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Ac/Ds标签系统与水稻功能基因组学 被引量:12
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作者 栾维江 孙宗修 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期441-450,共10页
自2002年水稻基因组测序完成后,水稻功能基因组学研究正在成为水稻研究的重要内容。构建突变体库是研究功能基因组学的一条重要而有效的途径。利用外源的Ac/Ds(Activator/Dissociation)标签系统是构建插入突变体库较为理想的方法,经过... 自2002年水稻基因组测序完成后,水稻功能基因组学研究正在成为水稻研究的重要内容。构建突变体库是研究功能基因组学的一条重要而有效的途径。利用外源的Ac/Ds(Activator/Dissociation)标签系统是构建插入突变体库较为理想的方法,经过多年发展完善,其在水稻中已有广泛的应用,但仍面临着一些需要解决的实际问题。文章对Ac/Ds标签系统的转座行为及其构建突变体库的问题和优点进行了综述,总结了近年来Ac/Ds标签系统在水稻中的研究进展,分析了利用Ac/Ds标签系统进行功能基因组学研究所面临的挑战。 展开更多
关键词 水稻 Ac/Ds标签系统 插入突变体库 转座行为 功能基因组学
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插入玉米Ds转座因子的水稻转化群体及其分子分析 被引量:21
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作者 王江 李琳 +3 位作者 宛新杉 安林升 张景六 洪孟民 《植物生理学报(0257-4829)》 CSCD 2000年第6期501-506,共6页
转座子标签法是一种利用转座因子插入高等植物基因组中造成基因突变 ,然后通过分离转座因子插入的旁邻顺序 ,进而克隆出突变基因的策略。这种策略在高等植物功能基因组学的研究中是十分有用的。为此目的 ,将玉米的Ds因子及bar基因连接... 转座子标签法是一种利用转座因子插入高等植物基因组中造成基因突变 ,然后通过分离转座因子插入的旁邻顺序 ,进而克隆出突变基因的策略。这种策略在高等植物功能基因组学的研究中是十分有用的。为此目的 ,将玉米的Ds因子及bar基因连接至载体pCAMBIA130 0的T DNA区域中 ,构建成重组Ti质粒pDsBar130 0。pDsBar130 0中T DNA区域中的潮霉素抗性基因可在转化过程中用作水稻转化植株的选择标记。插入在Ds因子中的bar基因可追踪转化后代的Ds因子。pDsBar130 0通过根瘤农杆菌介导引入水稻品种中花 11号的幼胚组织。从各转化愈伤组织中获得了 140 0株独立的Ds水稻转化植株。通过PPT抗性检测和PCR分析证明了水稻转化植株中Ds因子的整合。Southernblot分析了转化植株基因组中Ds因子的插入拷贝数 ,其中单拷贝插入比率约占 70 %。这些插有Ds因子的水稻转化植株 ,当引入自主型的Ac因子反式活化Ds因子后 ,可使Ds因子跳跃到不同位点上 。 展开更多
关键词 水稻 Ds因子 农杆菌 转座因子标签 突变体
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Ac/Ds转座子激活标签技术研究进展 被引量:2
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作者 王文静 马浩然 +1 位作者 李加纳 张洪博 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第14期2845-2855,共11页
随着植物基因组测序工作的迅速发展,植物功能基因组学已经成为植物分子生物学研究的重要内容,而大量有表型的突变体是进行功能基因组学研究的重要基础。Ac/Ds转座子激活标签技术(Ac/Ds transposonactivation tagging system)的产生使Ac... 随着植物基因组测序工作的迅速发展,植物功能基因组学已经成为植物分子生物学研究的重要内容,而大量有表型的突变体是进行功能基因组学研究的重要基础。Ac/Ds转座子激活标签技术(Ac/Ds transposonactivation tagging system)的产生使Ac/Ds转座子标签技术具有了产生显性突变的功能,并可避免在突变体库创建过程中进行大量繁重的人工转基因操作,是比较理想的植物功能基因组学研究工具。本文将对Ac/Ds转座子激活标签技术在发展过程中利用不同激活标签创建植物突变体库的研究进行介绍,并对近二十几年来报道的相关应用研究展开论述,以期对该领域的技术进步和应用研究提供一些有益的启发和参考。 展开更多
关键词 AC Ds转座子激活标签技术 突变体库 功能基因组学
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水稻Ac/Ds组织培养获得再生植株突变体 被引量:1
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作者 袁云香 万志刚 孙丙耀 《种子》 CSCD 北大核心 2009年第2期9-11,共3页
用含Ac/D s转座元件的水稻种子为实验材料,从成熟胚盾片诱导愈伤组织,并经分化培养获得一定量的再生植株(R0),经田间栽培收获再生植株的成熟种子(R1)。对获得的111株再生植株(R0)叶片取样,提取基因组DNA,采用PCR方法检测其Ac/D s插入。... 用含Ac/D s转座元件的水稻种子为实验材料,从成熟胚盾片诱导愈伤组织,并经分化培养获得一定量的再生植株(R0),经田间栽培收获再生植株的成熟种子(R1)。对获得的111株再生植株(R0)叶片取样,提取基因组DNA,采用PCR方法检测其Ac/D s插入。结果表明,有94%的再生植株含有Ac/D s,6%的再生植株仅含Ac。只带有Ac而无D s的再生植株是由于D s切离而丢失,其具体机制目前还不清楚,有待进一步研究。因此,利用组织培养的方法获得更多的突变体来构建突变体库是可行的。 展开更多
关键词 水稻 组织培养 Ac/Ds标签系统 突变体
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一个Ds插入标签基因OsPI-PLC2的分子鉴定及表达分析 被引量:1
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作者 高志超 栾维江 《天津师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2012年第3期85-90,共6页
在前期构建的水稻转座子标签插入突变体库中,鉴定了一个没有明显表型变化的Ds转座子标签系,发现Ds标签插入到一个编码磷脂酰肌醇磷脂酶C(PI-PLC)基因的第6个内含子中,分析该基因编码的氨基酸序列发现其含有已知的PI-PLC所具有的典型的X... 在前期构建的水稻转座子标签插入突变体库中,鉴定了一个没有明显表型变化的Ds转座子标签系,发现Ds标签插入到一个编码磷脂酰肌醇磷脂酶C(PI-PLC)基因的第6个内含子中,分析该基因编码的氨基酸序列发现其含有已知的PI-PLC所具有的典型的X、Y和C2-like保守结构域,与已知的其它植物的PI-PLC蛋白有较高的同源性.另外,利用RT-PCR对该基因进行了表达分析,结果表明该基因在正常条件下表达量很低,但在胁迫条件下(机械损伤、盐、干旱、低温)或一些信号分子(SA、ABA)的诱导下大量表达,表明该基因参与植物对不良环境条件的信号转导途径,对于植物抵御不良环境条件具有重要作用. 展开更多
关键词 水稻 Ds转座子标签 OsPI-PLC2 表达分析
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插入含Ds因子的T-DNA产生的水稻脆秆突变株的遗传和分子分析 被引量:14
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作者 张梅芳 张景六 《植物生理与分子生物学学报》 CAS CSCD 2002年第2期111-116,共6页
在构建由农杆菌介导的玉米Ds转座因子插入的水稻转化群体中 ,得到一个茎秆等组织发生脆性突变的株系。理化指标定量测定表明 ,脆性株系的载荷强度和纤维素含量都比正常植株低很多 ,可溶性糖含量略有减少。对这个突变株的分子检测结果表... 在构建由农杆菌介导的玉米Ds转座因子插入的水稻转化群体中 ,得到一个茎秆等组织发生脆性突变的株系。理化指标定量测定表明 ,脆性株系的载荷强度和纤维素含量都比正常植株低很多 ,可溶性糖含量略有减少。对这个突变株的分子检测结果表明Ds因子在脆性株系中为单位点插入。检测了自交 3代(T1、T2 、T3 )植株中T DNA(Ds)插入与脆性表型的共分离关系。初步结果表明这个突变是T DNA(Ds)的插入造成的 。 展开更多
关键词 Ds因子 T-DNA 水稻 脆秆突变株 遗传 分子分析 转座因子标签 共分离
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植物中Ac/Ds转座子的研究与应用 被引量:1
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作者 范明霞 姜敏 +4 位作者 王国宏 王东旭 周婷 张春宇 林凤 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期387-393,共7页
Ac/Ds转座子作为研究较为深入的植物转座子,已被广泛应用于植物功能基因组研究。利用Ac/Ds标签系统构建插入突变体库是研究功能基因组学的有效途径,也是进行基因克隆及功能分析的有利工具。结合课题组利用Ac/Ds转座子标签分离基因并进... Ac/Ds转座子作为研究较为深入的植物转座子,已被广泛应用于植物功能基因组研究。利用Ac/Ds标签系统构建插入突变体库是研究功能基因组学的有效途径,也是进行基因克隆及功能分析的有利工具。结合课题组利用Ac/Ds转座子标签分离基因并进行基因功能验证方面的研究工作,综述了Ac/Ds转座子在植物基因组中的插入特点、转座机制以及转座子标签法的应用与发展前景,为更有效的利用Ac/Ds转座子提供参考依据。 展开更多
关键词 AC Ds转座子 转座特点 转座机制 转座子标签
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水稻Ds插入易倒伏突变体的形态和生理鉴定
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作者 石丹 顾福根 孙丙耀 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期278-282,共5页
为了从形态学和生理学角度初步分析水稻Ds插入突变体出现倒伏的可能原因,继而为进一步开展水稻倒伏相关基因的功能研究提供参考,比较了该突变体与野生型在株高、茎上各主要节间的长度、粗度、茎壁厚、叶鞘厚度以及根、茎、叶片、叶鞘、... 为了从形态学和生理学角度初步分析水稻Ds插入突变体出现倒伏的可能原因,继而为进一步开展水稻倒伏相关基因的功能研究提供参考,比较了该突变体与野生型在株高、茎上各主要节间的长度、粗度、茎壁厚、叶鞘厚度以及根、茎、叶片、叶鞘、穗和稃片中纤维素和硅含量的差异。结果显示,易倒伏突变体各主要器官中纤维素含量均明显下降,硅在各器官中的分配方式也出现不同于野生型的变化。研究表明,各器官中纤维素含量下降引起的植株机械强度减弱可能是导致突变体易于倒伏的主要原因。 展开更多
关键词 水稻 Ds插入突变体 倒伏
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Ds 因子在烟草染色体插入位点旁邻顺序的克隆
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作者 张大兵 张景六 +1 位作者 王宗阳 洪孟民 《植物生理学报(0257-4829)》 CSCD 1999年第1期7-14,共8页
用NestedPCR 方法从含Ds 因子的转基因烟草DNA 中克隆了Ds 因子在烟草染色体插入位点的9 个旁邻DNA 片段,以这些片段作探针,和野生型烟草的DNA 进行Southern 杂交,以检测这些片段在烟草基因组中... 用NestedPCR 方法从含Ds 因子的转基因烟草DNA 中克隆了Ds 因子在烟草染色体插入位点的9 个旁邻DNA 片段,以这些片段作探针,和野生型烟草的DNA 进行Southern 杂交,以检测这些片段在烟草基因组中的拷贝数,结果表明它们都属于烟草染色体上的低拷贝DNA。另外,对这些DNA 片段进行核苷酸序列测定,并将它们的顺序与Genbank 数据库中已有的核苷酸序列相比较,其中长度为128 核苷酸的片段1 和荷兰芹的4CL2 基因的一个区段有57 .8 % 同源性,而另一长度为169 核苷酸的片段3 和百合中的反转座子的一个区段有60 .9 % 的同源性。这都表明Ds 因子在异源植物烟草中插入染色体单拷贝基因的机率很高,这对转座子标签法克隆基因是非常有利的。 展开更多
关键词 Ds因子 旁邻DNA片段 单拷贝 转座子标签
全文增补中
Web News Extraction via Tag Path Feature Fusion Using DS Theory 被引量:4
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作者 Gong-Qing Wu Lei Li Xindong Wu 《Journal of Computer Science & Technology》 SCIE EI CSCD 2016年第4期661-672,共12页
Contents, layout styles, and parse structures of web news pages differ greatly from one page to another. In addition, the layout style and the parse structure of a web news page may change from time to time. For these... Contents, layout styles, and parse structures of web news pages differ greatly from one page to another. In addition, the layout style and the parse structure of a web news page may change from time to time. For these reasons, how to design features with excellent extraction performances for massive and heterogeneous web news pages is a challenging issue. Our extensive case studies indicate that there is potential relevancy between web content layouts and their tag paths. Inspired by the observation, we design a series of tag path extraction features to extract web news. Because each feature has its own strength, we fuse all those features with the DS (Dempster-Shafer) evidence theory, and then design a content extraction method CEDS. Experimental results on both CleanEval datasets and web news pages selected randomly from well-known websites show that the Fl-score with CEDS is 8.08% and 3.08% higher than existing popular content extraction methods CETR and CEPR-TPR respectively. 展开更多
关键词 content extraction web news tag path extraction feature Dempster-Shafer (DS) theory
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