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DEAD box家族蛋白与大肠癌 被引量:4
1
作者 沈翠翠 黄培 《世界华人消化杂志》 CAS 2016年第18期2811-2816,共6页
大肠癌是常见的消化系肿瘤之一,严重威胁着人类健康.DEAD box家族在RNA加工过程中发挥重要作用,能够利用水解ATP产生的能量参与前mRNA剪接、翻译起始、mRNA转运、核蛋白体生成、RNA降解以及线粒体和细胞核内RNA转录后加工等生物学过程.... 大肠癌是常见的消化系肿瘤之一,严重威胁着人类健康.DEAD box家族在RNA加工过程中发挥重要作用,能够利用水解ATP产生的能量参与前mRNA剪接、翻译起始、mRNA转运、核蛋白体生成、RNA降解以及线粒体和细胞核内RNA转录后加工等生物学过程.已有研究表明多种RNA螺旋酶在肿瘤中表达失调,部分RNA螺旋酶参与细胞分化、细胞周期、细胞凋亡、癌基因表达和肿瘤耐药基因表达的调控.本文就DEAD box对大肠癌生理、生化影响的研究进展作一简要综述. 展开更多
关键词 dead box家族 大肠癌 作用机制
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DEAD box家族蛋白与精子生成的研究进展 被引量:2
2
作者 胡秀玉 彭弋峰 《生殖医学杂志》 CAS 2011年第1期73-77,共5页
精子的发生和成熟过程不但需要多种相关基因正确表达,而且还需要多种RNA的参与。因此,这些RNA需要较好的稳定性以保证其功能的正确执行。DEAD-box家族蛋白是一个ATP依赖的RNA解旋酶家族,参与RNA的各种代谢过程如RNA二级结构变换,转录起... 精子的发生和成熟过程不但需要多种相关基因正确表达,而且还需要多种RNA的参与。因此,这些RNA需要较好的稳定性以保证其功能的正确执行。DEAD-box家族蛋白是一个ATP依赖的RNA解旋酶家族,参与RNA的各种代谢过程如RNA二级结构变换,转录起始,线粒体RNA剪接,核糖体和剪接体装配、mRNA降解以及维持mRNA的稳定性等。最近的一些研究显示这个家族的一些成员如DDX3,DDX4,DDX25等与精子生成有着密切的关系。 展开更多
关键词 dead-box家族蛋白 基因 精子生成
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DEAD box-1在儿童常见肿瘤的研究进展
3
作者 方军 丁辉阳 +1 位作者 邓青 刘潜 《赣南医学院学报》 2019年第4期402-404,共3页
DEAD box-1是DEAD-box RNA解旋酶家族成员之一,在细胞内该酶能水解NTP,与其他蛋白组成复合体发挥作用。参与核糖体、RNA 或DNA的结构重塑,影响RNA的生成及RNA的多态性。目前,越来越多的研究表明,DEAD-box 1在肿瘤的发生、发展中起着重... DEAD box-1是DEAD-box RNA解旋酶家族成员之一,在细胞内该酶能水解NTP,与其他蛋白组成复合体发挥作用。参与核糖体、RNA 或DNA的结构重塑,影响RNA的生成及RNA的多态性。目前,越来越多的研究表明,DEAD-box 1在肿瘤的发生、发展中起着重要作用。MYCN基因扩增与多种儿童肿瘤密切相关,是儿童常见肿瘤的重要标记物,研究表明,DEAD box-1基因和MYCN基因在肿瘤中存在共扩增现象。本文根据DEAD box-1基因与儿童常见肿瘤的研究进展,对DEAD box-1与肿瘤关系进行综述。 展开更多
关键词 dead box-1 儿童 肿瘤
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RNA解旋酶DEAD-box蛋白家族与肿瘤的相关性研究
4
作者 武鹏立 刘博 吕洋 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第11期2088-2091,共4页
RNA解旋酶DEAD-box蛋白家族是RNA解旋酶中最大的家族,是基因表达的重要调控因子,在RNA代谢的多个方面发挥作用。RNA解旋酶DEAD-box蛋白家族既在RNA代谢中具有重要作用,又与人类细胞中基因组的不稳定性直接相关。而基因组的不稳定性是癌... RNA解旋酶DEAD-box蛋白家族是RNA解旋酶中最大的家族,是基因表达的重要调控因子,在RNA代谢的多个方面发挥作用。RNA解旋酶DEAD-box蛋白家族既在RNA代谢中具有重要作用,又与人类细胞中基因组的不稳定性直接相关。而基因组的不稳定性是癌症克隆进化的驱动因素,能够促进癌症的发生发展。该文对RNA解旋酶DEAD-box蛋白家族与肿瘤发生发展的相关性做一综述。 展开更多
关键词 dead-box蛋白家族 RNA解旋酶 肿瘤 作用机制
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DEAD-box解旋酶21对猪传染性胃肠炎病毒复制的调控作用
5
作者 谢立兰 尹杰 +1 位作者 黄冬蛾 李么明 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期215-222,共8页
旨在探究DEAD-box解旋酶21(DDX21)对猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)复制的调控作用。首先通过蛋白免疫印迹(Western Blot)分析了TGEV感染对DDX21表达的影响;进一步构建了猪DDX21真核表达质粒以及建立稳定敲低DDX21的PK-15细胞系,运用荧光定量... 旨在探究DEAD-box解旋酶21(DDX21)对猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)复制的调控作用。首先通过蛋白免疫印迹(Western Blot)分析了TGEV感染对DDX21表达的影响;进一步构建了猪DDX21真核表达质粒以及建立稳定敲低DDX21的PK-15细胞系,运用荧光定量PCR(RT-qPCR)、蛋白免疫印迹、间接免疫荧光(IFA)和半数细胞培养物感染量(TCID 50)探究外源过表达DDX21及敲低DDX21对TGEV体外复制的调控作用;构建一系列DDX21截短突变体真核表达质粒,鉴定了DDX21调控TGEV增殖的关键功能域。Western Blot分析显示,在TGEV WH-1株感染早期,PK-15细胞内源性DDX21蛋白的表达水平显著上调;RT-qPCR、Western Blot、IFA和TCID 50试验显示,超表达DDX21可以显著提高TGEV N基因的mRNA水平、N蛋白的表达及病毒滴度,且呈剂量依赖性,其601-784 aa区域是其影响TGEV复制的关键;与阴性对照相比,在相应DDX21敲低细胞系中TGEV的增殖显著被抑制,而回补试验逆转了DDX21敲低细胞系中TGEV的滴度。该研究首次揭示了猪DDX21对TGEV增殖的促进作用并鉴定了其调控TGEV复制的关键结构域,为今后研究DDX21蛋白的功能及TGEV的致病机理提供了理论依据。 展开更多
关键词 猪传染性胃肠炎病毒 dead-box解旋酶21 宿主蛋白 病毒复制
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黄鳝DEAD-box家族PL10基因的克隆与序列分析 被引量:5
6
作者 彭茂宇 宋平 桂建芳 《武汉大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期227-234,共8页
通过PCR克隆的方法,从黄鳝(Monopterus albus)中得到两个PL10 基因的cDNA片段Mo PL10A和Mo PL10B,长度均为1.127 kb,推测其编码375个氨基酸的蛋白片段.结合其他PL10类同源物序列,对这两条cDNA进行了分析和初步的功能推测.根据此片段的... 通过PCR克隆的方法,从黄鳝(Monopterus albus)中得到两个PL10 基因的cDNA片段Mo PL10A和Mo PL10B,长度均为1.127 kb,推测其编码375个氨基酸的蛋白片段.结合其他PL10类同源物序列,对这两条cDNA进行了分析和初步的功能推测.根据此片段的氨基酸序列构建的系统发育树与形态分类结果一致.在不同组织中的RT PCR结果表明Mo PL10A和Mo PL10B的mRNA在各组织中的分布有差异. 展开更多
关键词 黄鳝 PL10 dead-box RNA解旋酶 基因克隆 序列分析 系统发育树
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番茄DEAD-box RNA解旋酶基因SlDEAH1的克隆及表达分析 被引量:3
7
作者 张建苓 陈国平 +3 位作者 朱明库 涂昀 胡功铃 胡宗利 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期44-52,共9页
DEAD-box RNA解旋酶是一种特殊的RNA分子伴侣,参与了RNA代谢,包括前体RNA剪接、核糖体合成、RNA降解以及基因表达,并对植物的发育和抗性等也具有重要作用。根据已报道的拟南芥DEAD-box蛋白,通过同源比对,在NCBI据库中筛选得到一个DEAD-b... DEAD-box RNA解旋酶是一种特殊的RNA分子伴侣,参与了RNA代谢,包括前体RNA剪接、核糖体合成、RNA降解以及基因表达,并对植物的发育和抗性等也具有重要作用。根据已报道的拟南芥DEAD-box蛋白,通过同源比对,在NCBI据库中筛选得到一个DEAD-box RNA解旋酶同源蛋白,命名为SlDEAH1,并根据其基因序列设计特异引物,应用RT-PCR方法从野生型番茄(Solanum lycopersicum)AC++中克隆得到了该基因的全长编码区序列。利用生物学网站、软件及实时荧光定量PCR方法,对其进行生物信息学、表达模式、胁迫及激素处理分析。结果表明:SlDEAH1包括2 073 bp的开放阅读框,编码690个氨基酸残基,其编码蛋白有9个保守结构基序,其所涉及到的ATP结合、ATP水解及RNA结合等功能对于解旋酶活性是至关重要的;表达模式分析表明SlDEAH1基因可能在野生型番茄萼片、叶片发育及果实成熟方面起到重要作用;高温、低温、脱水、伤害、盐胁迫不同程度的诱导了SlDEAH1的表达,但在根中该基因的表达受盐胁迫抑制;ABA、ACC、IAA、GA3、MeJA和ZT均不同程度诱导了SlDEAH1的表达,其中ABA诱导效应最为明显。这些结果为进一步研究SlDEAH1在番茄发育和胁迫响应中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 dead-box RNA解旋酶 SlDEAH1 胁迫 激素 RT-PCR分析
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DEAD-box基因家族在拟南芥生长发育中的作用 被引量:5
8
作者 陈丹 彭雄波 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期941-948,共8页
在RNA代谢过程中,需要许多蛋白和核酸的参与,其中一类蛋白就是RNA解旋酶。RNA解旋酶通过水解ATP获得能量来参与RNA代谢的多个方面,包括核内转录、pre-mRNA的剪切、核糖体发生、核质运输、蛋白质翻译、RNA降解、细胞器内基因的表达。DEAD... 在RNA代谢过程中,需要许多蛋白和核酸的参与,其中一类蛋白就是RNA解旋酶。RNA解旋酶通过水解ATP获得能量来参与RNA代谢的多个方面,包括核内转录、pre-mRNA的剪切、核糖体发生、核质运输、蛋白质翻译、RNA降解、细胞器内基因的表达。DEAD-box蛋白家族是RNA解旋酶中最大的亚家族,它具有9个保守结构域,因motifyⅡ的保守氨基酸序列Asp-Glu-Ala-Asp(DEAD)而命名。该家族在酵母、拟南芥(Arabidopsis thaliana Heynh.)和人类基因组中都有较多的家庭成员。近年来,研究者对拟南芥DEAD-box蛋白家族的结构和功能进行了一些研究,本文着重总结DEAD-box基因家族对拟南芥生长发育的影响。 展开更多
关键词 dead-box 拟南芥 生长发育 RNA解旋酶
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金鱼DEAD-box家族基因p68和p110在配子发生中的表达特征 被引量:1
9
作者 吕道远 叶鼎 +2 位作者 宋平 陈云贵 桂建芳 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期585-590,共6页
利用组织原位杂交技术,以地高辛标记的反义RNA为探针,检测了金鱼(Carassius auratus)DEAD-box家族基因p68和p110在卵子发生及精子发生中的表达分布特点。结果表明:在金鱼配子发生中,p68基因在各个时期的卵母细胞均有表达,Ⅰ、Ⅱ期卵母... 利用组织原位杂交技术,以地高辛标记的反义RNA为探针,检测了金鱼(Carassius auratus)DEAD-box家族基因p68和p110在卵子发生及精子发生中的表达分布特点。结果表明:在金鱼配子发生中,p68基因在各个时期的卵母细胞均有表达,Ⅰ、Ⅱ期卵母细胞中的表达水平较Ⅲ、Ⅳ期卵母细胞中更高。p68基因的表达只限于精原细胞和初级精母细胞中。p110基因在金鱼精子发生各阶段持续表达,其中精原细胞和初级精母细胞中表达水平较高;在卵子发生中,Ⅰ期卵母细胞中没有p110 RNA阳性信号,Ⅱ期卵母细胞中信号较为强烈,但在Ⅲ、Ⅳ期卵母细胞中杂交信号明显减弱。 展开更多
关键词 金鱼 原位杂交 dead-box p68基因 p110基因 卵子发生 精子发生
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MYC-associated protein X binding with the variant rs72780850 in RNA helicase DEAD box 1 for susceptibility to neuroblastoma
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作者 Yaqiong Jin Jin Shi +9 位作者 Huanmin Wang Jie Lu Chenghao Chen Yongbo Yu Yaru Wang Yeran Yang Dong Ren Qi Zeng Xin Ni Yongli Guo 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2021年第6期991-999,共9页
Neuroblastoma(NB)is one of the most common malignant tumors in children,with variable clinical behaviors and a 15%death rate of all malignancies in childhood.However,genetic susceptibility to sporadic NB in Han Chines... Neuroblastoma(NB)is one of the most common malignant tumors in children,with variable clinical behaviors and a 15%death rate of all malignancies in childhood.However,genetic susceptibility to sporadic NB in Han Chinese patients is largely unknown.To identify genetic risk factors for NB,we performed an association study on 357 NB patients and 738 control subjects among Han Chinese children.We focused on DEAD box 1(DDX1),a putative RNA helicase,which is involved in NB carcinogenesis.The potential association of DDX1 polymorphisms with NB has not been discovered.Our results demonstrate that rs72780850(NM_004939.2:c.-1555 T>C)located in the DDX1 promoter region is significantly associated with higher expression of DDX1 transcript and increased NB risk(odds ratio=1.64,95%confidence interval=1.03%–2.60%,P=0.004),especially in aggressive NB compared with ganglioneuroma and ganglioneuroblastoma in a dominant model(TC+CC vs.TT).Furthermore,the MYC-associated protein X(MAX)transcription factor showed stronger binding affinity to the DDX1 rs72780850 CC allele compared with the TT allele,explaining the molecular mechanism of the increased NB risk caused by the rs72780850 polymorphism.Our results highlight the involvement of regulatory genetic variants of DDX1 in NB. 展开更多
关键词 NEUROBLASTOMA RNA helicase dead box 1 SUSCEPTIBILITY
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玉米DEAD-box RNA解旋酶基因的克隆及分析 被引量:5
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作者 张珊珊 陶勇生 +1 位作者 郑用琏 张方东 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期640-646,共7页
DEAD-box RNA解旋酶参与RNA转录、前体mRNA剪切、核糖体发生、核质运输、蛋白质翻译、RNA降解等重要的生命活动.根据本室在S-Mo17Rf3Rf3cDNA芯片研究中,检测到花粉发育后期RNA解旋酶上调表达的结果,应用RACE技术从S-Mo17Rf3Rf3花粉中克... DEAD-box RNA解旋酶参与RNA转录、前体mRNA剪切、核糖体发生、核质运输、蛋白质翻译、RNA降解等重要的生命活动.根据本室在S-Mo17Rf3Rf3cDNA芯片研究中,检测到花粉发育后期RNA解旋酶上调表达的结果,应用RACE技术从S-Mo17Rf3Rf3花粉中克隆得到该RNA解旋酶基因全长cDNA,命名为ZmRH2并在GenBank注册登记(DQ327709).序列分析表明该cDNA全长1652bp,从第163bp开始到1386bp含有一个开放阅读框,编码407个氨基酸.其编码的蛋白质具有DEAD-boxRNA解旋酶特有的9个保守模体,与水稻、拟南芥和豌豆中的DEAD-boxRNA解旋酶的氨基酸序列存在着很高的同源性.RT-PCR分析表明,该基因在近等基因系S-Mo17Rf3Rf3和S-Mo17rf3rf3的叶、根、和雌穗中的表达没有差异,但在花丝和花粉中有明显差异. 展开更多
关键词 玉米 dead-box RNA解旋酶 保守模体 细胞质雄性不育
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DEAD-box家族蛋白在癌症中的研究进展 被引量:7
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作者 文小红 张淑芳 张应爱 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1311-1315,共5页
DEAD-box家族蛋白是一类ATP依赖的RNA解旋酶,在RNA代谢的过程中发挥重要的作用。DEAD-box家族蛋白可通过调节癌基因和抑癌基因的表达及肿瘤相关信号通路等影响细胞的增殖、分化、凋亡,进而发挥促癌或抑癌的作用。
关键词 dead-box家族蛋白 RNA解旋酶 癌症 靶向治疗
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DEAD-box RNA解旋酶5和转录因子12与肌萎缩侧索硬化症的关系 被引量:2
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作者 林宝勇 徐进超 +5 位作者 应涵韬 蒋欣 刘焕彩 王箐 王巧真 陈燕春 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期698-705,共8页
目的通过检测DEAD-box RNA解旋酶5(DDX5)和转录因子12(TCF12)在SOD1-G93A突变型肌萎缩侧索硬化症(ALS)转基因小鼠海马中表达情况及其相互作用关系,揭示DDX5和TCF12表达改变与ALS海马病变的关系。方法将42对SOD1-G93A突变型ALS转基因小... 目的通过检测DEAD-box RNA解旋酶5(DDX5)和转录因子12(TCF12)在SOD1-G93A突变型肌萎缩侧索硬化症(ALS)转基因小鼠海马中表达情况及其相互作用关系,揭示DDX5和TCF12表达改变与ALS海马病变的关系。方法将42对SOD1-G93A突变型ALS转基因小鼠和野生型小鼠,按照95 d龄(发病早期)、108 d龄(发病中期)和122 d龄(发病晚期)分为3组,通过RT-PCR、Western blotting和免疫荧光双标记技术,检测DDX5和TCF12在海马中的表达情况,通过免疫共沉淀技术检测DDX5和TCF12蛋白之间是否具有相互作用。结果与同龄野生型小鼠相比,在SOD1-G93A突变型ALS转基因小鼠海马中DDX5和TCF12 m RNA无明显变化,而蛋白在95 d、108 d和122 d表达均上调,差异均有统计学意义。海马齿状回和海马本部均可见DDX5和TCF12阳性细胞,且DDX5和TCF12在海马神经元中表达。SOD1-G93A突变型ALS转基因小鼠海马中DDX5和TCF12免疫阳性反应均较同龄野生型小鼠增强。免疫共沉淀实验检测发现,DDX5和TCF12蛋白质之间存在相互作用。结论DDX5和TCF12蛋白在SOD1-G93A突变型ALS转基因小鼠海马组织中表达上调,DDX5和TCF12表达异常与ALS海马组织病变有关。 展开更多
关键词 肌萎缩侧索硬化症 dead-box解旋酶5 转录因子12 海马 免疫共沉淀技术 SOD1-G93A转基因小鼠
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小麦DEAD-box基因家族鉴定及其低温下的表达模式分析 被引量:1
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作者 齐越 于晶 +8 位作者 苍晶 田宇 彭瞰看 王多佳 王政委 任治鹏 梁伊 王晓楠 孟婧 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期127-138,共12页
DEAD-box RNA解旋酶是RNA代谢途後中的关键酶,在RNA代谢过程中调控植株的生长发育和抗逆性。目前,尚未见有人对小麦DEAD-box基因家族进行系统鉴定与分析。为探究小麦DEAD-box基因的功能,本研究以水稻DEAD-box基因家族基因为参照,从小麦... DEAD-box RNA解旋酶是RNA代谢途後中的关键酶,在RNA代谢过程中调控植株的生长发育和抗逆性。目前,尚未见有人对小麦DEAD-box基因家族进行系统鉴定与分析。为探究小麦DEAD-box基因的功能,本研究以水稻DEAD-box基因家族基因为参照,从小麦全基因组数据库中共鉴定到134个小麦DEAD-box家族基因,并利用生物信息学对其家族成员的理化性质、基因结构、进化树和共线性进行分析。结果表明,小麦DEAD-box蛋白多数为弱碱性蛋白,亚细胞定位分布广泛,核分布最多;小麦与水稻DEAD-box家族基因亲缘性较高,小麦DEAD-box蛋白结构域与核心基序排列有序稳定,高度保守;小麦DEAD-box家族基因在进化过程中可能发生了节段性复制事件,水稻与小麦DEAD-box基因无序共线性连线,说明DEAD-box基因在进化过程中可能存在染色体异位突变。进一步以强抗寒冬小麦品种东农冬麦1号(Dn1)和东农冬麦2号(Dn2)为材料,对其转录组库中低温差异表达的7个DEAD-box基因进行qRT-PCR分析,结果表明,这7个基因在不同品种和不同组织中表达量均有差异。Dn1中DEAD-box基因的表达量在-10℃达到峰值,而Dn2中DEAD-box基因的表达量在-25℃达到峰值。 展开更多
关键词 小麦 dead-box 生物信息学 QRT-PCR 低温胁迫
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低温诱导型凡纳滨对虾DEAD-box RNA解旋酶基因的克隆与表达分析 被引量:3
15
作者 彭金霞 吕丽虹 +2 位作者 韦嫔媛 何苹萍 陈晓汉 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期474-480,共7页
为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子基础,克隆鉴定了凡纳滨对虾DEAD-box RNA解旋酶的同源基因。根据差减文库中筛选到的一个低温上调表达的DEAD-box RNA解旋酶基因片段,通过RACE PCR扩增获得两条高度相似的c DNA全长序列,两条c DNA均为1430... 为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子基础,克隆鉴定了凡纳滨对虾DEAD-box RNA解旋酶的同源基因。根据差减文库中筛选到的一个低温上调表达的DEAD-box RNA解旋酶基因片段,通过RACE PCR扩增获得两条高度相似的c DNA全长序列,两条c DNA均为1430 bp,包含139 bp 5′UTR、79 bp 3′UTR和1212 bp开放阅读框,编码403个氨基酸残基。Blast比对结果显示,两条c DNA与其他物种的DDX5相似性最高,推测为凡纳滨对虾DDX5基因的两个变异体,分别命名为Lv DDX5variant A(Lv DDX5A)和Lv DDX5variant B(Lv DDX5B),在系统进化树中,Lv DDX5A和Lv DDX5B聚为最近的一支,并与虾类DDX5、文昌鱼DDX、贝类的DDX5距离较近。Real-time PCR分析结果显示,Lv DDX5A和Lv DDX5B都呈多组织遍在表达,在精巢、鳃、肠、肌肉和卵巢中,Lv DDX5B表达量高于Lv DDX5A,而在肝胰腺中Lv DDX5A表达量高于Lv DDX5B。在低温胁迫对虾肝胰腺和心中,Lv DDX5A呈上调表达而Lv DDX5B表达量无明显变化。进一步对Lv DDX5A在不同低温条件胁迫对虾的肝胰腺中表达变化进行了分析。结果显示,Lv DDX5A在18℃、15℃、13℃和11℃低温胁迫36h均被诱导表达,并随着15℃和13℃低温胁迫时间的增加呈先上升后下降的表达模式,在48h达到峰值,Lv DDX5A的低温诱导表达模式暗示其可能是在凡纳滨对虾低温适应中发挥作用的剪接体。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 低温诱导 dead-box RNA解旋酶 耐寒
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低温胁迫下红榄李(Lumnitzera littorea)DEAD-box RNA解旋酶基因的表达分析 被引量:3
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作者 郝露露 柯明思 +3 位作者 朱奕秀 许燕敏 张颖 郑春芳 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期44-55,共12页
转录组分析发现DEAD-box RNA解旋酶家族参与红榄李(Lumnitzera littorea)对低温胁迫的响应。本文对4个低温显著差异表达基因LlDEAD12,LlDEAD32,LlDEAD43和LlDEAD65的生物信息学特性、组织特异性以及在不同温度处理下的红榄李幼苗中的差... 转录组分析发现DEAD-box RNA解旋酶家族参与红榄李(Lumnitzera littorea)对低温胁迫的响应。本文对4个低温显著差异表达基因LlDEAD12,LlDEAD32,LlDEAD43和LlDEAD65的生物信息学特性、组织特异性以及在不同温度处理下的红榄李幼苗中的差异表达进行研究。结果表明,LlDEAD12、LlDEAD32、LlDEAD43和LlDEAD65均属于疏水性蛋白,二级结构均由α-螺旋、β-转角、延伸链和无规则卷曲组成,具有多个糖基化位点和磷酸化位点,且不含有跨膜结构域和信号肽。亚细胞定位分析表明,LlDEAD12和LlDEAD32分别定位于细胞质和细胞核,而LlDEAD43和LlDEAD65则定位于线粒体上。通过蛋白质氨基酸序列的比对分析发现LlDEAD12、LlDEAD32和LlDEAD43分别与马尾松(Pinus massoniana)、巨桉(Eucalyptus grandis)和石榴(Punica granatum)的DEAD-box RNA解旋酶有较近的亲缘关系。荧光定量PCR技术分析发现,LlDEAD12和LlDEAD32在叶中高表达,LlDEAD43和LlDEAD65在茎和花中高表达,但这4个基因在根中都不表达,说明这4个基因对红榄李生长发育的调控主要集中在叶、茎和花等器官。低温胁迫对红榄李幼苗这4个基因的表达均有显著的抑制,说明它们参与了红榄李在低温环境下的分子响应,其中LlDEAD12和LlDEAD32可能参与了叶绿体的发育, LlDEAD43和LlDEAD65可能参与到了维持线粒体功能的稳定。以上结果可为红榄李抗冷性苗木的培育提供科学依据。 展开更多
关键词 红树林 红榄李 dead-box解旋酶 低温胁迫 生物信息学分析
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DEAD-box RNA解旋酶41在髓系肿瘤中的作用机制的研究进展——骨髓增生异常综合征/急性髓系淋巴细胞白血病 被引量:1
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作者 马俊霞 《台州学院学报》 2020年第6期46-51,62,共7页
DEAD-box RNA解旋酶(DEAD-box helicase,DDX)参与RNA代谢的各个过程,包括基因转录、前体RNA剪切、mRNA转运和翻译、核糖体合成以及miRNA的调控等。DDX家族成员的突变对RNA代谢的影响可导致一系列疾病的产生。DEAD-box RNA解旋酶41(DDX41... DEAD-box RNA解旋酶(DEAD-box helicase,DDX)参与RNA代谢的各个过程,包括基因转录、前体RNA剪切、mRNA转运和翻译、核糖体合成以及miRNA的调控等。DDX家族成员的突变对RNA代谢的影响可导致一系列疾病的产生。DEAD-box RNA解旋酶41(DDX41)是DDX家族的一个重要成员,该分子是剪切复合体的一个重要组成成分,其突变可导致个体出现骨髓增生异常综合征,进而导致急性髓系淋巴细胞白血病这一血液恶性肿瘤的出现,严重影响患者的生存和预后。本文就DDX41在上述血液恶性肿瘤中的作用机制的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 dead-box RNA解旋酶41(DDX41) 髓系肿瘤(MN) 骨髓增生异常综合征(MDS) 急性髓系淋巴细胞白血病(AML)
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甘薯盐胁迫诱导IbDEAD1基因的克隆、生物信息学及表达分析 被引量:2
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作者 朱明库 孟小庆 +2 位作者 蔡敬 李格 李宗芸 《江苏师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2017年第3期23-29,共7页
DEAD-box解旋酶是植物中最大的解旋酶家族,不仅在几乎所有涉及DNA/RNA代谢的细胞过程中发挥关键作用,而且还广泛参与植物生长发育与胁迫响应过程.目前,甘薯中有关DEAD-box基因的功能研究尚未见报道.本研究以耐盐性品种徐薯22与盐敏感性... DEAD-box解旋酶是植物中最大的解旋酶家族,不仅在几乎所有涉及DNA/RNA代谢的细胞过程中发挥关键作用,而且还广泛参与植物生长发育与胁迫响应过程.目前,甘薯中有关DEAD-box基因的功能研究尚未见报道.本研究以耐盐性品种徐薯22与盐敏感性品种徐薯32为研究材料,通过RNA-seq及生物信息学分析,首次从甘薯中筛选出一个受盐胁迫诱导的DEAD-box基因,命名为IbDEAD1.根据转录组分析的测序结果设计引物,从徐薯22中克隆出该基因的全长序列(GenBank登录号:MF043568).序列分析表明,IbDEAD1基因包含一个1 701bp的开放阅读框,编码566个氨基酸.序列分析显示IbDEAD1蛋白具有一个DEAD-box蛋白典型的解旋酶中心和多个磷酸化位点,且为DEAD-box RNA解旋酶.系统进化树及qRT-PCR分析均表明,IbDEAD1基因可能在甘薯盐胁迫响应过程中发挥重要作用.这些结果为进一步研究IbDEAD1基因在甘薯盐胁迫响应中的功能奠定了基础. 展开更多
关键词 甘薯 dead-box解旋酶 生物信息学 表达分析
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恶性疟原虫abstrakt同源基因的克隆及DEAD盒家族蛋白的序列分析(英文) 被引量:1
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作者 宋平 张竞男 +3 位作者 Pawan MALHOTRA Narendra TUTEJA Virender Singh CHAUHAN 李奎 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第3期420-430,共11页
DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类参与细胞内几乎所有的RNA代谢过程 ,在几乎所有生物的细胞生长发育过程中扮演着众多不可或缺的角色。在本实验中 ,通过PCR和探针杂交相结合的筛选方法 ,筛选恶性疟原虫 (Plasmodiumfalciparum)... DEAD盒蛋白家族的ATP依赖性的RNA解旋酶类参与细胞内几乎所有的RNA代谢过程 ,在几乎所有生物的细胞生长发育过程中扮演着众多不可或缺的角色。在本实验中 ,通过PCR和探针杂交相结合的筛选方法 ,筛选恶性疟原虫 (Plasmodiumfalciparum)的基因组文库 ,克隆了FH1F———abstrakt同源基因的完整序列。通过搜索已经完成测序的恶性疟原虫基因组数据库 ,推测FH1F序列定位在第 5条染色体上。FH1F全长2 80 4bp,包含一个 1 1 6 1bp的完整阅读框 ,编码一个由 386个氨基酸组成的蛋白。对FH1F蛋白序列用BlastP进行搜索和分析以及用DNAStar与许多典型的DEAD盒蛋白序列进行比对分析 ,结果均提示FH1F蛋白应该是DEAD盒家族的一个Abstrakt蛋白。另一方面 ,用DNAStar对已知所有完整的DEAD盒蛋白进行详细的序列分析以及用Mega对这些序列进行系统发育研究的结果都显示 :DEAD盒家族的蛋白聚类成为若干不同的亚群 ;与DEAD盒蛋白的一般保守序列相比 ,Abstrakt,eIF 4A ,Vasa ,P6 8等不同亚群的DEAD盒蛋白在保守区具有各自不同的结构特征。本文对不同的DEAD盒蛋白的结构特征进行了总结并试图给出不同亚群分类上的结构标准 。 展开更多
关键词 恶性疟原虫 abstrakt 同源基因 克隆 dead 序列分析 RNA解旋酶
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DEAD盒多肽43在肺腺癌组织中的表达 被引量:1
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作者 崔黎 崔莹 +1 位作者 赵娜 陈奎生 《肿瘤基础与临床》 2020年第4期294-297,共4页
目的探讨DEAD盒多肽43(DDX43)在肺腺癌组织中的表达。方法应用免疫组化、荧光原位杂交技术观察DDX43在正常肺组织、肺泡上皮非典型腺瘤样增生及肺腺癌组织中表达情况,并对其数据进行比较分析。结果正常肺组织、肺泡上皮非典型腺瘤样增... 目的探讨DEAD盒多肽43(DDX43)在肺腺癌组织中的表达。方法应用免疫组化、荧光原位杂交技术观察DDX43在正常肺组织、肺泡上皮非典型腺瘤样增生及肺腺癌组织中表达情况,并对其数据进行比较分析。结果正常肺组织、肺泡上皮非典型腺瘤样增生、肺腺癌组织中DDX43蛋白的阳性表达率分别为0.00%、38.71%、88.71%,总体比较差异有统计学意义(χ^2=63.150,P<0.001)。正常肺组织、肺泡上皮非典型腺瘤样增生、肺腺癌组织中DDX43 mRNA的阳性表达率分别为8.06%、38.71%、82.26%,总体比较差异有统计学意义(χ^2=53.124,P<0.001)。肺腺癌组织中DDX43蛋白和mRNA的表达均与其有无淋巴结转移、胸膜侵犯、脉管侵犯有关(蛋白χ^2=3.214,P=0.040;χ^2=14.230,P=0.001;χ^2=10.400,P=0.001;mRNAχ^2=4.590,P=0.030;χ^2=6.223,P=0.008;χ^2=10.400,P=0.001)。结论肺腺癌组织中DDX43高表达,DDX43蛋白、mRNA表达与肺腺癌的发生、发展、浸润、转移有关。 展开更多
关键词 dead盒多肽43 肺腺癌 免疫组化 荧光原位杂交
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