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基于生物信息学数据分析ELTD1在肾透明细胞癌组织中的表达、甲基化水平及其临床意义 被引量:1
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作者 黄逸婷 王珂 方晨 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1115-1124,共10页
目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水平及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:通过公共数据库分析ccRCC组织中ELTD1表达和甲基化的差异水平,探讨ELTD1表达水平... 目的:探讨表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1(ELTD1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达、甲基化水平及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:通过公共数据库分析ccRCC组织中ELTD1表达和甲基化的差异水平,探讨ELTD1表达水平与患者临床病理特征和预后的相关性。通过TIMER2.0数据库评估ccRCC免疫细胞浸润,筛选ELTD1相关免疫检查点基因,进行GO功能和KEGG通路富集分析,通过基因共表达分析、筛选与ELTD1相关的基因。结果:与癌旁组织比较,ELTD1在ccRCC组织中呈高表达(P<0.05)。TCGA-KIRC队列中,ELTD1的甲基化水平与其表达呈负相关(R=-0.37,P<0.01)。ELTD1转录表达在ccRCC患者年龄、T分期、M分期、临床分期及病理分级组间存在显著差异(均P<0.01),且高表达ELTD1与较长的OS和PFS密切相关(HR=0.55、0.63,均P<0.01),ELTD1高表达是ccRCC的独立保护因素。ELTD1表达与B细胞、CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、巨噬细胞和嗜中性粒细胞的免疫浸润呈显著负相关(R=-0.16、-0.27、-0.25、-0.31、-0.27,均P<0.01)。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,血管生成及肿瘤相关信号通路在ELTD1高表达表型中显著富集(均P<0.01)。ELTD1共表达基因的生存分析提示,其肿瘤抑制作用与共表达网络有关。结论:ELTD1在ccRCC组织中高表达和低甲基化是患者预后良好的指标,且与免疫浸润相关。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 表皮生长因子蛛毒素受体7穿膜结构域蛋白1 甲基化 免疫浸润 预后标志物
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结直肠癌肿瘤细胞ELTD1基因表达水平及蛋白定位研究
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作者 钟智强 吴书玲 +2 位作者 骆丰 黄飞燕 孙明洪 《中国卫生检验杂志》 CAS 2015年第4期541-543,547,共4页
目的研究ELTD1基因在人结直肠正常上皮细胞和肿瘤细胞之间的表达差异,明确其表达蛋白的细胞定位。方法分别抽提对数生长期的人结直肠癌Lo Vo细胞株和正常上皮细胞NCM460细胞株的总RNA,RT-PCR半定量技术扩增靶基因ELTD1和内参基因B2M(β... 目的研究ELTD1基因在人结直肠正常上皮细胞和肿瘤细胞之间的表达差异,明确其表达蛋白的细胞定位。方法分别抽提对数生长期的人结直肠癌Lo Vo细胞株和正常上皮细胞NCM460细胞株的总RNA,RT-PCR半定量技术扩增靶基因ELTD1和内参基因B2M(β2微球蛋白)的mRNA,利用ELTD1/B2M光密度比值来表示细胞ELTD1 mRNA的相对表达量;Western blot法检测2种细胞株靶蛋白ELTD1和内参蛋白GAPDH,利用ELTD1/GAPDH比值来表示ELTD1蛋白的相对表达量;间接免疫荧光技术检测Lo Vo细胞ELTD1蛋白的细胞定位。结果 Lo Vo细胞和NCM460细胞的ELTD1/B2M灰度比值分别为0.83±0.07和0.11±0.04,ELTD1/GAPDH灰度比值分别是0.74±0.1和0.12±0.04,差异有统计学意义(P<0.05),荧光显微镜下,可见黄绿色荧光信号定位于细胞膜。结论 ELTD1基因在正常上皮NCM460细胞极低表达,而在人结直肠癌Lo Vo细胞株高表达,ELTD1蛋白定位于细胞膜,ELTD1是一种有助于结直肠癌的早期诊断、靶向治疗、疗效判断及预后的潜在生物标志分子。 展开更多
关键词 表皮生长因子蛛毒素受体7次跨膜结构域蛋白1 LOVO细胞 NCM460细胞 结直肠癌 逆转录聚合酶链反应 免疫荧光 蛋白免疫印迹
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MicroRNA-139-5p对多形性胶质母细胞瘤细胞增殖和细胞周期的影响及其机制研究 被引量:5
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作者 吴卫东 韦宁仙 +3 位作者 王立晖 曹远东 吴书庆 王轶霖 《临床医学研究与实践》 2016年第3期1-3,24,共4页
目的探讨MicroRNA-139-5p(mi R-139-5p)在多型性胶质母细胞瘤中对细胞增殖和细胞周期的影响及其机制。方法通过miR-139-5p类似物、miR-139-5p抑制物和阴性对照microRNA分别转染U87MG和T98G细胞,RT-PCR分析miR-139-5p表达,通过MTT法观察... 目的探讨MicroRNA-139-5p(mi R-139-5p)在多型性胶质母细胞瘤中对细胞增殖和细胞周期的影响及其机制。方法通过miR-139-5p类似物、miR-139-5p抑制物和阴性对照microRNA分别转染U87MG和T98G细胞,RT-PCR分析miR-139-5p表达,通过MTT法观察其对细胞增殖的影响,通过流式细胞术检测细胞周期和凋亡,通过Western blot检测ELTD1蛋白表达。结果转染miR-139-5p后胶质瘤细胞增殖能力下降、细胞凋亡增加,细胞侵袭能力下降,流式细胞术结果显示S期细胞比例增加,G0/G1期细胞比例下降。Western blot分析显示在miR-139-5p过表达的细胞中,ELTD1蛋白水平显著下降。结论 miR-139-5p过表达可抑制胶质瘤细胞增殖、诱导细胞凋亡,其机制可能与下调ELTD1蛋白和调节细胞周期有关。 展开更多
关键词 miR-139-5p 胶质瘤 eltd1 细胞周期
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Novel approaches to combat chemoresistance against glioblastomas 被引量:1
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作者 Rheal A.Towner Michelle Zalles +1 位作者 Debra Saunders Nataliya Smith 《Cancer Drug Resistance》 2020年第4期686-698,共13页
The poor prognosis of glioblastoma multiforme(GBM)patients is in part due to resistance to current standard-of-care treatments including chemotherapy[predominantly temozolomide(TMZ;Temodar)],radiation therapy and an a... The poor prognosis of glioblastoma multiforme(GBM)patients is in part due to resistance to current standard-of-care treatments including chemotherapy[predominantly temozolomide(TMZ;Temodar)],radiation therapy and an anti-angiogenic therapy[an antibody against the vascular endothelial growth factor(bevacizumab;Avastin)],resulting in recurrent tumors.Several recurrent GBM tumors are commonly resistant to either TMZ,radiation or bevacizumab,which contributes to the low survival rate for GBM patients.This review will focus on novel targets and therapeutic approaches that are currently being considered to combat GBM chemoresistance.One of these therapeutic options is a small molecule called OKlahoma Nitrone 007(OKN-007),which was discovered to inhibit the transforming growth factor β1 pathway,reduce TMZ-resistance and enhance TMZ-sensitivity.OKN-007 is currently an investigational new drug in clinical trials for both newly-diagnosed and recurrent GBM patients.Another novel target is ELTD1(epidermal growth factor,latrophilin and seven transmembrane domain-containing protein 1;alternatively known as ADGRL4,Adhesion G protein-coupled receptor L4),which we used a monoclonal antibody against,where a therapy against it was found to inhibit Notch 1 in a pre-clinical GBM xenograft model.Notch 1 is known to be associated with chemoresistance in GBM.Other potential therapeutic targets to combat GBM chemoresistance include the phosphoinositide 3-kinase pathway,nuclear factor-κB,the hepatocyte/scatter factor(c-MET),the epidermal growth factor receptor,and the tumor microenvironment. 展开更多
关键词 GLIOBLASTOMA pre-clinical models OKlahoma Nitrone 007 transforming growth factor-β1 eltd1 magnetic resonance imaging
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