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小麦抗白粉病基因pm42的EST连锁图谱构建和比较基因组学分析 被引量:10
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作者 刘子记 朱婕 +3 位作者 华为 杨作民 孙其信 刘志勇 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1569-1576,共8页
目的基因精细遗传连锁图谱的构建是图位克隆的基础,小麦功能基因精细遗传连锁图谱的构建依赖于比较基因组学分析。水稻和短柄草(Brachypodium distachyon)基因组序列是小麦比较基因组学分析和功能基因精细遗传定位的重要工具。本研究利... 目的基因精细遗传连锁图谱的构建是图位克隆的基础,小麦功能基因精细遗传连锁图谱的构建依赖于比较基因组学分析。水稻和短柄草(Brachypodium distachyon)基因组序列是小麦比较基因组学分析和功能基因精细遗传定位的重要工具。本研究利用小麦、短柄草和水稻的基因组共线性关系对小麦抗白粉病基因pm42进行比较基因组学分析,明确了pm42基因所在2BS基因组区域与短柄草第1染色体和水稻第3染色体直系同源基因组区域的对应关系,开发出与抗白粉病基因pm42连锁的EST-SSCP(expressed sequence tag-single strand conformation polymorphism)标记CD452782和BF201235,以及EST-STS(expressed sequence tag-sequence tagged site)标记CJ674042、EB513371和CV771633,构建了pm42基因EST标记遗传连锁图谱,CJ674042、BF201235、CD452782和CV771633位于pm42近端粒侧,距离pm42的遗传距离分别为1.9、12.0、19.7和25.7cM;EB513371位于pm42近着丝粒侧,与pm42的遗传距离为14.6cM。整合原有的作图数据,构建了pm42基因的高密度比较基因组学遗传连锁图谱,pm42被定位于3.3cM的区间,该区间对应于短柄草66kb的基因组区域及水稻69kb的基因组区域。该结果为抗白粉病基因pm42高密度精细遗传连锁图谱构建、分子辅助选择和基因聚合奠定了基础。 展开更多
关键词 小麦抗白粉病基因 pm42 比较基因组学 二穗短柄草 共线性 est-sts EST-SSCP
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基于EST-PCR的簇毛麦染色体特异分子标记筛选及应用 被引量:9
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作者 曹亚萍 曹爱忠 +1 位作者 王秀娥 陈佩度 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期1-10,共10页
为定位、转移和利用簇毛麦有益基因,通过花粉辐射,获得一批包括小麦-簇毛麦易位染色体的异染色体系。为了鉴定这批材料中的簇毛麦染色体身份,根据水稻、小麦的EST序列合成了240对STS引物,其中34对引物在普通小麦中国春与簇毛麦间存在多... 为定位、转移和利用簇毛麦有益基因,通过花粉辐射,获得一批包括小麦-簇毛麦易位染色体的异染色体系。为了鉴定这批材料中的簇毛麦染色体身份,根据水稻、小麦的EST序列合成了240对STS引物,其中34对引物在普通小麦中国春与簇毛麦间存在多态性;进一步对亲本及簇毛麦二体异附加系进行PCR扩增分析,标记CINAU32-300可追踪簇毛麦1V染色体,标记CINAU33-280、CINAU34-510、CINAU35-1100、CINAU36-380和CINAU37-400可追踪簇毛麦2V染色体,标记CINAU38-250可追踪簇毛麦3V染色体,标记CINAU39-950和CINAU40-800可追踪簇毛麦4V染色体,标记CINAU41-745和CINAU42-1050可追踪簇毛麦5V染色体,标记CINAU44-765和CINAU45-495可追踪簇毛麦7V染色体。加上本室已开发的2个6V染色体特异标记,用这些簇毛麦特异分子标记鉴定辐射诱导材料的部分回交后代,选育出小麦背景中只包含单条簇毛麦染色体的整套1V至7V染色体系,同时有18条易位染色体的簇毛麦身份得到确定,表明这些标记可以用来快速检测普通小麦背景中的簇毛麦染色体或染色体片段。 展开更多
关键词 小麦 簇毛麦 est-sts标记 小麦-簇毛麦异染色体系 小麦-簇毛麦易位染色体
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小麦-滨麦2D/2Ns异代换系DM2411的分子细胞遗传学鉴定 被引量:3
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作者 刘洋 赵继新 +7 位作者 谈宏斌 王秀娟 李家创 梁邦平 刁慧珊 白宇皓 武军 陈新宏 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期571-577,共7页
为进一步挖掘利用滨麦优异基因,并丰富小麦遗传种质资源,利用形态学、细胞遗传学、基因组原位杂交(Genomic in situ hybridization,GISH)、EST-STS分子标记、SSR分子标记等技术,对从八倍体小滨麦M842-16和硬粒小麦D4286杂交F_7代材料中... 为进一步挖掘利用滨麦优异基因,并丰富小麦遗传种质资源,利用形态学、细胞遗传学、基因组原位杂交(Genomic in situ hybridization,GISH)、EST-STS分子标记、SSR分子标记等技术,对从八倍体小滨麦M842-16和硬粒小麦D4286杂交F_7代材料中筛选出的1个遗传稳定的小滨麦异代换系DM2411进行了鉴定。细胞遗传学观察表明,DM2411的染色体主要构型为2n=42=21Ⅱ,遗传稳定。根尖体细胞和花粉母细胞的原位杂交研究表明,DM2411含有1对滨麦Ns基因组。SSR分析表明,DM2411可能缺失了小麦2D染色体。EST分析表明,DM2411可能含有滨麦2Ns染色体。形态学调查表明,DM2411的株高极显著降低。 展开更多
关键词 小麦 滨麦 代换系 GISH est-sts SSR
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普通小麦-华山新麦草1Ns二体异附加系的分子细胞遗传学研究 被引量:2
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作者 韩颜超 王长有 +2 位作者 陈春环 田增荣 吉万全 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1044-1049,共6页
为给后续研究和利用普通小麦-华山新麦草衍生后代H1-1-3-1-9-8提供依据,用形态学、细胞学及分子生物学方法对该材料进行分析研究。结果表明,H1-1-3-1-9-8在株高、穗长、穗型等性状上与华山新麦草无显著差异,千粒重平均44.2 g,较亲本显... 为给后续研究和利用普通小麦-华山新麦草衍生后代H1-1-3-1-9-8提供依据,用形态学、细胞学及分子生物学方法对该材料进行分析研究。结果表明,H1-1-3-1-9-8在株高、穗长、穗型等性状上与华山新麦草无显著差异,千粒重平均44.2 g,较亲本显著增加;H1-1-3-1-9-8的染色体构型为2n=44=22Ⅱ;经原位杂交鉴定,H1-1-3-1-9-8存在两条华山新麦草外源信号,且能够配对;选取普通小麦7个部分同源群上的64对EST-STS引物对H1-1-3-1-9-8进行分析,第一部分同源群上的BE443796、BE446010、BE497584、BF202643、BG262410、BG607965和BM140362七对引物扩增出了华山新麦草的特异条带;经种子贮藏蛋白变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,H1-1-3-1-9-8具有华山新麦草特有的高分子量谷蛋白亚基。以上结果说明,H1-1-3-1-9-8是普通小麦-华山新麦草1Ns二体异附加系。 展开更多
关键词 华山新麦草 异附加系 est-sts标记 原位杂交 SDS-PAGE
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Molecular Cytogenetic Characterization of a Wheat-Leymus mollis 3D(3Ns) Substitution Line with Resistance to Leaf Rust 被引量:6
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作者 Yuhui Pang Xinhong Chen +7 位作者 Jixin Zhao Wanli Du Xueni Cheng Jun Wu Yanli Li Liangming Wang Jing Wang Qunhui Yang 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2014年第4期205-214,共10页
Leymus mollis (Trin.) Pilger (NsNsXmXm, 2n = 28), a wild relative of common wheat, possesses many potentially valuable traits that could be transferred to common wheat during breeding programs. In this study, the ... Leymus mollis (Trin.) Pilger (NsNsXmXm, 2n = 28), a wild relative of common wheat, possesses many potentially valuable traits that could be transferred to common wheat during breeding programs. In this study, the karyotypic constitution of a wheat - L. mollis 3D(3Ns#1) disomic substitution line isolated from the F5 progeny of octoploid Tritileymus M842-16 x Triticum durum cv. D4286, which was designated as 10DM57, was determined using genomic in situ hybridization (GISH), fluorescent in situ hybridization (FISH), SSR markers, and EST- STS markers. Screening of mitosis and meiosis showed that 10DM57 had a chromosome karyotype of 2n = 42 =21Ⅱ. GISH indicated that 10DM57 was a line with 40 chromosomes from wheat and two of the Ns chromosomes from L. mollis, which formed a ring bivalent in pollen mother cells at metaphase I. FISH analysis showed that the chromosome 3D may be replaced by 3Ns#1 in 10DM57. DNA markers, including SSR and EST-STS primers, showed that the pair of wheat chromosome 3D in 10DM57 was substituted by the pair of chromosome 3Ns#t from L. mollis. Evaluation of the agronomic traits showed that, compared with its common wheat relative 7182, 10DM57 was resistant to leaf rust while the spike length and number of spikes per plant were improved significantly, which correlated with a higher wheat yield. The new germplasm, 10DM57, could be exploited as an intermediate material in wheat genetic and breeding programs. 展开更多
关键词 Alien substitution line est-sts FISH GISH Leymus mollis SSR WHEAT
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