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月月竹竹秆变色后全长转录组分析
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作者 邵欣瑜 熊星 +3 位作者 杨峰 赵云飞 刘昌来 刘国华 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第3期538-551,共14页
为探究月月竹竹秆受到光照由绿色变为紫色的分子机制,本研究采集月月竹同一竹节紫色部分(Z)、渐变部分(M)和绿色部分(L)的竹青,提取RNA,利用PacBio Sequel三代全长转录组测序技术,结合生物信息学方法对不同颜色的竹青进行全长转录组分... 为探究月月竹竹秆受到光照由绿色变为紫色的分子机制,本研究采集月月竹同一竹节紫色部分(Z)、渐变部分(M)和绿色部分(L)的竹青,提取RNA,利用PacBio Sequel三代全长转录组测序技术,结合生物信息学方法对不同颜色的竹青进行全长转录组分析。结果表明,经过三代测序和数据质量控制,共获得非冗余转录本66961条,长度为500~3000 bp,平均长度1389.22 bp,序列总长度为93.02 Mbp,N50为1830 bp,G+C碱基含量为49.56%。利用NR、Swiss-Prot、COG、GO、KEGG和Pfam数据库对所有转录本进行功能注释,共有56938条转录本被成功注释,占全部转录本的85.03%;49115条转录本被GO注释,其中催化活性、细胞器、代谢过程分别是GO数据库分子功能、细胞组分和生物过程中含转录本最多的项目;28231个转录本被KEGG数据库注释,其中与碳水化合物代谢和基因翻译相关的转录本最多。结合GO注释和KEGG注释,66961条转录本中有381条转录本与光信号的感受、传递以及光调控相关,包括红光和远红光的受体蛋白PHYA、PHYB及信号通路蛋白PIF3、ELF3,蓝光的受体蛋白CRY、ZTL及信号通路蛋白COP1、SPA1、ELF3、GI、HY5等。类黄酮(包括花青素)代谢、叶绿素合成、类胡萝卜素合成等与植物色素合成相关通路分别含有转录本187条、44条和72条。全长转录本共获得2079个转录因子,其中包括18个由35个转录本编码的与花青素合成相关的R2R3MYB转录因子。CNCI、CPC、Pfam、PLEK等数据库同时注释到的长链非编码RNA(LncRNA)6359个,数量高于孝顺竹等其他竹种。本研究获得了高质量的月月竹竹青全长转录组数据,与竹秆变色相关的红光和蓝光受体及光信号传递蛋白,与花青素、叶绿素和类胡萝卜素合成相关的转录因子及长链非编码RNA(LncRNA),为进一步深入分析月月竹竹秆变色机制提供基础。 展开更多
关键词 月月竹 变色竹秆 全长转录组测序 光信号
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元宝毛竹的秆形特征
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作者 袁金玲 岳晋军 +2 位作者 马婧瑕 于磊 刘蕾 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第5期71-80,共10页
【目的】为数量化地分析元宝毛竹的秆形特征、为其后继的科学研究和开发利用提供依据。【方法】建立元宝毛竹的节间长度、节间歪斜长度、节间直径、节间凹陷深度、节间扁圆指数等性状特征的测量分析方法,并以栽培于浙江省杭州市富阳区... 【目的】为数量化地分析元宝毛竹的秆形特征、为其后继的科学研究和开发利用提供依据。【方法】建立元宝毛竹的节间长度、节间歪斜长度、节间直径、节间凹陷深度、节间扁圆指数等性状特征的测量分析方法,并以栽培于浙江省杭州市富阳区黄公望森林公园的元宝毛竹试验林群体为材料,对其秆形特征进行了测量和分析。【结果】元宝毛竹在节位数1~30的范围内,平均节间长度随着节位数的增加而增大,至第30节达11.06 cm,为同等节位数毛竹节间长的36.87%。相邻的节间交替歪斜,同一节间的长度于不同方向存在变化,以具分枝两侧的节间长度交替最大或最小,而分枝侧垂直方向的节间长度变化幅度较小且均接近平均值。秆基部和上部的节间其歪斜长度较小,秆中部第9~14节的歪斜长度均较大。在节位数1~30的范围内,平均节间直径随着节位数的增加而减小。节间通常双面凹陷,凹陷深度的变化表现为秆基部较小、然后逐渐增大,至秆中部的第10~23节最大,第23~30节又逐步减小;具体表现在秆基部的第1~2节于具分枝的两侧略微凹陷,第2~3节之间有一处不凹陷,随后凹陷方向发生旋转,即第3~30节于具分枝的垂直侧方向上凹陷、且以第10~23节为甚。除基部第1~2节外,第3~30节的节间下部凹陷,故上部粗于下部。秆呈扁圆形,第1~2节近圆形,于具分枝两侧的垂直方向上略微扁圆,且节间上部的扁圆指数略大于节间下部;在第2~3节之间扁圆方向发生一次旋转;第3~30节于具分枝的两侧方向上扁圆,且节间上部的扁圆指数均小于节间下部。秆的扁圆指数在第3~15呈逐渐增大趋势,第15~23节扁圆指数均较大,第23节~30节的扁圆指数又逐渐减小,至第30节接近圆形。拓印图和摄影照片均显示显示元宝毛竹的节呈波状。【结论】本文建立了具有节间歪斜且凹陷、秆扁圆形等特异性状的元宝毛竹秆型测量和分析方法,弥补了已有方法仅适于圆筒形秆型的不足。通过该方法首次获得了元宝毛竹详细准确的秆型特征的数量化信息,为其深入开展科学研究和开发利用提供了依据,也为其他特异秆型竹子的研究提供参考。 展开更多
关键词 元宝毛竹 秆形特征 数量化分析 节间长度 节间直径 扁圆形
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Mathematical expression for the relationship between internode number and internode length for bamboo, Phyllostachys pubescens
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作者 A. Inoue K. Kuraoka F. Kitahara 《Journal of Forestry Research》 SCIE CAS CSCD 2012年第3期435-439,共5页
We analyzed the relationship between internode number and intemode length for one of the largest bamboo, Phyllostachys pubescens Mazel ex Houz. For 50 sample culms with various sizes felled in a pure stand of P. pubes... We analyzed the relationship between internode number and intemode length for one of the largest bamboo, Phyllostachys pubescens Mazel ex Houz. For 50 sample culms with various sizes felled in a pure stand of P. pubescens, the intemode number was assigned from base to tip and the length for each internode was directly measured. The result indicated that the intemode length should be cumulated from base to tip, and then the cumulated internode length should be relativized by the total culm length. It was inappropriate to relativize the internode length by the maximum intenode length. In addition, the relationship between the relative internode number (the intemode number relativized by the total number of intemodes) and the relative cumulated internode length should be described not by a power function but by a sigmoid function such as the third-order function. The determined function enabled us to estimate the actual internode length, with the root mean squared error being 4 cm. In conclusion, the mathematical expression presented here, i.e., the relativization of the cumulated internode length by the total culm length and the application of the sigmoid function, will be useful in describing the relationship between internode number and internode length for P. pubescens. 展开更多
关键词 culm form power function relative cumulated internode length relative internode number sigmoid function
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重穗型水稻植株抗倒伏能力的研究 被引量:170
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作者 马均 马文波 +3 位作者 田彦华 杨建昌 周开达 朱庆森 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期143-148,共6页
以 18个不同穗重型水稻品种为材料 ,研究了重穗型水稻植株的抗倒伏能力及其与茎秆的物理性状、机械组织特性的关系。结果表明 :重穗型品种单穗重大、产量高与其株高的适当增加密切相关。重穗型品种由于单穗重和株高的增加 ,弯曲力矩加... 以 18个不同穗重型水稻品种为材料 ,研究了重穗型水稻植株的抗倒伏能力及其与茎秆的物理性状、机械组织特性的关系。结果表明 :重穗型品种单穗重大、产量高与其株高的适当增加密切相关。重穗型品种由于单穗重和株高的增加 ,弯曲力矩加大 ,但抗折力也明显提高 ,故而其茎秆抗倒伏能力并未降低。重穗型品种茎秆抗折力强的主要原因是 :(1)株高的增加主要在上部第 1、2节间 ,基部第 4、5、6节间变化甚小 ;(2 )基部各节间横切面积和茎壁厚度均有明显的增加 ,且茎、鞘干重也大 ,茎秆的充实程度良好 ;(3)茎壁机械组织厚度大 ,表皮细胞壁厚、层数多、厚度大且木质化、纤维化程度高 ,茎秆中维管束数目、面积也明显增多、增大。结果也表明 ,基部节间粗而壮 ,不仅可增强茎秆的抗折力 ,而且与单穗重、产量也呈极显著、显著正相关。本文也讨论了与此有关的育种、栽培技术问题。 展开更多
关键词 重穗型水稻 植株 抗倒伏能力 株高 茎秆物理性状 茎壁组织结构 产量
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水、旱条件下水稻茎秆主要抗倒伏性状的QTL分析 被引量:28
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作者 穆平 李自超 +2 位作者 李春平 张洪亮 王象坤 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第7期717-723,共7页
以粳型旱稻IRAT10 9和粳型水稻越富杂交的 116个DH株系的群体为材料 ,利用已构建的分子标记连锁图 (包括 94个RFLP标记和 71个SSR标记 ) ,定位了水稻茎秆主要抗倒伏性状的QTL。在水田、旱田栽培条件下 ,考查了乳熟期DH系及其亲本的茎基... 以粳型旱稻IRAT10 9和粳型水稻越富杂交的 116个DH株系的群体为材料 ,利用已构建的分子标记连锁图 (包括 94个RFLP标记和 71个SSR标记 ) ,定位了水稻茎秆主要抗倒伏性状的QTL。在水田、旱田栽培条件下 ,考查了乳熟期DH系及其亲本的茎基粗、茎秆长及茎秆强度等性状。相关分析表明 ,茎基粗与茎秆长、茎基粗与茎秆强度及茎秆长与茎秆强度间均呈极显著正相关。利用QTLMAPPER进行水、旱田单环境定位分析及水、旱田联合定位分析定位了控制这些性状的QTL。水、旱田单环境定位分析结果表明 :3个性状共检测到 9个加性QTL和5对上位性QTL ;联合定位分析表明 :茎基粗、茎秆长共检测到 6个加性QTL和 6对上位性QTL ,其中 6个加性QTL和 1对上位性QTL在两种方法下都检测到。旱田条件下检测到 2个加性及 2对上位性QTL(bct1a、cl9、cl6a cl6c和cs5 cs12 )对表型变异的贡献率 (简称贡献率 )大于 30 %。这些高贡献率QTL可能对旱田条件下旱稻抗倒伏分子育种有重要意义。 展开更多
关键词 抗倒伏性 茎基粗 茎秆长 茎秆强度 QTL
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少穗竹种质秆形结构建模研究 被引量:4
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作者 陈红 冯云 +6 位作者 覃道春 岳祥华 周建梅 廉超 徐振国 孙立方 郭起荣 《世界竹藤通讯》 2012年第5期19-22,共4页
通过对少穗竹的胸径、竹高、枝下高、节间长等秆形因子进行了调查分析,结果表明:立竹胸径与竹高具有显著相关性,最佳拟合方程为H=0.1373D+2.1639(R=0.976),H=0.4401D0.7726(R=0.979);立竹胸径与枝下高相关性系数不高;尖削度最佳拟合方程... 通过对少穗竹的胸径、竹高、枝下高、节间长等秆形因子进行了调查分析,结果表明:立竹胸径与竹高具有显著相关性,最佳拟合方程为H=0.1373D+2.1639(R=0.976),H=0.4401D0.7726(R=0.979);立竹胸径与枝下高相关性系数不高;尖削度最佳拟合方程为Y=0.0011X3-0.0246X2+0.0399X+1.0266(R=0.997);节间长随高度的增加先增大,后减小,最大节间长出现在第9~11节处,节长与节间的最佳拟合方程为Y=0.006X3-0.3997X2+6.7965X+9.1536(R=0.984)。 展开更多
关键词 少穗竹 秆形结构 节间长 尖削度 建模
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冬大麦控长型生长调节剂的筛选
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作者 谢志新 丁守仁 +1 位作者 黄继荣 徐绍英 《浙江农业学报》 CSCD 1993年第4期220-224,共5页
1990—91年度在杭州实施了旨在筛选能有效控制冬大麦植株高度的植物生长调节剂的2因素3重复裂区设计田间试验。供试品种为二棱皮大麦浙农大3号(Hordeum distichum L.var. Z.A.U. no.3)、四棱皮大麦威24(H.vulgare L.var. V24)和小麦浙农... 1990—91年度在杭州实施了旨在筛选能有效控制冬大麦植株高度的植物生长调节剂的2因素3重复裂区设计田间试验。供试品种为二棱皮大麦浙农大3号(Hordeum distichum L.var. Z.A.U. no.3)、四棱皮大麦威24(H.vulgare L.var. V24)和小麦浙农大105(Triticum aestivum L.var. Z.A.U.105)。选用了5种植物生长调节剂(组合)于孕穗期一次性叶面喷布。试验结果表明,主处理(PGRs)对收获期植株高度及茎杆平均高度的效应均极显著。其中处理GR90-2,GR90-4及GR90-5的植株高度均较对照显著降低。方差分析显示,PGRs与基因型间存在极显著的交互作用,四棱大麦和小麦不同PGRs处理间的株高变异大于二棱大麦。主处理对籽粒产量的效应显著,但除GR90-5处理的籽粒产量显著低于对照外,其它处理与对照间均无显著差异。对主茎各节间长度的分析表明,除GR90-1外,各处理均使植株的穗下节和倒二节节间显著缩短,其中处理GR90-5还显著缩短了基部第二节间的长度。鉴此,作者认为通过调整喷布时期和剂量,可望获得能有效控制冬大麦基部节间长度,增强植株抗倒伏能力,在正常生长条件下对产量无不良效应的PGRs(组合)。 展开更多
关键词 大麦 生长调节剂 茎秆长度 产量
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冬大麦茎秆生长的化学控制
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作者 谢志新 丁守仁 +1 位作者 黄继荣 徐绍英 《大麦科学》 1993年第3期29-32,共4页
在杭州进行的以二棱皮大麦浙农大3号(Hordeum distichum L. var. Z. A. U no.3)和四棱皮大麦威24(H. vulgare L. var V24)为材料的田间试验结果显示,选用的5种植物生长调节剂(组合)中,GR90—2、GR90—4和GR90—5在孕穗期一次性叶面喷播... 在杭州进行的以二棱皮大麦浙农大3号(Hordeum distichum L. var. Z. A. U no.3)和四棱皮大麦威24(H. vulgare L. var V24)为材料的田间试验结果显示,选用的5种植物生长调节剂(组合)中,GR90—2、GR90—4和GR90—5在孕穗期一次性叶面喷播可有效地降低收获期的植株高度,且除GR90—5处理的行粒产量显著低于对照外,其它处理的籽粒产量与对照均无显著差异。对主茎各节间长度的分析表明:除GR90—1外,生长调节剂处理均使植株的穗下节和倒二节节间显著缩短,其中处理GR90—5还显著缩短了基部第二节间的长度。鉴此,作者认为,通过调整喷播时期和剂量,可望获得能有效控制冬大麦节间长度、增强植株抗倒伏能力,在正常生长条件下对产量无不良影响的生长调节剂配方。 展开更多
关键词 大麦 生长调节剂 茎秆长度
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多效唑对曲阜香稻抗倒性影响的研究
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作者 柯曼琴 徐承水 +2 位作者 卢元芳 张慧 秦月秋 《山东科学》 CAS 1996年第2期63-66,共4页
曲阜香稻拔节后喷洒多效唑.能降低茎秆高度,提高茎基抗折断力;多效唑浓度过大单穗谷重减轻.根据抗倒指数=茎基抗折断力/茎长×单穗谷重的公式计算结果明确了多效哩能增强茎杆抗倒性.试验表明既可增强茎杆抗倒性。
关键词 水稻 曲阜香稻 多效唑 抗倒性 茎杆性状
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