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应用生物信息学方法筛选华支睾吸虫功能基因-Cdc42样蛋白
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作者 张红梅 余新炳 +1 位作者 徐劲 吴忠道 《中国热带医学》 CAS 2005年第4期659-660,695,共3页
目的通过建立华支睾吸虫成虫cDNA文库,筛选其功能基因,以研制华支睾吸虫的药物靶标。方法应用SMART方法构建华支睾吸虫成虫cDNA文库,进行大量EST测序,然后应用生物信息学方法分析EST序列。结果从华支睾吸虫成虫cDNA文库中筛选出Cdc42样... 目的通过建立华支睾吸虫成虫cDNA文库,筛选其功能基因,以研制华支睾吸虫的药物靶标。方法应用SMART方法构建华支睾吸虫成虫cDNA文库,进行大量EST测序,然后应用生物信息学方法分析EST序列。结果从华支睾吸虫成虫cDNA文库中筛选出Cdc42样蛋白基因。结论应用生物信息学方法从华支睾吸虫成虫cDNA文库中筛选出Cdc42样蛋白基因。 展开更多
关键词 华支睾吸虫 CDNA文库 est cdc42样蛋白 生物信息学
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miR-93-3p和CDC42在上皮性卵巢癌化疗耐药组织中的表达及临床意义 被引量:9
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作者 杨雷 魏丽军 +1 位作者 王福花 曾勇 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第9期1217-1222,共6页
目的探讨miR-93-3p及CDC42在上皮性卵巢癌铂化疗耐药中的表达及临床意义。方法收集111例上皮性卵巢癌患者的组织学标本并分为敏感组和耐药组,通过靶基因预测网站预测miR-93-3p可能的靶基因为CDC42。采用实时荧光定量PCR检测miR-93-3p及C... 目的探讨miR-93-3p及CDC42在上皮性卵巢癌铂化疗耐药中的表达及临床意义。方法收集111例上皮性卵巢癌患者的组织学标本并分为敏感组和耐药组,通过靶基因预测网站预测miR-93-3p可能的靶基因为CDC42。采用实时荧光定量PCR检测miR-93-3p及CDC42在两组中的相对表达。比较两组miR-93-3p及CDC42的表达差异,分析上皮性卵巢癌组织中miR-93-3p、CDC42相对表达量与临床病理参数的关系。分析miR-93-3p和CDC42的相关性。结果 miR-93-3p在化疗耐药组中的表达水平明显低于敏感组(P <0.05);CDC42在化疗耐药组织中的表达较敏感组明显上调(P <0.05)。miR-93-3p与CDC42的表达呈负相关(r=-0.469,P <0.01)。结论 miR-93-3p在上皮性卵巢癌化疗耐药组织中低表达,可能通过靶向调控CDC42导致铂类化疗耐药。 展开更多
关键词 上皮性卵巢癌 miR-93-3p PCR cdc42 化疗耐药
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Cdc42在舌鳞状细胞癌中的表达及其对细胞增殖、迁移、侵袭的影响
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作者 慕家宁 袁文清 +4 位作者 陆洲 赵阳 王奇民 童磊 陈正岗 《中国口腔颌面外科杂志》 CAS 2023年第3期209-217,共9页
目的:观察细胞分裂周期蛋白42(Cdc42)在舌鳞癌中的表达及与临床病理特征和预后的关系,探讨体外沉默Cdc42基因对舌鳞癌细胞增殖、迁移、侵袭及上皮-间质转化(EMT)的影响及作用机制。方法:通过免疫组织化学法检测Cdc42基因在舌鳞癌及癌旁... 目的:观察细胞分裂周期蛋白42(Cdc42)在舌鳞癌中的表达及与临床病理特征和预后的关系,探讨体外沉默Cdc42基因对舌鳞癌细胞增殖、迁移、侵袭及上皮-间质转化(EMT)的影响及作用机制。方法:通过免疫组织化学法检测Cdc42基因在舌鳞癌及癌旁组织中的表达,分析Cdc42表达与舌鳞癌临床病理学参数的相关性及对预后的影响。将人舌鳞状细胞癌CAL27和SCC-4细胞随机分为3组,分别为Cdc42-siRNA组、阴性对照组和空白对照组。设计并构建针对人Cdc42基因序列的3条小干扰RNA(siRNA),应用脂质体介导转染方法分别将Cdc42-siRNA和NCsiRNA转染至Cdc42-siRNA组和阴性对照组,空白对照组仅加入转染试剂。通过实时荧光定量反转录PCR(qRTPCR)和蛋白免疫印迹法(Western blot)检测各组细胞Cdc42的mRNA及蛋白表达,将沉默效率最高的Cdc42-siRNA转染组作为后续实验组。Western blot检测EMT及MAPK JNK/p38通路相关蛋白的表达,CCK-8、细胞划痕实验和Transwell侵袭实验分别检测各组细胞的体外增殖、迁移和侵袭能力。采用SPSS 22.0软件包对数据进行统计学分析。结果:Cdc42在44例舌鳞癌患者中的阳性表达率为70.5%(31/44),在癌旁组织中的阳性率为38.6%(17/44),差异具有统计学意义(P<0.05)。Cdc42表达与不同颈淋巴结转移、临床分期、浸润深度相关(P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析显示,Cdc42阳性表达的舌鳞癌患者预后与阴性表达患者无显著差异(P>0.05)。体外实验中,Cdc42-siRNA组细胞Cdc42 mRNA和蛋白表达显著下降(P<0.05),EMT相关蛋白间叶标志物N-cadherin、Vimentin表达显著降低(P<0.05),MMP-9表达显著降低(P<0.05),而上皮标记物E-cadherin相对表达量显著增加(P<0.05);MAPK JNK/p38通路相关蛋白p38-MAPK和JNK蛋白相对表达量差异无统计学意义(P>0.05),而p-p38-MAPK、p-JNK蛋白表达水平显著下降(P<0.05),Cdc42-siRNA组细胞增殖、侵袭和迁移能力显著下降(P<0.05)。结论:舌鳞癌患者中Cdc42表达增加,并且其表达与颈淋巴结转移、临床分期及浸润深度相关。沉默Cdc42可能通过阻断MAPK JNK/p38通路抑制舌鳞癌细胞EMT过程,进而抑制侵袭迁移,同时可负向调节舌鳞癌细胞增殖。 展开更多
关键词 cdc42 舌鳞癌 增殖 侵袭 迁移 上皮-间质转化
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小分子RNA Cdc42 GTPase和微小RNA-363-5p在不同级别胶质细胞瘤中的分布规律 被引量:1
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作者 周浪浪 陈胜利 《中国医药》 2019年第3期374-377,共4页
目的探讨Cdc42 GTPase和微小RNA(miR NA)-363-5p在不同级别胶质细胞瘤中的分布规律。方法常规采集胶质细胞瘤患者术后肿瘤样本,多聚甲醛固定24 h后,用蔗糖溶液浸泡至沉底,冰冻切片后应用免疫组织化学方法检测Cdc42 GTPase的表达;其余样... 目的探讨Cdc42 GTPase和微小RNA(miR NA)-363-5p在不同级别胶质细胞瘤中的分布规律。方法常规采集胶质细胞瘤患者术后肿瘤样本,多聚甲醛固定24 h后,用蔗糖溶液浸泡至沉底,冰冻切片后应用免疫组织化学方法检测Cdc42 GTPase的表达;其余样品用液氮保存,实时荧光定量-聚合酶链反应检测Cdc42 GTPase和miR NA-363-5p在不同级别胶质细胞瘤中的表达情况。结果实时荧光定量-聚合酶链反应检测结果显示,随着肿瘤级别(肿瘤临床分期Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期)的增高,miR NA-363-5p表达量逐渐上调[(1.401±0.515)×10^(-6)、(1.665±0.686)×10^(-6)、(5.792±0.000)×10^(-6)、(8.383±2.858)×10^(-6)],而Cdc42GTPase表达量逐渐下调[(2.218±0.694)×10^(-2)、(2.004±0.236)×10^(-2)、(0.285±0.004)×10^(-2)、(0.071±0.007)×10^(-2)],两两比较差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论 miR NA-363-5p的靶基因可能是Cdc42GTPase,且随着miR NA-363-5p表达量的上调,Cdc42 GTPase表达量下调,胶质细胞瘤级别增高。 展开更多
关键词 神经胶质细胞瘤 cdc42 GTPASE 微小RNA-363-5p 细胞增殖 细胞凋亡
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Maternal miR-202-5p is required for zebrafish primordial germ cell migration by protecting small GTPase Cdc42 被引量:2
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作者 Yilin Jin Wei Liu +4 位作者 Yangxi Xiang Wanwan Zhang Hong Zhang Kuntong Jia Meisheng Yi 《Journal of Molecular Cell Biology》 SCIE CAS CSCD 2020年第7期530-542,共13页
In many lower animals,germ cell formation,migration,and maintenance depend on maternally provided determinants in germ plasm.In zebrafish,these processes have been extensively studied in terms of RNA-binding proteins ... In many lower animals,germ cell formation,migration,and maintenance depend on maternally provided determinants in germ plasm.In zebrafish,these processes have been extensively studied in terms of RNA-binding proteins and other coding genes.The role of small non-coding RNAs in the regulation of primordial germ cell(PGC)development remains largely unknown and poorly investigated,even though growing interests for the importance of miRNAs involved in a wide variety of biological processes.Here,we reported the role and mechanism of the germ plasm-specific miRNA miR-202-5p in PGC migration:(i)both maternal loss and knockdown of miR-202-5p impaired PGC migration indicated by the mislocalization and reduced number of PGCs;(ii)cdc42se1 was a direct target gene of miR-202-5p,and overexpression of Cdc42se1 in PGCs caused PGC migration defects similar to those observed in loss of miR-202-5p mutants;(iii)Cdc42se1 not only interacted with Cdc42 but also inhibited cdc42 transcription,and overexpression of Cdc42 could rescue PGC migration defects in Cdc42se1 overexpressed embryos.Thus,miR-202-5p regulates PGC migration by directly targeting and repressing Cdc42se1 to protect the expression of Cdc42,which interacts with actin to direct PGC migration. 展开更多
关键词 primordial germ cell miR-202-5p cdc42se1 cdc42 MIGRATION
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丹参酮ⅡA对嘌呤霉素诱导肾足细胞损伤的保护作用 被引量:11
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作者 贺良平 熊国良 曾又佳 《中国中西医结合肾病杂志》 2016年第3期221-223,I0005,I0006,共5页
目的:探讨丹参酮ⅡA对嘌呤霉素诱导肾足细胞骨架蛋白F-actin、synaptopodin损伤的作用及其可能的作用机制。方法:条件永生性人肾足细胞株AB8/13随机分为对照(control)组、嘌呤霉素氨基核苷(puromycin aminonucleoside,PAN)组、不同剂量(... 目的:探讨丹参酮ⅡA对嘌呤霉素诱导肾足细胞骨架蛋白F-actin、synaptopodin损伤的作用及其可能的作用机制。方法:条件永生性人肾足细胞株AB8/13随机分为对照(control)组、嘌呤霉素氨基核苷(puromycin aminonucleoside,PAN)组、不同剂量(10,20,40,80μmol)丹参酮ⅡA干预(tanshinoneⅡA,TⅡA)组。采用细胞免疫荧光法检测各组细胞骨架蛋白F-actin、synaptopodin在足细胞内的分布及形态;通过DAPI染色法观察各组细胞核的变化;免疫印迹法检测各组细胞p-Rac1/Cdc42蛋白的表达量。结果:(1)F-actin、synaptopodin细胞免疫荧光染色:较control组,PAN组F-actin、synaptopodin结构紊乱,胞质回缩,细胞边缘褶皱,凋亡小体增多。各浓度TⅡA组上述情况较PAN组显著改善。(2)p-Rac1/Cdc42蛋白表达量,与对照组相比,PAN组p-Rac1/Cdc42蛋白表达量显著上调。与PAN组相比,TⅡA组p-Rac1/Cdc42蛋白表达量显著下调,且呈浓度依赖方式。结论:TⅡA可改善PAN诱导的足细胞骨架蛋白F-actin、synaptopodin的重排及结构紊乱,对足细胞具有一定保护作用,其机制可能与下调Rac1/Cdc42磷酸化水平,减少足细胞丝状伪足、层状伪足形成,从而稳定PAN诱导的细胞骨架变构有关。 展开更多
关键词 丹参酮ⅡA 肾足细胞 嘌呤霉素 骨架蛋白 p - RAC1 /cdc42
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细胞内Ca^2+在轮状病毒感染对Caco-2细胞NHE3蛋白调控中的作用 被引量:2
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作者 王鹏 牛美兰 +4 位作者 陈长英 李玲 范媛媛 王世广 孙艺文 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期94-99,共6页
目的研究轮状病毒(rotavirus,RV)感染对Caco-2细胞表面钠-氢(Na^+-H^+)交换蛋白3(NHE3)水平和生物活性的影响及其调控机制。方法构建表达NHE3的Caco-2细胞模型,分为对照组(CTL组)、RV组、细胞内Ca^2+络合剂BAPTA-AM组和BAPTA-AM+RV组,用... 目的研究轮状病毒(rotavirus,RV)感染对Caco-2细胞表面钠-氢(Na^+-H^+)交换蛋白3(NHE3)水平和生物活性的影响及其调控机制。方法构建表达NHE3的Caco-2细胞模型,分为对照组(CTL组)、RV组、细胞内Ca^2+络合剂BAPTA-AM组和BAPTA-AM+RV组,用BCECF-AM法和细胞表面NHE3生物素化法测定Na^+-H^+交换蛋白活性和细胞表面NHE3蛋白水平,Western blot测定细胞Cdc42蛋白水平。结果与CTL组相比,RV感染可引起细胞Na^+-H^+交换蛋白活性以及细胞表面NHE3蛋白水平明显降低,此抑制作用可被BAPTA-AM拮抗,此外RV感染可引起Cdc42蛋白水平升高,这一作用也可被BATPA-AM拮抗。结论RV感染对NHE3蛋白水平及生物活性的调控可能与细胞内Ca^2+介导的Cdc42依赖性内吞途径有关。 展开更多
关键词 轮状病毒 -氢交换蛋白3 内吞途径 细胞内CA^2+ cdc42蛋白 CACO-2细胞
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