的耐受能力。 展开更多
关键词 苯胺 comamonas SP TZI PSEUDOMONAS SP JH1混合菌耐受能力 生物降解
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