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ETS1基因与中国北方汉族人群系统性红斑狼疮的相关性研究
被引量:
5
1
作者
郭小凡
单珊
+6 位作者
党洁
邱熔芳
赵海玲
辛倩
刘永超
李江夏
刘奇迹
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期477-480,共4页
目的验证ETSl基因在北方汉族人群系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)发生中的作用。方法应用病例一对照关联研究,在山东汉族人群中收集231例SLE患者和474名正常对照,采用Taqman探针对ETS1基因31非翻译区区域单核苷...
目的验证ETSl基因在北方汉族人群系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)发生中的作用。方法应用病例一对照关联研究,在山东汉族人群中收集231例SLE患者和474名正常对照,采用Taqman探针对ETS1基因31非翻译区区域单核苷酸多态位点rsll28334与r84937333进行基因分型,并对数据进行统计学计算和单倍型分析。结果rsll28334等位基因A在病例组中的频率显著高于对照组(42.8%VS.29.1%,OR=1.824,95%CI:1.445-2.302,P〈0.01),rs4937333等位基因T在病例组中的频率显著高于对照组,差异具有统计学意义(47.6%VS.38.1%,OR=1.478,95%CI:1.181-1.851,P〈0.01)。两位点的单倍型分析显示单倍型A-T与SLE的发病风险显著相关(P〈0.05,OR=0.738,95%CI:0.564-0.964),而单倍型GC可以显著降低SLE的发病风险(P〈0.01,OR=0.296,95%CI:0.232-0.378)。结论ET51基因rsll28334和rs4937333位点与北方汉族人群系统性红斑狼疮相关。
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关键词
系统性红斑狼疮
ets1
基因
单核苷酸多态性
关联分析
单倍型
原文传递
再生障碍性贫血患者外周血单核细胞microRNA的差异表达及生物信息学分析
被引量:
12
2
作者
李峻
陈劼
+3 位作者
刘月皎
孙雪梅
朱学军
Shouguo Gao
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2018年第5期661-666,共6页
目的探讨不同分型的再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)患者外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMNC)microRNA(miRNA)的差异表达情况。方法采用miRNA表达谱芯片筛查患者PBMNCmiRNA的差异表达谱,用实时定量PC...
目的探讨不同分型的再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)患者外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMNC)microRNA(miRNA)的差异表达情况。方法采用miRNA表达谱芯片筛查患者PBMNCmiRNA的差异表达谱,用实时定量PCR对差异表达的miRNA进行验证,对候选miRNA进行生物信息学分析。结果与正常对照相比,重型再生障碍性贫血(severe aplastic anemia,SAA)患者表达上调的miRNAs有6个,表达下调的miRNAs有10个;慢性非重型再生障碍性贫血(chronic aplastic anemia,CAA)患者表达上调的miRNAs有24个,表达下调的miRNAs有12个。SAA与CAA相比,表达上调的miRNAs有4个,表达下调的miRNAs有11个。与正常对照相比,sAA、CAA均表达上调的miRNAs有3个,均表达下调的miRNAs有4个。实时定量PCR检测提示,与正常对照相比,CAA、SAA患者miR-155-5p、miR-1260b表达均升高(P〈0.01),CAA患者miR-155-5p、miR-1260b表达均高于SAA患者(P〈0.01)。生物信息学分析提示,miR-155-5p、miR-1260b作用靶基因可参与调控细胞代谢、基因表达转录等生物过程及TNF信号通路、B细胞受体信号通路、FcγR-介导吞噬等信号通路过程。结论CAA和SAA患者具有特征性的miRNA差异表达谱,其中miRNA-155-5p和miRNA-1260b均表达上调。两者具有共同的靶基因ETS1,因此可能存在协同作用,通过抑制ETS1的表达,进而促进Th17的分化,在再生障碍性贫血的发病中具有重要的作用。
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关键词
再生障碍性贫血
miRNA-155-5p
miRNA-1260b
ets1
基因
生物信息学
原文传递
题名
ETS1基因与中国北方汉族人群系统性红斑狼疮的相关性研究
被引量:
5
1
作者
郭小凡
单珊
党洁
邱熔芳
赵海玲
辛倩
刘永超
李江夏
刘奇迹
机构
山东大学实验畸形学教育部重点实验室
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第4期477-480,共4页
基金
国家自然科学基金(81072451,81273281)
教育部博士点基金(20100131110035)
文摘
目的验证ETSl基因在北方汉族人群系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)发生中的作用。方法应用病例一对照关联研究,在山东汉族人群中收集231例SLE患者和474名正常对照,采用Taqman探针对ETS1基因31非翻译区区域单核苷酸多态位点rsll28334与r84937333进行基因分型,并对数据进行统计学计算和单倍型分析。结果rsll28334等位基因A在病例组中的频率显著高于对照组(42.8%VS.29.1%,OR=1.824,95%CI:1.445-2.302,P〈0.01),rs4937333等位基因T在病例组中的频率显著高于对照组,差异具有统计学意义(47.6%VS.38.1%,OR=1.478,95%CI:1.181-1.851,P〈0.01)。两位点的单倍型分析显示单倍型A-T与SLE的发病风险显著相关(P〈0.05,OR=0.738,95%CI:0.564-0.964),而单倍型GC可以显著降低SLE的发病风险(P〈0.01,OR=0.296,95%CI:0.232-0.378)。结论ET51基因rsll28334和rs4937333位点与北方汉族人群系统性红斑狼疮相关。
关键词
系统性红斑狼疮
ets1
基因
单核苷酸多态性
关联分析
单倍型
Keywords
Systemic lupus erythematosus
ets1 gene
Single nucleotide polymorphisms
Association study
Hyplotype
分类号
R593.241 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
再生障碍性贫血患者外周血单核细胞microRNA的差异表达及生物信息学分析
被引量:
12
2
作者
李峻
陈劼
刘月皎
孙雪梅
朱学军
Shouguo Gao
机构
南京中医药大学附属医院(江苏省中医院)血液科
南京中医药大学附属医院(江苏省中医院)病理科
南京中医药大学附属医院(江苏省中医院)检验科
National Heart
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2018年第5期661-666,共6页
基金
江苏省自然科学基金(BK20131034)
江苏省政府留学奖学金资助项目(苏教外[2015]44号)
+1 种基金
江苏省卫生国际(地区)交流支撑计划青年医师自选项目(苏卫国合[2016]155号)
江苏省中医药局科技项目(YB201812)
文摘
目的探讨不同分型的再生障碍性贫血(aplastic anemia,AA)患者外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMNC)microRNA(miRNA)的差异表达情况。方法采用miRNA表达谱芯片筛查患者PBMNCmiRNA的差异表达谱,用实时定量PCR对差异表达的miRNA进行验证,对候选miRNA进行生物信息学分析。结果与正常对照相比,重型再生障碍性贫血(severe aplastic anemia,SAA)患者表达上调的miRNAs有6个,表达下调的miRNAs有10个;慢性非重型再生障碍性贫血(chronic aplastic anemia,CAA)患者表达上调的miRNAs有24个,表达下调的miRNAs有12个。SAA与CAA相比,表达上调的miRNAs有4个,表达下调的miRNAs有11个。与正常对照相比,sAA、CAA均表达上调的miRNAs有3个,均表达下调的miRNAs有4个。实时定量PCR检测提示,与正常对照相比,CAA、SAA患者miR-155-5p、miR-1260b表达均升高(P〈0.01),CAA患者miR-155-5p、miR-1260b表达均高于SAA患者(P〈0.01)。生物信息学分析提示,miR-155-5p、miR-1260b作用靶基因可参与调控细胞代谢、基因表达转录等生物过程及TNF信号通路、B细胞受体信号通路、FcγR-介导吞噬等信号通路过程。结论CAA和SAA患者具有特征性的miRNA差异表达谱,其中miRNA-155-5p和miRNA-1260b均表达上调。两者具有共同的靶基因ETS1,因此可能存在协同作用,通过抑制ETS1的表达,进而促进Th17的分化,在再生障碍性贫血的发病中具有重要的作用。
关键词
再生障碍性贫血
miRNA-155-5p
miRNA-1260b
ets1
基因
生物信息学
Keywords
Aplastic anemia
miRNA-155-5p
miRNA-1260b
ets1 gene
Bioinformatics
分类号
R556.5 [医药卫生—血液循环系统疾病]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ETS1基因与中国北方汉族人群系统性红斑狼疮的相关性研究
郭小凡
单珊
党洁
邱熔芳
赵海玲
辛倩
刘永超
李江夏
刘奇迹
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
5
原文传递
2
再生障碍性贫血患者外周血单核细胞microRNA的差异表达及生物信息学分析
李峻
陈劼
刘月皎
孙雪梅
朱学军
Shouguo Gao
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
2018
12
原文传递
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