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题名甘蔗细胞色素C基因的电子克隆与分析
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作者
张玉叶
黄宁
肖新换
苏炜华
黄珑
罗俊
阙友雄
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机构
福建农林大学农业部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室国家甘蔗产业技术研发中心
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出处
《生物信息学》
2014年第1期10-17,共8页
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基金
国家自然科学基金(31340060)
教育部博士点基金(20103515120006)
福建农林大学杰出青年基金(xjq201202)
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文摘
以甘蔗类似细胞色素C的EST序列CF576943.1为探针,通过电子克隆技术获得了甘蔗细胞色素C基因(Cytochrome C,Cyt C)的一条cDNA全长序列,命名为ScCyt C。用生物信息学方法对该基因氨基酸序列与组成、亚细胞定位、跨膜区与信号肽、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构以及功能等进行分析与预测。结果表明:Cyt C基因全长1 073 bp,编码112个氨基酸,该基因位于细胞质,为非分泌型蛋白,无规卷曲为主要二级结构原件,含有1个保守功能域,主要功能为翻译并且在不同植物中具有高度保守性。电子表达分析结果显示,该基因在甘蔗各个组织均有表达,其中在茎和根中的表达量比其他组织类型中表达量高,此外,该基因的表达可能受到低温的调控。为甘蔗细胞色素C基因的结构及其功能的研究奠定了一定的基础。
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关键词
甘蔗
cyt
c基因
电子克隆
生物信息学
电子表达分析
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Keywords
Sugarcane
cyt c gene
In silico cloning
Bioinformatics
Electronic expression analysis
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分类号
TS242.1
[轻工技术与工程—制糖工程]
Q753
[生物学—分子生物学]
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