蚊类携带甲病毒属病毒CODEHOP RT-PCR检测方法的建立

目的建立蚊类感染甲病毒属病毒的CODEHOPRT—PCR检测方法。方法依据甲病毒属病毒非结构蛋白氨基酸序列，设计1对CODEHOP引物，建立甲病毒属病毒一步RT—PCR检测方法，分析该引物在对不同种甲病毒基因序列上的结合位点及所能获得的产物序列大小；通过检测甲病毒属基孔肯亚病毒JC2012株，评价该方法的特异性和灵敏度：对JC2012扩增产物进行Blast同源性比对。结果建立的CODEHOPRT-PCR方法可特异性扩增基孔肯亚病毒核酸，目的片段的大小与预期结果相符，核酸的最小检出量为56．7pg。经Blast比对，结果与Genebank公布的CHIKVJC2012序列结果一致。同时从GenBank获得的22种甲病毒均存在CODEHOP引物结合位点．扩增产物大小在510～550bp之间。结论建立的甲病毒CODEHOPRT—PCR检测方法敏感、特异，可用于蚊类甲病毒感染检测。