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Hexabromocyclododecane-induced Genotoxicity in Cultured Human Breast Cells through DNA Damage 被引量:2
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作者 LI Rui Jing GAO Hui +3 位作者 NA Guang Shui LU Zi Hao YAO Yao YANG Fan 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2017年第4期296-300,共5页
To investigate the genotoxicity and reveal the potential toxicological mechanisms of Hexabromocyclododecane (HBCD), human breast cells HBL-100 were exposed to a sequence of HBCD concentrations (0, 5, 10, and 50 mg/... To investigate the genotoxicity and reveal the potential toxicological mechanisms of Hexabromocyclododecane (HBCD), human breast cells HBL-100 were exposed to a sequence of HBCD concentrations (0, 5, 10, and 50 mg/L) for 24 h. With a series of zymology and molecular biology methods, we found that HBCD induced dose-dependent oxidative stress on HBL-100 DNA. As revealed in q RT-PCR, activated prognostic factor ATM down-regulated tumor suppressor gene BRCA1 and prompted DNA repair genes h OGG1 and h MTH1 expression in lower concentrations of HBCD (〈 10 mg/L). However, DNA repair were inhibited as well as cell proliferation rate by higher concentrations of HBCD (50 mg/L). The results inferred that the genotoxicity of HBCD was dose-dependent and related to DNA repair pathway. 展开更多
关键词 dna HBCD Hexabromocyclododecane-induced Genotoxicity in cultured Human Breast Cells through dna Damage
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Detection of Mycoplasma Contamination in Animal Cell Cultures
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作者 赵俊 王兴满 +2 位作者 胡勇 陈敬贤 王明丽 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2009年第4期4-6,33,共4页
[ Objective ] To develop a rapid efficient method for detecting mycoplasma contamination in cell cultures. [ Method] A pair of primers was designed according to two highly conserved nucleotide sequences of the 16S RNA... [ Objective ] To develop a rapid efficient method for detecting mycoplasma contamination in cell cultures. [ Method] A pair of primers was designed according to two highly conserved nucleotide sequences of the 16S RNA from six kinds of mycoplasma that commonly contaminated cells. Then the mycoplasma contamination of 25 cell samples was defected by PCR and DNA fluorescence staining. EResultl When these cell samples were detected by DNA fluorescence staining, the positive rate and probable positive rate were respectively 24% and 16%. And when they were detected by PCR, the positive rate was 36%. [ Condusion] The PCR method is more sensitive and specific than the DNA fluorescence staining, and combining these two methods is the optimal way to detect mycoplasma contamination in cell cultures. 展开更多
关键词 Mycoplasma Cell cultures dna fluorescence staining Polymerase chain reaction
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Rapid Generation of Selectable Marker-Free Transgenic Rice with Three Target Genes by Co-Transformation and Anther Culture 被引量:6
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作者 ZHU Li FU Ya-ping +4 位作者 LIU Wen-zhen HU Guo-cheng SI Hua-min TANG Ke-xuan SUN Zong-xiu 《Rice science》 SCIE 2007年第4期239-246,共8页
The 'double T-DNA' binary vector p13HSR which harbored two independent T-DNAs, containing hygromycin phosphotransferase gene (hpf) in one T-DNA region and three target genes (hLF, SB401, RZ10) in another T-DNA r... The 'double T-DNA' binary vector p13HSR which harbored two independent T-DNAs, containing hygromycin phosphotransferase gene (hpf) in one T-DNA region and three target genes (hLF, SB401, RZ10) in another T-DNA region, was used to generate selectable marker-free transgenic rice by Agrobacterium-mediated transformation. The regenerated plants with both the three target genes and the selectable marker gene hpt were selected for anther culture. RT-PCR analysis indicated that target genes were inserted in rice genomic DNA and successfully transcribed. It took only one year to obtain double haploid selectable marker-free transgenic plants containing the three target genes with co-transformation followed by anther culture technique, and the efficiency was 12.2%. It was also noted that one or two target genes derived from the binary vector were lost in some transgenic rice plants. 展开更多
关键词 anther culture CO-TRANSFORMATION selectable marker-free transgenic plants RICE double T-dna binary vector
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Non-genotoxicity of Dental Monomer Siloranes in the Sister Chromatid Exchange Assay with Cultured Mammalian Cells
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作者 ZHU Qi KOSTORYZ E. L. 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期677-680,共4页
目的:Siloranes是一种含硅的新型牙科复合树脂环氧乙烷单体,较传统的含碳的环氧乙烷单体具有更好的生物相容性。本研究的目的为用哺乳动物细胞培养检测姐妹染色体交换的方法评估Siloranes的基因毒性,并与传统的环氧乙烷比较。方法:研究... 目的:Siloranes是一种含硅的新型牙科复合树脂环氧乙烷单体,较传统的含碳的环氧乙烷单体具有更好的生物相容性。本研究的目的为用哺乳动物细胞培养检测姐妹染色体交换的方法评估Siloranes的基因毒性,并与传统的环氧乙烷比较。方法:研究所用的传统环氧乙烷为CyracureTM UVR6105。Silorane包括Ph-Sil,TET-Sil和二者50/50(w/w)的混合物(3M-ESPE)。用CHO细胞在有或无S9情况下检测姐妹染色体交换(SCE)。Bonferron post hoc统计分析检测有无显著性差异。结果:与溶剂对照相比,在有或无S9情况下,环氧乙烷UVR6105显著性地增加了培养CHO细胞的SCE数目。3种Silorane单体Ph-Sil,TET-Sil或Sil-Mix均未能增加SCE数目。结论:用哺乳动物细胞培养检测姐妹染色体交换的方法评估显示,3种新型Silorane单体Ph-Sil,TET-Sil或Sil-Mix均未检测出基因毒性效果,提示Silorane单体具有较低基因毒性,是适于研发牙科树脂的新型单体。 展开更多
关键词 姐妹染色体交换 dna损伤 细胞培养 Silorane 环氧乙烷
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基于线粒体DNA控制区序列的极边扁咽齿鱼群体遗传研究
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作者 杨濯羽 杜岩岩 +4 位作者 卡伟 焦文龙 王太 张艳萍 达虎 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期79-87,共9页
极边扁咽齿鱼是黄河上游特有的裂腹鱼类,由于人类活动的加剧,使其野生数量急剧下降,近年来通过增殖放流的方式为野生资源量进行补充。为评价增殖放流过程中人工繁育群体对野生群体的种质资源的影响,笔者利用线粒体DNA控制区(D-loop)序... 极边扁咽齿鱼是黄河上游特有的裂腹鱼类,由于人类活动的加剧,使其野生数量急剧下降,近年来通过增殖放流的方式为野生资源量进行补充。为评价增殖放流过程中人工繁育群体对野生群体的种质资源的影响,笔者利用线粒体DNA控制区(D-loop)序列来探究极边扁咽齿鱼野生和养殖的4个群体遗传多样性、遗传分化及遗传结构的差异。研究结果显示,4个群体均表现出了较高的单倍型多样性(0.950±0.011)和较低的核苷酸多样性(0.00987±0.00041),并且野生群体的单倍型数目、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数均高于人工繁育群体。遗传结构分析结果显示,野生群体与人工繁育群体之间已产生了一定的遗传分化。中性检验表明,2个野生群体可能经历过种群扩张事件。研究结果表明,极边扁咽齿鱼人工繁育群体可能受到亲本数量有限、人工选择等影响,遗传多样性略有降低,有必要定期开展增殖放流效果的评估,并采用科学的人工繁育方法,丰富极边扁咽齿鱼种群的遗传多样性。 展开更多
关键词 极边扁咽齿鱼 线粒体dna控制区 野生群体 人工繁育群体 遗传多样性
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结核菌培养联合结核分枝杆菌-DNA检测对菌阴肺结核诊断效能的研究
6
作者 陈菊 陈建仁 吴修宇 《中国医药科学》 2024年第17期152-155,共4页
目的探究结核菌培养联合结核分枝杆菌-DNA检测对菌阴肺结核的诊断效能。方法选取2021年9月至2022年9月阳江市公共卫生医院收治的188例疑似菌阴肺结核患者,均进行结核菌培养、结核分枝杆菌-DNA检测。以组织培养及病理检查为“金标准”。... 目的探究结核菌培养联合结核分枝杆菌-DNA检测对菌阴肺结核的诊断效能。方法选取2021年9月至2022年9月阳江市公共卫生医院收治的188例疑似菌阴肺结核患者,均进行结核菌培养、结核分枝杆菌-DNA检测。以组织培养及病理检查为“金标准”。比较结核菌培养、结核分枝杆菌-DNA检测单独检测、联合检测菌阴肺结核的诊断结果以及诊断效能。结果188例疑似菌阴肺结核患者中132例确诊为阳性,结核菌培养检测检出阳性115例,阴性73例;结核分枝杆菌-DNA检测检出阳性107例,阴性81例;联合检测检出阳性134例,阴性54例。结核菌培养联合结核分枝杆菌-DNA检测对菌阴肺结核的灵敏度、阴性预测值、准确率(91.67%、79.63%、87.23%)高于结核菌培养检测(78.79%、61.64%、79.26%)、结核分枝杆菌-DNA检测(75.00%、59.26%、78.19%),差异有统计学意义(P<0.05)。结核菌培养联合结核分枝杆菌-DNA检测对菌阴肺结核的特异度、阳性预测值(76.79%、90.30%)与结核菌培养检测(80.36%、90.43%)、结核分枝杆菌-DNA检测(85.71%、92.52%)比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论结核菌培养联合结核分枝杆菌-DNA检测对菌阴肺结核进行诊断,有利于提升诊断灵敏度、阴性预测值、准确率,诊断效能较高。 展开更多
关键词 结核菌培养 结核分枝杆菌-dna检测 菌阴肺结核 诊断效能
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营养条件对pcDNA3-HBS质粒DNA生产的影响 被引量:8
7
作者 王志军 乐国伟 +1 位作者 施用晖 汪垣 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期310-313,共4页
为了考查营养条件对质粒DNA的生产影响 ,采用不同的培养基培养含pcDNA33 HBS质粒的大肠杆菌JM10 9。实验结果表明 :碳源、氮源对质粒DNA产量有明显的影响。葡萄糖是质粒合成过程中较佳的碳源 ,蛋白胨是较佳的氮源。在M9P培养基中 ,选择... 为了考查营养条件对质粒DNA的生产影响 ,采用不同的培养基培养含pcDNA33 HBS质粒的大肠杆菌JM10 9。实验结果表明 :碳源、氮源对质粒DNA产量有明显的影响。葡萄糖是质粒合成过程中较佳的碳源 ,蛋白胨是较佳的氮源。在M9P培养基中 ,选择合适的硫酸铵浓度对质粒DNA的生产有一定的作用。由于Gly ,Asp ,Glu能提供合成核苷酸的氮源 ,在M9G培养基中添加 1 2g L的Asp ,1 0g L的Glu和 0 4g L的Gly后 ,经 2 0h培养 ,质粒产量可达 2 5mg L。外源核苷也影响质粒DNA的产量 ,通过添加 0 4g L胞苷与胸苷的混合物 (摩尔比为 1∶1)到M9P培养基中 ,质粒DNA的产量可达 35mg L。 展开更多
关键词 质粒dna dna疫苗 氨基酸 核苷 培养基 营养条件
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组培枣苗基因组DNA提取方法及其含量的比较 被引量:7
8
作者 陈宗礼 陈昱宇 +2 位作者 王睿婷 陈国梁 齐向英 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期110-116,共7页
本文以组培二倍体木枣、四倍体变异苗和二倍体京枣苗为供试材料,采用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度检测技术,研究了不同提取方法对其叶片基因组DNA的提取效果。结果表明,CTAB法提取枣叶片DNA的效果优于SDS法,表现为蛋白质杂质干扰少,DN... 本文以组培二倍体木枣、四倍体变异苗和二倍体京枣苗为供试材料,采用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度检测技术,研究了不同提取方法对其叶片基因组DNA的提取效果。结果表明,CTAB法提取枣叶片DNA的效果优于SDS法,表现为蛋白质杂质干扰少,DNA结构完整、纯度与得率高;用不同方法提取的样液中DNA片段的大小和分布是不同的,以改进的CTAB法提取的样液中大片段的DNA分子较多,所以在其底部分布较多,而用SDS法提取的样液中小片段的DNA分子较多,故在其上部分布较多;电泳时不同的加样量获得的DNA带也有较大差异,试验选出CTAB法提取样液的适宜的加样量为5μL(7.485μg),SDS法提取样液的适宜的加样量为4μL(5.988μg);枣品种间DNA的含量明显不同,木枣四倍体的DNA含量(3.074μg/μL)相当于组培木枣二倍体(1.497μg/μL)的2倍,也明显地高于京枣二倍体(2.182μg/μL)。这些结果为枣树遗传种质资源的研究奠定了一定的科学与技术基础。 展开更多
关键词 组培枣 基因组dna 提取方法 dna含量
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应用DNA芯片技术研究体外表达禽致病性大肠杆菌可能致病基因 被引量:7
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作者 宦海霞 周琼 +2 位作者 赵李祥 高崧 刘秀梵 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期103-111,共9页
应用DNA芯片研究禽致病性大肠杆菌可能致病基因的表达。构建禽致病性大肠杆菌毒力基因、潜在毒力基因的DNA芯片,应用基因芯片技术对同属O2血清型的禽高致病性大肠杆菌E058株和低致病性大肠杆菌E526株在体外LB培养基和鸡血清培养状态下... 应用DNA芯片研究禽致病性大肠杆菌可能致病基因的表达。构建禽致病性大肠杆菌毒力基因、潜在毒力基因的DNA芯片,应用基因芯片技术对同属O2血清型的禽高致病性大肠杆菌E058株和低致病性大肠杆菌E526株在体外LB培养基和鸡血清培养状态下进行差异表达分析。结果:在体外LB静置培养状态下,低致病株E526与高致病株E058相比共有16个差异基因,均为下调基因。在鸡血清静置培养中,E526与E058相比共有15个差异基因,均为下调基因。应用基因芯片成功筛选了禽致病性大肠杆菌在体外不同条件下的毒力基因及可能毒力基因中差异表达基因,表明一些铁摄取系统相关基因对APEC的毒力较重要,同时也筛选出了一些新的可能致病基因aes-1,aes-2,aes-3,aes-4,aes-6,aes-8,aes-10,aes-13,aes-15,aes-31等。 展开更多
关键词 禽致病性大肠杆菌 毒力基因 体外培养 基因表达 dna芯片
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原儿茶酸等化合物对HBV DNA转染人肝癌细胞株的作用 被引量:28
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作者 刘厚佳 胡晋红 +3 位作者 孙莲娜 蔡溱 石晶 刘涛 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第7期661-663,共3页
目的 :考察原儿茶酸等化合物对乙型肝炎病毒 (HBV)抗原及 DNA表达的抑制作用。方法 :以 HBV DNA转染人肝癌细胞所得的 Hep G2 .2 2 15为模型 ,EL ISA法检测用药后培养上清中 HBs Ag、HBe Ag的含量变化 ,Southern印迹检测用药后细胞内 HB... 目的 :考察原儿茶酸等化合物对乙型肝炎病毒 (HBV)抗原及 DNA表达的抑制作用。方法 :以 HBV DNA转染人肝癌细胞所得的 Hep G2 .2 2 15为模型 ,EL ISA法检测用药后培养上清中 HBs Ag、HBe Ag的含量变化 ,Southern印迹检测用药后细胞内 HBV DNA的变化。结果 :EL ISA检测结果表明 ,6种受试组分中有 4种化合物对 HBV抗原的表达均表现出一定的抑制作用 ,其中原儿茶酸对 HBe Ag的抑制率要高于对 HBs Ag的抑制率。 Southern印迹显示原儿茶酸在 70μg/ ml时对 HBVDNA的抑制率为 46 .5 4%。结论 :原儿茶酸对于 Hep G2 .2 2 15细胞系中的 HBV复制有较强的抑制作用 ,且该抑制效果可能与直接抑制病毒 DNA有关。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 肿瘤细胞 抗病毒药 dna复制
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仰韶文化人类遗骸古DNA的初步研究 被引量:6
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作者 赖旭龙 杨淑娟 +6 位作者 唐先华 施苏华 李润权 杨洪 高强 李涛 盛桂莲 《地球科学(中国地质大学学报)》 EI CAS CSCD 北大核心 2004年第1期15-20,共6页
近 2 0年来 ,古DNA研究技术和方法已迅猛发展 .目前从古人类残骸中获取DNA序列 ,进而讨论人类的演化、亲缘关系和迁移成为分子人类学的一个重要方向 .本研究对采自陕西临潼仰韶文化 6 0 0 0多年前的姜寨遗址第一期和第二期文化层中的古... 近 2 0年来 ,古DNA研究技术和方法已迅猛发展 .目前从古人类残骸中获取DNA序列 ,进而讨论人类的演化、亲缘关系和迁移成为分子人类学的一个重要方向 .本研究对采自陕西临潼仰韶文化 6 0 0 0多年前的姜寨遗址第一期和第二期文化层中的古人类残骸进行古DNA提取、扩增和测序 ,获得了 16 9bp的线粒体高变控制区Ⅰ的古DNA片段 ,与现代西安人同源性序列有 2个位点的突变 .另外 ,通过在不同实验室进行重复性实验和系统发育分析等方法详细地论证了所获得的DNA序列的可靠性 .在所研究的 6个姜寨遗址样品中有 3个样品获得古DNA序列 ,古DNA的提取成功率为 5 0 % ,高于一般的古DNA研究材料的提取率 ,说明姜寨遗址的人类残骸是研究古DNA的理想材料 ,为今后从分子水平上研究姜寨遗址及其他同地区仰韶文化遗址的古人类墓葬及中国古人类分子演化关系奠定了基础 . 展开更多
关键词 考古 仰韶文化 姜寨遗址 dna 可靠性分析 人类遗骸
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基于文化遗传算法的DNA编码序列设计 被引量:3
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作者 王延峰 牛莹 +1 位作者 崔光照 张勋才 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2008年第36期61-65,共5页
DNA编码问题是DNA计算的关键,然而,它已被证明为NP困难问题,通常采用优化算法求解。针对传统遗传算法缺乏有效指导,容易陷入局部极值的缺点,结合文化算法采用种群空间和信念空间的双层进化结构进行寻优,提出了一种基于遗传算法和文化算... DNA编码问题是DNA计算的关键,然而,它已被证明为NP困难问题,通常采用优化算法求解。针对传统遗传算法缺乏有效指导,容易陷入局部极值的缺点,结合文化算法采用种群空间和信念空间的双层进化结构进行寻优,提出了一种基于遗传算法和文化算法的混合优化算法用于解决DNA编码问题。仿真结果表明该混合算法能有效地用于DNA编码序列设计。 展开更多
关键词 dna编码 遗传算法 文化算法 dna计算
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植物组织培养过程中的DNA甲基化研究进展 被引量:4
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作者 石鹏 王永 +4 位作者 金龙飞 张大鹏 赵志浩 曹红星 雷新涛 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第1期199-207,共9页
组织培养是植物无性繁殖和遗传转化的重要技术基础。组织培养包括外植体脱分化、愈伤组织形成、再分化等过程,最后形成新的植株。在植物组织培养过程中,DNA甲基化模式不断发生变化,表明植物细胞发生了大量的表观遗传重编程事件。一般来... 组织培养是植物无性繁殖和遗传转化的重要技术基础。组织培养包括外植体脱分化、愈伤组织形成、再分化等过程,最后形成新的植株。在植物组织培养过程中,DNA甲基化模式不断发生变化,表明植物细胞发生了大量的表观遗传重编程事件。一般来说,DNA甲基化可以促进或加快组织培养过程,对于许多很难进行组织培养和再生的植物来说非常重要。本文主要总结了植物组织培养过程中DNA甲基化模式的变化规律和分子机制,以及新的研究手段和思路,旨在为开展植物组织培养过程中的DNA甲基化研究提供帮助。 展开更多
关键词 植物 组织培养 dna甲基化
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过氧化氢诱导肠上皮干细胞DNA氧化损伤模型的建立 被引量:7
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作者 蔡善荣 郑树 +1 位作者 张苏展 彭佳萍 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2006年第4期366-369,376,共5页
目的:探索建立过氧化氢诱导肠上皮细胞DNA氧化损伤模型,以便在体外进一步研究DNA氧化损伤在大肠癌发生发展中的作用。方法:过氧化氢以RPM11640培养基稀释成100、50、10、5、μmol/L5个浓度,以RPMI1640培养荆作空白对照。作用人胎... 目的:探索建立过氧化氢诱导肠上皮细胞DNA氧化损伤模型,以便在体外进一步研究DNA氧化损伤在大肠癌发生发展中的作用。方法:过氧化氢以RPM11640培养基稀释成100、50、10、5、μmol/L5个浓度,以RPMI1640培养荆作空白对照。作用人胎肠上皮干细胞不同时间(10min、30min、1h、1.5h、12h、24h)后,以MTT法检测细胞生存状况,以免疫组织化学方法检测DNA特异性氧化损伤产物8-羟-2-脱氧鸟苷(8-OhdG),用SPSS10.0软件以线性回归方法检验肠上皮干细胞在不同时间的生存率变化趋势。结果:MTT活性检测结果表明,在10~30min时,各浓度过氧化氢作用后的细胞活性较高,为60%~80%,但随时间推移,细胞活性下降,至24h,降至30%左右,时间趋势检验表明,除100、50μmol/L过氧化氢组和空白对照组外,其余各组的生存率随过氧化氢作用时间的延长,生存率下降,时间趋势差异具统计学意义。过氧化氢作用时间在10~30min内,100、50μmol/L组的细胞活性明显低于1~10μmol/L组20%左右,但在1.0h以上各组,虽然过氧化氢浓度不同,但在同一作用时间内细胞活性无明显差别。过氧化氢处理肠上皮细胞15min后进行8-OhdG免疫组织化学检测,结果除对照组阴性外,其余各组肠上皮细胞在不同浓度过氧化氢作用后的胞核及胞浆染色均呈棕褐色,为阳性。结论:过氧化氢能诱导肠上皮细胞发生DNA氧化损伤,肠上皮细胞DNA氧化损伤模型的条件以1~10μmol/L过氧化氢作用10~30min为宜。 展开更多
关键词 dna损伤/药物作用 细胞 培养的 dna氧化损伤 肠上皮干细胞 过氧化氢 8-OHDG
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砷致HeLa细胞基因组DNA损伤的特点 被引量:3
15
作者 孙树秋 姜树林 +1 位作者 姚洪菊 孙殿军 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期81-83,共3页
目的 观察砷致HeLa细胞基因组DNA损伤的特点。方法 在慧星实验中应用慧星图像分析系统(KIAS)技术。结果 砷剂量与DNA拖尾细胞比率之间存在明确的剂量效应递增关系。而且给药各组与阴性对照组细胞在拖尾形态上存在较大差异。结论 砷致H... 目的 观察砷致HeLa细胞基因组DNA损伤的特点。方法 在慧星实验中应用慧星图像分析系统(KIAS)技术。结果 砷剂量与DNA拖尾细胞比率之间存在明确的剂量效应递增关系。而且给药各组与阴性对照组细胞在拖尾形态上存在较大差异。结论 砷致HeLa细胞基因组DNA的损伤表现出一定的特异性。 展开更多
关键词 细胞培养 dna损伤 彗星实验 HELA细胞
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磁珠法半自动提取全血基因组DNA条件的优化 被引量:14
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作者 凌洁 王昊 +3 位作者 张帅 张丹丹 来茂德 朱益民 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期320-326,共7页
目的:探讨磁珠法提取基因组DNA的影响因素,建立快速、高效、批量提取全血基因组DNA的优化方案。方法:使用磁珠法核酸自动提取系统从全血中提取基因组DNA,紫外分光光度计测定DNA浓度和纯度。采用正交试验设计分析裂解时间、全血量、磁珠... 目的:探讨磁珠法提取基因组DNA的影响因素,建立快速、高效、批量提取全血基因组DNA的优化方案。方法:使用磁珠法核酸自动提取系统从全血中提取基因组DNA,紫外分光光度计测定DNA浓度和纯度。采用正交试验设计分析裂解时间、全血量、磁珠量和乙醇浓度4个因素的主效应和全血量与裂解时间、磁珠量,裂解时间与磁珠量的二阶交互作用对所提取DNA浓度和纯度的影响。结果:裂解时间、全血量、磁珠量和乙醇浓度4个主效应对DNA浓度的影响均存在统计学差异(P<0.05),当裂解时间为15 min,全血量为100μl,磁珠量为80μl,乙醇浓度为80%时,DNA平均浓度最高。磁珠量、裂解时间和全血量的交互作用对DNA OD260/OD280的比值有影响(P=0.008和P=0.013)。当磁珠量为40μl,裂解时间为15 min,全血量为100μl时,OD260/OD280的比值较好。磁珠量和乙醇浓度影响DNA OD260/OD230的比值(P=0.017和P<0.05),磁珠量为40μl,乙醇浓度为80%时,OD260/OD230的比值更好。结论:当DNA得率优先考虑时,可以选择裂解时间15 min、全血量100μl、磁珠量80μl、乙醇浓度80%的提取条件;而对DNA纯度要求较高时,可以将磁珠量改为40μl,以获得最优DNA提取效果。 展开更多
关键词 自动化 磁石 dna/分离和提纯 血液 基因组文库 正交试验 乙醇 细胞 培养的
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番木瓜组培苗叶片基因组DNA的微量提取 被引量:6
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作者 何玮毅 陈晓静 +3 位作者 申艳红 卢秉国 官磊 潘东明 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2009年第1期34-38,共5页
比较了3种从番木瓜组培苗叶片中提取基因组DNA的方法.结果表明:改良CTAB法步骤简单,DNA得率与质量均较高,并能用于转基因植株的PCR检测、限制性内切酶酶切以及后续的反向PCR反应;SDS-KAc法存在RNA残留;试剂盒法的DNA得率与质量均较低.
关键词 番木瓜 组培苗 基因组dna 微量提取
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Zn^(2+)对日本对虾肝胰腺细胞培养及其RNA/DNA比率的影响 被引量:5
18
作者 王宏伟 刘瑞兰 +3 位作者 商利新 赵伟 王维娜 王安利 《上海水产大学学报》 CSCD 2001年第3期282-284,共3页
关键词 日本对虾 细胞培养 RNA/dna比率 肝胰腺细胞 锌离子
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VA菌根真菌对转移Ri T-DNA胡萝卜根器官的侵染 被引量:26
19
作者 毕银丽 汪洪钢 李晓林 《植物营养与肥料学报》 CAS CSCD 1999年第1期76-80,共5页
在无菌条件下观察珠状巨孢囊霉(Gigasporamargarita)对转移RiTDNA胡萝卜根器官的侵染过程。采用发根土壤杆菌(Agrobacteriumrhizogenes)诱导出细胞中整合有RiTDNA胡萝卜... 在无菌条件下观察珠状巨孢囊霉(Gigasporamargarita)对转移RiTDNA胡萝卜根器官的侵染过程。采用发根土壤杆菌(Agrobacteriumrhizogenes)诱导出细胞中整合有RiTDNA胡萝卜的不定根作宿主,比较了孢子的4种表面消毒方法,经过2~3个月的双重培养,看到VA菌根真菌对根器官的侵染,并获得成熟孢子。形成的孢子无须休眠,只要提供发芽条件,就能立即发芽,接种到根的周围又能侵染。文中对侵染的全过程作了较详细的描述。 展开更多
关键词 VA菌根 转移Ri T-dna 胡萝卜根 双重培养
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一种快速提取基因组DNA的方法 被引量:10
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作者 卢瑛 刘照关 +1 位作者 徐宏 古宏晨 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期69-73,共5页
采用氧化硅超顺磁性纳米磁珠和自己设计的试剂体系及提取流程,建立了一种基因组DNA的快速提取方法,该方法以氧化硅磁珠为固相吸附载体,盐酸胍、β-巯基乙醇和SDS为主要裂解吸附试剂。以全血或培养细胞为实验材料进行基因组DNA的提取... 采用氧化硅超顺磁性纳米磁珠和自己设计的试剂体系及提取流程,建立了一种基因组DNA的快速提取方法,该方法以氧化硅磁珠为固相吸附载体,盐酸胍、β-巯基乙醇和SDS为主要裂解吸附试剂。以全血或培养细胞为实验材料进行基因组DNA的提取结果显示建立的方法提取100μl小鼠抗凝血,可得2~3μg基因组DNA,OD260/OD280为1.8±0.05,其纯度可满足后续的酶切和PCR生物操作要求。该方法整个提取过程只需12分钟,不需特殊实验条件同时可省略蛋白酶K的消化过程和离心操作,适用于一般实验室的需求,是一种操作简便、快速高效的提取方法。 展开更多
关键词 氧化硅超顺磁性纳米磁珠 基因组dna 全血 培养细胞
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