中国7个地方绵羊品种遗传多样性的微卫星分析

利用 2 6个微卫星标记分析了中国 7个地方绵羊 (Ovisaries)品种的遗传多样性。通过计算基因频率、平均杂合度 (H)、多态信息含量 (PIC)及有效等位基因数 (Ne) ,并根据Nei氏标准遗传距离 ,利用UPGMA法进行了聚类分析 ,评估其种内遗传变异和品种间遗传关系。结果表明 :2 6个微卫星位点共检测到 2 78个等位基因 ,Ne在 2 .12 88- 13.392 4之间 ;以等位基因频率为基础 ,得出位点的平均杂合度在 0 .0 6 2 9- 0 .5 90 3之间 ,品种平均杂合度在0 .36 33- 0 .4 4 89之间。 2 6个位点均为高度多态位点 ,PIC在 0 .6 6 2 8- 0 .8712之间。聚类分析表明哈萨克羊、阿勒泰羊和巴音布鲁克羊遗传关系最近 ;然后与白藏羊、黑藏羊聚为一类 ;湖羊和晋中羊聚为一类。各绵羊品种的聚类关系与其来源、育成史及地理分布基本一致。

10个绵羊品种的微卫星DNA多态性研究

本研究利用FAO和ILRI推荐的21个微卫星引物，结合荧光标记PCR，检测了中国9个地方绵羊（Ovisaries）品种和1个外来绵羊品种的遗传多样性。21个微卫星座位均呈现出高度多态，多态性信息含量和杂合度均表明我国地方绵羊品种有着丰富的遗传多样性。本研究共检测到342个等位基因，有效等位基因数在2．1752～9．4997之间，座位平均杂合度在0．5248～0．8551之间，品种平均杂合度在0．633-0．761之间。聚类关系和主成分分析结果与其起源、育成历史及地理分布基本一致。

稻蝗属部分种类RAPD及其分子系统学关系

用经筛选的 8个随机引物对稻蝗属 (OxyaAudient Serville)中的中华稻蝗 (Oxyachinensis)、日本稻蝗 (Oxyajaponica)、山稻蝗 (Oxyaagavisa)、短翅稻蝗 (Oxyabrachyptera)和小稻蝗 (Oxyaintricata)等 5个种 4 1个个体进行扩增 ,均扩增出特异性产物 ,在 96条清晰稳定的扩增片段中 ,多态性片段为 95条 ,种间共有片段 1条 (引物S36 2扩增的约 85 0bp的片段 ) ,所获片段的长度大小为 2 0 0～ 2 5 0 0bp ,单个引物扩增的条带数在 8～ 16之间 ,平均为 12。根据扩增结果 ,应用SPSS软件包中的Between groupslinkage法进行聚类分析 ,得到 5种稻蝗的分子系统树。结果显示 :中华稻蝗与短翅稻蝗关系密切 ,日本稻蝗与山稻蝗关系较近 ,而小稻蝗与它们的亲缘关系较远。聚类图所呈现的种间关系与传统的形态及细胞分类学结果基本一致 ,5种稻蝗亲缘关系的远近程度得以清楚显示 。

基于Adh1基因分析高粱属的系统进化关系

高梁属中有重要的粮食作物和优良牧草,也有农业生产上的重要杂草。文章旨在进一步从分子水平阐明高梁属种间的系统进化关系,为有效利用种质资源进行分子育种改良作物品质提供理论依据,并明确检疫性杂草的分类地位。根据二色高粱(Sorghum bicolor)的Adh1全基因序列(GenBank登录号:AF050456)设计引物,扩增并测定黑高粱(S.almum)、假高粱(S.halepense)、丝克高粱(S.silk)和苏丹草(S.sudanense)共计8个植物材料约2 000 bp的Adh1基因部分序列,结合GenBank中其他24个Sorghum属的同源序列,以Cleistachne sorghoides的对应序列为外群,进行了高梁属的亲缘关系分析,用MP、ML和NJ法分别构建了分子进化树,得到了基本相同的拓扑结构。结果显示:(1)高梁属可明显分为三大支,一支是蒴柄高梁(Chaetosorghum)和异高梁(Heterosorghum)二个亚属,一支是优高梁亚属(Eusorghum),这两个分支包含2n=20、40,染色体较小的种类,另一分支包括拟高梁(Parasorghum)和有柄高梁(Stiposorghum)两个亚属,包含2n=10的种类和它们的多倍体近缘种,染色体相对较大;(2)S.almum的Adh1基因表现出明显的地理分化;(3)Parasorghum亚属的S.pur-pureosericeum和多色高粱(S.versicolor)、光高粱(S.nitidum)和S.leiocladum聚在一起,而该亚属中的S.mata-rankense、S.grande、S.timorense却与亚属Stiposorghum的种聚在一起,表现出更近的亲缘关系;(4)S.mac-rospermum和S.laxiflorum之间具有比其他高梁属种更近的亲缘关系。

16种平菇遗传关系的SRAP分析

为了确定不同来源的平菇遗传差异,利用相关序列扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)分子标记技术,对安徽地区的16个平菇品种的遗传多样性进行了分析。筛选出24对随机引物组合,获得了627条清晰条带,平均每对引物产生26.1条。多态性条带共189条,占总条带数的30.1%,平均每对引物组合得到7.88条多态性条带。依据SRAP标记聚类,在遗传相似系数0.65的水平上,供试的16个平菇品种分为2个大类:Ⅰ和Ⅱ。Ⅰ类分为2个亚类:A类和B类,Ⅱ类也分为2个亚类:C类和D类。其中A类和D类各包括4个品种,B类中有3个品种,C类中有5个品种,从而在DNA水平上证明了所研究的平菇种质资源的遗传多样性。

六个绵羊品种遗传距离的微卫星分析

利用30个微卫星DNA标记对乌珠穆沁羊、苏尼特羊、内蒙古细毛羊、宁夏滩羊、小尾寒羊和无角多赛特羊共237个体进行遗传距离分析,结果表明:⑴苏尼特羊和乌珠穆沁羊遗传距离为0.0833最小,无角多赛特羊与其它5个绵羊品种的遗传距离在1.0146～1.2876之间,滩羊、内蒙古细毛羊和小尾寒羊彼此之间及与乌珠穆沁羊和苏尼特羊的遗传距离为0.3623～0.6020;⑵聚类图将6个绵羊品种划分为4个分支,即苏尼特羊和乌珠穆沁羊,内蒙古细毛羊和小尾寒羊,宁夏滩羊,无角多赛特羊。⑶6个绵羊品种间遗传距离和聚类图与品种的历史演化和资料记载基本符合,为绵羊种质资源的利用和保护提供了科学依据。

中国六群体MSY2小卫星位点的遗传学研究(英文)

目的研究中国回族、四川省汉族、福建省汉族、锡伯族、蒙古族、赫哲族群体MSY2小卫星位点的遗传多态性。方法采用聚合酶链式反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳检测方法,对上述六群体334份男性血样本的遗传多态性进行分析。结果MSY2位点有三拷贝和四拷贝两种等位基因型。其中各群体中的大多数成员呈现四拷贝等位基因型,而三拷贝等位基因型频率较低且在各个群体中频率分布是呈现多样。结论根据MSY2位点等位基因频率的分布可评估出六个群体之间的遗传距离,对研究六群体之间的遗传关系和遗传结构具有重要意义。

新疆南疆地区4个地方绵羊品种微卫星标记的遗传多样性分析

该研究利用联合国粮食及农业组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的9个微卫星引物,结合荧光标记PCR对新疆南疆地区4个地方绵羊(Ovis aries)品种的遗传多样性进行研究,为中国地方绵羊品种资源保护和种质创新提供参考。结果表明:共检测到136个等位基因,平均有效等位基因数在5.20~6.03之间,以等位基因为基础,得出群体平均杂合度在0.7146~0.8573之间,座位的平均杂合度在0.7497~0.8600之间。对各微卫星标记进行F-统计分析,Fst的变化范围从MCM140的0.0222到BM1314的0.0545;基因流平均值为6.4686。9个微卫星座位均呈现高度多态,表明新疆南疆地区4个地方绵羊品种有着丰富的遗传多样性。遗传距离表明柯尔克孜羊和巴音布鲁克羊的距离最远,多浪羊和巴尔楚克羊的距离最近。聚类分析表明多浪羊群体单独聚为一类,巴尔楚克羊和柯尔克孜羊聚为一类,这与品种起源、育成历史及地理分布基本一致。研究结果提示,新疆南疆地区绵羊遗传多样性较为丰富,保护与利用价值较高,这些信息可为新疆现有地方绵羊品种类型的划分和品种资源遗传多样性的保护和利用提供科学依据。

基于PG蛋白的蔷薇科植物分子进化树的构建与分析

为了分析蔷薇科植物PG蛋白序列的进化关系,从NCBI网站搜索到177条相关蔷薇科植物PG蛋白序列,筛选出23条可用序列,采用ClustalW2和MEGA6两种聚类方法联配,并构建分子进化树。结果表明:蔷薇科植物23条PG序列聚类成2个类群,一类群有14条序列,主要为苹果亚科梨属和苹果属植物;另一类群包括8条序列,为李亚科的桃属和杏属植物。ClustalW2和MEGA6两种方法的分析结果基本一致,表明两种方法都可用于评价蔷薇科植物的演化与进化关系。本研究通过对23条蔷薇科植物PG序列的亲缘关系的分析,为蔷薇科植物在基因工程育种方面提供了理论依据。