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新型超声快速处理活检标本保存不同年限对DNA质量的影响
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作者 石晨曦 朱卫东 +3 位作者 李三恩 李秀明 师逢 丁亚云 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第13期2655-2660,共6页
背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探... 背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探索最佳的标本存储时间。方法:收集40例乳腺穿刺小活检组织,采用超声技术制作石蜡标本,按照存储年限分为4组:<1年组、1-3年组、>3-5年组及>5年组,每组10例,对石蜡标本进行切片,每张切片厚3μm,切片10-15张,提取DNA后通过Nanophotometer N60超微量分光光度计和Qubit 4.0荧光计检测DNA的质量浓度,记录A_(260)/A_(280)比值判定DNA的纯度,利用全自动毛细管电泳核酸分析仪(Qsep 100)检测DNA片段完整性,以评估DNA片段的质量。结果与结论:4组样本A_(260)/A_(280)均值在1.8-2.0之间,达到纯度要求,无明显差异。4组样本的DNA质量浓度(Qubit浓度)均值分别为30.39,14.33,2.52,1.95 ng/μL;DNA的平均N/Q比值分别为6.48,14.18,24.56,29.86;DNA质量数均值分别为5.64,1.76,1.24,0.80;大片段占比均值分别为56.08%,17.72%,12.68%,7.90%。PCR检测内控基因Ct均值分别为15.32,17.09,18.39,21.24。与<1年组相比,其余3组DNA浓度显著降低,N/Q比值显著增加,DNA质量数和大片段占比均值显著降低,Ct值升高,差异有显著性意义(P<0.05)。实验结果表明,对于新型超声处理活检标本,应优先选择存储<1年的样本进行日常分子检测,储存3年内的样本可满足二代测序等检测要求,5年内样本仅可尝试进行PCR等检测,存储超过5年的样本不建议进行后续分子检测。 展开更多
关键词 超声处理 存储年限 dna质量 片段完整性 降解程度 二代测序
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DNA甲基化转移酶1表达水平与急性髓系白血病临床特征的相关性
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作者 余静静 曾雪娇 +2 位作者 仝佳音 闫齐敏 曲建华 《中国急救复苏与灾害医学杂志》 2025年第1期48-52,共5页
目的 探讨DNA甲基化转移酶1(DNMT1)在急性髓系白血病(AML)患者中的表达水平,并分析其与临床特征和分子突变的相关性。方法 本研究纳入34例初诊AML患者和17例复发/难治(R/R)AML患者,另选取同时期50例健康体检的正常受试者作为对照组。通... 目的 探讨DNA甲基化转移酶1(DNMT1)在急性髓系白血病(AML)患者中的表达水平,并分析其与临床特征和分子突变的相关性。方法 本研究纳入34例初诊AML患者和17例复发/难治(R/R)AML患者,另选取同时期50例健康体检的正常受试者作为对照组。通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、蛋白质印迹法(WB)和免疫组织化学染色法,检测了样本中DNMT1的表达水平,并评估了其与临床特征及分子突变的关联。结果 初诊AML组、R/R AML组患者组中DNMT1的表达水平显著高于对照组(F=226.385, P<0.05)。DNMT1表达水平与复发状态、年龄、血红蛋白计数、外周血原始细胞比例、DNMT3A突变、RAS突变和NPM1突变呈正相关(β>0),而与白细胞计数、血小板计数、骨髓原始细胞比例、FLT3突变、IDH1突变和TP53突变呈负相关(β<0)。多因素分析显示,复发状态是DNMT1表达水平的独立危险因素(OR=132.497,95%CI=2.053~8 550.566,P=0.022)。结论 DNMT1的表达水平与AML患者的复发状态、临床参数和分子突变密切相关,可作为AML的潜在生物标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 dna甲基化转移酶1 急性髓系白血病 表达水平 临床特征 相关性分析 生物标志物
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基于中医证候与精液质量相关参数构建精子DNA碎片预测模型与验证
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作者 周超 庾广聿 +4 位作者 阳绍华 高磊磊 金珍 蒋月园 李欢 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第13期2661-2668,共8页
背景:中医证候与精液质量相关参数相结合,共同预测精子DNA碎片指数(DNA fragmentation index,DFI)异常增高的发生并绘制列线图,能显著提高临床的实操性与应用效能,为临床全面评估精液质量,采取积极干预措施以改善临床结局及制定个体化... 背景:中医证候与精液质量相关参数相结合,共同预测精子DNA碎片指数(DNA fragmentation index,DFI)异常增高的发生并绘制列线图,能显著提高临床的实操性与应用效能,为临床全面评估精液质量,采取积极干预措施以改善临床结局及制定个体化医疗方案提供依据。目的:探讨基于中医证候与精液质量相关参数构建精子DNA碎片的预测模型与验证。方法:回顾性分析2019年7月至2021年7月在广西壮族自治区南溪山医院中医男科接受中医证候诊断及精子DNA碎片率检查的不育患者共420例,据《人类精液检查与处理实验室手册》(第6版),将其中137例精子DFI>30%患者纳入精子DFI异常增高组,将283例精子DFI≤30%作为对照组;首先采用单因素分析筛选精子DFI异常增高的影响因素,然后采用套索算法(LASSO)校正因子共线性问题并筛选出最佳匹配因子后,将其纳入多因素向前逐步Logistic回归找出其独立影响因素并绘制列线图,最后采用受试者工作曲线、校准曲线、临床决策曲线、临床影响曲线对该预测模型进行区分度与准确度及临床应用效能验证。结果与结论:①单因素分析结果显示,年龄、体质量指数、前向运动率、精子总活率、精子浓度、精子形态学、肾阳虚衰证、湿热下注证、肾精不足证为引发精子DFI异常增高的影响因子(P<0.05);②通过LASSO回归进一步筛选出的最佳匹配因素为年龄、体质量指数、精子总活率、精子浓度、精子形态学、肾阳虚衰证、湿热下注证、肾精不足证(P<0.05);③多因素向前逐步Logistic回归结果显示年龄、体质量指数、精子浓度、精子总活率、湿热下注证、肾阳虚衰证共6项为引发精子DFI异常增高的独立影响因素;④受试者工作曲线显示,模型组曲线下面积为0.760(0.713,0.806),验证组曲线下面积为0.745(0.714,0.776),说明该预测模型具有较好的区分度;⑤校准曲线平均绝对误差0.040,Hosmer-Lemeshow检验P>0.05,表明该模型预测发生精子DFI异常增高的概率与实际发生精子DFI异常增高的概率无显著统计学差异,证实该模型具有较好的准确度;⑥临床决策曲线与临床影响曲线显示,模型组与验证组分别在阈概率值为0.08-0.84与0.09-0.78时具有临床最大净获益,且在该阈概率范围内具有较好的临床应用效能;⑦结果表明,年龄、体质量指数、精子浓度、精子总活率、湿热下注证、肾阳虚衰证为引发精子DFI异常增高的独立影响因素,通过其构建的临床预测模型列线图具有较好的临床预测价值与临床应用效能,可为临床全面评估精液质量、预后与干预及个体化医疗服务提供依据。 展开更多
关键词 精子dna碎片 精子dna完整性 中医证候 精子dna碎片指数 预测模型
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HBV相关慢加急性肝衰竭恢复期患者肝组织HBV cccDNA水平及其临床意义
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作者 蔡哲凯 徐龙 +4 位作者 刘文丽 肖影群 钟青梅 张伟 吴敏 《临床肝胆病杂志》 北大核心 2025年第1期57-62,共6页
目的观察HBV cccDNA在HBV相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)恢复期患者肝组织中的表达水平,并探讨其与HBV标志物、肝组织病理改变的关系。方法选取2015年1月—2023年10月在南昌市第九医院住院的HBV-ACLF恢复期患者30例为肝衰竭组,另选取同期... 目的观察HBV cccDNA在HBV相关慢加急性肝衰竭(HBV-ACLF)恢复期患者肝组织中的表达水平,并探讨其与HBV标志物、肝组织病理改变的关系。方法选取2015年1月—2023年10月在南昌市第九医院住院的HBV-ACLF恢复期患者30例为肝衰竭组,另选取同期9例性别及年龄匹配的慢性乙型肝炎患者(CHB)作为对照组,检测肝组织HBV cccDNA水平,并分析其与临床资料、实验室检查指标的关联性。计量资料两组间比较采用成组t检验或Mann-Whitney U检验;多组间比较采用单因素方差分析或Kruskal-Wallis H检验。计数资料组间比较采用Fisher精确检验。相关性分析采用Spearman相关分析。结果肝衰竭组肝组织HBV cccDNA水平显著低于对照组[(−0.92±0.70)log10 copies/cell vs(−0.13±0.91)log10 copies/cell,t=2.761,P=0.009]。肝衰竭组中,血清HBeAg阳性与阴性患者肝组织HBV cccDNA水平比较,差异无统计学意义(P>0.05);肝组织炎症活动度G0~G2级、G3级、G4级患者的肝组织HBV cccDNA水平比较,差异无统计学意义(P>0.05);肝组织纤维化程度S0~S2期、S3期、S4期患者的肝组织HBV cccDNA水平比较,差异无统计学意义(P>0.05);血清HBV DNA阴性与血清HBV DNA阳性患者肝组织HBV cccDNA水平比较,差异无统计学意义(P>0.05)。肝衰竭组肝组织HBV cccDNA水平与肝组织HBV DNA水平呈正相关(r=0.426,P=0.043),与血清HBV DNA水平无明显相关性(P>0.05)。结论肝组织HBV cccDNA水平在HBV-ACLF恢复期明显降低,肝组织HBV cccDNA持续稳定存在,较血清及肝组织HBV DNA更能反映HBV的持续感染与复制。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 慢加急性肝功能衰竭 恢复期 共价闭合环状dna
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^(125)I的俄歇电子和氚的β射线细胞S值及DNA损伤模拟研究
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作者 沈江燕 朱坤 +3 位作者 李清 张德颂 李君利 闫聪冲 《原子能科学技术》 北大核心 2025年第2期478-486,共9页
氚的辐射生物效应一直是研究热点,特别是在福岛核电站排放核废水后成为公众关注的焦点。氚极易进入人体并参与机体代谢活动,衰变放出的β射线对人体具有极大的危害,而靶向放射治疗则利用摄入的俄歇电子发射体能够进入癌细胞,并放出俄歇... 氚的辐射生物效应一直是研究热点,特别是在福岛核电站排放核废水后成为公众关注的焦点。氚极易进入人体并参与机体代谢活动,衰变放出的β射线对人体具有极大的危害,而靶向放射治疗则利用摄入的俄歇电子发射体能够进入癌细胞,并放出俄歇电子造成DNA严重损伤这一特性,达到有效杀死癌细胞的目的。为探究β射线在微纳米尺度的辐射生物效应,本研究利用清华大学研发的纳剂量学程序NASIC模拟计算了^(125)I和氚在不同尺度细胞内的细胞S值以及造成的DNA双链断裂(DSB)产额,深入探讨了其DNA损伤机制。结果表明,由于研究方法和粒子截面的不同,细胞S值的计算结果存在偏差,尤其对于S(N←Cy),相对偏差可达26.35%。此外,相较于^(125)I或氚均匀分布在细胞核内,与DNA结合时造成的DSB产额显著增加:^(125)I结合到DNA时的DSB产额是均匀分布时的2倍;而氚结合到DNA中使得DSB产额从1.31×10^(-11)Gy^(-1)·Da^(-1)增加至1.46×10^(-11)Gy^(-1)·Da^(-1)。本研究深入探究了微纳米尺度下放射性核素的损伤作用效应,为精确医疗和环境放射性污染风险评估提供重要的理论基础。 展开更多
关键词 放射性核素 ^(125)I 俄歇电子 氚β射线 细胞S值 dna损伤 蒙特卡罗方法
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FTA-环介导等温扩增技术直接提取变异链球菌DNA的效果评价 被引量:1
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作者 王玥晖 尚进 +4 位作者 杨晨 符冬格 曹灿 张晓东 王敬夫 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第5期1043-1049,共7页
背景:变异链球菌是龋病的重要病原菌,及时检测变异链球菌水平对龋病的早发现、早治疗有重要意义。目的:建立并评价FTA-环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术直接提取变异链球菌DNA的应用效果。方法:①制备... 背景:变异链球菌是龋病的重要病原菌,及时检测变异链球菌水平对龋病的早发现、早治疗有重要意义。目的:建立并评价FTA-环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术直接提取变异链球菌DNA的应用效果。方法:①制备含有ATCC标准菌株变异链球菌的菌悬液,接种于脑心浸出液培养基,充分混匀后按10倍梯度稀释成7种浓度(4.2×10^(7),4.2×10^(6),4.2×10^(5),4.2×10^(4),4.2×10^(3),4.2×10^(2),4.2×10 CFU/mL),每个稀释级做2个平行对照,并增加无菌水作为空白对照;②分别采用FTA卡、常规煮沸法、试剂盒提取及裂解液提取4种方法直接提取菌株DNA,通过LAMP技术进行扩增,并进行特异性试验,比较4种提取方法的差异。结果与结论:①4种方法提取的DNA均满足LAMP扩增的要求;②特异性试验结果显示,只有变异链球菌才可特异扩增出靶基因;③裂解液提取法最低检测限为4.2×10^(3) CFU/mL,FTA卡提取法最低检测限为4.2×10^(4) CFU/mL,试剂盒提取法和常规煮沸法最低检测限分别为4.2×10^(6) CFU/mL和4.2×10^(7) CFU/mL;④4种提取方法其他方面的比较显示,试剂盒提取法的实验成本、步骤数和时间都是最高;其他3种方法步骤数一致,其中FTA卡所需仪器设备最少,常规煮沸法单次成本最低,裂解液提取法所需时间最少;FTA卡和裂解液提取法仅需少量菌即可提取成功,后者在时间方面优于FTA卡,但相较于FTA卡其单次成本高,所需设备多;⑤结果说明,该研究建立的FTA-LAMP技术具有操作简便、特异性强、灵敏度高、结果可视化等优势,有望为高效提取检测变异链球菌提供新途径。 展开更多
关键词 变异链球菌 环介导等温扩增 FTA卡 dna 可视化
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肾移植中供体来源的游离DNA作为潜在的排斥生物标志物的研究进展
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作者 程贤雄 莫银竹 +5 位作者 吕仕杰 胡军 李志伟 梁爱君 郑鹏肖 杨焕芝 《中国现代医学杂志》 2025年第1期54-61,共8页
肾脏疾病已成为全球公共卫生问题。终末期肾病患者必须依靠透析或肾移植治疗,而肾移植是终末期肾病的最佳治疗方法。肾移植提高了患者生活质量,延长了患者生存时间,然而,由于免疫或非免疫因素导致一些患者移植物功能过早丧失,因此,并非... 肾脏疾病已成为全球公共卫生问题。终末期肾病患者必须依靠透析或肾移植治疗,而肾移植是终末期肾病的最佳治疗方法。肾移植提高了患者生活质量,延长了患者生存时间,然而,由于免疫或非免疫因素导致一些患者移植物功能过早丧失,因此,并非所有患者都能从移植术中完全受益。循环游离DNA(cfDNA)是指存在于血液等体液中的小片段DNA,通常源自身体各个组织的细胞。供体来源的cfDNA(ddcfDNA)是患者外源性且来自移植器官的cfDNA。与侵入性活检不同,dd-cfDNA可以通过对样本的非侵入性分析来检测。dd-cfDNA浓度可能在肌酐水平升高之前就增加了,这有助于早期诊断移植损伤和充分治疗,以避免移植物过早丢失。该文综述有关cfDNA在肾移植中的作用研究,希望为dd-cfDNA检测广泛应用于临床实践提供参考依据。 展开更多
关键词 肾移植 供体来源的游离dna 免疫排斥反应 生物标志物
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基于植物形态和DNA分子技术鉴定党参属五种植物
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作者 张志宇 刘付松 +3 位作者 刘莎 张德林 王化东 吴发明 《北方园艺》 北大核心 2025年第2期14-22,共9页
以13个省市的106份党参种质资源为试材,采用植物形态和DNA分子鉴定相结合的方法,研究了106份党参种质资源间的亲缘关系,以期为植物形态特征和DNA分子技术鉴定党参种质资源提供参考依据。结果表明:党参、川党参、素花党参与管花党参、羊... 以13个省市的106份党参种质资源为试材,采用植物形态和DNA分子鉴定相结合的方法,研究了106份党参种质资源间的亲缘关系,以期为植物形态特征和DNA分子技术鉴定党参种质资源提供参考依据。结果表明:党参、川党参、素花党参与管花党参、羊乳在植物形态上有较大的差异,而党参、川党参和素花党参之间差异较小,但均可以通过植物形态差异进行鉴别;利用ITS2序列和psbA-trnH序列可准确鉴别党参、川党参、素花党参与管花党参、羊乳,但对变种与原变种间的鉴定仍存在一定局限性。 展开更多
关键词 党参 植物形态 dna分子 ITS2序列 psbA-trnH序列
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基于活产建立体外受精-胚胎移植精子DNA碎片指数的参考阈值及子代短期安全性
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作者 周超 王淑娴 +2 位作者 于春梅 庾广聿 蒋月园 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第1期111-119,共9页
背景:精子DNA碎片指数与受精、胚胎发育潜能、胚胎植入、流产及子代安全性等存在显著的相关性。然而,其临床参考值受多种因素的影响,导致临床意义极其有限,该研究以活产为结局,通过倾向评分匹配校正其他混杂因素后,构建精子DNA碎片指数... 背景:精子DNA碎片指数与受精、胚胎发育潜能、胚胎植入、流产及子代安全性等存在显著的相关性。然而,其临床参考值受多种因素的影响,导致临床意义极其有限,该研究以活产为结局,通过倾向评分匹配校正其他混杂因素后,构建精子DNA碎片指数与活产的最佳临床截断值,并对其进行内外部验证,具有较好的预测价值及临床应用效能。目的:探讨基于活产建立体外受精-胚胎移植精子DNA碎片指数的参考阈值及子代短期安全性。方法:选取2019年5月至2021年5月于常州市妇幼保健院接受体外受精-胚胎移植患者1921例,以倾向匹配容差0.02为标准,1∶1进行倾向评分匹配,结果活产组与非活产组各成功匹配540例,以此建立模型组;通过选取同时期广西壮族自治区南溪山医院接受体外受精-胚胎移植患者135例作为外部验证组;采用受试者工作曲线探求精子DNA碎片指数对活产的临床最佳截断值,分别采用限制性立方样条曲线、标准曲线、临床决策曲线、临床影响曲线及内外部验证等方法,对该截断值的准确性及临床应用效能进行评估。结果与结论:(1)非活产组精子DNA碎片指数显著高于活产组且与活产存在显著的负相关性(r=-0.444,P<0.001);(2)受试者工作曲线结果显示,DNA碎片指数对活产的最佳截断值为24.33%,曲线下面积为0.775(0.746,0.804),特异度为72.60%,敏感度为78.90%,准确度为75.70%;(3)限制性立方样条曲线拟合Logistic回归结果显示,当精子DNA碎片指数大于24.57%时,临床非活产的风险呈趋势性增涨;(4)Logistic回归概率分析结果显示,精子DNA碎片指数为活产的危险因素[OR(95%CI)=0.916(0.904,0.928),P<0.001],且当精子DNA碎片指数大于27.78%时,临床活产发生的概率将小于50%,随着精子DNA碎片指数每增高1个单位,活产的概率下降8.4%;(5)内外部对该临床截断值的验证均显示,该截点具有一定的临床预测价值及准确性;(6)临床决策曲线与临床影响曲线显示,以该临床截断值建立的预测模型在阈概率为0.22-0.73时具有临床最大净获益值,且在该阈概率范围内损失与获益的比值始终小于1,证实该预测模型具有较好的临床应用效能;(7)精子DNA碎片指数与子代短期安全性分析结果显示,精子DNA碎片指数与出生儿早产、体质量、畸形、性别差异无显著性;(8)结果表明,精子DNA碎片指数对体外受精-胚胎移植活产的最佳临床截断值为24.33%,以此建立的临床预测模型具有较好的区分度、准确度与临床应用效能,精子DNA碎片指数对子代短期安全性影响并不显著,但仍需大样本及长期的追踪评估。 展开更多
关键词 精子dna碎片指数 活产 体外受精-胚胎移植 子代安全性 最佳截断值
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基于SM2和DNA的图像加密算法
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作者 唐亦昕 张英男 《陕西科技大学学报》 北大核心 2025年第1期203-210,共8页
近年来,随着互联网的全面普及,公民对信息安全和隐私保护提出了新的更高的要求,为了保护公民的数据安全,并且满足“打赢新时代网络战争”的要求,对图像加密算法的研究与实现进行深入的研究,提出了一种基于国密SM2数字信封和脱氧核糖核酸... 近年来,随着互联网的全面普及,公民对信息安全和隐私保护提出了新的更高的要求,为了保护公民的数据安全,并且满足“打赢新时代网络战争”的要求,对图像加密算法的研究与实现进行深入的研究,提出了一种基于国密SM2数字信封和脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic acid,DNA)编码的图像加密技术,将图像编码技术、公钥技术、口令保护技术相结合.在该算法中,通过使用Python重点实现了密钥空间的复杂性、图像的鲁棒性、随机性、低相关性,同时对图像的直方图进行了分析,研究结果表明,在实现公钥加密算法国产化替代的同时,增强了加密的安全性. 展开更多
关键词 SM2数字信封 Chen超混沌 Logistic混沌 鲁棒性 脱氧核糖核酸(dna)
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市售灵芝DNA分子鉴定方法的研究与应用
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作者 张庆英 董岩岩 郭荣硕 《山东化工》 2025年第1期19-22,26,共5页
目的:建立灵芝的DNA分子鉴定方法;并鉴定8批市售灵芝是否为药典规定赤芝。方法:进行灵芝的DNA提取方法和PCR扩增引物、扩增系统、扩增程序的考察,以及PCR扩增产物纯化、测序、输入中草药鉴定系统,建立灵芝的DNA鉴定方法。结果:建立了市... 目的:建立灵芝的DNA分子鉴定方法;并鉴定8批市售灵芝是否为药典规定赤芝。方法:进行灵芝的DNA提取方法和PCR扩增引物、扩增系统、扩增程序的考察,以及PCR扩增产物纯化、测序、输入中草药鉴定系统,建立灵芝的DNA鉴定方法。结果:建立了市售灵芝DNA鉴定方法,并对市售灵芝进行鉴定。其中样品1、2、3、4、5、6为药典规定赤芝,而样品7、8不是药典规定赤芝。结论:本法快速、简便,结果准确可靠,可以用来鉴定市售灵芝是否为药典规定的赤芝。 展开更多
关键词 灵芝 dna分子 鉴定方法 PCR扩增
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第四纪晚期中国大型哺乳动物古DNA研究进展
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作者 盛桂莲 郑铭旻 +1 位作者 肖博 袁俊霞 《遗传》 北大核心 2025年第1期46-57,共12页
从古DNA视角探讨古代生物的遗传组成已有40多年历史。自2005年开始,随着高通量测序技术平台的开发应用及对小片段DNA分子提取能力的加强,古DNA研究跨入全新的深时古基因组时代,不仅解决了诸多生物谱系系统学问题,丰富了包括人类在内的... 从古DNA视角探讨古代生物的遗传组成已有40多年历史。自2005年开始,随着高通量测序技术平台的开发应用及对小片段DNA分子提取能力的加强,古DNA研究跨入全新的深时古基因组时代,不仅解决了诸多生物谱系系统学问题,丰富了包括人类在内的多种生物的迁移、演化细节,而且启动了“全基因组-大数据-多物种”尺度研究生物对气候变化的分子响应,将古DNA研究涉及的样品年代从10万年以内拓展到近200万年前的早更新世。中国科学家近几年在东亚人群遗传演化和迁徙融合方面实现了诸多有影响力的突破,填补了现代人类演化进程中的重要“缺环”。相比而言,学界对除人类之外的脊椎动物古DNA研究关注度较低。本文回顾了第四纪晚期中国大型哺乳动物古DNA研究系列进展,分别总结了相关研究在揭示古代群体与现生群体的系统演化关系、古哺乳动物基因交流、动物种群对气候变化的分子响应等方面的研究突破,并对中国哺乳动物古基因组领域面临的机遇和挑战进行了展望。 展开更多
关键词 dna 第四纪晚期 哺乳动物 二代测序 分子演化
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染色体外环状DNA在疾病及畜禽表型中的调控作用研究进展
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作者 仲翠微 陈亚玲 +1 位作者 王健 李辉 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第1期106-114,共9页
染色体外环状DNA(Extrachromosomal Circular DNA,eccDNA)是一种在真核细胞中普遍存在的独立于染色体外的双链环状DNA分子,它在基因表达调控、编码功能性蛋白质或RNA中发挥关键作用,并参与免疫炎症反应、促进肿瘤发生等多种生理和病理过... 染色体外环状DNA(Extrachromosomal Circular DNA,eccDNA)是一种在真核细胞中普遍存在的独立于染色体外的双链环状DNA分子,它在基因表达调控、编码功能性蛋白质或RNA中发挥关键作用,并参与免疫炎症反应、促进肿瘤发生等多种生理和病理过程,因此eccDNA的研究日益受到关注。为鉴定和研究eccDNA的特性,科学家们开发了一系列研究工具,并基于测序数据构建了eccDNA综合性数据库,但eccDNA的来源、发生机制、生物学功能及如何准确鉴定等尚不明确。目前,在牛、家鸽等畜禽中已鉴定出eccDNA,但其在畜禽领域的研究仍处于起步阶段。本文总结了eccDNA分类、生物学功能以及主要研究方法等方面的研究进展,以期为其后续在医学及畜牧领域研究提供参考。 展开更多
关键词 染色体外环状dna 机体生理调控 生物标志物 高通量测序
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病原宏基因组测序DNA检测流程性能验证及结果分析
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作者 杨尚栋 肖洋 +3 位作者 习文 刘哲 王方 王晓琴 《西安交通大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期162-168,共7页
目的 建立病原宏基因组测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)DNA检测流程的性能验证方案。方法 设计参考品并收集临床样本,从检测限、重复性、稳健性、抗干扰能力、特异性和准确性等维度评价mNGS分析性能,以及对不同建... 目的 建立病原宏基因组测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)DNA检测流程的性能验证方案。方法 设计参考品并收集临床样本,从检测限、重复性、稳健性、抗干扰能力、特异性和准确性等维度评价mNGS分析性能,以及对不同建库方式及测序仪性能参数进行评估。结果 参考品内各物种均能稳定检出,mNGS检测限为(5.0E+02)CFU/mL(copies/mL)。重复性符合率100%,批内变异系数(coefficient of variation, CV)介于8.53%~38.73%。病原投入浓度与检出序列数的线性相关系数|r|>0.9,mNGS检测系统具有良好的稳定性。抗干扰实验结果显示,人源核酸浓度越高,mNGS检出病原序列数越少。近缘物种检出序列数比值与实际病原浓度比值接近,具有良好的检测特异性。零病原投入组D0检测结果为阴性。临床样本病原检出准确率为90.9%(10/11)。自动化移液工作站与手工建库的文库质控结果均合格。三台测序仪运行性能参数均满足或优于出厂标准。结论 初步建立了包含参考品设计、不同建库方式比较和测序仪性能参数评价等多方面在内的mNGS DNA检测流程的性能验证方案,可用于mNGS临床实验室分析性能评价及实验过程中的质量保障。 展开更多
关键词 病原宏基因组测序(mNGS) dna检测 性能验证 参考品
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基于DNA条形码的天津渤海湾鱼类资源鉴定及遗传分析
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作者 何晓旭 白晓慧 +1 位作者 汪笑宇 孟一耕 《河北渔业》 2025年第1期25-31,共7页
为探索DNA条形码对渤海湾部分鱼类物种鉴定的有效性并进行相关的遗传分析,对天津渤海湾10种海水鱼类共177条线粒体COI基因序列进行扩增测序和比对分析。结果表明,10种海水鱼类COI基因T、C、A和G碱基平均含量分别为30.0%、27.9%、24.1%、... 为探索DNA条形码对渤海湾部分鱼类物种鉴定的有效性并进行相关的遗传分析,对天津渤海湾10种海水鱼类共177条线粒体COI基因序列进行扩增测序和比对分析。结果表明,10种海水鱼类COI基因T、C、A和G碱基平均含量分别为30.0%、27.9%、24.1%、18.0%,具有碱基偏倚性,177个基因序列共检测到70个单倍型。遗传多样性分析显示,总体的单倍型多样性为0.4327~0.9474,核苷酸多样性为0.0008~0.0063,其中焦氏舌鳎(Cynoglossus joyneri)的变异位点、单倍型数和单倍型多样性最高。遗传距离结果显示,种间遗传距离为0.2375~0.3575,其中种间平均遗传距离是种内平均遗传距离的77倍。系统进化树具有明显的分化谱系,与形态学的鉴定结果相吻合。研究结果表明,DNA条形码技术可以对天津近岸海域常见的10种鱼类进行有效鉴定,相关遗传分析可为天津渤海湾鱼类资源保护提供数据支持。 展开更多
关键词 dna条形码 COI基因 遗传多样性 鱼类
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辅助生殖技术中精子DNA损伤的研究现状
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作者 徐姗 孟江萍(审校) 《国际生殖健康/计划生育杂志》 2025年第1期71-77,共7页
精子DNA完整性对受精卵的形成至关重要,精子DNA损伤可能影响辅助生殖技术(assisted reproductive technology,ART)的成功率。精子DNA损伤主要包括单链和双链损伤,这些损伤可能在受精、胚胎质量和着床能力等多个方面影响ART的成功率。精... 精子DNA完整性对受精卵的形成至关重要,精子DNA损伤可能影响辅助生殖技术(assisted reproductive technology,ART)的成功率。精子DNA损伤主要包括单链和双链损伤,这些损伤可能在受精、胚胎质量和着床能力等多个方面影响ART的成功率。精子DNA损伤的因素主要包括氧化应激、年龄、激素以及环境等。同时,卵母细胞对精子DNA损伤的修复能力也至关重要。目前临床和实验室主要通过药物干预、优化精子选择来降低精子DNA碎片指数(DNA fragmentation index,DFI),从而改善ART的临床治疗结局。综述精子DNA损伤的研究现状,分析其对ART治疗结局的影响,并提出了可能的改进精液制备方法。 展开更多
关键词 精子 dna损伤 dna碎片 生殖技术 辅助 不育 男(雄)性 体外受精 精子注射 细胞质内
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循环肿瘤DNA与EGFR、KRAS、NRAS突变型可切除非小细胞肺癌的病理关系
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作者 王磊 刘先 +1 位作者 吴清辉 高珂 《局解手术学杂志》 2025年第2期154-158,共5页
目的 探讨循环肿瘤DNA(ctDNA)与表皮生长因子受体基因(EGFR)、Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因(KRAS)、神经母细胞瘤RAS病毒致癌基因(NRAS)突变型可切除非小细胞肺癌(NSCLC)患者临床病理特征的关系。方法 纳入在我院接受手术切除并且在生物... 目的 探讨循环肿瘤DNA(ctDNA)与表皮生长因子受体基因(EGFR)、Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因(KRAS)、神经母细胞瘤RAS病毒致癌基因(NRAS)突变型可切除非小细胞肺癌(NSCLC)患者临床病理特征的关系。方法 纳入在我院接受手术切除并且在生物库中有匹配血浆样本的36例NSCLC患者进行突变分析。使用肽核酸钳制PCR法分析血浆ctDNA和活检组织EGFR、KRAS、NRAS突变,探讨血浆ctDNA脱落与患者临床病理特征的关系。结果 36例患者活检组织和血浆样本中EGFR、KRAS、NRAS的一致性分别为63.89%(23/36)、88.89%(32/36)、86.11%(31/36)。在突变型肿瘤中,血浆ctDNA中EGFR、KRAS、NRAS突变检测的敏感度分别为23.53%(4/17)、33.33%(2/6)、40.00%(2/5)。在腺癌患者中,血浆ctDNA脱落与较高的肿瘤分期、N分期、TNM分期、肿瘤坏死率、10HPFs核分裂象及较大的肿瘤最大直径、肿瘤体积有关(P<0.05)。在肺腺癌患者亚组分析中,ctDNA脱落与较高的N分期、血管浸润率、肿瘤坏死率、10HPFs核分裂象及更大的肿瘤最大直径、肿瘤体积显著相关(P<0.05)。结论 肺腺癌ctDNA脱落与原发性肿瘤的直径、体积以及侵袭性组织学特征(如坏死和高核分裂象)有关。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 循环肿瘤dna 基因突变 肽核酸钳制PCR法
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精浆氧化还原电位与精子DNA碎片指数、高DNA着色性及运动参数的相关性研究
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作者 刘星池 张倩 +3 位作者 李栗妍 关小川 张宁 于月新 《中国医科大学学报》 北大核心 2025年第1期56-60,共5页
目的研究精浆氧化还原电位(ORP)和归一化氧化还原电位(nORP)与精子DNA碎片指数(DFI)、高DNA着色性(HDS)及运动参数的相关性,探讨其是否能作为评估男性生育潜能的生物标志物。方法选取2023年10月至12月于中国人民解放军北部战区总医院生... 目的研究精浆氧化还原电位(ORP)和归一化氧化还原电位(nORP)与精子DNA碎片指数(DFI)、高DNA着色性(HDS)及运动参数的相关性,探讨其是否能作为评估男性生育潜能的生物标志物。方法选取2023年10月至12月于中国人民解放军北部战区总医院生殖医学科男科门诊就诊的309例男性作为研究对象。采用电极法检测精浆ORP、nORP,分析其与DFI、HDS、年龄、禁欲时间、精液量、精子总数、精子浓度、前向运动精子数、前向运动精子百分率、非前向精子数、非前向精子百分率、不动精子数、不动精子百分率、精子活动率、曲线速度(VCL)、直线速度(VSL)、平均速度(VAP)、线性指数(LIN)、直性指数(STR)及振动指数(WOB)的相关性;对nORP结果进行三等分,比较其与上述参数的差异。采用广义线性回归探讨nORP与HDS的关系,同时生成HDS与nORP的平滑曲线拟合。结果Pearson相关性及Spearman相关性分析显示,ORP和nORP均与精液量、不动精子百分率及DFI呈正相关,与前向运动精子数、前向运动精子百分率、精子活动率、VSL、VAP呈负相关(P<0.05);不同的是ORP还与禁欲时间、不动精子数呈正相关(P<0.05),与LIN、STR及WOB呈负相关(P<0.05),而nORP还与HDS呈正相关(P<0.05),与精子总数、精子浓度、非前向精子数、非前向精子百分率、不动精子数、VCL呈负相关(P<0.05)。nORP分组结果显示,精液量、精子总数、精子浓度、前向运动精子数、前向运动精子百分率、非前向精子数、非前向精子百分率、不动精子数、不动精子百分率、精子活动率、VCL、VSL、VAP、DFI、HDS组间比较差异有统计学意义(P<0.05);将nORP与HDS制作曲线拟合,对年龄及禁欲时间进行了调整。随着HDS的增加,nORP呈线性上升趋势。结论ORP、nORP都与精子DFI和主要运动参数相关,但nORP还与代表精子成熟度的HDS相关,更能反映精液质量,可作为评估男性生育潜能的生物标志物。 展开更多
关键词 精浆氧化还原电位 精子dna碎片指数 精子高dna着色性 精子运动参数 氧化应激性不育
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阿魏酸对乙醇诱导的LO2肝细胞DNA损伤的修复机制研究
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作者 钟恒 陈杉彬 +4 位作者 王德良 杨冬莹 温银萍 罗蕊琪 黄丹 《食品与发酵工业》 CAS 北大核心 2025年第1期174-181,共8页
阿魏酸是一种天然化合物,其对肝细胞的影响尚不完全清楚。该研究旨在探讨不同浓度阿魏酸对乙醇诱导的LO2肝细胞DNA损伤的潜在修复机制。通过将不同浓度的阿魏酸作用于LO2肝细胞,并分析其对细胞增殖活性的影响。进一步研究了乙醇对LO2细... 阿魏酸是一种天然化合物,其对肝细胞的影响尚不完全清楚。该研究旨在探讨不同浓度阿魏酸对乙醇诱导的LO2肝细胞DNA损伤的潜在修复机制。通过将不同浓度的阿魏酸作用于LO2肝细胞,并分析其对细胞增殖活性的影响。进一步研究了乙醇对LO2细胞周期的影响及阿魏酸的干预作用,使用Western blot技术检测DNA损伤标记物p-H2AX的表达,以及通过流式细胞仪检测活性氧水平和细胞自噬的变化。结果表明,阿魏酸在低浓度时能促进LO2细胞增殖,中等浓度(0.25~2 mmol/L)能显著减少乙醇诱导的p-H2AX表达,降低活性氧水平,并可能促进细胞自噬。然而,高浓度阿魏酸则显示出对细胞的毒性作用,在DNA修复和自噬方面有潜在抑制效应。该研究表明,在特定浓度范围内,阿魏酸能够对抗乙醇诱导的LO2肝细胞DNA损伤,并可能通过促进细胞自噬机制来增强细胞的修复能力。但在高浓度下,阿魏酸则可能逆转其保护效应,表现出细胞毒性。 展开更多
关键词 阿魏酸 LO2肝细胞 dna损伤修复 细胞周期 活性氧 细胞自噬 流式细胞仪
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融合全置乱超混沌序列和DNA编码的图像加密
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作者 刘雨欣 栗风永 《计算机工程》 北大核心 2025年第1期235-245,共11页
图像加密是保护图像安全的重要方法,现有的图像加密方案安全性不高且加解密效率较低,无法抵御多种类型的攻击。针对上述问题,提出一种基于全置乱超混沌序列和多进制脱氧核糖核酸(DNA)编码的图像加密算法,以提高加密效率同时保证密文图... 图像加密是保护图像安全的重要方法,现有的图像加密方案安全性不高且加解密效率较低,无法抵御多种类型的攻击。针对上述问题,提出一种基于全置乱超混沌序列和多进制脱氧核糖核酸(DNA)编码的图像加密算法,以提高加密效率同时保证密文图像的安全性。首先,结合灰度图像的内容,使用图像哈希算法和外部密钥生成五维超混沌系统和逻辑映射的初始值;其次,将原始图像转换为四值图像,使用五维超混沌系统和逻辑映射生成的混沌序列对图像进行DNA加密,包括DNA编码、DNA置乱、DNA扩散和DNA解码4个阶段;最后,对图像进行位平面分解,利用五维超混沌系统和逻辑映射生成的随机矩阵分别与高四位平面和低四位平面做异或运算,得到最终的密文图像。实验结果表明,该图像加密算法具有密钥空间大、密钥敏感性强、加密效果良好、加密效率高等优点,能够抵抗统计分析、差分攻击、裁剪攻击、噪声攻击等多种常规攻击方式。 展开更多
关键词 图像加密 超混沌系统 四值图像 dna加密 位平面
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