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表达猪瘟病毒E2基因和gfp报道基因的伪狂犬病病毒双基因转移载体的构建 被引量:9
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作者 潘兹书 张楚瑜 +1 位作者 陈玉栋 闵平 《武汉大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期466-470,共5页
将以PRVgG为启动子 ,SV4 0polyA为加尾信号的CSFVE2表达盒克隆于包含伪狂犬病病毒 (PRV)tk基因和gH基因片段的重组质粒pTK2 .5 ,替换掉tk基因的SalⅠ与XhoⅠ酶切位点之间的序列 ,构建了携带CSFVE2基因的转移载体pTKE2 免疫荧光检测证... 将以PRVgG为启动子 ,SV4 0polyA为加尾信号的CSFVE2表达盒克隆于包含伪狂犬病病毒 (PRV)tk基因和gH基因片段的重组质粒pTK2 .5 ,替换掉tk基因的SalⅠ与XhoⅠ酶切位点之间的序列 ,构建了携带CSFVE2基因的转移载体pTKE2 免疫荧光检测证实 ,转染BHK2 1细胞的pTKE2在感染PRV的情况下 ,能表达E2蛋白 采用特异性引物PCR方法扩增gfp表达盒 ,对酶切位点进行改造 ,将其克隆到pTKE2的SalⅠ位点 ,构建了用PRVgG启动子和HCMVIE启动子分别控制E2基因和gfp基因表达、两基因取向相反的双基因转移载体pTKE2 .GFP 将双基因转移载体pTKE2 .GFP转染BHK2 1细胞中 ,12h后在荧光显微镜下观察到呈绿色荧光的GFP表达 。 展开更多
关键词 伪狂犬病毒 转移载体 绿色荧光蛋白 e2基因
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基孔肯雅病毒包膜蛋白E2的全基因合成及原核表达 被引量:3
2
作者 章萍萍 潘卫 +7 位作者 曹洁 陈秋莉 王锦红 张华群 葛宜兵 祁培培 刘超 邓松华 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2012年第6期617-622,共6页
目的通过对全长基孔肯雅病毒包膜蛋白E2(CHIKV-E2,1~404 aa)及其跨膜疏水区(351~378 aa)缺失突变体E2(1~350 aa)进行原核表达,分析跨膜疏水区对E2蛋白在大肠杆菌中表达的影响。方法利用ExPasy预测软件对E2蛋白跨膜疏水区进行预测分析... 目的通过对全长基孔肯雅病毒包膜蛋白E2(CHIKV-E2,1~404 aa)及其跨膜疏水区(351~378 aa)缺失突变体E2(1~350 aa)进行原核表达,分析跨膜疏水区对E2蛋白在大肠杆菌中表达的影响。方法利用ExPasy预测软件对E2蛋白跨膜疏水区进行预测分析,根据GenBank数据库中CHIKV-E2氨基酸序列获得其对应的基因序列。结合重叠延伸PCR(OE-PCR)原理设计用于全基因合成的核酸引物对CHIKV-E2全长基因(404 aa)进行体外合成,构建全长E2蛋白及其缺失突变体原核表达质粒,将序列正确的两种重组质粒分别转至E.coli BL21(DE3),经IPTG诱导表达,SDS-PAGE检测重组质粒的表达情况。结果 OE-PCR法成功合成了大小为1 212 bp的编码CHIKV-E2(1~404 aa)蛋白的全长基因,构建了全长E2蛋白及其缺失突变体重组表达质粒pET21b-E2(1~404)和pET21b-E2(1~350),经IPTG诱导表达后,SDS-PAGE结果显示缺失突变体pET21b-E2(1~350)融合蛋白表达量较pET21b-E2(1~404)有明显提高。结论 E2蛋白跨膜疏水区(351~378 aa)对该蛋白的原核表达具有重要影响,缺失该疏水区的突变体在大肠杆菌中表达量比全长E2蛋白表达量明显提高。 展开更多
关键词 CHIKV-e2 跨膜疏水性蛋白 全基因合成 缺失突变体 原核表达
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融合His标签的HCV包膜糖蛋白E2的真核表达及意义 被引量:1
3
作者 杜德伟 贾战生 +5 位作者 秦鸿雁 孙强 刘秋平 聂青和 周永兴 韩骅 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第10期904-906,共3页
目的 构建HCV包膜糖蛋白E2与His标签融合的真核表达载体并在CHO细胞中表达 ,为研究HCV包膜糖蛋白的功能奠定基础。方法 利用PCR技术从HCV基因组序列中扩增出编码HCV包膜糖蛋白E2的基因 ,将其插入原核表达载体pET2 8(a)载体中 ,构建pET... 目的 构建HCV包膜糖蛋白E2与His标签融合的真核表达载体并在CHO细胞中表达 ,为研究HCV包膜糖蛋白的功能奠定基础。方法 利用PCR技术从HCV基因组序列中扩增出编码HCV包膜糖蛋白E2的基因 ,将其插入原核表达载体pET2 8(a)载体中 ,构建pET2 8(a) HCVE2 ,从pET2 8(a) HCVE2上获得His HCVE2融合基因 ,插入pcDNA3 1,构建表达HCV包膜糖蛋白E2与His标签融合蛋白的真核表达载体pcDNA3 1 His E2。用脂质体介导法将pcDNA3 1 His E2转染CHO细胞 ,通过间接免疫荧光、Westernblot检测融合蛋白在CHO细胞内的表达。结果 转染HCVE2与His融合基因的真核表达载体的CHO细胞内有融合蛋白的表达。结论 与His标签融合的HCV包膜糖蛋白E2能够在CHO细胞内表达。 展开更多
关键词 肝炎病毒 丙型 包膜糖蛋白e2 融合基因 真核表达
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猪瘟病毒表面抗原E2基因的克隆与原核表达 被引量:9
4
作者 吴思敏 王钊哲 +10 位作者 许瑞 林矫矫 洪炀 陈兆国 陆珂 李浩 石耀军 江嘉欣 李嘉静 朱传刚 唐亚兰 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2017年第5期32-36,共5页
为获得可用于诊断的猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)E2蛋白重组抗原,对CSFV-E2的多个B细胞抗原表位进行重构和表达。将人工合成的E2蛋白多抗原表位基因与p ET-28a(+)载体连接后,转化至宿主菌BL21(DE3),IPTG诱导表达,SDS-PAG... 为获得可用于诊断的猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)E2蛋白重组抗原,对CSFV-E2的多个B细胞抗原表位进行重构和表达。将人工合成的E2蛋白多抗原表位基因与p ET-28a(+)载体连接后,转化至宿主菌BL21(DE3),IPTG诱导表达,SDS-PAGE电泳分析蛋白可溶性,His亲和层析柱纯化蛋白并进行抗原性检测。重构后的猪瘟病毒E2基因多抗原表位基因大小约500 bp,PCR、双酶切鉴定结果显示与预期相符;重组蛋白为可溶性表达,大小约23 k Da;Western blot结果显示,重组蛋白可与猪瘟阳性血清发生特异性结合,具有良好的免疫反应性,可作为诊断抗原用于猪瘟病毒感染动物的血清抗体检测。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 e2基因 原核表达 蛋白纯化
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牛病毒性腹泻病毒E2蛋白的克隆、表达及多克隆抗体制备 被引量:4
5
作者 陈文龙 张阳阳 +2 位作者 张生英 邢小勇 胡永浩 《吉林大学学报(理学版)》 CAS 北大核心 2020年第3期711-717,共7页
利用原核系统表达牛病毒性腹泻病毒(BVDV)E2蛋白,制备鼠源多克隆抗体.通过MDBK细胞增殖病毒,提取RNA,RT-PCR扩增E2全长基因,进行生物信息学分析后设计截短引物,构建优化表达载体pET-30-E2,转化BL21,用异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG... 利用原核系统表达牛病毒性腹泻病毒(BVDV)E2蛋白,制备鼠源多克隆抗体.通过MDBK细胞增殖病毒,提取RNA,RT-PCR扩增E2全长基因,进行生物信息学分析后设计截短引物,构建优化表达载体pET-30-E2,转化BL21,用异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(IPTG)诱导蛋白表达;用SDS-PAGE电泳分析蛋白表达,纯化蛋白联合弗氏佐剂免疫小鼠;用酶联免疫吸附测定(ELISA)法测定抗体效价水平,用免疫印迹(WB)和免疫荧光(IFA)法验证抗体特异性.结果表明:E2基因在大肠杆菌中成功表达,蛋白大小为32000,不可溶形式表达,表达量为0.4 mg/mL;多克隆抗体效价为1∶256000,可特异性结合重组蛋白及细胞中的病毒. 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 e2基因 e2蛋白 原核表达 多克隆抗体
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猪瘟病毒Erns和E2蛋白重组表达及抗体间接ELISA检测方法的建立 被引量:1
6
作者 张洪亮 郝占武 +6 位作者 林喜平 张志 王凤雪 解倩倩 韩先杰 单虎 温永俊 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2022年第1期76-83,共8页
本研究将CSFV Erns和E2基因的主要抗原区进行克隆,构建pET32a-Erns和pET32aEK-E2重组质粒,将其转化大肠杆菌BL21(DE3)进行诱导表达和纯化,以纯化的rErns、rE2重组蛋白为包被抗原,经条件优化,分别建立CSFV rErns和rE2抗体间接ELISA检测... 本研究将CSFV Erns和E2基因的主要抗原区进行克隆,构建pET32a-Erns和pET32aEK-E2重组质粒,将其转化大肠杆菌BL21(DE3)进行诱导表达和纯化,以纯化的rErns、rE2重组蛋白为包被抗原,经条件优化,分别建立CSFV rErns和rE2抗体间接ELISA检测方法。SDS-PAGE结果显示,分别获得约为47 kDa和42 kDa的重组蛋白,rErns重组蛋白主要在上清液中存在,rE2重组蛋白主要以包涵体形式存在。Western blot结果显示,纯化后的重组蛋白具有良好的免疫原性。通过方阵试验进行了ELISA反应条件优化,确定了Erns蛋白最佳包被量为2.5μg/mL,rE2蛋白最佳包被量为0.625μg/mL,待检血清最佳稀释倍数为1∶100,最佳封闭液为0.25%PVA溶液,HRP标记的兔抗猪IgG二抗最佳稀释度为1∶2000,临界值分别为0.24和0.33。上述方法仅与CSFV阳性血清发生特异性反应,检测敏感性可达到1∶1600,批内重复性和批间重复性变异系数均小于10%。本研究建立的间接ELISA方法可初步应用于CSFV Erns和E2抗体的检测,鉴别E2亚单位疫苗免疫抗体和野毒感染抗体,有利于猪瘟净化工作的实施。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 Erns基因 e2基因 蛋白表达 间接ELISA
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1株牛病毒性腹泻病毒的分离鉴定及其结构蛋白E2序列分析 被引量:4
7
作者 王妍瑾 宋涛 +6 位作者 杨雨杰 金宇航 乔天一 孟赓 严世杰 芮萍 马增军 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2023年第4期13-18,共6页
为了解河北省唐山市规模化奶牛场中牛病毒性腹泻病毒(BVDV)流行毒株的基因特征,本试验于唐山市2个规模化奶牛场采集了49份临床样品进行逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测,并对阳性样品进行病毒的分离,最终成功分离到1株非致细胞病变的B... 为了解河北省唐山市规模化奶牛场中牛病毒性腹泻病毒(BVDV)流行毒株的基因特征,本试验于唐山市2个规模化奶牛场采集了49份临床样品进行逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测,并对阳性样品进行病毒的分离,最终成功分离到1株非致细胞病变的BVDV毒株,命名为HB-1株。电镜观察结果显示,HB-1株具有典型的BVDV病毒粒子形态。对HB-1株全基因组序列进行扩增和测序,基因遗传进化分析结果显示,HB-1株属于BVDV-1m亚型。HB-1株结构蛋白E2全长序列糖基化位点和抗原表位预测结果显示,HB-1株E2蛋白含有4个保守的糖基化位点,其中抗原表位1高度保守。本试验为河北省进一步开展牛病毒性腹泻(BVD)流行病学调查、疫苗株筛选以及检测方法建立提供数据支撑。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 分离和鉴定 全基因组测序 e2蛋白序列分析
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血清PGE2、HMGB1和CGRP在慢性牙周炎患者中的表达及预测效能 被引量:6
8
作者 何龙 云蔓 +3 位作者 吴薇薇 翁海勇 王琼超 罗文 《分子诊断与治疗杂志》 2022年第7期1242-1245,共4页
目的 探索血清降钙素基因相关肽(CGRP)、高迁移率族蛋白1(HMGB1)、前列腺素E2(PGE2)在慢性牙周炎患者中的表达及临床价值。方法 选取2018年6月至2019年12月期间在海南医学院第一附属医院收集的研究者,93例牙周健康者(对照组)、186例慢... 目的 探索血清降钙素基因相关肽(CGRP)、高迁移率族蛋白1(HMGB1)、前列腺素E2(PGE2)在慢性牙周炎患者中的表达及临床价值。方法 选取2018年6月至2019年12月期间在海南医学院第一附属医院收集的研究者,93例牙周健康者(对照组)、186例慢性牙周炎患者(观察组),均进行血清TNF-α、PGE2、HMGB1、CGRP检测,观察组根据病情严重程度分为,轻度组(n=51),中度组(n=89),重度组(n=46),比较各组血清指标,再经ROC曲线分析各血清指标预测效能。结果 观察组TNF-α、PGE2、HMGB1高于对照组,CGRP低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);三组TNF-α、PGE2、HMGB1水平比较显示:重度组>中度组>轻度组,CGRP水平比较显示:重度组<中度组<轻度组,差异有统计学意义(P<0.05)。经Spearman法分析,慢性牙周炎TNF-α、PGE2、HMGB1呈正相关性,与CGRP呈负相关(P<0.05)。经ROC曲线分析,TNF-α、PGE2、HMGB1、CGRP及四项预测慢性牙周炎AUC分别为0.609、0.776、0.722、0.825、0.923;预测牙周炎病情严重程度的AUC值分别为0.735、0.802、0.814、0.859、0.967。结论慢性牙周炎患者血清CGRP呈低表达,PGE2、HMGB1呈高表达,均参与了患者疾病发生、发展过程。 展开更多
关键词 牙周炎 前列腺素e2 高迁移率族蛋白1 降钙素基因相关肽
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Tn5转座子介导表达猪瘟E2蛋白和EGFP重组伪狂犬病毒的构建 被引量:2
9
作者 高博 范志强 +7 位作者 韩乃君 张念 张锦霞 王颖 白安斌 黄红梅 扈荣良 吴健敏 《中国动物传染病学报》 CAS 2011年第3期14-18,共5页
为构建猪瘟重组伪狂犬疫苗,以Tn5转座子为介导,采用体外转座的方法将猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)E2基因和增强绿色荧光蛋白(enhanced green fluoresce protein,EGFP)的表达盒随机插入伪狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV... 为构建猪瘟重组伪狂犬疫苗,以Tn5转座子为介导,采用体外转座的方法将猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)E2基因和增强绿色荧光蛋白(enhanced green fluoresce protein,EGFP)的表达盒随机插入伪狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)基因组中,随后将转座产物转染BHK-21细胞,获得表达E2蛋白和EGFP的病毒库,并对E2蛋白和EGFP在细胞上的表达效果进行PCR鉴定和间接免疫荧光分析。试验结果表明,运用体外转座的方法可以将外源基因插入PRV基因组中,并且外源基因可以在细胞中表达。本研究为重组病毒的研究提供了新思路,并为新型重组猪瘟疫苗的研制进一步奠定了基础。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 e2基因 Tn5转座子 绿色荧光蛋白 伪狂犬病毒
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基因缺失杆状病毒载体的构建及应用
10
作者 王同燕 仝晓丹 +5 位作者 苏晓蕊 宋欢欢 李伟国 刘武杰 谭菲菲 田克恭 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第1期48-55,共8页
为解决杆状病毒表达系统存在的表达量低和毒种种子批代次窄问题,加快杆状病毒表达系统产业化进程。本研究首次通过Red和Cas9两种重组技术,先后对影响蛋白表达的V-cath、ChiA、P10和重组杆状病毒基因组稳定性的FP25K和DA26基因进行缺失... 为解决杆状病毒表达系统存在的表达量低和毒种种子批代次窄问题,加快杆状病毒表达系统产业化进程。本研究首次通过Red和Cas9两种重组技术,先后对影响蛋白表达的V-cath、ChiA、P10和重组杆状病毒基因组稳定性的FP25K和DA26基因进行缺失。同时基于对CSFV-E2蛋白的结构和糖基化预测分析,突变影响同源二聚体二硫键形成的糖基化位点。最后通过悬浮转染的方式提高拯救病毒的滴度。结果表明对E2基因突变后,表达的E2蛋白95%以同源二聚体形式存在。通过供体质粒优化和病毒载体基因缺失,E2蛋白的表达水平提高约4倍,可稳定表达蛋白的重组杆状病毒毒株代次从P7代延长至P20代。悬浮转染获得的重组杆状病毒滴度提高约70倍,同时获得足量低代次的毒种,有效缩短从毒种构建到蛋白表达时间,有效解决杆状病毒表达系统表达量低和毒种种子批代次窄的问题,为猪瘟亚单位疫苗研发奠定基础。 展开更多
关键词 杆状病毒 猪瘟病毒 基因缺失 e2蛋白
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猪瘟病毒DNA疫苗的构建及动物免疫试验 被引量:3
11
作者 许信刚 胡建和 张彦明 《中国农学通报》 CSCD 2005年第3期9-11,29,共4页
利用DNA重组技术将猪瘟病毒(CSFV)C株E2囊膜蛋白全长基因克隆到真核表达载体pcDNA4.0的CMV启动子下游,采用磷酸钙转染法将重组质粒转入293T细胞,流式细胞仪(FACS)检测293T细胞瞬时表达了E2囊膜蛋白。将构建的重组质粒肌肉注射BALB/c小鼠... 利用DNA重组技术将猪瘟病毒(CSFV)C株E2囊膜蛋白全长基因克隆到真核表达载体pcDNA4.0的CMV启动子下游,采用磷酸钙转染法将重组质粒转入293T细胞,流式细胞仪(FACS)检测293T细胞瞬时表达了E2囊膜蛋白。将构建的重组质粒肌肉注射BALB/c小鼠,用流式细胞仪和酶联免疫吸附试验(ELISA)检测证明成功诱导小鼠产生了抗E2蛋白的抗体,为下一步利用DNA疫苗免疫小鼠研制抗猪瘟病毒单克隆抗体打下基础。 展开更多
关键词 DNA疫苗 T细胞 流式细胞仪 重组质粒 抗E 酶联免疫吸附试验(ELISA) 肌肉注射 猪瘟病毒 动物免疫 囊膜蛋白
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NF-κB p65介导的前列腺素E2分泌及DNA结合抑制因子2蛋白表达在促进大鼠桡骨骨折早期愈合的作用 被引量:4
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作者 牛增志 王乐禹 +5 位作者 胡晓芳 汪海仪 欧阳钧 黄文华 余磊 邱小忠 《中国修复重建外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期569-574,共6页
目的骨再生过程包含一系列复杂的分子信号途径,通过探讨NF-κB作为骨折愈合过程中"关键性激活点"的可能性,为基因治疗骨折延迟愈合和骨不连提供实验依据。方法取6~7周龄Wistar雄性大鼠33只,体重180~220 g,随机分为4组。对照... 目的骨再生过程包含一系列复杂的分子信号途径,通过探讨NF-κB作为骨折愈合过程中"关键性激活点"的可能性,为基因治疗骨折延迟愈合和骨不连提供实验依据。方法取6~7周龄Wistar雄性大鼠33只,体重180~220 g,随机分为4组。对照组(A组,n=3)、单纯NF-κB抑制剂Bay 11-7082处理组(B组,n=6):分别在大鼠右前肢桡骨中下段经皮注射0.3 mL生理盐水或含50μmol/L Bay 11-7082的生理盐水,每天1次,持续至处死。单纯骨折组(C组,n=12)、Bay 11-7082干预骨折组(D组,n=12):制备右侧桡骨中下段骨折模型后,C组不作任何处理,D组处理方法同B组。观察大鼠一般情况,A组于注射后7 d,B、C、D组于注射后3、7 d取标本行ALP活性、前列腺素E2(prostaglandins E2,PGE2)含量检测以及Western blot检测NF-κB p65、BMP-7和DNA结合抑制因子2(inhibitor of DNA binding 2,Id2),并取C、D组14、28 d标本行HE染色观察。结果各组大鼠均存活至实验完成。注射后3、7 d B组ALP活性及PGE2含量与A组比较,差异均无统计学意义(P>0.05);C组较A组增高,D组较A组降低,差异均有统计学意义(P<0.01)。注射后3、7 d,各组骨折端组织中均见NF-κB p65、BMP-7、Id2表达,B组各因子表达水平与A组比较,差异均无统计学意义(P>0.05);C组NF-κB p65和BMP-7蛋白表达水平较A组增高,Id2蛋白表达水平较A组降低,差异均有统计学意义(P<0.01);D组NF-κB p65、BMP-7蛋白表达水平较A组降低,Id2蛋白表达较A组增高,差异均有统计学意义(P<0.01)。组织学观察示,注射后14、28 d C组骨折端组织见大量骨性骨痂,而D组28 d时才见骨性骨痂。结论 NF-κB p65可通过调控PGE2分泌以及BMP-7和Id2蛋白表达促进大鼠桡骨骨折的早期愈合。 展开更多
关键词 骨折愈合 NF-ΚB 前列腺素e2 BMP-7 DAN结合抑制因子2 基因治疗 大鼠
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丙型肝炎病毒基因组部分E2/NS1蛋白基因在大肠杆菌中的表达
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作者 曾经瑗 毕胜利 +2 位作者 李景源 赵洪兰 刘崇柏 《中华实验和临床病毒学杂志》 CSCD 1995年第4期303-306,共4页
在大肠杆菌中表达了丙型肝炎病毒基因组的部分E2/NS1蛋白(氨基酸364-512)。表达蛋白经SDS-PAGE分析,主要表达带的分子量在~43000左右。表达蛋白用于检测已用C33c及Q22检测过的血清,发现E2NS... 在大肠杆菌中表达了丙型肝炎病毒基因组的部分E2/NS1蛋白(氨基酸364-512)。表达蛋白经SDS-PAGE分析,主要表达带的分子量在~43000左右。表达蛋白用于检测已用C33c及Q22检测过的血清,发现E2NS1引抗体阳性率占C33c及Q22抗体阳性血清的20%,尚没有发现单独E2/NS1抗体阳性的血清。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 基因 外膜蛋白 e2/NS1 大肠杆菌
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我国新分离盖塔病毒的部分基因组分子特征研究 被引量:12
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作者 陈维欣 王环宇 +7 位作者 付士红 李铭华 刘桂芳 姜红月 王力华 王海岩 王志玉 梁国栋 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期399-404,共6页
目的 通过分子生物学方法研究我国山东省2008年分离的盖塔病毒(DY0824)基因组分子生物学特征.方法 应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出结构区基因和3' UTR片段,连接到载体中进行序列测定,然后用Clustal X1.83和MegaAlign软件对... 目的 通过分子生物学方法研究我国山东省2008年分离的盖塔病毒(DY0824)基因组分子生物学特征.方法 应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出结构区基因和3' UTR片段,连接到载体中进行序列测定,然后用Clustal X1.83和MegaAlign软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用Mega4软件绘制系统发生树.结果 DY0824病毒株衣壳蛋白由804个核苷酸组成,编码268个氨基酸,与国内外其他分离株的核苷酸同源性为95.4%~99.9%,氨基酸同源性为97.4%~100%.E2蛋白全长1266个核苷酸,编码422个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.8%~99.5%,氨基酸同源性为97.6%~100%.该病毒3' UTR由401个核苷酸组成,存在3个重复序列.结论 山东省新分离盖塔病毒衣壳蛋白和E蛋白基国与该病毒原型分离株相比分别存在7个和10个氨基酸差异位点,病毒3'UTR区域存在多个核苷酸差异位点. 展开更多
关键词 盖塔病毒 衣壳蛋白基因 e2蛋白基因 3’非翻译区 核苷酸序列
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四川省首株盖塔病毒SC1210的鉴定 被引量:6
15
作者 李伟 潘明 +7 位作者 周兴余 林世华 刘学成 付士红 陈丹林 曹一欧 梁国栋 张佳珂 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2017年第1期2-7,共6页
目的 对四川省从蚊虫分离到的病毒SC1210进行鉴定并分析其基因组特征.方法 利用披膜病毒科甲病毒属特异性引物进行RT-PCR鉴定,并采用二代测序平台Ion Torrent PGM进行基因组全序列测定,然后利用Mega Align软件对测定的核苷酸和推测的氨... 目的 对四川省从蚊虫分离到的病毒SC1210进行鉴定并分析其基因组特征.方法 利用披膜病毒科甲病毒属特异性引物进行RT-PCR鉴定,并采用二代测序平台Ion Torrent PGM进行基因组全序列测定,然后利用Mega Align软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,利用Mega 6软件绘制系统发生树.结果 SC1210为盖塔病毒(Getah virus,GETV),该株病毒基因组全长11 690nt,与国内外其他分离株的核苷酸同源性为99.2%-99.7%,氨基酸同源性为96.5%-99.4%.衣壳蛋白全长为804nt,编码268个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.9%-99.2%,氨基酸同源性97%-99.6%.E2基因全长1 266 nt,编码422个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.6%-99.6,氨基酸同源性为97.1%-99.5%.3'UTR全长402 nt,具有GETV病毒独特的3个完整的重复序列元件和19 nt的保守序列.结论 四川省分离到的首株GETV SC1210与云南分离株YN0540亲缘关系较近,而与马来西亚原始株MM2021亲缘关系较远. 展开更多
关键词 盖塔病毒 衣壳蛋白基因 e2蛋白基因 3’非翻译区 核苷酸序列
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