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两株登革2型病毒E、NS1蛋白基因序列测定及其系统发生分析 被引量:7
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作者 郝牧 左丽 +1 位作者 舒莉萍 李永念 《贵阳医学院学报》 CAS 2004年第4期356-356,共1页
关键词 登革2型病毒 e蛋白 ns1蛋白 基因序列测定 登革出血热
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庚型肝炎病毒杭州株E_2/NS_1基因区的克隆及序列分析
2
作者 陈勇 洪艳 +2 位作者 杨连华 凌志强 俞为群 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期29-30,共2页
目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2 /NS1区部分核酸序列。方法 选择 1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者 ,从其血清中分离HGVRNA ,通过逆转录套式聚合酶链反应(RT nPCR)法 ,扩增该散发性HGV(HZ 2株 )E2 /NS1区部分cDNA片段 ,然后克隆... 目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2 /NS1区部分核酸序列。方法 选择 1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者 ,从其血清中分离HGVRNA ,通过逆转录套式聚合酶链反应(RT nPCR)法 ,扩增该散发性HGV(HZ 2株 )E2 /NS1区部分cDNA片段 ,然后克隆到质粒 pGEX 4T 3中 ,并进行核苷酸序列分析。结果 HGV杭州株与河北株 (HGVC96 4、美国株 )(HGU44 40 2 )的核苷酸同源性为 92 5 %和 89 8% ,氨基酸同源性为 98 0 %和 93 9%。 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 e2/ns1基因区 CDNA克隆 序列分析
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Ⅲ型中国株HCV E2/NS1基因的扩增及其哺乳动物细胞表达质粒克隆构建
3
作者 吴朝栋 陶其敏 +1 位作者 杜绍财 常锦红 《北京医科大学学报》 CSCD 1998年第4期371-32,共1页
Ⅲ型中国株HCVE2/NS1基因的扩增及其哺乳动物细胞表达质粒克隆构建吴朝栋陶其敏杜绍财常锦红(北京医科大学人民医院肝病研究所,北京100044)E2/NS1基因被认为是丙型肝炎病毒(HCV)基因组的结构区基因,具... Ⅲ型中国株HCVE2/NS1基因的扩增及其哺乳动物细胞表达质粒克隆构建吴朝栋陶其敏杜绍财常锦红(北京医科大学人民医院肝病研究所,北京100044)E2/NS1基因被认为是丙型肝炎病毒(HCV)基因组的结构区基因,具有较大的变异性[1],而且在不同的... 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 e2/ns1 基因扩增 细胞表达
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Ⅲ型中国株HCVE2/NS1基因与已知分离株的同源性比较
4
作者 吴朝栋 陶其敏 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 1998年第5期553-556,共4页
利用逆转录套式PCR扩增Ⅲ型中国株HCVE2/NS1基因片段,将其克隆到pcDNA3载体上.采用双脱氧链终止法测定插入片段的核苷酸序列.并与已知分离株的相应区域进行同源性比较.首次克隆出Ⅲ型中国株HCVE2/NS1基... 利用逆转录套式PCR扩增Ⅲ型中国株HCVE2/NS1基因片段,将其克隆到pcDNA3载体上.采用双脱氧链终止法测定插入片段的核苷酸序列.并与已知分离株的相应区域进行同源性比较.首次克隆出Ⅲ型中国株HCVE2/NS1基因(HC-W14),其核苷酸序列与Ⅲ型日本株HCV(HC-J6)该区域同源性为88.37%,其推定的氨基酸同源性为89.29%.而与已知的非Ⅲ型株HCV该区域相比,核苷酸及氨基酸的同源性均相对较低.Ⅲ型中国株HCV与Ⅱ型中国株HCV在E2/NS1区域有较大的变异,揭示研制我国的HCV疫苗应该考虑这种基因型之间的变异性. 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 e2/ns1 同源性
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Antibody to El peptide of hepatitis C virus genotype 4 inhibits virus binding and entry to HepG2 cells in vitro
5
作者 Mostafa K EL-Awady Ashraf A Tabll +7 位作者 Khaled Atef Samar S Yousef Moataza H Omran Yasmin EI-Abd Noha G Bader-Eldin Ahmad M Salem Samir F Zohny Wael T EI-Garf 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2006年第16期2530-2535,共6页
AIM: To analyze the neutralizing activity of antibodies against E1 region of hepatitis C virus (HCV). Specific polydonal antibody was raised via immunization of New Zealand rabbits with a synthetic peptide that had... AIM: To analyze the neutralizing activity of antibodies against E1 region of hepatitis C virus (HCV). Specific polydonal antibody was raised via immunization of New Zealand rabbits with a synthetic peptide that had been derived from the E1 region of HCV and was shown to be highly conserved among HCV published genotypes. METHODS: Hyper-immune HCV E1 antibodies were incubated over night at 4 ℃ with serum samples positive for HCV RNA, with viral loads ranging from 615 to 3.2 million IU/mL. Treated sera were incubated with HepG2 cells for 90 min. Blocking of viral binding and entry into cells by anti E1 antibody were tested by means of RTPCR and flow cytometry. RESULTS: Direct immunostaining using FITC conjugated E1 antibody followed by Flow cytometric analysis showed reduced mean fluorescence intensity in samples pre-incubated with E1 antibody compared with untreated samples. Furthermore, 13 out of 18 positive sera (72%) showed complete inhibition of infectivity as detected by RT-PCR. CONCLUSION: In house produced E1 antibody, blocks binding and entry of HCV virion infection to target cells suggesting the involvement of this epitope in virus binding and entry. Isolation of these antibodies that block virus attachment to human cells are useful as therapeutic reagents. 展开更多
关键词 Flow cytometry Hepatitis C virus e1 envelope Therapeutic antibodies Direct immuno-fluorescence HepG2 cells
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乙型脑炎病毒SA14-14-2株NS1和E蛋白的原核表达及其免疫原性 被引量:10
6
作者 徐宏山 俞永新 +3 位作者 贾丽丽 黄莺 董关木 俞炜源 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2010年第2期118-123,共6页
目的原核表达乙型脑炎病毒(JEV)NS1和E蛋白,并初步探讨其免疫原性。方法采用RT-PCR法扩增JEVSA14-14-2株NS1和E蛋白基因片段,分别克隆入原核表达载体pET-30a(+)和pET-32a(+),构建重组表达质粒pET-30NS1和pET-32Et,转化大肠杆菌BL21(DE3)... 目的原核表达乙型脑炎病毒(JEV)NS1和E蛋白,并初步探讨其免疫原性。方法采用RT-PCR法扩增JEVSA14-14-2株NS1和E蛋白基因片段,分别克隆入原核表达载体pET-30a(+)和pET-32a(+),构建重组表达质粒pET-30NS1和pET-32Et,转化大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导表达,SDS-PAGE分析目的蛋白的表达形式及表达水平。两种蛋白经亲和层析纯化后,Western blot鉴定其反应原性。通过小鼠主动和被动保护力试验及豚鼠病毒血症试验,检测两种蛋白的免疫原性。结果酶切及测序证明重组表达质粒构建正确;表达的重组NS1和E蛋白的相对分子质量分别约为40000和47000,均以包涵体形式表达;纯化的重组NS1和E蛋白的浓度分别为160.7和380μg/ml,均具有良好的反应原性;小鼠主动和被动保护力试验表明两种蛋白均有保护活性;豚鼠病毒血症试验显示,NS1蛋白免疫豚鼠后能明显抑制病毒血症的产生。结论已成功表达并纯化了JEVSA14-14-2株NS1和E蛋白,两种蛋白均有较好的免疫保护活性。 展开更多
关键词 乙型脑炎病毒 SA14-14-2 ns1蛋白 e蛋白 原核表达 免疫原性
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登革2型病毒浙江分离株的鉴定与分子流行病学研究 被引量:1
7
作者 夏时畅 严菊英 +3 位作者 卢亦愚 翁景清 茅海燕 徐昌平 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期404-408,共5页
目的为了对2004年浙江省报告的输入性疑似登革热病例查明病因,从分子水平分析流行毒株的生物学特征,追踪传染源,为疾病的预防控制提供实验室依据。方法对疑似患者血清标本采用ELISA、IFA和荧光RT-PCR方法分别检测登革病毒IgMI、gG抗体... 目的为了对2004年浙江省报告的输入性疑似登革热病例查明病因,从分子水平分析流行毒株的生物学特征,追踪传染源,为疾病的预防控制提供实验室依据。方法对疑似患者血清标本采用ELISA、IFA和荧光RT-PCR方法分别检测登革病毒IgMI、gG抗体和病毒核酸,并用C6/36和BHK-21细胞分离登革病毒。采用RT-PCR方法扩增病毒E基因和NS1基因后分别进行序列测定,并与不同国家和地区的登革热毒株进行同源性和进化树分析。结果从患者血清中检测到登革病毒IgM、IgG抗体和登革2型病毒核酸,并分离到登革2型病毒;浙江省登革2型病毒分离株(ZJ/01/04)与登革2型国际标准株Jamaica、国内Fujian/10/99株和Saudi/92株在E基因上氨基酸的同源性分别为97.1%、99.2%和99.6%,而与登革1、3、4型毒株相同区域氨基酸同源性分别为68.7%、66.9%和63.6%。基因进化树显示ZJ/01/04分离株与Saudi/92株亲缘关系最近,在进化树的同一分支上。结论从病原学、血清学和分子生物学特征上均证实该输入病例是由登革2型病毒引起,该毒株最有可能来源于沙特阿拉伯。 展开更多
关键词 输入病例 登革2型病毒 e基因 ns1基因 序列分析
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两株登革2型病毒E、NS1蛋白基因序列测定及其系统发生分析 被引量:1
8
作者 郝牧 左丽 +1 位作者 舒莉萍 李永念 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期287-291,共5页
目的 对从登革出血热 (denguehemorrhagicfever,DHF)病人血清分离到的一株登革 2型病毒 (denguevirustype 2 ,DEN 2B株 )和DEN 2NGC株作E、NS1蛋白部分基因序列测定并进行系统发生树分析 ,了解其变异及分子进化特征。方法 利用RT PCR... 目的 对从登革出血热 (denguehemorrhagicfever,DHF)病人血清分离到的一株登革 2型病毒 (denguevirustype 2 ,DEN 2B株 )和DEN 2NGC株作E、NS1蛋白部分基因序列测定并进行系统发生树分析 ,了解其变异及分子进化特征。方法 利用RT PCR法扩增B株和NGC株E、NS1部分基因片段 ,PCR产物直接测序 ;利用DNAssist软件预测其氨基酸序列 ,以及PHYLIP软件的CLUSTAL方法绘制系统发生树。结果 B株与NGC株E蛋白基因区第 1~ 4 76nt( 4 76bp)碱基序列存在 8个位点的差异 ;编码氨基酸存在 4个位置的不同 ;NS1基因区第 5 89~ 10 0 2nt( 4 13bp)碱基序列存在 7个位点的差异 ,编码氨基酸有 2个位置的改变 ;B株与NGC株和DEN 2 4 4株E区部分片段核苷酸同源性分别为99 .1%和 98.7% ;与NS1区部分片段核苷酸同源性分别为 98.3%和 98.1%。B株E基因、NS1基因序列已登录GenBank ,注册号分别为AY179733和AY2 384 71。结论 B株E、NS1基因序列和氨基酸序列与NGC株存在差异 ;B株与我国海南 1989年流行的DEN 2 4 4株和NGC株系统进化关系较近。 展开更多
关键词 登革2型病毒 e基因 ns1基因 系统发生树 基因序列 登革出血热
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合并感染HIV对1b型HCV E2/NS1包膜区基因影响
9
作者 黄璜 李军 张卫东 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期778-780,共3页
目的研究人类免疫缺陷病毒(HIV)感染对1 b型丙型肝炎病毒(HCV)E2/NS1包膜区基因变异的影响,探讨2组间E2/NS1区基因序列同源性差异,为HCV/HIV合并感染者中HCV的治疗提供依据。方法对河南省某有偿献血村进行随访,将得到的所有HCV阳性病例... 目的研究人类免疫缺陷病毒(HIV)感染对1 b型丙型肝炎病毒(HCV)E2/NS1包膜区基因变异的影响,探讨2组间E2/NS1区基因序列同源性差异,为HCV/HIV合并感染者中HCV的治疗提供依据。方法对河南省某有偿献血村进行随访,将得到的所有HCV阳性病例255例根据合并HIV感染的情况分成2组,并对其基因分型,然后进行逆转录(RT)-巢式PCR扩增1 b型HCV E2/NS1包膜区基因,继而进行单链构象多态性分析(SSCP)、纯化后测序。结果 HCV单纯感染组和HIV/HCV合并感染组SSCP平均条带数分别为(3.4±0.55)、(2.6±0.55)条,差异有统计学意义(t=2.32,P=0.049);HCV单纯感染组和HIV/HCV合并感染组HCV E2/NS1包膜区同源性分别为76.7%和87.6%,差异有统计学意义(χ2=20.13,P<0.001);2组第一高变区(HVR-1)同源性分别为59.3%和81.9%,差异有统计学意义(χ2=10.39,P=0.001);2组第3高变区(HVR-3)同源性分别为71.7%和83.9%,差异有统计学意义(χ2=4.60,P=0.03);单纯HCV组中变异性较高的氨基酸位点在HCV/HIV合并感染组中表现出较高的保守性。结论 HIV感染对1b型HCV E2/NS1包膜区基因变异具有抑制作用,且其主要体现在HVR-1和HVR-3区。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 人类免疫缺陷病毒 逆转录聚合酶链反应 e2/ns1包膜区 基因变异
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丙型肝炎病毒基因组部分E2/NS1蛋白基因在大肠杆菌中的表达
10
作者 曾经瑗 毕胜利 +2 位作者 李景源 赵洪兰 刘崇柏 《中华实验和临床病毒学杂志》 CSCD 1995年第4期303-306,共4页
在大肠杆菌中表达了丙型肝炎病毒基因组的部分E2/NS1蛋白(氨基酸364-512)。表达蛋白经SDS-PAGE分析,主要表达带的分子量在~43000左右。表达蛋白用于检测已用C33c及Q22检测过的血清,发现E2NS... 在大肠杆菌中表达了丙型肝炎病毒基因组的部分E2/NS1蛋白(氨基酸364-512)。表达蛋白经SDS-PAGE分析,主要表达带的分子量在~43000左右。表达蛋白用于检测已用C33c及Q22检测过的血清,发现E2NS1引抗体阳性率占C33c及Q22抗体阳性血清的20%,尚没有发现单独E2/NS1抗体阳性的血清。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 基因 外膜蛋白 e2/ns1 大肠杆菌
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Comparison between homologies of E2/NS1 gene from genotype Ⅲ Chinese isolates of hepatitis C virus and that from reported isolates 被引量:2
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作者 吴朝栋 陶其敏 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 1998年第9期39-41,共3页
HepatitisCvirus(HCV)isthemajorcausativeagentofnonA,nonBhepatitisthroughouttheworld.1Recently,itwassuggestedt... HepatitisCvirus(HCV)isthemajorcausativeagentofnonA,nonBhepatitisthroughouttheworld.1Recently,itwassuggestedthatproductencod... 展开更多
关键词 GeNe GeNOTYPe e2/ns1 COMPARISON CHINeSe
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2010年浙江省输入性登革2型病毒分子特征研究 被引量:2
12
作者 鲁姣英 翁彭剑 严菊英 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2012年第1期99-102,106,共5页
目的:为确证2010年浙江省输入性疑似登革热病例病因,分析病原的分子特征并进行溯源。方法:对患者血清标本分别检测登革IgM抗体、病毒核酸和病毒分离。对分离株E和NS1基因测序,并进行同源性和进化分析。结果:从血清中检测到登革IgM抗体... 目的:为确证2010年浙江省输入性疑似登革热病例病因,分析病原的分子特征并进行溯源。方法:对患者血清标本分别检测登革IgM抗体、病毒核酸和病毒分离。对分离株E和NS1基因测序,并进行同源性和进化分析。结果:从血清中检测到登革IgM抗体和登革2型核酸,并分离到登革2型病毒株(ZJ/02/10);浙江登革2型分离株与标准株NGC在E基因的核苷酸(nt)和氨基酸(aa)同源性分别为94.7%和97.6%,而与登革1、3、4型的nt同源性分别为65.3%、64.3%和65.9%。ZJ/02/10株与菲律宾PHI/St68/00株E基因nt和aa同源性最高,进化树显示二者亲缘关系最近。NS1基因进化树结果与E基因相似。结论:从血清学、病原学和分子特征均证实输入性疑似登革病例由登革2型病毒引起,该毒株最有可能来源于菲律宾。 展开更多
关键词 输入病例 登革2 e基因 ns1基因 测序
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散发性庚型肝炎病毒部分核苷酸序列分析
13
作者 陈勇 洪艳 《浙江省医学科学院学报》 2000年第1期1-3,共3页
目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2/NS1区部分核苷酸序列。方法 选择1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者,从其血清中分离HGVRNA,通过逆转录-套式聚合酶链反应(RT-nPCR)法,扩增该散发性HGV(HZ-2株)E2/NS1区部分cDNA片段,然后克隆... 目的 获得散发性庚型肝炎病毒杭州株E2/NS1区部分核苷酸序列。方法 选择1例浙江杭州散发性庚型肝炎患者,从其血清中分离HGVRNA,通过逆转录-套式聚合酶链反应(RT-nPCR)法,扩增该散发性HGV(HZ-2株)E2/NS1区部分cDNA片段,然后克隆到质粒pGEX-4T-3中,并进行核苷酸序列分析结果 HGV杭州株与河北株(HGVC964)、美国株(HGU44402)的核苷酸同源性为92.5%和89.8%。氨基酸同源性为98.0%和93.9%。结论 该项研究将为HGV诊断试剂盒 的研制及基因工程疫苗的研制提供资料。 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 e2/ns1基因区 CDNA克隆 序列分析
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1b型丙型肝炎病毒基因组不同区域基因变异对干扰素疗效的影响 被引量:2
14
作者 张琳 白菡 +2 位作者 黄芬 赵桂珍 李颖 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期83-84,共2页
本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2/NS1(含HVR1和HVR2)、NSSA区准种异质性进行了检测,对HVR区准种异质性程度与干扰素(IFN)疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区(ISDR)等热点问题进行... 本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2/NS1(含HVR1和HVR2)、NSSA区准种异质性进行了检测,对HVR区准种异质性程度与干扰素(IFN)疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区(ISDR)等热点问题进行了探讨,为1b型慢性丙型肝炎患者应用IFN抗病毒治疗时进行疗效预测提供理论依据。 展开更多
关键词 干扰素敏感决定区 丙型肝炎患者 疗效预测 1b型 病毒基因组 基因变异 e2/ns1 HCV基因组
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