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Cloning, Sequence Analysis, and Prokaryotic Expression of the Porcine DECR1 Gene
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作者 Bugao Li Xiaohong Guo +3 位作者 Guoqing Cao Xiaofen Yang Xiaojing Wang Zhongxiao Zhou 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS 2011年第2期61-67,共7页
2,4-dienoyl-CoA reductase 1 ( DECR1 ) is the key rate-limiting enzyme in the metabolism of polyunsaturated fatty acids. Although this protein has been studied in a variety of mammals, its role in por- cine is yet to... 2,4-dienoyl-CoA reductase 1 ( DECR1 ) is the key rate-limiting enzyme in the metabolism of polyunsaturated fatty acids. Although this protein has been studied in a variety of mammals, its role in por- cine is yet to be fully elucidated. However, it is a candidate determinant/indicator of meat quality, growth traits, and carcass quality. Here, we employed RT-PCR and rapid amplification of cDNA ends (RACE) analysis to amplify the full-length cDNA of DECR1 from Mashen pig liver, and cloned it into the expression vector pET-32a+. After confirmation by sequencing and restriction analysis, the recombinant plasmid was transformed into E. coli BL21 cells. The cDNA of pig DECR1 contained 2,352 nucleotides, including a 987 bp open reading frame flanked by a 53 bp 5'-untranslated region (UTR) and a 1,312 bp 3'-UTR. The pig DECR1 coding sequence encoded 328 amino acid residues, which shared 99%, 88%, 87%, 87%, 87%, 87%, and 83% identity with those of Sus scrofa (predicted), Bos taurus, Homo sapiens, Macaca mulatta, Pan troglodytes, Equus caballus, Canis, and Mus musculus, respectively. SDS-PAGE analysis revealed that the recombinant protein was expressed and that the expression level reached its highest level after 4 h induction. Western blot analysis indicated that the molecular weight of the expressed protein was the same as that predicted, ap- proximately 35 kDa. Collectively these data provide the basis for further studies into the physiological functions and molecular mechanisms of the pig DE- CR1 gene. 展开更多
关键词 CLONING decr1 gene PIG prokaryotic expression RACE sequence analysis
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马身猪和大白猪不同组织DECR1基因的表达 被引量:4
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作者 李步高 郭晓红 +4 位作者 曹果清 王效京 高鹏飞 刘宏 周忠孝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期475-480,共6页
旨在研究DECR1基因在猪不同组织和品种中mRNA和蛋白水平的表达规律,探讨该基因与脂肪代谢的关系。以山西马身猪与大白猪为试验材料,提取肝脏、心脏、肾脏、脾脏、肺脏、胃、小肠、皮下脂肪和背最长肌组织的总RNA和总蛋白,应用实时荧光定... 旨在研究DECR1基因在猪不同组织和品种中mRNA和蛋白水平的表达规律,探讨该基因与脂肪代谢的关系。以山西马身猪与大白猪为试验材料,提取肝脏、心脏、肾脏、脾脏、肺脏、胃、小肠、皮下脂肪和背最长肌组织的总RNA和总蛋白,应用实时荧光定量PCR技术检测DECR1基因在2个品种各组织中mRNA的相对表达量,采用Western blot技术对各组织中DECR1蛋白进行半定量分析。实时荧光定量PCR结果显示:DECR1基因在各组织中均有表达,组织之间的表达量存在极显著差异(P<0.01),DECR1基因在肝脏、皮下脂肪与心脏中为高丰度表达;在不同品种的皮下脂肪组织中,大白猪DECR1的mRNA表达极显著高于马身猪(P<0.01)。Western blot检测结果显示:DECR1在各组织中均有表达,不同组织的表达量存在极显著差异(P<0.01),在皮下脂肪、肝脏与小肠中高表达;不同品种的皮下脂肪组织中,大白猪DECR1蛋白的表达显著高于马身猪(P<0.05)。猪DECR1基因在不同组织的表达差异可能与脂肪代谢和脂肪沉积有关。 展开更多
关键词 decr1基因 实时荧光定量PCR WESTERN BLOT 组织表达
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猪DECR1基因cDNA的克隆、序列分析及原核表达研究 被引量:3
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作者 李步高 郭晓红 +3 位作者 曹果清 杨晓奋 王效京 周忠孝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1371-1378,共8页
旨在研究猪2,4-dienoyl-CoA reductase1(DECR1)基因的结构,揭示该基因的原核表达规律。试验以山西马身猪的肝脏组织为材料,采用RT-PCR与RACE技术克隆了DECR1基因的cDNA全序列,并将其重组于pET32a+原核表达载体中,经酶切、序列鉴定正确后... 旨在研究猪2,4-dienoyl-CoA reductase1(DECR1)基因的结构,揭示该基因的原核表达规律。试验以山西马身猪的肝脏组织为材料,采用RT-PCR与RACE技术克隆了DECR1基因的cDNA全序列,并将其重组于pET32a+原核表达载体中,经酶切、序列鉴定正确后,重组质粒转化大肠杆菌BL21进行诱导表达。结果表明:猪DECR1基因的cDNA全长2352bp,包括987bp的开放阅读框(ORF),53bp的5′非翻译区(UTR)和1312bp的3′-UTR;编码区(CDS)编码328个氨基酸残基与猪(电子预测序列)、牛、人、猩猩、猴、马、犬、鼠相应序列的同源性分别为99%、88%、88%、87%、87%、87%、87%和83%;SDS-PAGE电泳结果显示,在IPTG诱导4h时,外源蛋白表达效率最高;Western blot检测发现经诱导表达的蛋白产物大小约为35ku,与预测的大小一致。猪DECR1基因的克隆和表达研究,为进一步探究该基因的生物学功能及其分子遗传机制提供了理论基础。 展开更多
关键词 decr1基因 克隆 RACE 序列分析 原核表达
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山西白猪DECR1基因多态性与生长性状的关联分析 被引量:2
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作者 李步高 李根银 +3 位作者 王效京 李游山 曹果清 周忠孝 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第12期70-73,共4页
采用PCR-SSCP方法检测了192头山西白猪DECR1基因第5外显子位点的多态性,并采用最小二乘法拟合线性模型(GLM)对该位点多态性与山西白猪生长性状的关联性进行了分析。结果表明,DECR1基因第5外显子位点存在多态性,表现出CC、CD、DD 3种不... 采用PCR-SSCP方法检测了192头山西白猪DECR1基因第5外显子位点的多态性,并采用最小二乘法拟合线性模型(GLM)对该位点多态性与山西白猪生长性状的关联性进行了分析。结果表明,DECR1基因第5外显子位点存在多态性,表现出CC、CD、DD 3种不同基因型。DECR1基因不同基因型对山西白猪6月龄体重、体高和胸围均有显著影响。CD基因型个体6月龄体重、体高、胸围都显著高于DD型个体(P<0.05);3种基因型对体长的影响均未达到显著水平(P>0.05),但呈现出CD>CC>DD的趋势;3种基因型对背膘厚的影响差异不显著(P>0.05),但呈现出CC<CD<DD的趋势。因此,初步推定CD基因型对选择有正向遗传效应。 展开更多
关键词 decr1基因 生长性状 多态性 PCR-SSCP
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猪DECR1基因SNPs筛选及其多态性分析 被引量:1
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作者 黄生强 柳小春 +1 位作者 蒋隽 马乐 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期192-194,共3页
以大白猪、长白猪和杜洛克3个猪种共327头为试验材料,对2,4-dienoyl-CoA reductase 1(DECR1)基因第6至第10外显子区域进行SNPs筛选,分析SNP突变位点的遗传多态性;采用比较基因组方法,根据人DECR1基因全长序列设计引物,筛选猪DECR1基因的... 以大白猪、长白猪和杜洛克3个猪种共327头为试验材料,对2,4-dienoyl-CoA reductase 1(DECR1)基因第6至第10外显子区域进行SNPs筛选,分析SNP突变位点的遗传多态性;采用比较基因组方法,根据人DECR1基因全长序列设计引物,筛选猪DECR1基因的SNP,经PCR-SSCP技术和测序检测,发现Exon6和Exon8区域各存在1个SNP突变位点(C/T,C/G),但Exon6区域的SNP突变是无义突变,而Exon8的是错义突变;在对Exon8 SNP的遗传结构分析中,3个猪种中均检测到CC、CG、GG 3种基因型,说明猪群在该位点均具有丰富的遗传多态性。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 decr1基因 遗传多态性
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The development of the 2,4-dienoyl CoA reductase 1 gene(DECR 1) in pig 被引量:3
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作者 WANG Wentao YANG Xiuqin +1 位作者 HE Xinmiao LIU Di 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2007年第3期241-244,共4页
2,4-dienoyl CoA reductase gene (DECR 1) is mapped on pig 4 q1.2, includes ten exons and nine introns of variable size that span 30 kb. DECR 1 gene participates in the β-oxidation pathway, affects the content of int... 2,4-dienoyl CoA reductase gene (DECR 1) is mapped on pig 4 q1.2, includes ten exons and nine introns of variable size that span 30 kb. DECR 1 gene participates in the β-oxidation pathway, affects the content of intramuscular fatty acid, especially the percentage of linoleic acid. The expression of DECR 1 gene has important influence on IMF, the pH, and the meat colour of pork further affects the meat quality. 展开更多
关键词 decr1 gene meat quality β-oxidation pathway SNPs
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猪2,4-双烯-辅酶A还原酶(DECR1)基因的多态性研究
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作者 李步高 郭晓红 +4 位作者 李根银 王效京 张维军 曹果清 周忠孝 《家畜生态学报》 2009年第6期22-24,39,共4页
选取山西马身猪、山西白猪、长白猪、大白猪和杜洛克猪5个品种共454头,采用PCR-SSCP技术,检测了DECR1基因第5外显子位点的遗传多态性。结果显示,DECR1基因第5外显子位点存在多态性,表现出CC、CD、DD三种不同基因型。群体遗传学分析结果... 选取山西马身猪、山西白猪、长白猪、大白猪和杜洛克猪5个品种共454头,采用PCR-SSCP技术,检测了DECR1基因第5外显子位点的遗传多态性。结果显示,DECR1基因第5外显子位点存在多态性,表现出CC、CD、DD三种不同基因型。群体遗传学分析结果表明,除山西马身猪外,其余品种都是等位基因D为优势基因;Hardy-Weinberg平衡检验显示,长白猪、大白猪、山西白猪处于平衡状态,山西马身猪、杜洛克处于非平衡状态;各品种猪的多态信息含量均表现为中度多态,PIC值均在0.3629~0.3748之间。 展开更多
关键词 decr1基因 PCR-SSCP 遗传多态性
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5个猪种DECR1基因外显子2单链构象多态性的群体遗传学分析 被引量:1
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作者 李根银 王效京 +4 位作者 曹宁贤 刘宏 张维军 曹果清 李步高 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第7期128-131,共4页
试验利用PCR-SSCP技术检测了山西马身猪、山西白猪、长白猪、大白猪和杜洛克猪5个品种共490头猪的DE-CR1基因外显子2的多态性。结果显示,DECR1基因外显子2位点存在多态性,表现出AA、BB和AB 3种基因型。群体遗传学分析结果表明,5个猪种... 试验利用PCR-SSCP技术检测了山西马身猪、山西白猪、长白猪、大白猪和杜洛克猪5个品种共490头猪的DE-CR1基因外显子2的多态性。结果显示,DECR1基因外显子2位点存在多态性,表现出AA、BB和AB 3种基因型。群体遗传学分析结果表明,5个猪种都是等位基因B为优势基因;Hardy-Weinberg平衡检验结果显示,山西白猪和杜洛克猪处于平衡状态,山西马身猪、长白猪和大白猪处于非平衡状态;各品种猪的多态信息含量均为中度多态。 展开更多
关键词 decr1基因 PCR-SSCP 多态性
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