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基于线粒体Cty b基因的西藏马鹿种群遗传多样性研究
被引量:
14
1
作者
刘艳华
张明海
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第7期1976-1981,共6页
西藏马鹿(Cervus elaphus wallichi)为我国特有物种,仅分布在西藏东南部的桑日县,目前关于西藏马鹿的研究报道很少。因此,深入了解西藏马鹿各地理单元内种群的遗传变异,可以制定保护管理策略提供依据,进而使其种群得到有效的保护和管理...
西藏马鹿(Cervus elaphus wallichi)为我国特有物种,仅分布在西藏东南部的桑日县,目前关于西藏马鹿的研究报道很少。因此,深入了解西藏马鹿各地理单元内种群的遗传变异,可以制定保护管理策略提供依据,进而使其种群得到有效的保护和管理。对54个不同西藏马鹿个体(来自3个不同地点)的线粒体DNA Cty b基因进行了测定和群体分析,获得了731bp的片断,并检测到24个变异位点,占分析长度的3.28%,且这24个变异位点皆为碱基置换,并未出现碱基插入或缺失的现象,并定义了14种单倍型,核苷酸多样性平均值为0.02781,种群总体遗传多样性较高。从Tajima's D和Fu and Li's D值的估算结果来看,这3个马鹿种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离(P>0.1),没有明显的证据显示这3个西藏马鹿种群间存在很强的平衡选择。分子变异分析表明3个群体间基因流(5.36>Nm>1.87)均大于1,说明这3个马鹿种群间存在着丰富的基因流,并建议将3个地区的西藏马鹿作为一个管理单元进行保护和管理。
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关键词
西藏马鹿
粪便DNA
cty
b
遗传多样性
西藏
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职称材料
管蚜蝇族7种食蚜蝇Cty b基因序列差异及系统进化关系
被引量:
5
2
作者
张宏杰
霍科科
《汉中师范学院学报》
2004年第6期54-59,共6页
采用PCR和测序方法,首次获得管蚜蝇族(Eristalini)7种食蚜蝇线粒体基因组的Ctyb基因部分序列(419bp).经对位排列,序列间未见有插入和缺失,共检测到119个可变核苷酸位点,变异率为28 40%,其中简约位点74个.属内序列差异值在5 01%~9 55...
采用PCR和测序方法,首次获得管蚜蝇族(Eristalini)7种食蚜蝇线粒体基因组的Ctyb基因部分序列(419bp).经对位排列,序列间未见有插入和缺失,共检测到119个可变核苷酸位点,变异率为28 40%,其中简约位点74个.属内序列差异值在5 01%~9 55%之间,属间序列差异值在10 02%~16 23%之间.以直翅目的中华稻蝗为外群,用多种方法构建进化关系树,结果类似.从4个属间关系来看,管蚜蝇属和斑眼蚜蝇属首先聚合为姊妹群,BCL值为61%,其次与条胸蚜蝇属聚合,BCL值为89%,宽盾蚜蝇属最后聚合.管蚜蝇族的4个属的聚类系统发生树为单系.
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关键词
系统进化关系
b
基因序列
序列差异
属间关系
直翅目
线粒体基因组
中华稻蝗
首次
系统发生树
PCR
下载PDF
职称材料
题名
基于线粒体Cty b基因的西藏马鹿种群遗传多样性研究
被引量:
14
1
作者
刘艳华
张明海
机构
东北林业大学野生动物资源学院
出处
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第7期1976-1981,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(30870309)
国家林业局项目
文摘
西藏马鹿(Cervus elaphus wallichi)为我国特有物种,仅分布在西藏东南部的桑日县,目前关于西藏马鹿的研究报道很少。因此,深入了解西藏马鹿各地理单元内种群的遗传变异,可以制定保护管理策略提供依据,进而使其种群得到有效的保护和管理。对54个不同西藏马鹿个体(来自3个不同地点)的线粒体DNA Cty b基因进行了测定和群体分析,获得了731bp的片断,并检测到24个变异位点,占分析长度的3.28%,且这24个变异位点皆为碱基置换,并未出现碱基插入或缺失的现象,并定义了14种单倍型,核苷酸多样性平均值为0.02781,种群总体遗传多样性较高。从Tajima's D和Fu and Li's D值的估算结果来看,这3个马鹿种群相对于中性进化的歧异度并没有明显的偏离(P>0.1),没有明显的证据显示这3个西藏马鹿种群间存在很强的平衡选择。分子变异分析表明3个群体间基因流(5.36>Nm>1.87)均大于1,说明这3个马鹿种群间存在着丰富的基因流,并建议将3个地区的西藏马鹿作为一个管理单元进行保护和管理。
关键词
西藏马鹿
粪便DNA
cty
b
遗传多样性
西藏
Keywords
Ti
b
et red deer(Cervus elaphus wallichi)
fecal DNA
cty b
genetic diversity
Ti
b
et
分类号
S829.9 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
管蚜蝇族7种食蚜蝇Cty b基因序列差异及系统进化关系
被引量:
5
2
作者
张宏杰
霍科科
机构
陕西理工学院陕西省资源生物重点实验室
出处
《汉中师范学院学报》
2004年第6期54-59,共6页
基金
陕西省教育厅科研基金资助项目(02JK196)
文摘
采用PCR和测序方法,首次获得管蚜蝇族(Eristalini)7种食蚜蝇线粒体基因组的Ctyb基因部分序列(419bp).经对位排列,序列间未见有插入和缺失,共检测到119个可变核苷酸位点,变异率为28 40%,其中简约位点74个.属内序列差异值在5 01%~9 55%之间,属间序列差异值在10 02%~16 23%之间.以直翅目的中华稻蝗为外群,用多种方法构建进化关系树,结果类似.从4个属间关系来看,管蚜蝇属和斑眼蚜蝇属首先聚合为姊妹群,BCL值为61%,其次与条胸蚜蝇属聚合,BCL值为89%,宽盾蚜蝇属最后聚合.管蚜蝇族的4个属的聚类系统发生树为单系.
关键词
系统进化关系
b
基因序列
序列差异
属间关系
直翅目
线粒体基因组
中华稻蝗
首次
系统发生树
PCR
Keywords
Eristalini
Diptera
cty b
DNA sequence
phylogeny
分类号
Q959.842 [生物学—动物学]
R373 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于线粒体Cty b基因的西藏马鹿种群遗传多样性研究
刘艳华
张明海
《生态学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
14
下载PDF
职称材料
2
管蚜蝇族7种食蚜蝇Cty b基因序列差异及系统进化关系
张宏杰
霍科科
《汉中师范学院学报》
2004
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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