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肠道病毒ECHO25河南分离株基因特征分析 被引量:4
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作者 晁灵 黄学勇 +1 位作者 李幸乐 许汴利 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期443-446,共4页
首次对ECHO25病毒进行分子生物学分析,阐明ECHO25(Entric Cytopathic Human Orphanviruses Type25)病毒河南分离株的分子生物学特征及其与世界其它分离株的基因关系。逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP1蛋白编码基因并进行序列测定,... 首次对ECHO25病毒进行分子生物学分析,阐明ECHO25(Entric Cytopathic Human Orphanviruses Type25)病毒河南分离株的分子生物学特征及其与世界其它分离株的基因关系。逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP1蛋白编码基因并进行序列测定,将所测4株ECHO25病毒的VP1序列与GenBank上已发表的ECH-O25病毒VP1区进行同源性比较及遗传进化分析发现:河南省4株ECHO25与标准株JV-4核苷酸同源性为79.2%~80.1%,氨基酸同源性为89.0%~92.4%;河南省4株ECHO25核苷酸同源性为93.0%~99.0%,氨基酸同源性为92.4%~97.5%;HN-01分离株与HN-26分离株高度同源,其核苷酸同源性达99.0%;河南省4株ECHO25同属B1基因亚型。 展开更多
关键词 echo25 基因 序列分析 系统发生树
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引起病毒性脑炎Echo25型肠道病毒龙岩分离株基因特征分析 被引量:1
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作者 张彦锋 曹春远 +5 位作者 何春荣 罗招福 何云 廖亦红 吴水新 陈前进 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期328-332,共5页
目的对从龙岩市病毒性脑炎患者脑脊液(CSF)标本中分离的Echo25型VP1区序列进行分析。方法收集龙岩市某医院2012年诊断为病毒性脑炎或中枢神经系统感染的住院病例CSF标本进行肠道病毒(EV)的分离鉴定,4株经血清中和鉴定为Echo25型EV... 目的对从龙岩市病毒性脑炎患者脑脊液(CSF)标本中分离的Echo25型VP1区序列进行分析。方法收集龙岩市某医院2012年诊断为病毒性脑炎或中枢神经系统感染的住院病例CSF标本进行肠道病毒(EV)的分离鉴定,4株经血清中和鉴定为Echo25型EV,测定4株分离株的VP1编码区序列,与GenBank上已发表的Echo25型病毒VP1区进行同源性比较及遗传进化分析。结果4株龙岩分离株VP1区片段核苷酸序列长度为498 bp,编码166个氨基酸。同源性分析的结果显示,4株龙岩分离株中的3株VP1区核苷酸相似性为100%,另一株与其他3株相似性为97%。与2010年的北京分离株KJ957190和2008年的河南分离株HM031189相似性较高。遗传进化分析显示,4株Echo25毒株均为B1基因亚型。结论Echo25是2012年龙岩市病毒性脑炎病原之一,且出现了不同传播链,提示应加强EV的监测,及时掌握Echo25病毒的遗传变异情况,为相关疾病的防控提供科学依据。 展开更多
关键词 肠道病毒 echo25型病毒 病毒性脑炎 VP1 基因特征
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