DiversiLab系统沙门氏菌分子分型评价

目的:评价DiversiLab(DVL)系统对沙门氏菌(SA)的分型能力。方法:用rep-PCR技术为原理的DVL系统对进出口食品中分离的44株SA进行分子分型,并与脉冲场凝胶电泳(PFGE)结果比较,探讨DVL对SA的种群分类能力和分辨率。结果:44株SA经rep-PCR分型分成22个群,分离自不同国家、不同食品中的相同血清型SA分布在同一个群,而且菌株之间相似性非常高。在rep-PCR结果中分在同一个群中的SA,在PFGE结果中除SA2和SA15外,其他菌株之间相关性较低。结论:DVL在SA的种群的分类能力上优于PFGE,但分辨率低于PFGE。

应用DiversiLab系统对肺炎克雷伯菌进行同源性分析

目的应用DiversiLab系统对肺炎克雷伯菌进行同源性分析,为医院感染控制工作提供依据。方法对2010年天津一家甲级医院外科同一病房临床分离的8株肺炎克雷伯菌,应用以细菌基因组重复序列PCR技术(rep-PCR)为原理的DiversiLab系统分型技术进行分型,并与脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型结果进行比较。结果药敏试验结果显示,除K8-02号菌株外,其余7株肺炎克雷伯菌对11种抗菌药物具有相同的药敏谱,且为多重耐药菌;PFGE分析显示此7株菌为同一型;DiversiLab系统同时也显示该7株菌为同一组,K8-02菌为单独一组。结论 DiversiLab系统的操作简单、快速、可重复性好、结果准确,是一种标准化和自动化系统,并且DiversiLab系统与PFGE方法可获得一致结论。,肺炎;电泳,凝胶,脉冲场;细菌分型技术;

利用DiversiLab系统快速诊断医院感染菌的亲缘关系

目的应用DiversiLab系统对医院感染的鲍曼不动杆菌进行同源性分析,评价DiversiLab系统在诊断医院性感染细菌中的作用。方法收集该院重症监护病房暴发的鲍曼不动杆菌16株,应用VITEK 2COMPACT全自动微生物分析系统进行鉴定和药敏试验,同时应用基于重复序列聚合酶链反应(rep-PCR)技术的DiversiLab系统进行同源性分析。结果 16株鲍曼不动杆菌被分为4个克隆组,其中第1克隆组是主要的流行克隆,有4个亚克隆,9株鲍曼不动杆菌同属于第1亚克隆,亲缘关系近。结论第1克隆组是该院医院感染主要流行克隆,DiversiLab系统可在24h内快速、准确地诊断医院感染细菌的同源性,可广泛应用于医院感染细菌的诊断。

应用DiversiLab分型系统对奶制品中的阪崎肠杆菌进行同源性分析

为研究奶制品污染中阪崎肠杆菌的同源性关系,并建立起阪崎肠杆菌基于重复序列的分型技术。对2005-2006年福建省出入境检验检疫局从各类奶制品中分离出的阪崎肠杆菌先进行API鉴定,然后进行DiversiLab分型。其中DiversiLab分型包括:DNA提取,rep-PCR和微电泳芯片分离检测。rep-PCR条件为:94℃预变性2 min;94℃变性30 s,55℃退火30 s,70℃延伸90 s,35个循环;最后70℃延伸3 min。结果表明:31株阪崎肠杆菌被API分成了5种不同的生物型,DiversiLab分型能将阪崎肠杆菌分为不同的亚型,但它们之间没有必然的联系。部分同一企业来源的菌株具有同源性,样品的同源性与采样地无关。DiversiLab分型系统是一种快速,高效,易于操作,高重复性,高分辨率的基因分型方法,可作为食源性污染的同源性分型工具。

禽肉制品中单增李斯特菌的DiversiLab分型

目的:研究从同一类食品中分离出的单增李斯特菌间的同源性关系,为预测预警保障食品安全和食源性疾病溯源提供科学依据和技术支持。方法:应用Diversi Lab分型系统对2001—2010年福建出入境检验检疫局从各类禽肉制品中分离出的25株单增李斯特菌进行分型,其中包括:DNA提取、重复序列-聚合酶链式反应(repetitive sequence-based polymerase chain reaction,rep-PCR)、微电泳芯片分离检测及数据分析。结果:Diversi Lab分型中,相似系数为95%时,25株菌被分为了6组(G);相似系数为97%时,25株菌被分为11组(P)。结论:Diversi Lab分型结果较准确地揭示了25株菌株间的亲缘性关系。基于rep-PCR的Diversi Lab分型系统,是一种操作简单、分辨率高、重复性好且高效快速的基因分型方法,可作为食源性病原体检测及食源性疾病溯源的工具。

利用DiversiLab细菌同源性分析技术分析地震伤员分离的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌特点

目的分析华西医院地震伤员所分离的耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）特点，并与同期非灾区患者分离MRSA进行同源性比较。方法使用细菌基因组重复序列PCR（Rep—PCR）技术以及DiversiLab细菌同源性分析技术对地震住院伤员所分离出的5株MRSA与同期非灾区的住院患者分离的6株MRSA进行同源性分析。结果11株MRSA的基因图谱分为5组（A—E组），地震伤员MRSA分布为A组1株、B组2株、C组1株以及E组1株，非地震伤员的MRSA分布为A组3株、B组1株、C组1株以及D组1株。结论地震伤员的MRSA与同期部分科室的非灾区患者的MRSA呈高度同源性。

应用DiversiLab分型系统对沙门氏菌进行同源性分析

目的:为研究食品污染中沙门氏菌间的同源性关系,建立起沙门氏菌基于重复序列的分型技术。通过建立DiversiLab基因图谱数据库,以便对将来不同来源的沙门氏菌的基因图谱进行即时比较,确定其同源性,进而追溯污染来源,切断传播途径,为预测预警保障食品安全提供科学依据,为防止食源性疾病的发生提供技术支持。同时进行血清分型,比较分析2种方法的优劣和之间的关系。方法:对2002～2010年福建省出入境检验检疫局从各类食品及饲料中分离出的沙门氏菌先进行血清分型,然后进行DiversiLab分型,其中包括:DNA提取,rep-PCR和微电泳芯片分离检测。rep-PCR条件:94℃预变性2min;94℃变性30s,50℃退火30s,70℃延伸90s,35个循环,最后70℃延伸3min。结果:23株沙门氏菌被分成6个血清型,DiversiLab分型能将相同血清型的菌株分为不同的亚型。同一企业来源的菌株具有同源性。结论:DiversiLab分型系统是一种快速、易于操作、高重复性、高分辨率的基因分型方法,可作为食源性疾病同源性分型工具。结论:DiversiLab分型的分辨率高于血清型,2种分型方法密切相关。

用DiversiLab系统对食品中分离的金黄色葡萄球菌进行分型溯源研究

目的:对分离自食品样本中的44株金黄色葡萄球菌进行DiversiLab分型,研究其基因特征和聚类分布,为食源性疾病溯源及预警提供依据。方法:采用DiversiLab自动分型系统扩增广泛分布于金黄色葡萄球菌基因组中的重复序列,并在Agilent2100自动生物分析仪上对扩增产物进行微流体电泳分离,然后使用DiversiLabSoftware软件实时分析和处理数据,对44株金黄色葡萄球菌进行分子分型。结果:DiversiLab分型系统将44株金黄色葡萄球菌分为26个型别,其中P1型包含菌株n76、n78和n71;P2型包含z78、z60和g75菌株;P3型包含菌株n61、z77、g31;P4型包含菌株0868和10786;P5型包含菌株6’-3600和13-3462;菌株1167、11219和z12属于P6型;菌株n73和n75属于P7型;菌株1151和11059为P8型;菌株3-1154和0979为P9型;菌株11-2063和6-1310为P10型;P11型包含菌株z67、z63、z64、z61和z36;其余15株金黄色葡萄球菌的每一个菌株被分为一个单独的型别。结论:DiversiLab分型结果准确揭示了44株来自食品的金黄色葡萄球菌的遗传特征和亲缘关系;Diversilab自动化分型技术方便快捷、结果可靠,是监测分析食源性致病菌和对食源性疾病溯源及预警的有力工具。

DiversiLab系统用于食品中单增李斯特菌同源性分析

R]DiversiLabSystemDNA指纹分型系统（DiversiLab系统）对食品中分离到的91株单增李斯特菌进行分子分型，分析菌株之间的同源性，评价该系统的分析能力。结果显示91株单增李斯特茵可以分成22群，菌株之间的相似性64．8％--09．8％，未表现地区特异性。DiversiLab系统分析结果准确揭示了91株单增李斯特茵的遗传特征和亲缘关系，可以作为一种单增李斯特茵的快速分型和溯源方法。

速冻水饺中金黄色葡萄球菌的DiversiLab分型研究

目的:对速冻水饺中分离的20株金黄色葡萄球菌进行DiversiLab分型,研究其基因特征和聚类分布。方法:采用DiversiLab自动分型系统扩增金黄色葡萄球菌基因组中广泛分布的重复序列,然后在Agilent2100自动生物分析仪上对扩增片段进行微流体电泳分离,并使用DiversiLab Software软件实时分析和处理数据,对20株金黄色葡萄球菌进行分子分型。结果:DiversiLab分型系统将20株金黄色葡萄球菌分为13个型别,其中P1型包含菌株L17、L14、L11,P2型包含L16、L12、L19、L4菌株,P3型包含菌株L3、L18、L13,其余10株金黄色葡萄球菌的每一个菌株被分为一个单独的型别。结论:20株金黄色葡萄球菌从基因型来看有一定的聚集性,可能来自相近的污染源。同时也有一些金黄色葡萄球菌菌株之间的基因型差异较大,遗传学上关系较远,可能来自不同的污染途经。Diversilab自动化分型技术方便快捷,是监控食品及其生产企业细菌性污染的有力工具。

自动化DiversiLab System DNA指纹分型系统在白假丝酵母同源性分析中的应用

目的:探讨自动化DiversiLab System DNA指纹分型系统(DiversiLab系统)在白假丝酵母同源性分析中的应用,并评价该系统的作用。方法:应用标准化试剂盒进行白假丝酵母的PCR扩增,在微流控芯片电泳和Agilent 2100生物分析仪上收集扩增产物,并用DiversiLab系统分析软件进行DNA指纹分析。结果:35株从重症加强治疗病房患者中分离的白假丝酵母分为7个型别,其中A型13株,B型8株,C型6株,D型3株,E型2株,F型2株,G型1株。2株氟康唑耐药菌株属于B型,4株氟康唑剂量依赖敏感菌株为C型。结论:自动化DiversiLab系统有快速、简便、重复性和分辨率高的特点,且具建立数据库并行不同实验室间数据比对的优势,可作为临床同源性分析鉴定和分型的一线工具。

Diversilab系统用于金黄色葡萄球菌同源性分析

目的:用Diversilab System DNA指纹分型系统(Diversilab系统)绘制金黄色葡萄球菌DNA指纹图谱,分析各菌株间的同源性。方法:对食品中分离到的42株金黄色葡萄球菌提取DNA,进行rep-PCR,用Diversilab系统中的软件对DNA指纹图谱进行同源性分析。结果:实验得到了42株的金黄色葡萄球菌的DNA指纹图谱,可以分成14群,菌株之间的相似性68.9%～99.7%,未表现地区特异性。结论:Diversilab系统具有操作简便、快速、重复性好、分辨率高的特点,可用于黄色葡萄球菌快速分型和溯源。

对食品中分离的金黄色葡萄球菌进行DiversiLab分型研究

目的:对来自湛江的食品样本中分离的16株金黄色葡萄球菌进行DiversiLab分型,研究其基因特征和聚类分布,为食源性疾病溯源及预警提供依据。方法:采用DiversiLab自动分型系统对16株金黄色葡萄球菌进行分子分型。结果:DiversiLab分型系统将16株金黄色葡萄球菌分为9个型别,其中P1型包含菌株0902和0901;P2型包含0971、0923、0967、09108菌株;P3型包含菌株0969、0970、10010;P4型包含菌株09118和09119。其余5株金黄色葡萄球菌的每一个菌株被分为一个单独的型别。结论:DiversiLab分型结果准确揭示了16株食品中金黄色葡萄球菌的遗传特征和亲缘关系;Diversilab自动化分型技术方便快捷、结果可靠,是监测分析食源性致病菌和对食源性疾病溯源及预警的有力工具。

DiversiLab系统单增李斯特氏菌分子分型评估

目的用DiversiLab系统(DVL)对单增李斯特菌进行分子分型,评估其分型能力。方法用DVL对食品中分离的24株单增李斯特菌进行分子分型,并与脉冲场凝胶电泳(PFGE)结果进行比较,探讨DVL的分群能力和分辨率。结果 DVL将24株单增李斯特菌分成9个群,菌株之间的相似度46.7%～99.7%,DVL的相似度明显高于PFGE;DVL将PFGE型别相同的单增李斯特菌分在同一个的群中,也将不同PFGE型别的单增李斯特菌分在不同的群,但同一群中的单增李斯特菌有不同的PFGE型。结论 DVL操作简便、快速,重复性好,但分辨率低于PFGE;对大量单增李斯特菌分型时,先用DVL筛选再用PFGE对分布在同一群中的单增李斯特菌进行分型,能快速明确单增李斯特菌之间的关系。

对同一地区分离的单增李斯特菌进行DiversiLab分型及同源性分析

目的对同一地区食品污染中分离出的单增李斯特菌进行DiversiLab分型,研究其同源性关系,为保障食品安全和进行食源性疾病溯源提供科学依据。方法应用DiversiLab分型系统对2005年-2007年从哈尔滨地区食品样品中分离出的21株单增李斯特菌进行分型,其中分型流程包括DNA提取、rep-PCR、微电泳芯片分离检测和数据分析。结果经DiversiLab分析软件聚类分析,相似度为97%时,21株菌被分成了11组,这11组中的菌株在遗传水平不可区分;相似度为95%时,21株菌被分成了9组,这9组中的菌株在遗传水平具有相关性。结论 DiversiLab分型结果较准确地揭示了21株菌株间的遗传特征和亲缘性关系;自动化的DiversiLab分型是一种分辨率高、重复性好、操作简单的基因分型方法,可以作为食源性疾病同源性分析的分型工具。

Agilent2100分析仪在鲍曼不动杆菌同源性分析中的应用

目的Agilent 2100分析仪在基因组外非编码重复序列片段的聚合酶链反应(REP-PCR)同源性分析中的应用并评估该系统。方法应用REP设计引物并进行PCR扩增,用Agilent2100分析仪DL7500 Labch ip芯片进行产物分析。结果51株碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌中,耐药菌株分为4大型别(A、B、C、D),其中A型共48株,分别为A1型33株,A2型13株,A3型和A4型各1株;B、C、D型各1株;18株碳青霉烯类敏感菌株中,有2株与A1型别一致,其他菌株型别都不一致。结论基于REP-PCR的Agilent2100同源性分析具有快速、易于操作、高重复性和高分辨率、结果定量处理和多种形式输出等优点,可作为临床同源性分析鉴定和分型的一线工具。

烧伤病区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的耐药性及同源性分析

目的研究烧伤病区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的耐药性及同源性,为控制MRSA的院内传播提供依据。方法烧伤病区9名患者分离到的MRSA,用VITEK 2-Compact微生物鉴定系统进行菌种鉴定和药敏,以DiversiLab分型系统进行同源性分析。结果除MRSA-9外,其余8株MRSA对11种抗菌药物具有相同药敏谱,且为多重耐药株,但不存在万古霉素和利奈唑胺耐药株;DiversiLab系统也显示该8株菌为同一组,MRSA-9为一组。结论烧伤病区MRSA院内感染较为严重,应采取有效的预防与控制措施。

副溶血性弧菌REP-PCR分型研究

[目的]了解食品中分离的副溶血性弧菌REP-PCR分子型别,探讨DiversiLab系统对副溶血性弧菌的分型能力。[方法]采用以REP-PCR为原理的DiversiLab系统对食品中分离的21株副溶血性弧菌进行分子分型,分析菌株之间的相关性,并与PFGE分型结果比较。[结果]DiversiLab将21株副溶血性弧菌分成16个群,菌株之间的相似度64.5%-99.1%,分离自相同食品中的副溶血性弧菌在REP-PCR聚类图中分在同一个群;7株副溶血性弧菌PFGE分型结果产生7种不同的PFGE型别,菌株之间不相关,在REP-PCR聚类图中分在7个不同的群中。[结论]食品中分离的副溶血性弧菌REP-PCR型别分散,未表现出地区特异性;DiversiLab简便、快速、分辨率高,可应用于副溶血性弧菌的快速分型和溯源。

南疆地区结核分枝杆菌复合群耐药性及同源性分析

目的了解新疆南疆地区的结核分枝杆菌复合群耐药情况及各菌株间的同源性。方法用改良罗氏培养基培养分离菌株及初步鉴定菌种;用比例法对分离菌株进行药物敏感实验;随机抽取50株耐药结核分枝杆菌复合群菌株,用DiversiLab系统进行分型及同源性分析。结果共分离出371株分枝杆菌,结核分枝杆菌314株,牛型结核分枝杆菌55株,非结核分枝杆菌2株。371株中119株(32.1%)有耐药性。根据DiversiLab系统同源性的判断,以相似性95%为分割点,50株耐药结核分枝杆菌复合群分成27个群。其中,初治患者耐药菌同源率为41.2%(7/17),复治患者耐药菌同源率为18.8%(3/16);喀什市的耐药菌同源率为33.3%(5/15),莎车县的耐药菌同源率为41.2%(7/17)。结论南疆地区结核分枝杆菌获得性耐药仍处于较高水平,不同患者群分离的耐药菌均有一定的同源性。

临床与环境分离肠球菌属的耐药性及同源性分析

目的利用分子分型方法,调查住院患者各类标本中分离到的肠球菌属与环境中肠球菌属分离株之间的同源性,探寻肠球菌属医院感染的传播途径及潜在高危环节。方法收集于同时期医院医疗环境及临床标本的51株粪肠球菌和16株屎肠球菌作为研究对象,用VITEK-32微生物鉴定药敏分析系统进行菌种鉴定和药敏;利用Diversilab基因分型系统进行同源性分析。结果肠球菌属分离未发现万古霉素耐药株,同时为耐高水平氨基糖苷类粪肠球菌9.8%、屎肠球菌12.5%;Diversilab基因分型系统将51株粪肠球菌分成5组流行克隆和17株散发克隆,16株屎肠球菌分成3组流行克隆和4株散发克隆。结论粪肠球菌对一般所选抗菌药物敏感性高,屎肠球菌对抗菌药物的耐药率明显高于粪肠球菌;肠球菌属的医院感染形式有交叉感染、自身感染、母婴垂直感染,其中以粪肠球菌G1组克隆的产科交叉感染为主要存在感染形式,此外环境中感染菌定植也是医院感染播散的重要环节。