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含74个腺嘌呤poly(A)尾的猪水泡病病毒HK/70株3′非编码区的克隆及其特征分析
被引量:
1
1
作者
郑海学
刘湘涛
+9 位作者
尚佑军
吴锦艳
冯霞
白兴文
田宏
孙世琪
尹双辉
郭建宏
刘在新
谢庆阁
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期7-12,共6页
应用3′RACE法降落式扩增并克隆了猪水泡病病毒(SVDV)HK/70株基因组3′端的真实序列。测序结果表明,所扩增的目的基因片段长4 200 nt,包括非结构蛋白编码区(P2和P3)、3′端非编码区和poly(A)尾,其中3′NTR位于终止密码子TAA之后,长99 nt...
应用3′RACE法降落式扩增并克隆了猪水泡病病毒(SVDV)HK/70株基因组3′端的真实序列。测序结果表明,所扩增的目的基因片段长4 200 nt,包括非结构蛋白编码区(P2和P3)、3′端非编码区和poly(A)尾,其中3′NTR位于终止密码子TAA之后,长99 nt,poly(A)至少含有74个腺嘌呤碱基。经与参考毒株进行序列比较,结果显示,HK/70株与J1′73、H/3′76和AUG/22/90株的核苷酸同源性较高,为99.0%(仅第65位碱基不同),而与NET/1/92参考毒株的核苷酸同源性较低,为83.3%,与人柯萨奇病毒B5 UK/54株(UK/54-CB5)的同源性为75.7%。同时对3′NTR的二级结构进行分析,并与参考毒株和CB5毒株的二级结构进行了比较。结果表明,它们具有协同变异性,有共同的祖先,显示出3′NTR存在支持其功能所必需的一些结构域。
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关键词
猪水泡病病毒
3’NTR
POLY(A)
二级结构
柯萨奇病毒
b5
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职称材料
题名
含74个腺嘌呤poly(A)尾的猪水泡病病毒HK/70株3′非编码区的克隆及其特征分析
被引量:
1
1
作者
郑海学
刘湘涛
尚佑军
吴锦艳
冯霞
白兴文
田宏
孙世琪
尹双辉
郭建宏
刘在新
谢庆阁
机构
中国农业科学院兰州兽医研究所农业部畜禽病毒学重点实验室
出处
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期7-12,共6页
基金
国家高技术研究发展计划(863)项目(2003AA241110)
文摘
应用3′RACE法降落式扩增并克隆了猪水泡病病毒(SVDV)HK/70株基因组3′端的真实序列。测序结果表明,所扩增的目的基因片段长4 200 nt,包括非结构蛋白编码区(P2和P3)、3′端非编码区和poly(A)尾,其中3′NTR位于终止密码子TAA之后,长99 nt,poly(A)至少含有74个腺嘌呤碱基。经与参考毒株进行序列比较,结果显示,HK/70株与J1′73、H/3′76和AUG/22/90株的核苷酸同源性较高,为99.0%(仅第65位碱基不同),而与NET/1/92参考毒株的核苷酸同源性较低,为83.3%,与人柯萨奇病毒B5 UK/54株(UK/54-CB5)的同源性为75.7%。同时对3′NTR的二级结构进行分析,并与参考毒株和CB5毒株的二级结构进行了比较。结果表明,它们具有协同变异性,有共同的祖先,显示出3′NTR存在支持其功能所必需的一些结构域。
关键词
猪水泡病病毒
3’NTR
POLY(A)
二级结构
柯萨奇病毒
b5
Keywords
swine vesicular disease virus
3'NTR
poly(A)
secondary structure
coxsackiev b5
分类号
S852.659.6 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
含74个腺嘌呤poly(A)尾的猪水泡病病毒HK/70株3′非编码区的克隆及其特征分析
郑海学
刘湘涛
尚佑军
吴锦艳
冯霞
白兴文
田宏
孙世琪
尹双辉
郭建宏
刘在新
谢庆阁
《中国兽医科学》
CAS
CSCD
北大核心
2006
1
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