用mPCR检测江西籍三种常见的缺失型α-Thal基因

目的用单管多重聚合酶链技术(mPCR)检测江西省缺失型-áThal基因。方法用单管多重聚合酶链反应(mPCR)技术检测-SEA、-á3.7和-á4.2缺失型-áThal基因。结果用mPCR技术可检测-SEA、-á3.7和-á4.2。12例江西籍-áThal检出-á3.74例(33.3%)、-á4.22例(16.6%)、-SEA1例(8.3%).三种突变占12例缺失型-áThal基因57.9%。末定型6例。结论mPCR是一种简单、省时、经济、准确的检测3种常见-áThal缺失基因的方法。

泰国缺失型α地中海贫血1的基因诊断和临床血液学表型分析

目的:探讨少见的泰国缺失型α地中海贫血1(泰国缺失型,--^(THAI)/αα)的血液学特征及其基因诊断的方法。方法:对32例泰国缺失型地中海贫血患者进行了回顾性分析,采用常规血液学检查、常见地中海贫血基因检测和泰国缺失型地中海贫血检测方法对泰国缺失型α地中海贫血1的血液学特征和基因诊断进行了分析,并与同期正常对照组、东南亚型缺失组(--^(SEΑ)/αα)进行了血液学特征比较。结果:在32例病例中,29例检出泰国缺失型α地中海贫血1杂合子,1例检出泰国缺失型α地中海贫血1和-α3.7缺失双重杂合子,2例检出泰国缺失型α地中海贫血1杂合子合并β地中海贫血突变(1例合并CD41-42突变杂合子,1例合并CD17(Α→T)突变杂合子)。泰国缺失型地中海贫血患者均有MCV、MCH水平降低;正常对照组、--^(SEΑ)/αα组间Hb、RBC、MCV、MCH比较差异有显著性,(P<0.05);正常对照组与--^(THAI)/αα组间RBC、MCV、MCH比较差异有显著性,(P<0.05);--^(SEΑ)/αα、--^(THAI)/αα组间MCHC比较差异有显著性,(P<0.05),其余各组指标差异无显著性。结论:泰国缺失型α地中海贫血1血液学除MCHC外类似于东南亚型地中海贫血,而在地中海贫血高发区存在一定比例的泰国缺失型α地中海贫血,因此在临床上对泰国缺失型α地中海贫血1应综合分析常规检测和泰国缺失型检测结果,以及患者的临床表现、血液学参数和超声结果后方可作出正确的诊断,避免由泰国缺失型引起α重型和中间型地中海贫血的婴儿出生。

中国人群少见血红蛋白H病的分子遗传学特征分析

目的分析由少见基因类型导致的血红蛋白H病家系的分子遗传学特征。方法采用标准的血液学分析技术检测先证者及家系成员红细胞参数,包括RBC、Hb、MCV、MCH、MCHC和RDW,进行表型诊断。利用SPIFE快速自动电泳分析系统检测其血红蛋白组分Hb A、HbA2、Hb F、Hb H和Hb Bart′s。采用反向斑点杂交技术诊断-地中海贫血基因非缺失突变,利用gap-PCR扩增特异位点序列并对扩增序列进行克隆测序,明确突变位点。结果先证者母亲MCV、MCH均降低,Hb A2为2.39%且亨氏小体阳性,基因检测结果为泰国型缺失杂合子。先证者父亲各红细胞参数正常,但RDB检测结果为携带CS点突变。先证者及其弟表现为中重度小细胞低色素贫血,蛋白电泳结果显示他们均有Hb H和Hb Bart′s带,先证者Hb H为10.8%,Hb Bart′s为7.51%,其弟Hb H为14.78%,Hb Bart′s为9.11%,基因检测结果证实该姐弟均为Hb H病患者,遗传了母亲的泰国型缺失片段和父亲的CS点突变,故地中海贫血型别为THAI/CS。结论首次报道中国人群少见的H病类型THAI/CS地贫基因类型是中国人群少见的H病类型,丰富了中国人群珠蛋白基因突变谱。

多重聚合酶链反应对缺失型α地中海贫血的诊断

目的 探讨一种简便、快速可同时检测东南亚缺失 ( SEA)、右侧缺失 ( α3 .7)和左侧缺失 ( α4.2 )地中海贫血的多重聚合酶链反应 (PCR)技术。方法 采用单管四重聚合酶链反应 (PCR)技术。结果 正常等位基因的扩增产物为 1.8kb ,东南亚缺失基因 ( SEA/αα)的扩增产物为 1.8kb和 1.3kb。右侧缺失 ( α3 .7/αα)扩增产物为 2 .0kb和 1.8kb。左侧缺失 ( α4.2 /αα)扩增产物为 1.8kb和 1.6kb。根据出现的不同条带还可判断杂合子和纯合子及缺失型HbH病。结论 本法简便、快速 ,可作为常规方法用于临床样品的分子筛查及产前诊断。

一种新的3.8kb缺失α地贫基因的鉴定

目的首次报道一种新的3.8 kb缺失α地贫基因,利用gap-PCR技术建立该缺失片段检测方法。方法采集先证者及其母亲外周血,进行血液学参数常规地贫基因检测,对常规基因检测结果存在疑问标本重新设计新gap-PCR引物及体系以测试发现证实新的缺失α地贫基因类型。结果先证者检出新的α珠蛋白基因缺失,缺失片段大小为3814 bp,确认先证者α地贫基因型为-α4.2/-α3.8,其母亲基因型为αα/-α3.8。结论本研究首例报告了一种新发现的3.8 kb缺失α地贫基因,丰富了世界地中海贫血突变基因数据库,特异性gap-PCR的建立为该类型地贫基因检出提供方便、有效的检测手段。

广东清远地区非缺失型α珠蛋白生成障碍性贫血基因型分布调查

目的分析广东清远地区非缺失型α珠蛋白生成障碍性贫血(简称地贫)基因携带率、基因型分布以及等位基因构成比,探讨该地区非缺失型α地贫基因分布特征。方法采用PCR+膜杂交法对受检标本进行α^WSα、α^CSα、α^QSα3种常见的非缺失型α地贫基因突变检测。结果9047例受检者中共检出非缺失型α地贫256例,包括12种基因型,非缺失型α地贫基因携带率为2.83%;α^WSα、α^CSα、α^QSα等位基因构成比依次为48.84%、30.62%、20.54%。结论该研究初步阐明了广东清远地区非缺失型α地贫基因的分布特征,为该地区制订有效、可行的地贫防控策略提供了参考依据。

基于基因拷贝数的缺失型α地中海贫血检测体系研究

目的建立并评价基于α珠蛋白基因拷贝数变化的缺失型α地中海贫血检测体系。方法建立三重TapMan实时荧光定量PCR检测体系,结合2^-△△ct相对定量分析的原理,根据缺失型α地中海贫血分子机制中α珠蛋白基因和看家基因的拷贝数比例差异,快速诊断α地中海贫血基因拷贝数。以本研究建立的方法检测69例已知α地中海贫血基因型标本和100例临床标本,并通过Gap-PCR+MLPA技术进行验证,评价该方法的敏感度与特异度。结果本研究建立的检测体系对100例临床标本进行α地中海贫血基因型的检测,敏感度和特异度均为100%;临床常规检测方法的特异度为100%,敏感度只有96%。结论本研究建立的检测体系敏感度高,特异性好,能够检测临床常规检验方法未检出的非常见型α地中海贫血基因型,减少或避免出生缺陷,优生优育。

采用Amplicon文库构建法对地中海贫血的基因检测

目的进一步完善现有地中海贫血的检测方法并且建立一种新的基于高通量测序的基因诊断方法,研究α/β地中海贫血基因的突变类型及分布情况。方法采用Amplicon文库构建法,基于高通量测序平台,对219例地中海贫血患者全血样本进行上机测序与数据分析。结果在219例地中海贫血患者中,共计检测出14种突变类型,包括CD122、CD125、CD142 3种非缺失型α-地贫突变及IVS-Ⅱ-654、CD41-42、CD17等11种常见β-地贫突变型别。此外,通过生物信息学软件作图分析,筛查出--^(SEA)、-α^(3.7)、-α^(4.2)3种缺失型α-地贫。结论本研究进一步完善了基于高通量测序的基因诊断方法,建立了一套Amplicon文库构建法,能准确、有效地用于诊断α/β地中海贫血基因的缺失与突变类型,对人群筛查,优生优育的遗传咨询,防止该病重症患儿的出生等具有重要意义。

异柠檬酸脱氢酶基因突变的弥漫性较低级别胶质瘤中α地中海贫血伴智力低下综合征基因缺失与1p/19q联合缺失的表达分析

目的探讨不同亚型异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变弥漫性较低级别胶质瘤中α地中海贫血伴智力低下综合征X染色体连锁基因(ATRX)缺失和1号染色体短臂和19号染色体长臂(1p/19q)联合缺失的表达及意义。方法回顾性分析2012年6月至2017年6月确诊并在苏州大学第一附属医院和常熟市第二人民医院手术及放化疗治疗的IDH突变型成年较低级别弥漫性胶质瘤患者142例,依据组织学分型分为星形细胞瘤与少突胶质细胞瘤两组,采用免疫组化法检测ATRX缺失,FISH法检测1p/19q联合缺失,比较两组ATRX缺失及1p/19q联合缺失的差异,χ2检验评价各参数间相关性的显著性。平均随访40个月(10-88个月),分析ATRX缺失及1p/19q联合缺失与生存时间之间的关系。结果星形细胞瘤组ATRX缺失显著高于少突胶质细胞瘤组,少突胶质细胞瘤组1p/19q联合缺失显著高于星形细胞瘤组,差异有统计学意义(P<0.05)。星形细胞瘤组中ATRX缺失的患者预后优于野生型ATRX的患者,中位生存时间分别为46、40个月,差异有统计学意义(P<0.05)。少突胶质细胞瘤组中1p/19q联合缺失患者的预后优于1p/19q正常患者,中位生存时间分别为53个月、42个月,差异有统计学意义(P<0.05)。结论ATRX缺失和1p/19q联合缺失可用于鉴别IDH突变型星形细胞瘤与少突胶质细胞瘤,可作为评价IDH突变型弥漫性较低级别胶质瘤预后的独立因素。联合应用基因变异的分类比单纯组织学分类更准确。

泰国缺失型α地中海贫血的基因分析及产前诊断

目的:通过分析--THAI缺失型α地贫的筛查、基因检测、产前诊断及妊娠结局情况,旨在减少重型α地贫的漏诊和中间型α地贫患儿的出生.方法:选取2018年1月~2018年12月来我院就诊并进行地贫筛查和地贫基因诊断且地贫筛查结果一方或双阳性的1543对育龄夫妇作为研究对象.经地贫筛查及常见23种地贫基因检测后进行遗传咨询,若地贫基因检测结果与地贫筛查结果不符的,行地贫基因301型检测.分析1543对夫妇地贫检出及α地贫基因型构成情况,比较--THAI型α地贫人群与常见α地贫基因型人群相关指标水平,分析至少一方携带--THAI基因夫妇地贫产前诊断及妊娠结局情况.结果:1543对一方或双方筛查阳性育龄夫妇共检出α地贫976例,其中检出的α地贫中,--SEA、-α3.7、-α4.2等三种型别检出率最高;--THAI、ααQS检出率为0.23%、0.39%.αα/--THAI型α地贫人群MCV、MCH水平低于-α3.7/-α3.7型人群(均P<0.05).至少一方携带--THAI基因的7对夫妇中,需进一步做产前诊断的有3对,占比为42.86%,其中有一对产前诊断结果为巴氏水肿胎须终止妊娠,占比为14.29%;不需产前诊断的有4对,占比为57.14%.结论:--THAI缺失型α地贫存在一定的发生机率,应加强实验室与临床医生之间的联系,若发现常见地贫基因检测结果与地贫筛查结果不符时,应考虑存在--THAI缺失型α地贫的可能性,以避免漏诊.--THAI缺失型α地贫基因检测,有助于重型α地贫胎儿的早期诊断,能有效减少重型α地贫的漏诊和中间型地贫患儿的出生,对降低出生缺陷发生率,提高人口素质具有重要的意义.

粤西地区非缺失型a地中海贫血分子流行病学分析

目的调查广东省粤西地区(包括湛江,茂名)育龄人群中常见非缺失型α地中海贫血基因携带率及分布特征。方法连续采集粤西地区(包括湛江,茂名)3758例计划试管婴儿助孕夫妇外周静脉血进行常规地贫基因筛查检测血样本中的αCSα、αQSα、αWSα3种突变基因,对直接筛查出62例阳性标本进一步进行常见3种非缺失型α地中海贫血基因分析。结果育龄人群中常见非缺失型α地中海贫血基因携带率为1.65%,其中常见3种缺失型α地中海贫血中αWS位点突变(杂合子)基因型为αWSα/αα占0.98%,CS位点突变(杂合子)基因型为αCSα/αα占0.29%,QS位点突变(杂合子)基因型为αQSα/αα占0.27%,WS、CS位点双重突变(双重杂合子),基因型为αCSα/αWSα占0.03%,检测到α2珠蛋白CS位点突变(纯合子),基因型为αCSα/αCSα占0.03%,检测到α2珠蛋白QS位点突变(纯合子),基因型为αQSα/αQSα占0.03%,检测到α2珠蛋白WS位点突变(纯合子)基因型为αWSα/αWSα占0.03%。结论本文赘述阐明了粤西地区育龄人群中常见非缺失型α地中海贫血分子流行病学情况,为本地区开展地中海贫血的防御提供了重要的科学依据。

两种常见缺失型α-地中海贫血快速检测技术的研究

目的 建立简便快速准确可推广使用的检测α 地中海贫血 (α Thal)右侧缺失型 ( α3 .7)和左侧缺失型 ( α4 .2 )的聚合酶链反应 (PCR)方法。方法 自行研究设计两组引物。优化PCR反应条件。PCR反应产物用 1%琼脂糖凝胶电泳分离 ,溴化乙啶染色 ,UVP凝胶成像仪下观察记录电泳图谱。结果 运用引物A′、B′、C3进行PCR ,出现 170 0bp扩增带表示 α3 .7,出现 190 0bp扩增带表示α 珠蛋白基因正常或为野生型。二条扩增带同时出现表示是 α3 .7缺失杂合子。无任何扩增带表示是东南亚型缺失纯合子。运用引物G′、E、F′进行PCR ,根据出现 15 80bp扩增带和 1180bp扩增带可诊断为 α4 .2 ,还可区分杂合子与纯合子。结论 本研究设计的两组引物及优化的PCR条件 ,可以简便准确地检测出α Thal标本中有无 α4 .2 和 α3 .7。

两对交叉引物PCR检测非缺失型α地中海贫血点突变的建立及临床应用

目的建立一种基于两对交叉引物PCR技术(PCR with confronting two-pair primers,PCR-CTPP)同时快速检测非缺失型α地中海贫血WS、QS和CS三种突变类型的方法及其在临床中的应用。方法根据α珠蛋白基因中发生WS、QS和CS突变的区域基因序列,分别针对单个位点设计两对引物即通用外引物和特异性引物,经过聚合酶链反应、电泳鉴别基因型,同时检测非缺失型α地中海贫血。将该方法与PCR反向斑点杂交(PCR-RDB)技术比较,验证其检测准确性。结果PCR-CTPP方法可用于准确检测非缺失型α地中海贫血的WS、QS和CS突变类型,结果显示与常规非缺失型α地中海贫血PCR-RDB检测方法一致。结论PCR-CTPP技术检测非缺失型α地中海贫血WS、QS、CS三种突变位点,简单快速、经济省力,可用于非缺失型α地中海贫血的快速筛查和分子流行病学研究,适合在一般实验室推广应用。适用于非缺失型α地中海贫血的人群筛查及婚前或产前筛查,适合各个层次医院应用。

用SYBR-Q-PCR结合融解曲线分析及mPCR检测江西籍三种常见的缺失型α-Thal基因

目的用自动化、高通量、准确快速技术检测江西省缺失型α-Thal基因。方法用实时荧光定量聚合酶链反应(SYBR-Q-PCR)结合融解曲线(D.C)分析及用单管多重聚合酶链反应(mPCR)技术检测-SEA、-α3.7和-α4.2缺失型α-Thal基因。结果SYBR-Q-PCR结合融解曲线分析较mPCR结合琼脂糖凝胶电泳法高出16倍以上,用SYBR-Q-PCR结合D.C、mPCR技术检测出--SEA、-α3.7和-α4.2。19例江西籍α-Thal检出-SEA/-α4.2-SEA/-α3.7-α3.7/-α3.7-α4.2/-α4.2-α3.7/-α4.2。结论SYBR-Q-PCR和mPCR能简单、省时、经济、准确的检测3种常见α-Thal缺失基因的方法。SYBR-Q-PCR结合融解曲线分析技术是一种高敏感、快速、自动化程度高、高通量,并不需要荧光标记探针。

广西地区缺失型α地中海贫血基因分布特征

目的 分析广西地区缺失型α地中海贫血（地贫）检出情况及基因分布特征,为基因诊断与遗传咨询提供理论依据.方法 采用跨越缺U PCR检测中国人群3种常见缺失型α地贫基因（-SEA、-α37、-α4.2）突变情况,对于常规地贫检测基大型与临床表型不相符的标本,采用多重连接探针扩增及α或β珠蛋白基大测序技术检测基因突变情况.分析广西地区缺失型α地贫的基因分布特征.结果 51 191名疑诊地贫者中,共检出缺失型α地贫19 853例,占39.9％,其中中国人群常见缺失型（--SEA、-α3 7、-α4.2）19 780例,泰国型缺失61例,三联体（香港型）（αααHK）9例,21.9 kb缺失1例及809 bp缺失2例.结论 广西地区缺失型α地贫所占比例高,类型复杂多样,对于基因型与临床表型不符的人群,进一步基因诊断可能检出罕见类型的地贫基因型,避免漏诊误诊,更好的为临床遗传咨询和产前诊断提供依据.

一个α地中海贫血基因新缺失突变家系

目的 报告1例α地中海贫血（地贫）基因新型大片段缺失的患者,并对其家系进行分析,以提高对地贫发病机制及其诊断的认识.方法 采用血细胞分析和血红蛋白电泳进行地贫筛查,采用跨越缺口PCR（Gap-PCR）检测中国人常见的3种缺失型α地贫基因,采用PCR-寡核苷酸探针反向斑点杂交法检测中国人常见的3种非缺失型α地贫基因和17种β地贫基因点突变.对于常规地贫基因分析仍未能明确诊断的样本,采用多重连接探针扩增技术（MLPA）和DNA测序技术进行鉴定.结果 先证者表现为Hb H病,HGB 71 g/L、红细胞平均体积52.4 fl、红细胞平均血红蛋白含量16.1 pg、Hb A21.4％.常规地贫基因分析提示先证者α地贫基因大片段缺失.MLPA及DNA测序结果显示,该缺失片段长度为21 925 bp,为世界首次报道,命名为-α21.9,美国DNA数据库注册编号为KF360979.先证者及其胞妹基因型为--SEA/-α21.9,先证者母亲、父亲、胞弟基因型分别为αα-α21.9、--SEA/-α3.7及αα/-α3.7.结论 -α21.9缺失突变的发现,丰富了地贫基因突变数据库,对遗传咨询和地贫产前基因诊断具有重要意义.

双重TaqMan实时荧光嵌套PCR快速检测α地中海贫血SEA缺失方法的建立与应用

目的建立一种快速检测α地中海贫血（α地贫）SEA缺失的双重TaqMan实时荧光嵌套PCR方法。方法收集2010年5—7月在广州市天河区妇幼保健院进行地贫筛查的外周血标本100份，2010年12月至2011年2月东莞东华医院进行产前诊断的胎儿标本7份（绒毛2份、羊水5份）。从本实验室样本资源库中选取α地贫SEA缺失已知基因型标本50份。采用双重TaqMan实时荧光嵌套PCR技术，于同一检测体系同时检测各标本α地贫SEA缺失截短序列及缺失范围内正常序列，根据荧光PCR阳性扩增结果结合其α值差异诊断受检个体的仪地贫SEA缺失基因型。同时采用检测α地贫SEA缺失的常规gap-PCR法，以PCR扩增结合产物凝胶电泳分析各标本α地贫SEA缺失基因型，以验证及对比分析新方法的准确性与实用性。结果所建立的双重TaqMan实时荧光嵌套PCR优化体系中2个PCR的扩增效率分析曲线的斜率分别为-3．153（SEA缺失截短目的片段）和-3．182（正常内参序列），扩增效率均接近100％。应用此方法检测50份仅地贫SEA缺失已知基因型标本，结果显示该方法不但能实现其快速分子诊断，而且能准确判断受检标本中的外源性污染，从而有效避免假阴性或假阳性误诊。100份外周血标本中，两种方法分别检出SEA缺失标本11份，对比分析两方法的诊断符合率为100％。7份胎儿标本中，gap—PCR法检出SEA缺失3份，而本方法则检出SEA缺失标本2份、受--SEA／（xet母源性污染的基因型为αα／αα的绒毛标本1份。结论本研究建立的双重TaqMan实时荧光嵌套PCR可以快速准确检测α地贫SEA缺失，操作简单实用，适合大规模人群筛查和常规分子诊断。

广西地区440例血红蛋白H病胎儿产前诊断

目的探讨广西地区胎儿血红蛋白(Hb)H病产前诊断情况、基因突变类型及其妊娠结局。方法选择2015年1月1日至2019年12月31日,在本院接受胎儿产前地中海贫血基因检测的广西地区单胎妊娠α地中海贫血高风险胎儿中,被诊断为Hb H病的440例胎儿为研究对象。采用DNA提取试剂盒提取胎儿及其父母基因组DNA。采用跨越缺口PCR(Gap-PCR)法,检测其3种常见缺失型α地中海贫血基因(--^(SEA)、-α^(3.7)、-α^(4.2))缺失突变情况;采用PCR-反向斑点杂交法,检测其常见α、β地中海贫血基因点突变情况。对于上述常规方法检测结果未见异常,而地中海贫血筛查提示高风险的夫妇,则进一步采用多重连接探针扩增技术(MLPA)及DNA测序技术进一步进行α、β地中海贫血基因检测。对本组胎儿2015-2019年每年的胎儿Hb H病检出率比较,采用线性趋势χ^(2)检验。本研究遵循的程序符合2013年新修订的《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求。结果①本研究胎儿Hb H病检出率为9.95%(440/4421)。2015-2019年,每年的胎儿Hb H病检出率总体比较,差异无统计学意义(P>0.05)。②在440例Hb H病胎儿中,占比前4位的Hb H病基因型分别为-α^(3.7)/--^(SEA)(39.32%,173/440),α^(CS)α/--^(SEA)(30.23%,133/440),-α^(4.2)/--^(SEA)(14.09%,62/440)与α^(WS)α/--^(SEA)(10.91%,48/440)。另外,32例Hb H病胎儿被检出同时合并β地中海贫血基因突变,其中20例被检出合并β^(CD41-42)/β^(N),6例合并β^(CD17)/βN,2例合并β^(CD17)/β^(CD17),2例合并β^(CD71-72)/β^(N)基因型,1例合并β^(CD43)/β^(N),1例合并β^(-28)/β^(N)。③妊娠440例Hb H病胎儿的孕妇中,1例(0.23%)自然流产,228例(51.82%)选择人工终止妊娠;135例(30.68%)顺产分娩,65例(14.77%)剖宫产术分娩;11例(2.50%)妊娠结局不详。结论近年广西地区胎儿Hb H的基因突变类型多样,少数合并β地中海贫血基因突变。妊娠Hb H病胎儿孕妇中,选择人工终止妊娠者的比例较高。对生育人群广泛开展地产前中海贫血筛查及其基因检测,对预防Hb H病新生儿出生缺陷具有重要意义。

一个携带罕见的2.4kb缺失型α地中海贫血基因家系的研究

目的罕见α地贫缺失型基因的漏检,会给地中海贫血产前诊断工作带来风险。研究组对一例地贫检测中基因型与血液学检测数据不匹配的个体进行罕见地贫分析,同时采集其家系辅助分析,以阐述其分子生物学机制。方法采用商品化地贫基因检测试剂盒实施常规地贫基因分析,罕见地贫分析方法采用测序法、实验室自研qPCR体系、MLPA、Gap-PCR法等完成。结果先证者样本中检出-α2.4地贫基因,家系分析验证了这是一个携带-α2.4地贫基因的家系。结论-α2.4地贫基因在南方地区人群有一定的分布频率。国内地贫检测机构所使用的常规地贫基因检测试剂盒的检测范围并未包含-α2.4地贫基因,地贫基因检测机构在实施地贫基因分析时,应密切留意受测者血液学数据与基因分析数据的匹配性,避免相对少见的地贫基因的漏诊。