考虑病毒DNA核衣壳和细胞间传播的一般HBV扩散模型

该文综合考虑了诱发HBV感染的两类途径、一般发生率函数和HBV病毒及其核衣壳的扩散效应,建立了一般性的HBV扩散模型.证明了模型解的适定性,两类平衡态的存在唯一性和模型的一致持久性,然后通过构造Lyapunov函数,得出模型的阈值动力学行为.最后结合数值模拟验证理论结果的同时,揭示了扩散对各状态变量的影响,结果显示:扩散影响HBV感染,且扩散系数越大,HBV感染的空间区域越大.

胃癌和癌旁组织DNA含量、细胞增殖活性的定量分析与临床意义

目的探讨胃癌及癌旁组织DNA含量、异倍体、细胞增殖活性与胃癌手术范围及胃癌临床病理因素的关系。方法采用流式细胞术(FCM)对40例胃癌及相应癌旁组织中细胞DNA含量(DI值)、细胞增殖活性(PI值)进行定量检测,并根据DNA含量分析异倍体。结果胃癌组织中DI值为1.35±0.10,PI值为18.25±7.32,异倍体为82.5%,癌旁组织3cm、5cm、7cm、最远端断端,其DI值分别为1.20±0.08、1.05±0.05、1.01±0.03、0.96±0.01,其PI值分别为16.03±6.27、9.98±3.20、9.54±2.23、6.27±2.17,其异倍体率为70.0%、22.5%、17.5%、15.0%。异倍体率、细胞增殖活性与胃癌组织分化程度、浸润深度、淋巴结转移、手术断端癌残留、TNM分期密切相关。结论胃癌、癌旁组织3㎝组DNA含量、细胞增殖活性及异倍体率,高于癌旁组织5cm、7cm、最远端断端组,可作为胃癌手术切除范围的理论依据。异倍体率、细胞增殖活性可作为评价胃癌恶性程度、判断预后的重要指标。

DNA修复率与晚期消化道肿瘤含铂化疗方案疗效相关性的研究

目的探讨晚期消化道恶性肿瘤患者外周血淋巴细胞(PBLC)的DNA修复率(DRR)与含铂联合化疗方案疗效的关系。方法通过单细胞凝胶电泳法检测112例晚期消化道恶性肿瘤患者(肿瘤组)PBLC的DRR,另选取60例健康体检者作为对照(对照组)。肿瘤组患者均接受含铂联合化疗方案治疗并评价近期疗效,分析两组铂类暴露前与暴露修复后的DRR及肿瘤组DRR与临床病理特征及含铂联合化疗方案疗效的相关性。结果利用尾长(TL)和尾相(TM)检测食管癌(Z=-4.687,P=0.000;Z=-4.939,P=0.000)、胃癌(Z=-5.473,P=0.000;Z=-3.789,P=0.000)及结直肠癌(Z=-5.796,P=0.000;Z=-5.206,P=0.000)的PBLC DRR均低于对照组。肿瘤组的PBLC DRR与性别、年龄、ECOG评分、嗜酒习惯和组织分化均无关(P>0.05)。112例患者中110例可评价疗效,其中食管癌PR 3例、SD 6例、PD 12例,有效率(RR)为14.3%,疾病控制率(DCR)为42.9%;胃癌CR 1例,PR 5例、SD 10例、PD 20例,RR为16.7%,DCR为44.4%;结直肠癌CR 2例、PR 8例、SD 13例、PD 30例,RR为18.9%,DCR为43.4%。以TL作为评价DRR的指标,提示食管癌(r=-0.500,P=0.021)、胃癌(r=-0.546,P=0.001)、结直肠癌(r=-0.362,P=0.008)的DRR与化疗疗效均呈负相关,而以TM作为评价DRR的指标则提示食管癌(r=-0.481,P=0.027)和胃癌(r=-0.361,P=0.030)与化疗疗效呈负相关,而结直肠癌(r=-0.256,P=0.064)的DRR与化疗疗效无关。结论消化道恶性肿瘤患者较健康者DNA修复能力低;DRR与晚期食管癌、胃癌患者含铂联合化疗方案的近期疗效呈负相关。

集装箱装载问题的一种DNA遗传算法

三维集装箱装载是一个复杂的组合优化问题,约束条件多,属于NP完全问题,求解难度大.在考虑方向性约束和稳定性约束的情况下,提出了一种DNA遗传算法(DNA-GA),给出了有效的编码和解码方法。实例计算结果表明,利用DNA-GA解决装箱问题是行之有效的一种方法,对推广DNA计算在求解NP难解问题中的应用具有一定的意义。

膀胱癌的Ag-NORs计数与其分级及DNA含量关系的研究

用流式细胞仪(FCM)对37例膀胱癌标本进行DNA的定量测定和核仁组织形成区嗜银蛋白(Ag-NORs)研究。结果显示,二倍体肿瘤的Ag-NORs计数为2.8±0.54,明显低于异倍体肿瘤Ag-NORs的4.2±1.85(P<0.01)。分化Ⅰ级。Ⅱ级、Ⅲ级膀胱癌的Ag-NORs分别为1.9±0.37、2.7±0.62和5.7±1.73,三者间有非常显著性差异(P<0.01)。因此,Ag-NORs可作为膀胱癌定量诊断的新指标应用于肿瘤研究。

3,5-二碘水杨醛缩-2-氨基苯并噻唑schiff碱过渡金属配合物的合成及与DNA的作用

合成3,5-二碘水杨醛缩-2-氨基苯并噻唑schiff碱及其过渡金属(Cu,Zn,Ni,Co)的配合物.用元素分析、UV和IR吸收光谱、TG-DTA分析和摩尔电导率方法表征了配合物的组成和基本性质;通过荧光发射光谱、黏度及其与溴化乙锭(EB)的竞争实验研究了配合物与CT DNA的作用情况.结果表明,该系列配合物的组成为M(NO3)L·H2O;配合物与CT DNA的作用方式为插入模式.另外,4种配合物对藤黄微球菌的抑菌作用明显高于配体.

鸡VCP蛋白全长cDNA的克隆及序列分析

目的获得鸡含缬酪肽蛋白(Valosin-containing protein,VCP)的cDNA和氨基酸序列,为进一步研究VCP和视网膜发育及病变的关系提供理论依据。方法根据已发表的鸡ATP酶p97的基因序列片段设计引物,从白来杭鸡视网膜cDNA文库中获得VCP全基因序列,并进行序列分析和比较。结果获得了VCP的全长cDNA序列,此基因cD-NA全长为有2 916 bp,并有2 421 bp的完整开放阅读框,编码806个氨基酸。鸡VCP的基因及其对应的氨基酸序列与人、小鼠VCP基因及其对应的氨基酸序列高度同源,并具有ATP酶结合位点的高度保守AAA序列。结论获得了全长cDNA序列已在Genbank中登录(AB195711),为从基因及蛋白质水平研究VCP和视网膜发育及病变的关系奠定了基础。

螯型含磷衍生物稀土配合物合成及其在DNA电化学传感器上的应用

设计合成了一种螯型含磷衍生物及其稀土配合物,用1HNMR、13CNMR、红外光谱、元素分析以及差热-热重对结构及其组成进行分析和表征。在pH 7.0的Tris-HCl缓冲溶液中,使用紫外-可见光谱法对该系列稀土配合物与DNA的作用模式进行了研究。通过循环伏安法发现,该系列配合物在测定区间内为电化学活性物质。根据此特性设计以Re(pic)3L为杂交探针的DNA电化学传感器,发现该系列配合物可以识别发生在电极表面的杂交过程,并依杂交序列的不同作出相应的响应。

考虑病毒DNA核衣壳和细胞-细胞感染的HBV感染模型的阈值动力学研究

为研究HBV DNA核衣壳和“细胞-细胞”感染对HBV感染过程的影响,建立了一类具有病毒DNA核衣壳和细胞-细胞感染的HBV感染模型,给出模型的基本再生数,并使用Routh-Hurwitz判据和Lyapunov稳定性理论得到基本再生数的阈值动力学性质.即如果基本再生数小于1,则无病毒感染平衡点是全局渐近稳定的;如果基本再生数大于1,则病毒感染平衡态是全局渐近稳定的.结合Matlab数值模拟验证了模型的理论结果,并揭示细胞-细胞感染将低估HBV感染过程中感染细胞和病毒载量的最终水平.

基于含N、O配体过渡金属配合物的合成及与DNA相互作用研究

合成了金属配合物[Cu 4(bipy)4(OH)4(H_(2)O)(1,3-BDC)](1,3-BDC)·13H_(2)O。并利用紫外光谱法和粘度法,研究了配合物与DNA的相互作用模式。实验结论为,配合物与CT-DNA之间的相互作用模式应该为静电作用或沟槽结合。本文还研究了配合物的核酸酶活性,结果表明,配合物有较好的核酸酶活性。希望本文的研究能为配合物类药物价值研究提供有效的理论依据。

ZSCAN4在早期胚胎及多能干细胞中的作用及调节机制

含有锌指和SCAN结构域的蛋白质4(zinc finger and SCAN domain containing 4,ZSCAN4)在2细胞期胚胎以及胚胎干细胞中作为DNA结合蛋白质特异性表达。ZSCAN4能够调控早期胚胎发育过程,在合子基因组激活(zygotic genome activation,ZGA)期间通过促进DNA损伤修复和纠正染色体异常,以维持植入前胚胎的基因组和染色体完整性。在小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells,mESCs)向2细胞样细胞转换期间,ZSCAN4与ATP依赖性染色质重塑因子相互作用,调节鼠内源性逆转录病毒L(murine endogenous retrovirus L,MERVL)增强子的活性,激活周边的2细胞期基因的表达,促进胚胎干细胞向2细胞样细胞的转变。ZSCAN4还能通过降低DNA甲基化水平同时介导异染色质沉默,并促使端粒重组和端粒延伸,保持基因组稳定性,进一步维持多能干细胞的无限自我更新能力和多能性,促进mESCs向胚胎2细胞样细胞转变。此外,ZSCAN4还能在重编程中重新激活早期胚胎基因,显著提高诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cells,iPSCs)的产生效率,降低iPSCs形成过程中的DNA损伤,并通过延长端粒保持基因组稳定性,从而促进无遗传缺陷和高质量iPSCs的生成。该文围绕ZSCAN4调控早期胚胎发育过程、介导多能干细胞的端粒延长以及在体细胞重编程中的作用等生物学功能展开论述,以期为早期胚胎发育、多能干细胞的维持以及重编程技术的优化提供参考。

化学消毒剂对纤维胃镜消毒效果的实验观察

经试验检测，以有效氯浓度为１０００ｍｇ／Ｌ的８４消毒剂、四环牌清洗消毒剂或８９１消毒剂溶液浸泡纤维胃镜３分钟，可将ＨＢｓＡｇ破坏与ＨＢＶ－ＤＮＡ灭活。在同样条件下，金星消毒液仅能破坏ＨＢｓＡｇ，戊二醛、新洁尔灭、洗必泰与诗乐氏消毒剂溶液对两者均不能破坏。前３种有效消毒液对胃镜有一定腐蚀性，使用亦不理想。

硒化亚油酸与亚硒酸钠抗突变作用的比较研究

本文应用人全血白细胞非程序ＤＮＡ合成（ＵＤＳ）试验，对硒化亚油酸（Ｓｅ－ＬＡ）和亚硒酸钠（Ｎａ２ＳｅＯ３）两者抑制ＭＮＮＧ诱发ＤＮＡ损伤作用进行了观察和比较。结果表明：Ｓｅ－ＬＡ（０．０２３～３．４２４μｇ／ｍｌ）对ＭＮＮＧ诱发ＵＤＳ反应有明显抑制作用，其抑制率远大于含硒量相同的Ｎａ２ＳｅＯ３；０．０５μｇ／ｍｌＮａ２ＳｅＯ３（含Ｓｅ量为０．０２３μｇ／ｍｌ）对ＵＤＳ反应呈最强的抑制率（２１．７％），随Ｎａ２ＳｅＯ３浓度增高，其抑制作用反而降低，说明Ｎａ２ＳｅＯ３作为抗突变剂，它在高剂量时又呈现遗传毒性；当含Ｓｅ量≥０．０４６μｇ／ｍｌ时，Ｎａ２ＳｅＯ３对ＭＮＮＧ诱发ＤＮＡ损伤的抑制作用显著下降，而Ｓｅ－ＬＡ仍保持较高的抑制率（４２．２％～４３．９％）。

CHD5和WWOX基因在胃癌中的表达及其对预后的影响

目的:探讨抑癌基因CHD5和WWOX的蛋白在胃癌中的表达及其对预后的影响。方法:随机选取我院收治的胃癌患者65例,采用免疫组化法检测胃癌组织及相应癌旁组织CHD5和WWOX蛋白的表达及与预后的关系。结果:CHD5和WWOX蛋白在胃癌组织中的阳性表达率分别为36.92%(24/65)和41.54%(27/65),明显低于在癌旁组织的(P<0.05)。在胃癌组织中,CHD5和WWOX蛋白的表达与TNM分期、肿瘤分化程度及淋巴结转移均有关(P<0.05)。生存分析KaplanMeier法显示,CHD5和WWOX蛋白阳性表达的患者1、3年生存率显著高于阴性表达的患者,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论:CHD5和WWOX在胃癌组织中低表达与胃癌的病变程度、侵袭转移及预后不良关系密切,提示CHD5和WWOX蛋白低表达可能参与胃癌的发生、发展及胃黏膜恶性转变等过程。

高选择性端粒G-四链体稳定性配体:9-O-多胺取代小檗碱衍生物的合成及活性评价

设计合成了3个多胺取代的小檗碱衍生物5a～5c,并利用圆二色(CD)光谱、荧光共振能量转移(FRET)熔点实验、荧光光谱和聚合酶链反应(PCR)终止实验等手段研究了小檗碱衍生物5a～5c与端粒DNA的相互作用.结果表明,小檗碱衍生物5a～5c可以诱导端粒DNA序列形成反平行结构G-四链体,显著地提高了端粒G-四链体的稳定性,有效地抑制了端粒的扩增;而与双链DNA的相互作用则很小,是高选择性的端粒G-四链体配体.

抑癌基因WWOX甲基化与肿瘤的研究进展

含WW域的氧化还原酶(WW domain-containing oxidaseredurase,WWOX)是位于人类16号染色体q23.3~24.1脆性位点区域的抑癌基因,WWOX基因参与调控肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭和转移等生物学行为。近年研究发现WWOX基因在乳腺癌、肝癌、胰腺癌、鼻咽癌、肺癌、胃癌、膀胱癌等多种肿瘤中低表达或不表达,可能与DNA甲基化共价修饰抑制其转录有关,DNA甲基转移酶抑制剂去甲基化治疗能内源性地恢复WWOX表达,抑制肿瘤的发生发展。肿瘤的发生由遗传学和表观遗传学共同调控,抑癌基因甲基化是肿瘤早期发生过程中的频发事件,有望成为肿瘤早期诊断、预后评估的潜在标志物和抗肿瘤治疗靶点。本文就WWOX作为抑癌基因,着重阐述其甲基化与肿瘤的研究进展。

Sox2上调EGFR并促进胶质瘤干细胞的自我复制机制的实验研究

目的观察性别决定区Y框蛋白2(Sox2)对表皮生长因子受体(EGFR)的调控及Sox2对胶质瘤细胞成球率的影响。方法构建表皮生长因子同源受体ErbB2、ErbB3、ErbB4启动子报告质粒,并用双报告基因检测分析方法检测Sox2对ErbB2、ErbB3、ErbB4表达的调控;Sox2表达质粒转染胶质瘤U251细胞,采用悬浮成球的方法培养U251细胞并计数成球率,观察U251细胞的自我复制;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测EGFR和ErbB2蛋白的表达情况。结果 Sox2可以增加悬浮培养U251细胞的成球率(P<0.05);上调ErbB2、ErbB3、ErbB4启动子介导的荧光素酶蛋白表达活性,且表现出剂量依赖性。此外,Sox2可以提高EGFR和ErbB2受体的表达。结论 Sox2可以上调EGFR受体并促进胶质瘤干细胞的自我复制。

BRD4、Ki-67、SSBP1水平与胃癌前病变进展的关系及在胃癌早期诊断中的价值

目的分析溴结构域蛋白(BRD4)、核抗原Ki-67(简称Ki-67)、线粒体单链DNA结合蛋白(SSBP1)水平与胃癌前病变进展的关系及在胃癌早期诊断中的价值。方法选择2016年3月至2019年3月在该院普外科接受手术切除或消化内镜黏膜下剥离术(ESD)切除或胃镜活检获得胃组织的267例患者纳入本研究。其中胃组织包括早期胃癌组织82例,胃癌前病变组织135例,正常胃黏膜上皮组织50例。采用免疫组织化学法分析以上组织BRD4、Ki-67、SSBP1表达水平。结果正常胃黏膜、胃癌前病变和早期胃癌组织中Ki-67阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。正常胃黏膜、胃癌前病变和早期胃癌组织BRD4阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。正常胃黏膜、胃癌前病变和早期胃癌组织SSBP1阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论BRD4、Ki-67、SSBP1水平与胃癌前病变的进展存在一定的相关性,可作为预测胃癌前病变的潜在指标进行深入研究。

金黄色葡萄球菌核酸酶基因的片段缺失与定点突变

金黄色葡萄球菌核酸酶R(SNase R)是金黄色葡萄球菌核酸酶(SNase A)的一种类似物,具有与SNaseA相同的酶活性,与SNase A唯一不同之处是在N端多出6个氨基酸残基。为了得到完整的SNase基因并使其在E.Coli中表达,我们利用单链U模板—单引物突变法,将为6个额外氨基酸残基编码的18个氨基酸残基删除,其突变率可达90％。进而,完整的SNase A基因被重组入表达载体pBV221。细菌表达产物的PAGE分析结果指出,SNase A在E.coli中得到高效表达。与此同时,我们利用两个不同的引物在单链U模板上同时介导两种不同类型的突变(片段缺失、碱基取代)其突变率可达83％以上,这为进行多种类型的高效突变提供一个有用的方法。本文也对影响突变率的某些实验因素进行了讨论。

基于phy基因的双边界植物表达载体构建

采用同源克隆方法从泡盛曲霉中克隆了1515bp的植酸酶基因,与黑曲霉(A.niger963)phyA2的核苷酸同源性为95%。以植物表达载体pTTBUG8为基础,构建了由35S启动子调控、具有磷高效利用功能基因(phy)的双边界植物表达载体pBSP。解决了bar基因及其产物PAT蛋白的安全性及产权等问题,并为植物养分高效利用基因工程研究奠定了重要基础。