曼氏迭宫绦虫线粒体载体蛋白结构和功能的生物信息学分析

目的应用生物信息学技术预测曼氏迭宫绦虫线粒体载体蛋白超家族的结构和功能,为进一步研究曼氏迭宫绦虫的蛋白质提供理论依据。方法将测得的曼氏迭宫绦虫成虫EST序列用ORF finder获取开放读码框,Blast进行分析其结构域。应用分析工具Protparam、InterProScan、protscale、SignalP-3.0、PSORTⅡ、BepiPred、TMHMM、VectorNTI Suite 9软件包、Phyre2分别进行该蛋白质的基本性质、结构域、疏水性、信号肽、亚细胞定位、抗原表位、跨膜区及空间结构的预测及分析。结果 Blast预测该蛋白质为线粒体载体蛋白超家族,保守功能域为线粒体二羧酸载体,含294个氨基酸残基,理论分子量为32132.2Da。与曼氏血吸虫进化地位最接近;有1个信号肽位点和6个潜在的抗原表位。结论曼氏迭宫绦虫线粒体二羧酸载体能够介导苹果酸、琥珀酸等二羧酸的转运,使其跨越线粒体膜参与三羧酸循环,为虫体自身提供能量,可能是潜在的疫苗候选分子及药物作用靶点。

关于二羧酸-三羧酸盐载体蛋白负调控黄瓜花叶病毒积累的初步研究

黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的复制场所位于液泡膜,但是参与调控CMV复制的寄主蛋白因子有待进一步研究。植物二羧酸-三羧酸盐载体蛋白(Dicarboxylate-tricarboxylate carrier,DTC)为线粒体膜和液泡膜定位的跨膜蛋白,参与二羧酸盐和三羧酸盐的跨膜转运。为了探索DTC在CMV复制中的调控作用,通过基于烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)的基因载体下调本氏烟体内DTC2(NbDTC2)的mRNA水平,并通过GFP荧光和Western blot分析DTC2下调表达后对CMVΔ2b-eGFP积累量的影响,发现NbDTC2的下调表达增加CMV的积累水平;同时分析本氏烟DTC2的瞬时过表达对CMVΔCP-eGFP积累的影响,通过观察eGFP荧光和Western blot检测,发现NbDTC2的过表达在一定程度上抑制病毒的积累。以上结果表明:DTC2负调控CMV的积累,可能参与植物对病毒的防御。