云烟87突变体新品系的特征特性及其DNA指纹图谱鉴定

为进一步提高目前生产上推广面积最大的烤烟品种云烟87的产量和品质,从云烟87自然变异群体中经系统选择育成2个突变体新品系T24和凹叶烟,对其特征特性进行鉴定,为其生产应用和品种鉴别与保护提供依据。田间试验以主栽烤烟品种云烟87和K326为对照,对T24和凹叶烟的植物学性状、农艺性状、产量和品质进行鉴定;利用简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记,构建T24、凹叶烟及与其亲缘关系较近的云烟87、K326及其突变系片片黄、云烟97及其突变系M97-1、烤烟新品系09-1和客田烟共9个品种(系)的DNA指纹图谱。结果表明:1)T24和凹叶烟的株型、植物学特征及大田生育期与云烟87相似,但有效叶片数、叶片长宽、茎围、株高都超过了云烟87;两者的产量分别为2 247.38和2 195.62kg/hm2,产值为53 657.56和52 586.47元/hm2,上中等烟率为90.59%和90.38%,均高于对照;两者的烟叶还原糖、总糖、淀粉、总植物碱含量等均达到优质烟叶标准;感官评吸评价T24为80.0分,高于云烟87(76.3分)和K326(77.7分),凹叶烟为75.3分。2)从14对SSR的核心引物中筛选出重复性好、多态性好、品种鉴别效率高的4对引物PT20213、PT30028、PT30224、PT30399,在T24、凹叶烟、云烟87、K326等9个品种中扩增出了18条多态性条带;选择其中7个谱带构建了这9个烟草品种的指纹数据库,据此绘制了DNA指纹图谱,建立了这9个品种的鉴别流程,即用至少3对引物可将这9个品种完全鉴别开。上述结果表明:T24的产量和品质均优于云烟87,具有良好的生产应用潜力;构建的参试品种的特异性指纹图谱,可作为品种鉴别的依据。

直接扩增甜瓜小卫星DNA指纹图谱

以小卫星DNA YNZ22核心序列为引物,甜瓜DNA为模板,在甜瓜上研究了直接扩增小卫星DNA(DAMD)的优化反应体系,结果表明:在20μL的反应体系中,5种主要成分Taq DNA聚合酶、Mg2+、引物、模板DNA和dNTPs的最适浓度分别为1U,2.5 mmol/L,0.5 mmol/L,30 ng,5 mmol/L。在优化的DAMD-PCR反应体系下,利用该引物在28个甜瓜品种上构建了直接扩增小卫星DNA(DAMD)的指纹图谱,分析结果表明,该引物在28个甜瓜品种上共扩增出13位点,其中9位点具有多态性,多态性条带比率为69%,可一次性从28个甜瓜品种中鉴别出其中的21个,鉴别率高达75%。

利用SSR分子标记构建‘太湖糯’、‘苏御糯’及部分优质糯稻的DNA指纹图谱

为了探明国内部分优质糯稻资源的遗传背景,从分子水平揭示其遗传多样性,同时为优质糯稻资源的种质鉴定和创新利用提供理论依据,以太湖稻区地产优质糯稻太湖糯、苏御糯和国内其他地区部分糯稻共14个品种为研究材料,利用SSR分子标记进行了DNA指纹图谱的构建,并进行聚类分析,研究其亲缘关系。结果表明,从35对国标中公布的水稻SSR引物中筛选出17对核心引物,在这14个糯稻品种中共检测到63个多态性片段。利用这17对核心引物进行聚类分析,发现供试14个品种的遗传相似系数在0.619以上,表明14个糯稻品种具有较丰富的遗传变异;并利用其中6个引物,经PCR扩增获得的23条清晰、稳定、重复性好的多态扩增条带,建立了14个糯稻品种的DNA指纹图谱。

畜禽DNA指纹的研究与应用

综述了DNA指纹技术的原理、方法，以及在个体（品种）鉴别、亲缘关系分析、群体遗传变异分析、连锁分析等方面的研究进展．

35份甘蔗种质的遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

【目的】利用SRAP分子标记分析35份甘蔗种质的遗传多样性,并构建其DNA指纹图谱,为甘蔗种质资源的分子鉴定提供技术支持。【方法】以凉蔗系列(26份)为主的35个甘蔗品种(系)为供试材料,利用SRAP分子标记的8条正向引物和14条反向引物随机组成112对引物组合,从中筛选出核心引物对35份甘蔗材料进行遗传多样性分析,并利用POPGENE 1.32计算各材料间的Nei’s遗传相似系数,使用Ntsyspc 2.1 UPGMA方法进行聚类分析,并构建DNA指纹图谱。【结果】从112对引物组合中筛选出4对核心引物组合(Me3/Em8、Me4/Em8、Me5/Em8和Me6/Em2),利用其从35份甘蔗材料中共扩增出102条条带,平均每对引物的扩增条带数、多态性条带数和多态性比率分别为25.5条、21条和81.20%,各引物组合扩增的条带数为21~30条,多态性比率为61.90%~96.55%。根据Nei’s遗传相似系数,在遗传相似系数为0.751时,可将35份甘蔗材料分为五大类,26个凉蔗系列品种(系)(除凉蔗07-54外)均归在I类和II类,说明凉蔗系列的亲缘关系较近;桂糖73-167和农垦2号分别被单独归为一类,说明这两个品种(系)间及与其他品种(系)间的亲缘关系较远;I类中除凉蔗系列之外,还包括粤糖91-976和ROC16,说明这两个品种(系)有可能是I类中凉蔗系列的杂交亲本或存在血缘关系;II类中除凉蔗系列外,还包括B8、ROC22、ROC24和ROC10,说明这4个品种(系)的亲缘关系较近,ROC系列可能存在II类中凉蔗系列的亲本。利用这4对核心引物组合构建的DNA指纹图谱均可将35份甘蔗材料鉴别开。【结论】35份甘蔗材料的遗传多样性丰富,构建的DNA指纹图谱可用于甘蔗品种(系)鉴定。

宜昌地区杂交籼稻品种DNA指纹图谱构建

通过SSR引物多态性分析,构建了宜昌地区49份杂交籼稻品种的DNA指纹图谱。35对SSR引物共检测到61个多态性位点,其中最少的为2个,最多的为6个,平均每对引物可以检测到2.5个位点。利用10对核心引物,构建了不同杂交籼稻品种DNA指纹图谱,为宜昌地区水稻品种保护和种子鉴定提供了基础。

太湖稻区及国内部分香稻SSR指纹图谱构建及遗传多样性初析

以太湖稻区和国内其他地区的39个香稻品种,以及籼型恢复系2个对照品种为研究材料,利用SSR分子标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。从40对国标中公布的水稻SSR引物中筛选出13对核心引物,在41个水稻品种中共检测到36个多态性片段。据此建立41个水稻品种的DNA指纹图谱,进行聚类分析,发现供试41个品种的遗传相似系数在0.58以上,而供试香稻品种的遗传相似系数在0.64以上,基本反映了不同品种间的亲缘关系。

糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)的AFLP指纹图谱分析

在对糙皮侧耳 (Pleurotusostreatus)的AFLP分析条件进行优化的基础上 ,利用该技术建立了 14株产自不同地区的糙皮侧耳DNA指纹图谱 ,并进行了数据分析。结果表明 ,在合成的 14条引物的不同组合中 ,引物对E 3 M 3可以产生较多的DNA多态片段 ,E AGC M CAT引物对的扩增效果最好 ,共获得 184条DNA扩增带 ,其中多态性条带 10 1条 ,占 5 4 89%。利用UPGMA法对所获数据进行聚类分析 ,计算得到糙皮侧耳菌株之间的遗传距离 ,发现不同品种间遗传距离差异较大 ,从 0 192到 0 75 4 ,说明糙皮侧耳的遗传多样性比较丰富。绘制的指纹分析树状图表明 ,14个糙皮侧耳菌株被分为 6个组群 ,其中P17和杂 3的相似性系数最高 ,达到了 81 2 % ,而侧

我国部分香稻SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析

以太湖稻区和引自国内其它地区的39个香稻品种以及2个籼型恢复系对照品种为研究材料,利用SSR分子标记进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。从已公布的40对水稻SSR引物中筛选出13对核心引物,在这41个水稻品种中共检测到36个多态性片段。据此建立41个水稻品种的DNA指纹图谱,进行聚类分析,发现它们的遗传相似系数在0.58以上,而供试香稻品种的遗传相似系数在0.64以上,基本反映了不同品种间的亲缘关系。

分子标记及其在林木遗传多样性研究中的应用

介绍了RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR等遗传标记技术的基本原理与特点.综述了DNA分子标记在林木遗传多样性研究、林木遗传资源研究、DNA指纹图谱研究和种质资源鉴定等方面的应用及前景.

甜瓜DAMD反应体系优化及指纹图谱分析

以甜瓜DNA为模板,以小卫星DNA YNZ22核心序列为引物,在甜瓜上建立了DAMD的优化反应体系,并用该优化体系分析了28份甜瓜的遗传多样性,开发了一种揭示甜瓜种质间遗传差异的新型分子标记.

SSR分子标记及其在农作物育种中的应用

在概述简单重复序列(SSR)标记的发现过程、结构特征、原理和方法、技术优缺点的基础上,详细介绍此技术在遗传多样性、DNA指纹库、遗传图谱构建和基因定位及分子标记辅助选择等研究上的应用情况,并分析了SSR技术在农作物育种领域的广阔应用前景。

贵州48个玉米杂交种及其亲本SSR指纹图谱的构建与分析

从北京市农林科学院筛选出的100对玉米SSR核心引物中选取20对,利用SSR分子标记技术,构建了贵州省2000年以来审定的48个玉米杂交种及其亲本的数字化指纹图谱。图谱构建所用的20个SSR标记每个位点的等位基因数平均为5.3个,多态信息量平均为0.66,标记索引系数平均为3.58,多态性丰富。图谱中,来自不同地区或不同育种家的同名自交系,有的指纹图谱较一致,有的有差异,有的扩增片段大小不同,有的扩增片段数目也不同;杂交种的谱带表现为偏母型、偏父型、杂种型和双亲互补型4种类型。经验证,建立图谱时所用的材料符合最小品种内变异的原则,表明所建立的图谱是准确的。该图谱对于玉米品种及其亲本的纯度鉴定、真实性鉴定以及维护育种家的权益有一定的应用价值。

澳洲坚果SCoT反应体系的建立及应用

为建立澳洲坚果(Macadamia spp.)的SCoT最适反应体系,用单因素设计方法对影响SCoT-PCR反应体系的主要影响因素进行了优化筛选,并构建了澳洲坚果种质的指纹图谱。结果表明,澳洲坚果的SCoT最适反应体系为:反应体系总体积为20μL,包含2.5 mmol L–1Mg2+,0.3 mmol L–1dNTPs,0.8μmol L–1引物,40 mg L–1模板DNA和1.0 U Taq DNA聚合酶。最适退火温度为50℃。该反应体系对澳洲坚果种质具有良好的稳定性、可靠性和较高的分辨率。选用多态性良好的单引物SC5和引物组合SC34+SC39,可以将12份澳洲坚果种质完全区分开,每份种质都各有独特的指纹图谱,置信概率达到99.988%。构建的SCoT反应体系可为澳洲坚果种质鉴定和遗传多样性分析等提供技术支持。

SSR标记及其在蔬菜育种中的应用

SSR(SimpleSequenceRepeats,SSR)是指以1～6个串联核苷酸为单位的重复DNA序列。因每个SSR序列的基本单元重复次数在不同基因型间差异很大,从而形成其座位的多态性。SSR操作程序包括DNA的提取、DNA的扩增、电泳及染色3个主要环节。SSR技术在蔬菜育种中有着广泛的应用,主要是构建遗传图谱、DNA指纹图谱的建立、种质资源的遗传多样性等方面。

新疆主栽骨干棉花品种指纹图谱构建及纯度鉴定

[目的]构建新疆主栽骨干棉花品种的指纹图谱,分析棉花品种纯度,为棉花品种提供分子鉴定依据。[方法]以典型代表性的新疆北疆早熟棉花主推骨干棉花品种为材料,利用SSR分子标记技术从1000多对SSR引物中筛选出稳定性好、多态性高的25对核心引物构建指纹图谱,从核心引物中筛选10对引物作为标记,分析4个棉花品种的纯度。[结果]检测到等位基因数70个,每个标记检测到的等位基因数介于2~7个,平均2.8个;引物多态信息量(PIC)值介于0.1690~0.8729,平均值为0.6883;利用4个特征引物将4个棉花品种一次性完全区分开,构建供试品种的指纹图谱;利用10对引物检测4个品种的纯度,新陆早6号纯度变化范围85%~100%,系62纯度变化范围95%~100%。[结论]构建了4个棉花品种的指纹图谱及鉴定纯度,系62号纯度最高,为99.5%,新陆早6号纯度最低,为92.0%。

基于SCoT标记血叶兰资源的亲缘关系分析

目的采用SCoT分子标记方法对血叶兰Ludisia discolor及其近缘属植物资源进行亲缘关系及DNA指纹图谱构建,从分子水平对血叶兰及其近缘属种质进行区分。方法使用正交设计方法,对SCoT-PCR反应体系进行优化,筛选适合血叶兰的反应体系、最佳退火温度及SCoT引物。以供试的12份种质资源为材料,利用筛选的引物对其进行分析,用POPgene计算材料间的遗传多样性系数,NTSYS软件进行聚类分析,并构建DNA指纹图谱。结果获得适用于血叶兰的SCoT-PCR反应体系,筛选出12条多态性好的血叶兰SCoT引物,多态性比率为98.98%。根据Nei’s遗传相似系数,在相似系数为0.45时,12份种质资源可被分为3个分支。其中,斑叶兰与7份血叶兰种质归为Ⅰ类,3份金线兰种质为Ⅱ类,而绿石蚕单独聚为Ⅲ类。利用SC8引物构建的DNA指纹图谱即可将12份材料鉴别开。结论12份血叶兰及其近缘属种质具有丰富的遗传多样性,构建的DNA指纹图谱可用于血叶兰及其近缘属品系鉴定。