细胞治疗产品中关键原材料风险控制策略的审评考虑

以嵌合抗原受体基因修饰T淋巴细胞(CAR-T细胞)为代表的免疫细胞治疗产品已经在白血病等血液瘤中取得了重大进步。细胞治疗产品的生产原材料种类多样,成分复杂,其中基因修饰载体和其他一些赋予细胞特定功能或影响其质量的原材料通常为关键原材料。这些关键原材料往往会对细胞治疗产品的质量属性和体内疗效产生重要的影响,因此是细胞治疗产品审评的重要关注点。本文论述了细胞治疗产品中常用的几种关键原材料(包括慢病毒载体和γ-逆转录病毒载体、CRISPR/Cas编辑系统、转座子系统、分选磁珠和滋养细胞),提出了目前的审评考虑和风险控制策略,以期促进此类产品的临床转化和应用。

生物信息学方法对影响肺癌发生发展关键基因的初步筛选

背景与目的肺癌是最常见的恶性肿瘤之一。对于肺癌基因芯片的研究已在很多报道里提及,但是鲜有报道汇总所有的基因芯片数据来研究肺癌的共同表达通路从而挖掘出特殊的基因标记来作为治疗肺癌的靶点。本研究从肺癌相关的基因芯片数据库(GEO DataSets)中初步筛选出与肺癌发生发展有关键联系的基因与通路。方法运用基因富集(geneset enrichment analysis,GSEA)等生物信息学方法比较选择出的6套肺癌基因芯片表达谱数据,初步筛选出在转录水平上影响肺癌的通路及基因。结果用GSEA方法分析6组芯片集中所得的通路对比,上调中皆有的通路有3条;下调中皆有的通路有26条。本研究挑选共同存在于6套芯片数据集的下调通路即紧密连接(tightjunction)通路里的基因进行meta分析,可得差异有统计学意义(P<0.05)的基因11个。结论紧密连接通路在肺癌发生发展过程中的共性可能有一定研究意义,可在后续研究中探讨通路里的显著性基因。

脱胶关键酶基因的克隆及其在黑曲霉中的整合表达

通过PCR的方法从苎麻脱胶菌株枯草芽孢杆菌B10中扩增出木聚糖酶基因。将该基因克隆在载体pB luescript II KS+上,并在该基因的前面连接CaMV 35S启动子,随后将潮霉素抗性基因(Hygr)片段克隆在上述载体上,成功构建了表达载体pKS-35SXYHyg。将该表达载体线性化后转化果胶酶产生菌黑曲霉菌株An1的原生质体。对抗潮霉素黑曲霉转化子进行基因组Southern杂交分析结果表明,木聚糖酶基因已整合到受体基因组中。与原出发菌株An1相比,黑曲霉转化子AT1的木聚糖酶活性提高2倍多,经AT1处理后苎麻的残胶率下降55.18%。

海量种群基因表达式编程的内存删冗算法

在大样本、多种群、高进化代数的情况下,基因表达式编程(GEP)容易产生冗余个体染色体有效串,从而影响计算性能。为解决该问题,提出一种基于内存检测种群冗余的算法MPRRGEP。分析单基因、多基因对种群冗余性的影响,设计个体染色体有效性的测度方法。提出内存Hash种群映射删冗算法,在内存中索引个体染色体数据,减少相同有效串的重复计算次数,大幅提高GEP计算性能。实验结果表明,相比传统GEP算法,MPRRGEP算法平均减少60%以上的计算时间。