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Effect of treatment failure on the Cag A EPIYA motif in Helicobacter pylori strains from Colombian subjects
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作者 Javier Andres Bustamante-Rengifo Andres Jenuer Matta +1 位作者 Alvaro Jairo Pazos Luis Eduardo Bravo 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2017年第11期1980-1989,共10页
AIM To evaluate effect of treatment failure on cag A and vac A genotypes in Helicobacter pylori(H. pylori) isolates from Colombia.METHODS One hundred and seventy-six participants infected with H. pylori from Colombia ... AIM To evaluate effect of treatment failure on cag A and vac A genotypes in Helicobacter pylori(H. pylori) isolates from Colombia.METHODS One hundred and seventy-six participants infected with H. pylori from Colombia were treated during 14 d with the triple-standard therapy. Six weeks later, eradication was evaluated by 13C-Urea breath test. Patients with treatment failure were subjected to endoscopy control; biopsies obtained were used for histopathology and culture. DNA from H. pylori isolates was amplified using primers specific for cag A and vac A genes. The phylogenetic relationships among isolates obtained before and after treatment were established by conglomerate analysis based on random amplified polymorphic DNA(RAPD) fingerprinting.RESULTS Treatment effectiveness was at 74.6%. Of the par-ticipants with treatment failure, 25 accepted subjected to a second endoscopy. Prevalence of posttreatment infection was 64%(16/25) and 40%(10/25) by histology and culture, respectively. Upon comparing the cag A and vac A genotypes found before and after therapy, multiple cag A genotypes(cag A-positive and cag A-negative) were found before treatment; in contrast, cag A-negative genotypes decreased after treatment. vac A s1m1 genotype was highly prevalent in patients before and after therapy. The 3'cag A region was successfully amplified in 95.5%(21/22) of the isolates obtained before and in 81.8%(18/22) of the isolates obtained after treatment. In the isolates obtained from patients with treatment failure, it was found that 72.7%(16/22) presented alterations in the number of EPIYA motifs, compared to isolates found before treatment.CONCLUSION Unsuccessful treatment limits colonization by lowvirulence strains resulting in partial and selective eradication in mixed infections, and acts on the cag A-positive strains inducing genetic rearrangements in cag A variable region that produces a loss or gain of EPIYA repetitions. 展开更多
关键词 Helicobacter pylori RAPD-PCR Treatment failure epiya motifs 3’ cag A variable region
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不同地区幽门螺杆菌cagA基因羧基端可变区及其蛋白序列差异分析 被引量:13
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作者 吴莺 张尤历 +2 位作者 王文兵 陈劲频 沈琰 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2007年第7期746-749,共4页
目的:比较不同地区H pylori cagA 3'端可变区序列差异及序列的地域特征,分析差异与疾病的相关性.方法:选择本实验室所收集的20例cagA+的PCR产物进行测序,并通过ExPASy-Translation软件推测其氨基酸序列,搜索并收集GenBank中已公布... 目的:比较不同地区H pylori cagA 3'端可变区序列差异及序列的地域特征,分析差异与疾病的相关性.方法:选择本实验室所收集的20例cagA+的PCR产物进行测序,并通过ExPASy-Translation软件推测其氨基酸序列,搜索并收集GenBank中已公布的不同地区3-6个H pyloricagA 3'端可变区序列及其氨基酸序列进行比较分析.结果:cagA蛋白的氨基酸序列可分为具有明显地域特征的东亚型和西方型两类;部分东亚型菌株表现出西方型变异.87.4%的菌株具有3个串联排列的EPIYA基序,8.2%的菌株具有4个或以上EPIYA基序.新发现1条具有区域特征的含有3个氨基酸的序列.cagA蛋白氨基酸序列中的EPIYA数目与临床结果没有相关性.结论:H pylori cagA基因及其cagA蛋白序列具有明显多态性,可以根据H pylori cagA 3'端可变区的主要序列差异进行地域分型,cagA 3'端可变区的EPIYA基序的数目与临床结果没有相关性. 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 细胞毒性相关基因A epiya基序 差异
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Influence of Helicobacter pylori oncoprotein CagA in gastric cancer:A critical-reflective analysis 被引量:4
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作者 Fabrício Freire de Melo Hanna Santos Marques +5 位作者 Samuel Luca Rocha Pinheiro Fabian Fellipe Bueno Lemos Marcel Silva Luz Kádima Nayara Teixeira Cláudio Lima Souza Márcio Vasconcelos Oliveira 《World Journal of Clinical Oncology》 CAS 2022年第11期866-879,共14页
Gastric cancer is the fifth most common malignancy and third leading cancerrelated cause of death worldwide.Helicobacter pylori is a Gram-negative bacterium that inhabits the gastric environment of 60.3%of the world’... Gastric cancer is the fifth most common malignancy and third leading cancerrelated cause of death worldwide.Helicobacter pylori is a Gram-negative bacterium that inhabits the gastric environment of 60.3%of the world’s population and represents the main risk factor for the onset of gastric neoplasms.CagA is the most important virulence factor in H.pylori,and is a translocated oncoprotein that induces morphofunctional modifications in gastric epithelial cells and a chronic inflammatory response that increases the risk of developing precancerous lesions.Upon translocation and tyrosine phosphorylation,CagA moves to the cell membrane and acts as a pathological scaffold protein that simultaneously interacts with multiple intracellular signaling pathways,thereby disrupting cell proliferation,differentiation and apoptosis.All these alterations in cell biology increase the risk of damaged cells acquiring pro-oncogenic genetic changes.In this sense,once gastric cancer sets in,its perpetuation is independent of the presence of the oncoprotein,characterizing a“hit-and-run”carcinogenic mechanism.Therefore,this review aims to describe H.pylori-and CagA-related oncogenic mechanisms,to update readers and discuss the novelties and perspectives in this field. 展开更多
关键词 Helicobacter pylori Virulence factors CAGA Gastric cancer epiya motifs Hit-and-run carcinogenesis
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重庆地区幽门螺杆菌的EPIYA基序多态性与胃十二指肠疾病的关系 被引量:3
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作者 林震 田志颖 +3 位作者 朱黎黎 田玲 郑建 杨致邦 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1160-1165,1170,共7页
目的:幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)产生的细胞毒素相关蛋白A(cytotoxin associated antigen A,Cag A)羧基末端的EPIYA序列与胃十二指肠疾病的关系一直存在争议。本研究采集大量H.pylori高感染率同时也是胃癌高发病率... 目的:幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)产生的细胞毒素相关蛋白A(cytotoxin associated antigen A,Cag A)羧基末端的EPIYA序列与胃十二指肠疾病的关系一直存在争议。本研究采集大量H.pylori高感染率同时也是胃癌高发病率的中国重庆地区的病例,通过检测患者感染的H.pylori Cag A羧基末端EPIYA基序的多态性,探讨EPIYA基序与临床胃十二指肠疾病发生的潜在关系。方法:收集消化不良患者的胃黏膜标本分离培养H.pylori,提取细菌基因组DNA,PCR扩增Cag A基因的3'端区域并分型,根据分型结果随机抽样测序确认,结合分离出H.pylori患者的病历资料,分析EPIYA类型与胃十二指肠疾病之间的关系。结果:292(97.3%)株为Cag A阳性,但Cag A阳性与胃十二指肠疾病病型无关(P〉0.5)。19例(6.51%)为不同EPIYA类型菌株混合感染,胃癌病例中混合感染出现的概率明显高于NUD者(OR=4.46,95%CI=1.17~17.03)。单一菌株感染者273株(93.49%),其中EPIYA-ABD型254株(93.04%),EPIYA分型和胃十二指肠疾病的临床病型之间无显著性差异。另外,基因测序标本中发现8株EPIYA-B基序的核苷酸序列存在基因突变。结论:该研究中EPIYA-ABD型占H.pylori感染者的绝大多数,但Cag A阳性和EPIYA-ABD型均与H.pylori感染引起的胃十二指肠疾病无关;然而胃癌患者中混合感染出现的概率明显高于非溃疡性胃炎患者。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 细胞毒素相关蛋白A epiya基序 多态性 胃十二指肠疾病 混合感染
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幽门螺杆菌临床株cagA基因克隆及序列分析 被引量:4
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作者 熊林 陈峥宏 +5 位作者 刘正美 龙妮娅 谢渊 赵艳 官志忠 周建奖 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2015年第9期769-773,777,共6页
目的分离鉴定临床分离株幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp),分析其CagA蛋白的磷酸化基序EPIYA,探讨东亚株HpCagA序列的结构特点。方法选取胃相关疾病患者的胃黏膜组织,剪碎后接种于哥伦比亚血琼脂平板,微需氧培养,菌落生长后... 目的分离鉴定临床分离株幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp),分析其CagA蛋白的磷酸化基序EPIYA,探讨东亚株HpCagA序列的结构特点。方法选取胃相关疾病患者的胃黏膜组织,剪碎后接种于哥伦比亚血琼脂平板,微需氧培养,菌落生长后通过尿素酶试验、革兰染色及显微镜检查对Hp进行初步鉴定。提取菌落基因组,PCR扩增HP16SrRNA基因并进行测序鉴定;扩增cagA基因全长序列,连接入pMD18-T载体。将重组质粒转入感受态E.coliDH5a,测序鉴定重组质粒,利用DNAStar和MEGA6软件对cagA序列进行比对及聚类分析。结果成功分离Hp共26株。构建pMD18-T/cagA克隆载体后对26株Hp的cagA基因全长测序,序列比对分析显示有6株为西方型,20株为东亚型。东亚型CagA第815~834位点存在13个氨基酸的缺失、部分缺失或变异,西方型中有3株丢失磷酸化位点EPIYA-C;聚类分析显示Hp分离株分别聚类为东亚群、西方型东亚群以及西方群3群。结论Hp分离株以东亚株为主,但也存在西方株感染;东、西方型CagA在EPIYA基序及侧翼序列显著差异,菌株之间存在聚类关系。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 CAGA蛋白 epiya基序 聚类分析
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幽门螺杆菌临床分离株CagA的序列比对及其对胃上皮细胞形态与功能的影响 被引量:1
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作者 全欣莹 曾晓燕 +6 位作者 熊林 王文玲 赵艳 谢渊 王琴容 张启芳 周建奖 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期1681-1688,共8页
【背景】细胞毒素相关基因A蛋白(Cytotoxin Associated Gene A Protein,CagA)是幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)重要的效应蛋白,CagA的多态性与胃癌的发生发展密切相关。【目的】比较幽门螺杆菌临床分离株的CagA结构差异,探讨不同CagA... 【背景】细胞毒素相关基因A蛋白(Cytotoxin Associated Gene A Protein,CagA)是幽门螺杆菌(Helicobacter pylori)重要的效应蛋白,CagA的多态性与胃癌的发生发展密切相关。【目的】比较幽门螺杆菌临床分离株的CagA结构差异,探讨不同CagA对胃上皮细胞形态及功能的影响。【方法】对27株幽门螺杆菌的CagA序列进行比对,分析氨基酸组成差异及变异情况,用含不同CagA序列的5株H.pylori感染低恶性胃上皮细胞AGS 6 h,感染复数(Multiplicity of Infection,MOI)为30:1,显微镜观察细胞形态变化,Western Blot法检测极性调节激酶1b(Polarity-Regulating Kinase 1b,PAR1b)的表达,ELISA检测培养液中白介素8(Interleukin-8,IL-8)的浓度。【结果】临床分离株的CagA存在结构和氨基酸组成差异,西方株的EPIYA基序存在更多变异,具有完整cagA基因的菌株感染后细胞形态发生显著变化。Western Blot分析结果显示:与对照组比较,西方株NCTC 11639和H.pylori 26695感染的细胞中PAR1b的表达升高,而东亚株H.pylori GZ7感染的细胞中PAR1b表达降低,差异均有统计学意义(P<0.05);突变株H.pylori GZ15及H.pylori GZ7/ΔcagA感染后PAR1b的表达无显著变化。与对照组比较,实验组中H.pylor感染的细胞培养液中IL-8浓度均增加,东亚株促进IL-8分泌的能力大于西方株。【结论】含不同CagA的幽门螺杆菌发挥不同的生物学功能。东亚株能抑制PAR1b的表达,促进IL-8分泌的能力更强,H.pylori感染引起的细胞形态变化依赖cagA基因的完整性。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 细胞毒素相关基因A 蛋白 epiya 基序 极性调节激酶1b 白介素8
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