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Molecular Epidemiological Analysis of Group A Streptococci Isolated from Children in Chaoyang District of Beijing, 2011:emm Types, Virulence Factor Genes and Erythromycin Resistant Genes 被引量:3
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作者 WANG Hai Bin SONG Yan Yan +4 位作者 YOU Yuan Hai WANG Heng Wei HAN Qin Hua ZHAO Jian Hong ZHANG Xiao Xi 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2013年第9期782-784,共3页
Group A streptococcus (GAS) causes a wide range of diseases in the human population. GAS diseases are more common in children than in adults, with clinical manifestations ranging from pharyngitis and impetigo to inv... Group A streptococcus (GAS) causes a wide range of diseases in the human population. GAS diseases are more common in children than in adults, with clinical manifestations ranging from pharyngitis and impetigo to invasive infections and post streptococcal sequelae, such as acute rheumatic fever and acute post-streptococcal glomerulonephritis[1]. GAS harbors a host of virulence factors that contribute to its complex pathogenicity and differences in the disease severity and frequency. M protein, one of the major virulence factors, is encoded by the emm gene induces a type of specific host immune response and confers antiphagocytic properties. 展开更多
关键词 Virulence Factor Genes and Erythromycin Resistant Genes emm types Molecular Epidemiological Analysis of Group A Streptococci Isolated from Children in Chaoyang District of Beijing GAS
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猩红热患儿A族链球菌emm基因分型及地域与毒力基因分布相关研究 被引量:5
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作者 禹定乐 梁云梅 +5 位作者 卢清华 马耀玲 沈叙庄 王传清 郑跃杰 杨永弘 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期55-61,共7页
目的探讨猩红热儿童分离来源的A族链球菌(GAS)emm分型、地域与毒力基因分布的相关性。方法采集北京和上海地区猩红热患儿标本进行GAS分离鉴定,应用聚合酶链式反应(PCR)方法检测emm基因型以及13种毒力基因(speA、speB、speC、speF、speG... 目的探讨猩红热儿童分离来源的A族链球菌(GAS)emm分型、地域与毒力基因分布的相关性。方法采集北京和上海地区猩红热患儿标本进行GAS分离鉴定,应用聚合酶链式反应(PCR)方法检测emm基因型以及13种毒力基因(speA、speB、speC、speF、speG、speH、speI、speJ、speK、speL、speM、ssa和smeZ)携带情况,分析GAS菌株毒力基因分布与地域、emm基因型的关系。结果114株GAS分离株中,emm1.0型60株,emm12.0型54株;52株分离自北京(emm1.0型31株,emm12.0型21株),62株分离自上海(emm1.0型29株,emm12.0型33株)。speA、speC、speG、speH、speI、speJ、speK、ssa和smeZ基因携带率分别为52.6%、76.3%、80.7%、43.9%、55.3%、57.0%、75.4%、97.4%、93.0%,speB和speF携带率均为98.2%,未检出speL、speM基因。北京地区emm1.0型与emm12.0 GAS菌株speA、speH、speI和speJ基因携带率比较,上海地区emm1.0型与emm12.0 GAS菌株speA、speH、speI、speJ和speK基因携带率比较,差异均有统计学意义(均P<0.05)。emm1.0型GAS菌株speC、speH、speJ和speK基因携带率北京与上海两地区比较,差异均有统计学意义(均P<0.05),emm12.0型GAS菌株speC、speH、speI、speJ和speK基因北京与上海两地区比较,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论GAS菌株毒力基因的分布状态因emm基因分型及地域不同存在差异。 展开更多
关键词 猩红热 A族链球菌 emm基因分型 地域 超抗原
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广州市儿童致咽炎β溶血性链球菌的流行情况及其emm基因分型 被引量:8
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作者 丁月霞 倪琼琼 刘金来 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期411-414,共4页
【目的】了解近期广州市儿童致咽炎β溶血性链球菌(BHS)的流行情况及其emm基因分型。【方法】对我院儿科门急诊1190例急性咽扁桃体炎的患儿进行咽拭子培养。鉴定为BHS者包括A、B、C和G组溶血性链球菌(groupA、B、C、Gstreptococcal,GAS... 【目的】了解近期广州市儿童致咽炎β溶血性链球菌(BHS)的流行情况及其emm基因分型。【方法】对我院儿科门急诊1190例急性咽扁桃体炎的患儿进行咽拭子培养。鉴定为BHS者包括A、B、C和G组溶血性链球菌(groupA、B、C、Gstreptococcal,GAS、GBS、GCS和GGS)进行细菌组DNA的提取;通过PCR扩增emm基因并测序;其结果与NCBI和CDCHome中已知的基因序列进行同源性比对大于95%则认为是同型菌株,藉此确定其分型。【结果】在1190例符合条件的患儿咽拭子标本中[男:678例,(6.96±2.73)岁;女:512例,(6.70±2.60)岁],鉴定为BHS的共有46例(3.87%)。其中GAS、GBS、GCS和GGS分别有4例、20例、2例和20例,分别占BHS约8.7%、43.5%、4.3%和43.5%;而GAS、GBS、GCS和GGS的阳性率分别约为0.37%、1.68%、0.17%和1.68%。男患儿BHS的阳性率约为5.01%,女患儿约为2.34%,两组比较(χ2=26.431,P<0.001)有统计学意义。除了GBS外,其他BHS(GAS、GC/GS)均有emm基因表达(1000~1500bp)。经测序共有15型emm,其中4株GAS分别表达emm1和emm12(7.69%)。【结论】致咽炎GAS阳性率低于0.5%,而GBS、GGS阳性率接近2%。但GBS无emm表达,GAS表达emm1和emm12,而GCS、GGS无明确的emm优势型。 展开更多
关键词 Β溶血性链球菌 急性咽扁桃体炎 emm基因
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重庆地区扁桃体炎患儿GAS分离株emm分型、红霉素耐药基因与超抗原基因关系研究 被引量:4
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作者 黎敏 罗征秀 +1 位作者 何国琴 符州 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期408-412,共5页
目的:分析重庆地区扁桃体炎患儿A族链球菌(Group A streptococcus,GAS)分离株emm分型、红霉素耐药基因和超抗原基因相关性。方法:收集2007年重庆地区扁桃体炎患儿GAS分离株44株。对44株菌株进行emm分型,红霉素耐药基因ermB、ermTR和mef... 目的:分析重庆地区扁桃体炎患儿A族链球菌(Group A streptococcus,GAS)分离株emm分型、红霉素耐药基因和超抗原基因相关性。方法:收集2007年重庆地区扁桃体炎患儿GAS分离株44株。对44株菌株进行emm分型,红霉素耐药基因ermB、ermTR和mefA以及8种超抗原基因(ssa、SMEZ、speA、speC、speG、speH、speI、speJ)检测。结果:儿童扁桃体炎GAS分离株emm分型以emm12最多见,共26株(占59.1%);其次为emm1,共7株(占15.9%);少见的emm型为emm22有2株,emm6有2株,emm3有2株,emm80、emm63、emm102、stG485和st1815分别各有1株。44株GAS菌株均检出耐药基因ermB(100%),33株检出耐药基因ermTR(75.0%),3株检出耐药基因mefA(6.8%)。44株菌株均检出ssa、SMEZ和speH超抗原基因,其余5种超抗原基因检出率依次为speG37株(84.1%),speC36株(81.8%),speI28株(63.6%),speA22株(50%),speJ7株(15.9%)。7株emm1菌株有6株检出speA基因(占85.7%),26株emm12菌株有7株检出speA基因(占26.9%),speA基因分布在emm1、emm12分布中的差异具有统计学意义(P=0.008,<0.05);耐药基因ermB、ermTR和mefA在不同的emm型中分布是随机的,emm分型和耐药基因之间未发现明显相关性。结论:重庆地区儿童扁桃体炎GAS分离株emm分型以emm12和emm1为主;对红霉素的耐药机制以ermB编码为主的23SrRNA甲基化酶致靶位改变为主;emm型与大环内酯类抗生素耐药基因分布无明显相关性;speA超抗原基因分布主要与emm1相关。 展开更多
关键词 A族链球菌 红霉素 超抗原 emm分型
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上海成人和儿童患者分离的A群链球菌分子流行病学分析 被引量:5
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作者 蒋浩琴 陈明亮 +4 位作者 李天铭 朱元军 刘红 曾玫 李敏 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期222-229,共8页
目的研究和比较上海成人和儿童患者分离的A群链球菌(GAS)耐药、克隆分型、emm分型、生物膜形成及毒力因子携带等分子特征,为感染控制及治疗提供临床流行病学信息。方法 39株成人(13株)和儿童(26株)患者分离的GAS,用K-B纸片法测定对9种... 目的研究和比较上海成人和儿童患者分离的A群链球菌(GAS)耐药、克隆分型、emm分型、生物膜形成及毒力因子携带等分子特征,为感染控制及治疗提供临床流行病学信息。方法 39株成人(13株)和儿童(26株)患者分离的GAS,用K-B纸片法测定对9种常用抗菌药物的敏感性;采用多位点序列分型(MLST)方法进行克隆分型;采用编码M蛋白的emm基因序列分析进行基因分型;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法分析不同emm型菌株的基因组特征;采用半定量生物膜形成试验分析其生物膜形成。聚合酶链反应(PCR)方法检测20个包括超抗原在内的GAS主要毒力基因。结果 39株GAS主要基因型为emm12-ST36(64.1%),emm1-ST28(17.9%);成人和儿童均以emm12-ST36为主。儿童菌株对红霉素和克林霉素的耐药率显著高于成人(P=0.008 7)。相同emm分型-克隆分型菌株在PFGE脉冲场带型中呈现高度聚集。生物膜形成与emm1型菌株明显相关(P=0.005),与红霉素和克林霉素耐药密切相关(P=0.000 3),儿童菌株的生物膜形成强于成人菌株(P<0.000 1)。毒力基因speG、speB、sdaB、Mac全部阳性;speA、speJ、spd3与emm1型菌株有明显相关(分别为P<0.000 1、P=0.005 5、P<0.000 1);speI、sic与emm12型菌株有明显相关(均为P<0.000 1);speH、ssa在emm12和emm1型菌株中有明显分布差异(分别为P=0.036 4、P=0.025 8);20个毒力基因在成人和儿童emm12型菌株中均没有明显分布差异(均为P>0.05)。结论 emm分型与克隆分型、PFGE、毒力基因有很好相关性。成人和儿童菌株在耐药情况、生物膜形成中均存在差异。特定emm型菌株与抗生素耐药和致病力密切相关,为感染控制提供依据。重要毒力基因将是未来研制新型疫苗降低GAS感染的新型靶标。 展开更多
关键词 A群链球菌 药敏试验 多位点序列分型 emm分型 脉冲场凝胶电泳 生物膜 毒力基因
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24株停乳链球菌似马亚种的分子鉴定和基因分型 被引量:3
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作者 何放晴 李曲文 +1 位作者 张志珊 邓艳琴 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期607-613,共7页
目的探讨停乳链球菌似马亚种(Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis,SDSE)感染的临床分布特点及分子特征。方法收集SDSE感染患者的临床资料及相应分离菌株,分离株经全自动微生物分析系统、基质辅助激光解析电离飞行时间... 目的探讨停乳链球菌似马亚种(Streptococcus dysgalactiae subspecies equisimilis,SDSE)感染的临床分布特点及分子特征。方法收集SDSE感染患者的临床资料及相应分离菌株,分离株经全自动微生物分析系统、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)及PCR扩增16S rRNA和链激酶前体基因等3种方法进行鉴定。对SDSE菌株进行M蛋白基因(emm)分型和多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST),并通过BioNumerics 6.6软件进行聚类分析。结果24株停乳链球菌似马亚种主要分离自咽拭子、皮肤、血液,分别占58.33%、20.83%、8.33%;24株SDSE被分为5种emm类型,以stCNSRT2.0(n=16,66.7%)占优势,其次是stG840.0(n=3,12.5%)。通过MLST分型,共有6种ST型别,以ST44(n=17,70.8%)为主,ST605为新定义的ST型。结论本研究中SDSE分离株具有分子多样性,ST605为首次报告的MLST型别。 展开更多
关键词 停乳链球菌似马亚种 M蛋白基因分型 多位点序列分型
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Investigation of <i>Streptococcus pyogenes</i>Carriage in Population Vulnerable to Scarlet Fever during 2015-2017 in Shanghai, China
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作者 Mingliang Chen Chi Zhang +3 位作者 Dechuan Kong Hao Pan Xi Zhang Min Chen 《Journal of Biosciences and Medicines》 2018年第11期89-97,共9页
This study aimed to investigate the carriage of Streptococcus pyogenes in population vulnerable to scarlet fever and to compare their genotypic characterization between different age groups. Pharyngeal swabs were coll... This study aimed to investigate the carriage of Streptococcus pyogenes in population vulnerable to scarlet fever and to compare their genotypic characterization between different age groups. Pharyngeal swabs were collected from 120 - 150 students in each of the three districts in Shanghai in May and December during 2015 to 2017, while emm typing and detection of 12 superantigen genes were performed to characterize the isolates. During 2015-2017, the average carriage rate in students was 5.7% (135/2,371), without significant difference between different years or districts. The carriage rate was significantly different between children from the three age groups, with 2.4% in 3 - 4 years, 5.4% in 5 - 9 years, and 9.1% in 10 - 14 years. Eight emm types were found, including emm 1, emm 4, emm 12, emm 22, emm 75, emm 89, emm 70 and emm 241, among which emm 12 accounted for 60%, and emm 1 27.5%. The predominance of emm 12 was found in each year, but the proportion of emm 12 was lower in 10 - 14 years (43.3%) than in 3 - 4 years (86.7%) and in 5 - 9 years (73.3%) (P = 0.002 and 0.003). Superantigen genes of speB, speC, speG, ssa and smeZ were found in almost all the isolates. The average carriage of S. pyogenes in population vulnerable to scarlet fever was 5.7% in Shanghai, highest in 10 - 14 years (9.1%), while emm 12 was the predominant type. 展开更多
关键词 SCARLET Fever CARRIAGE Rate Child emm type SUPERANTIGEN
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儿童链球菌感染分离株emm分型及超抗原基因谱的变迁 被引量:12
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作者 赵成松 马耀玲 +9 位作者 林弘睿 冯丽娟 梁云梅 俞桑洁 姚开虎 高微 袁林 李艳 杨永弘 沈叙庄 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第22期1730-1732,1744,共4页
目的通过对1993-1994年和2005-2006年359株儿童A族溶血性链球菌(GAS)分离株进行emm分型及8种超抗原基因检测,探讨不同时期儿童GAS感染分离株emm分型及超抗原基因的变化。方法采用PCR法对2个时期359株儿童GAS分离株进行emm分型及8种超抗... 目的通过对1993-1994年和2005-2006年359株儿童A族溶血性链球菌(GAS)分离株进行emm分型及8种超抗原基因检测,探讨不同时期儿童GAS感染分离株emm分型及超抗原基因的变化。方法采用PCR法对2个时期359株儿童GAS分离株进行emm分型及8种超抗原基因扩增。结果 emm1和emm12在不同时期均为主要流行型,其他型别不断变化。与1993-1994年比较,2005-2006年GAS菌株emm型较集中,emm1和emm12显著增多(Pa<0.01)。携带6种或6种以上超抗原基因的GAS分离株从46.53%(1993-1994年)增加到78.39%(2005-2006年),ssa,speH和speJ基因的携带率明显增加(P<0.05),而speA基因的携带率显著下降(P<0.05)。超抗原emm基因谱与emm分型之间有密切关系,相同的emm型在不同的时期携带不同的超抗原基因,emm型的分布和超抗原基因谱与GAS感染性疾病之间无显著性联系。结论儿童链球菌感染分离株emm分型及超抗原基因谱随年代变迁。此数据为制备符合我国GAS感染的疫苗提供依据。 展开更多
关键词 emm分型 流行病学 化脓性链球菌 超抗原
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北京地区儿童携带的酿脓链球菌emm分型和超抗原speA及speC的相关性研究 被引量:11
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作者 梁云梅 常贺生 +3 位作者 沈叙庄 俞桑洁 袁林 杨永弘 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第22期1700-1702,共3页
目的分析北京地区儿童携带的酿脓链球菌酿脓链球菌的emm分型及携带超抗原speA及speC基因情况。方法应用PCR对2007年1-12月155株北京地区猩红热、咽扁桃体炎患儿及健康儿童咽部酿脓链球菌emm基因及超抗原speA和speC基因进行扩增。结果健... 目的分析北京地区儿童携带的酿脓链球菌酿脓链球菌的emm分型及携带超抗原speA及speC基因情况。方法应用PCR对2007年1-12月155株北京地区猩红热、咽扁桃体炎患儿及健康儿童咽部酿脓链球菌emm基因及超抗原speA和speC基因进行扩增。结果健康儿童、猩红热患儿及咽扁桃体炎患儿中有emm1.0(51.6%)、emm4.0(0.6%)、emm12.0(41.3%)、emm18.0(1.9%)、emm22.0(0.6%)、st1815(1.3%)、st5240(0.6%)及stG485(1.9%)8种酿脓链球菌克隆株流行。其中13.5%酿脓链球菌只携带超抗原speA基因,26.5%只携带超抗原speC基因,40.6%同时携带超抗原speA和speC基因,19.4%2种基因均不携带。25.0%emm1.0型酿脓链球菌只携带超抗原speA基因,2.5%emm1.0型和51.6%emm12.0型酿脓链球菌只携带超抗原speC基因,68.8%emm1.0型和12.5%emm12.0型酿脓链球菌同时携带speA及speC基因,3.8%emm1.0型和35.9%emm12.0型酿脓链球菌2种基因均不携带。27.3%致猩红热emm1.0型酿脓链球菌只携带超抗原speA基因,4.5%只携带超抗原speC基因,61.4%同时携带超抗原speA和speC基因,6.8%克隆株2种基因均不携带。18.8%致咽扁桃体炎emm1.0型酿脓链球菌只携带超抗原speA基因,81.2%emm 1.0型酿脓链球菌同时携带超抗原speA和speC基因。50.0%健康儿童携带的emm1.0型酿脓链球菌只携带超抗原speA基因,50.0%同时携带超抗原speA和speC基因。39.1%致猩红热emm12.0型酿脓链球菌只携带超抗原speC基因,17.4%同时携带超抗原speA和speC基因,43.5%2种基因均不携带。73.3%致咽扁桃体炎emm12.0型酿脓链球菌只携带超抗原speC基因,10.0%同时携带超抗原speA和speC基因,16.7%2种基因均不携带。18.2%健康儿童携带的emm12.0型酿脓链球菌只携带超抗原speC基因,9.1%同时携带超抗原speA和speC基因,72.7%2种基因均不携带。结论 emm1.0型和emm12.0型酿脓链球菌是导致北京地区儿童发生猩红热及咽扁桃体炎的2个主要克隆菌株。stG485、emm18.0、emm1.0型和emm12.0型酿脓链球菌是北京地区健康儿童携带的4个主要克隆菌株。不同emm分型酿脓链球菌、致猩红热酿脓链球菌、致急性咽扁桃体炎酿脓链球菌及健康儿童携带的酿脓链球菌对超抗原speA和speC基因携带率各有不同。 展开更多
关键词 猩红热 咽扁桃体炎 健康携带者 酿脓链球菌 超抗原 emm分型
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深圳市2016年至2018年猩红热A族链球菌emm基因型及基因组多态性分析 被引量:1
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作者 高外外 禹定乐 王文建 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第21期1655-1659,共5页
目的明确导致猩红热的A族链球菌(GAS)流行型别,比较不同emm型别GAS的基因结构及基因变异性,阐明猩红热病原学的流行、进化规律。方法回顾性研究。收集2016年1月1日至2018年5月31日深圳市儿童医院诊断为猩红热的儿童咽拭子标本,保存GAS菌... 目的明确导致猩红热的A族链球菌(GAS)流行型别,比较不同emm型别GAS的基因结构及基因变异性,阐明猩红热病原学的流行、进化规律。方法回顾性研究。收集2016年1月1日至2018年5月31日深圳市儿童医院诊断为猩红热的儿童咽拭子标本,保存GAS菌株,进行emm基因分型,选取在分型上具有代表性的菌株进行全基因组测序,通过比较基因组学分析,描述GAS菌株基因组多态性,并基于单核苷酸多态性(SNP)位点分析构建遗传进化树,阐明菌株之间的进化关系。2组比较采用秩和检验。结果在导致儿童猩红热的176株GAS分离株中,共检测到8种emm型别,emm12.0及其亚型(108/176株,61.4%)占比最高,其次为emm1.0及其亚型(53/176株,30.1%),两者共占91.5%。以GCA-900984775为参考序列进行比较基因组分析显示,GAS菌株基因组之间存在丰富的SNP和插入或缺失(InDel)多态性,emm12.0型菌株SNP数[183(163,213)个]大于emm1.0型菌株SNP数[63(54,75)个],差异有统计学意义(P<0.05);InDel分析中,emm12.0型菌株基因序列插入数[4(3,6)个]和缺失数[8(6,10)个]大于emm1.0型菌株[1(0,2)个,5(3,7)个]。以MGAS5005参考序列,基于SNP的分析结果构建进化树得出18株菌株及参考菌株处于2个分支。结论引起儿童猩红热的GAS菌株型别以emm12.0型、emm 1.0型多见,不同型别菌株基因组组成之间存在差异,emm12.0型菌株存在较高的遗传多样性。 展开更多
关键词 猩红热 A族链球菌 emm分型 基因组多态性 儿童
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emm簇分组系统在A族链球菌相关研究中的应用
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作者 高外外 禹定乐 王文建 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第21期1677-1680,共4页
A族链球菌(GAS)是造成全球儿童死亡的重要病原之一。细菌分型是研究病原微生物流行特征最常用的手段,emm分型是研究GAS常用的分型方法。近些年新提出的emm簇分组系统是基于M蛋白氨基酸序列同源性和与宿主血清蛋白结合能力进行分型,在国... A族链球菌(GAS)是造成全球儿童死亡的重要病原之一。细菌分型是研究病原微生物流行特征最常用的手段,emm分型是研究GAS常用的分型方法。近些年新提出的emm簇分组系统是基于M蛋白氨基酸序列同源性和与宿主血清蛋白结合能力进行分型,在国外已被广泛用于流行病学调查、菌株选择及疫苗开发等,但在国内目前尚未被应用。emm分型是基于emm基因的一个小的可变区域,而emm簇分组系统根据emm基因的几乎完整序列定义GAS类型,且emm簇分组系统可直接由emm分型比对获得,简单易行。因此,emm簇分组系统可提供有关GAS不同emm型中M蛋白的功能和结构特性的更多信息,现就emm簇分组系统的方法、原理及目前在GAS相关研究中的应用等作一综述,以便于在国内推广应用。 展开更多
关键词 A族链球菌 emm簇分型 emm分组 M蛋白
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北京市朝阳区2011年儿童A组溶血性链球菌超抗原基因的分子流行病学研究 被引量:8
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作者 王海滨 尤元海 +6 位作者 王恒伟 韩庆华 张玉松 赵剑虹 宋衍燕 闫笑梅 张晓曦 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期741-744,共4页
目的描述2011年北京市朝阳区儿童A组溶血性链球菌(GAS)的超抗原分子流行病学特征,分析超抗原基因与emm型别和GAS相关疾病的关系。方法从猩红热、咽炎及扁桃体炎患儿的咽拭子分离培养获得71株GAS,应用PCR法检测这些GAS是否携带8类超... 目的描述2011年北京市朝阳区儿童A组溶血性链球菌(GAS)的超抗原分子流行病学特征,分析超抗原基因与emm型别和GAS相关疾病的关系。方法从猩红热、咽炎及扁桃体炎患儿的咽拭子分离培养获得71株GAS,应用PCR法检测这些GAS是否携带8类超抗原基因(speA、spel、$sa、speC、speJ、speG、spell和SMEZ);PCR扩增emm基因片段并测序,进行emm型别鉴定;分析超抗原基因、emm型别和GAS所致疾病之间的相互关系,应用,检验进行显著性分析。结果71株GAS的超抗原基因检出率从高到低分别为speC(100.0%)、SMEZ(100.0%)、s50(97.2%)、speG(95.8%)、speH(80.3%)、spel(80.3%)、speA(15.5%)和speJ(12.7%);71株GAS中检出emml2.0型菌株62株、emml.0型7株、emm22.0型1株、emm75.0型1株;spel和渺H基因与speA和speJ基因在emml2.0型与emml.0型菌株中的分布差异有统计学意义(P均〈0.05);spel和spetf基因在猩红热患儿和咽炎扁桃体炎患儿中的分布差异有统计学意义(P均〈0.05);未发现emm型别在不同的疾病中的分布有差异。结论北京市朝阳区儿童携带的GAS超抗原基因的检出率与地域有一定关系;不同emm型别的GAS对超抗原基因的携带有一定的选择性,尤其是针对噬菌体携带的超抗原基因;较emm型别,超抗原基因能更好地建立菌株与疾病之间的关系。 展开更多
关键词 A组溶血性链球菌 超抗原基因 emm型别
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2011年北京地区儿童病例A组链球菌超抗原基因特征研究 被引量:4
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作者 彭晓旻 刘爽 +6 位作者 杨鹏 李静 张代涛 崔淑娟 吴双胜 刘医萌 王全意 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期299-302,共4页
目的分析2011年北京市儿童来源A组链球菌(GAS)临床分离株13种超抗原基因的携带情况及其与病例特征和emm分型问的关系。方法2011年5—7月在北京市36家医院收集儿童来源GAS临床分离株635株。采用实时荧光PCR方法检测菌株超抗原基因speA... 目的分析2011年北京市儿童来源A组链球菌(GAS)临床分离株13种超抗原基因的携带情况及其与病例特征和emm分型问的关系。方法2011年5—7月在北京市36家医院收集儿童来源GAS临床分离株635株。采用实时荧光PCR方法检测菌株超抗原基因speA、speB、speC、speF、speG、speH、spei、speJ、speK、speL、speM、smeZ、ssa的携带情况,PCR法扩增M蛋白N末端基L大l片段,并对产物测序确定GAS的emm型别。结果13种超抗原基因的携带率分别为speA(22.4%)、speB(100.0%)、speC(99.4%)、speF(99.7%)、speG(99.7%)、spell(76.4%)、speI(76.2%)、speJ(21.7%)、speK(O.6%)、speL(1.1%)、speM(2.2%)、smeZ(99.7%)、ssa(98.O%),共观察到26种超抗原谱。超抗原speA、speH、speI、speJ在emml和emml2型GAS间分布的差异有统计学意义(P〈0.05)。致咽部感染菌株超抗原speK和speL的检出率高于致猩红热菌株(P〈0.05);而对SS(Z的携带率低于致猩红热菌株(P〈0.05)。结论2011年北京市儿童来源GAS对超抗原基因speB、speF、smeZ、speG、speC和ss0的携带率较高,speM、speL和speK的携带率较低。GAS的eMn分型与超抗原基因问存在密切联系。未观察到超抗原基因speA和speCj在致猩红热和致咽部感染菌株问的分布差异。 展开更多
关键词 A组链球菌 超抗原 emm基因分型 儿童
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2014年北京市儿童A组链球菌感染分离株超抗原基因谱分析 被引量:3
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作者 卢桂兰 张代涛 +7 位作者 赵佳琛 刘医萌 郭婧 吴双胜 张莉 杨鹏 王全意 彭晓旻 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期988-992,共5页
目的分析2014年北京地区儿童A组链球菌(groupAStreptococcus,GAS)超抗原基因谱,探讨其与GAS的emm型别和感染相关疾病的关系。方法于2014年5—7月在北京市16个区(县)36家哨点医院被临床诊断为猩红热和咽扁桃体炎的儿童患者咽拭子... 目的分析2014年北京地区儿童A组链球菌(groupAStreptococcus,GAS)超抗原基因谱,探讨其与GAS的emm型别和感染相关疾病的关系。方法于2014年5—7月在北京市16个区(县)36家哨点医院被临床诊断为猩红热和咽扁桃体炎的儿童患者咽拭子样本中分离到259株GAS。采用Real-timePCR方法检测GAS超抗原基因(speA、speB、speC、speF、speG、speH、speI、speJ、speK、speL、speM、smeZ、ssa);PCR法扩增GAS菌株M蛋白N末端基因片段,产物经测序比对后确定GAS的emm型别。比较不同组间超抗原基因、emm型别分布的差异。结果259株GAS中,13种超抗原基因的检出率分别为:speA48.6%(126株)、speB99.2%(257株)、speC99.2%(257株1、speF98.8%(256株)、speG98.5%(255株)、speH43.6%(113株)、speI46.3%(120株)、speJ49.0%(127株)、smeZ99.2%(257株)、ssa98.5%(255株),speK、speL、speM均未检出,共观察到11种超抗原基因谱(A—K)。超抗原基因speA、speJ在emml型GAS中检出率分别为94.2%(113/120)、95.0%(114/120),高于在emml2型GAS中的检出率(均为5.6%,7/124),差异有统计学意义(x。值分别为191.20、194.80,P值均〈0.001);超抗原spell、speI在emml2型GAS中检出率分别为83.9%(104/124)、88.7%(110/124),高于emml型GAS的检出率[3.3%(4/120)、4.2%(5/120)1,差异有统计学意义(x2值分别为160.30、174.90,P值均〈0.001)。致猩红热和致咽扁桃体炎病例GAS分离株的超抗原基因、eliza型别分布差异均无统计学意义(P〉0.05)。结论2014年北京市儿童来源GAS的超抗原基因speB、speC、speF、speG、smeZ和ssa的检出率较高,未检测到超抗原基因speK、speL、speM;超抗原基因分布与GAS的emm型别密切相关;未发现超抗原基因及emm型别在致咽扁桃体炎和致猩红热菌株间的分布差异。 展开更多
关键词 链球菌属 超抗原 儿童 emm分型
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引起儿童猩红热和咽峡炎的化脓性链球菌的分子流行病学特征 被引量:6
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作者 张颖华 俞蕙 +2 位作者 王小光 何樱瑛 闫红静 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期821-826,共6页
目的分析化脓性链球菌的抗生素敏感性、大环内酯类耐药基因、毒力基因和emm基因型特征。方法收集2018年1—12月复旦大学附属儿科医院猩红热监测点患儿的咽拭子,分离培养化脓性链球菌,用杆菌肽敏感试验进行鉴别试验并测量抑菌圈直径大小,... 目的分析化脓性链球菌的抗生素敏感性、大环内酯类耐药基因、毒力基因和emm基因型特征。方法收集2018年1—12月复旦大学附属儿科医院猩红热监测点患儿的咽拭子,分离培养化脓性链球菌,用杆菌肽敏感试验进行鉴别试验并测量抑菌圈直径大小,用Vitek GP卡进行生化确认。KB法测定其对红霉素、克拉霉素、克林霉素、氨苄西林、头孢曲松、诺氟沙星和氯霉素7种抗生素的敏感性。PCR法检测大环内酯类耐药基因mefA、ermA、ermB和Tn916,以及毒力基因speA、speB、speC、speG、speH、speI、speJ和speK,扩增emm基因并进行emm基因型测序。结果247份咽拭子标本中分离培养出86株化脓性链球菌。对红霉素、克拉霉素和克林霉素的耐药率分别为89.5%、95.3%和96.5%。对氨苄西林、头孢曲松、诺氟沙星和氯霉素敏感率分别为100%、100%、90.7%和95.3%。mefA、ermA、ermB和Tn 916的携带率分别为20.9%、24.4%、96.6%和95.4%,mefA携带率在猩红热患儿和咽峡炎患儿中差异有统计学意义。毒力基因speA、speB、speC、speG、speH、speI、speJ、speK、speL和speM的携带率分别为8.1%、100.0%、95.3%、100.0%、80.2%、90.7%、10.5%、100.0%、5.8%和5.8%。共测出7种emm基因型,主要流行基因型为emm12.0(75.6%)、emm12.19(9.3%)和emm1.0(8.1%)。emm1.0基因型的杆菌肽抑菌圈直径小于emm12.0型。不同emm基因型携带毒力基因谱不同,speB、speG和speK出现在所有基因型中,speA阳性的菌株基因型为emm1.0,speB、speC、speG、speH、speI和speK阳性的菌株emm基因型多为emm12.0型。结论emm基因型和毒力基因、杆菌肽抑菌圈直径存在关联。杆菌肽敏感试验中,除了观察抑菌圈的有无,建议增加杆菌肽抑菌圈直径大小这一指标。 展开更多
关键词 化脓性链球菌 抗生素耐药 毒力基因 emm基因型 杆菌肽敏感试验
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深圳儿童酿脓链球菌分离株多基因序列分型 被引量:3
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作者 禹定乐 梁云梅 +4 位作者 卢清华 赵瑞珍 陈运生 郑跃杰 杨永弘 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期295-298,共4页
目的探讨酿脓链球菌,即β溶血性A族链球菌(GAS)在深圳的流行病学特征。方法对2016年1月至2018年12月深圳市儿童医院分离的GAS流行克隆群进行多基因序列分型(MLST)回顾性分析。本研究中32株分属于7个不同emm分型的GAS菌株分别来自32例患... 目的探讨酿脓链球菌,即β溶血性A族链球菌(GAS)在深圳的流行病学特征。方法对2016年1月至2018年12月深圳市儿童医院分离的GAS流行克隆群进行多基因序列分型(MLST)回顾性分析。本研究中32株分属于7个不同emm分型的GAS菌株分别来自32例患有脓疱病、蜂窝组织炎、猩红热、脓毒症、肺炎、阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征、支气管炎、过敏性鼻炎、臀部脓肿、过敏性紫癜或咽扁桃体炎的患儿,分离自咽拭子23份,痰液5份,脓液3份和血液1份。应用聚合酶链反应技术对32株GAS菌株的7对等位看家基因(gki、gtr、murI、mutS、recP、xpt和yqiL)进行扩增,对目标基因产物进行测序。然后将获得的每个等位基因的基因序列提交至MLST网站,以获得相应的等位基因谱。最后将等位基因谱再次提交至MLST网站,以确认序列分型(ST)。结果emm 1.00及其亚型、emm 4.00、emm 12.00及其亚型、emm 22.00、emm 28.00、emm 75.00和emm 89.00的GAS克隆群分别属于MLST分型中的ST28、ST39、ST36、ST46、ST52、ST49和ST921。结论2016年至2018年导致深圳地区儿童感染的GAS分离株的MLST流行克隆群分别为ST28、ST39、ST36、ST46、ST52、ST49和ST921。 展开更多
关键词 酿脓链球菌 多基因序列分型 emm分型 儿童
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儿童A族β溶血链球菌的主要毒力特征 被引量:2
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作者 曾婷 王全意 +11 位作者 吴琼 林弘睿 董燕红 刘岚 郑跃杰 王丽娟 杨鹏 袁琳 俞桑洁 姚开虎 杨永弘 沈叙庄 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第16期1235-1239,共5页
目的研究儿童A族β溶血链球菌(GAS)分离株超抗原、链球菌DNA酶(DNase)、纤维结合蛋白(FBP)基因的分布特征,分析其与感染儿童及主要cram流行型的关系。方法收集2008年至2012年3所儿童医院临床分离的GAS72株感染菌株,40株健康携... 目的研究儿童A族β溶血链球菌(GAS)分离株超抗原、链球菌DNA酶(DNase)、纤维结合蛋白(FBP)基因的分布特征,分析其与感染儿童及主要cram流行型的关系。方法收集2008年至2012年3所儿童医院临床分离的GAS72株感染菌株,40株健康携带株。PCR扩增及测序对菌株进行emm分型;PCR检测12种超抗原(speA、speC、speH、speI、speG、speJ、ssa、smeZ、speL、speM、speK和speF)、5种DNase基因(sda、sdn、spdI、spd3和spd4)及磷脂酶A2基因sla和FBP基因(prtFl、prtF2、fba)的携带。结果112株GAS分离株,共7种emm型,包括:emml、emml2、emm22、emm4、emm77、emm86、stG485,以emml2型为主,占68.8%,感染株与非感染株emm型分布一致。112株GAS超抗原基因携带率分别为speA 13.4%,speC 95.5%,speF 85.7%,speG 74.1%,speH 63.4%,speI 63.4%,speJ 14.3%,speK、speL、speM各占0.9%,ssa 74,1%,smeZ 93.8%;DNase基因:sda 66.96%,sdn 12.5%,spdI 94.64%,spd 327.68%,spd 40.89%,没有分离株携带sla;FBP基因:prtFI 69.6%,prtF 279.5%,加030.4%,prtFI和prtF2同时阳性67.9%,三者都不携带的占3.6%。感染儿童分离株speJ、spd3的携带率明显高于健康儿童携带株,而ssa,speF,speG、prtFl、prtF2、同时携带prtFl/prtF2甩基因在健康儿童携带株更常见。在emml2型GAS中,speH、speI、speG、sda、spdl、prtFl、prtF2、prtFl和prtF2同时阳性的携带率高于非emml2型,而speA、speJ、sdn、spd3、fba的携带率则低于非emml2型。结论儿童GAS主要流行型为emml2型,其次为emml、emm22型,与菌株来源无关;感染儿童分离株与健康儿童携带株有不同的毒力基因分布特征;emml2型的流行可能与特定毒力基因的高携带有关。 展开更多
关键词 A族链球菌 毒力因子 emm分型
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暴发猩红热病原学检测和分子特征分析 被引量:3
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作者 徐云龙 罗芸 +1 位作者 孙亚萍 陈燕 《中国卫生检验杂志》 CAS 2016年第4期553-555,共3页
目的对分别发生在幼儿园和小学的2起猩红热疫情进行病原学检测和分子特征分析,为流行病学分析提供资料。方法按照国家行业标准WS 282—2008进行病原菌分离和鉴定,采用PCR法扩增链球菌致热外毒素基因spe A、spe B和spe C,参照Pulse Net... 目的对分别发生在幼儿园和小学的2起猩红热疫情进行病原学检测和分子特征分析,为流行病学分析提供资料。方法按照国家行业标准WS 282—2008进行病原菌分离和鉴定,采用PCR法扩增链球菌致热外毒素基因spe A、spe B和spe C,参照Pulse Net发布的单核细胞增生李斯特菌的PFGE操作程序进行脉冲场凝胶电泳分析,应用PCR法扩增emm基因,进行测序,通过比对获得emm基因型。结果 2起疫情中共检出9株化脓性链球菌,血清学分群结果判定均为A群链球菌,所有分离株均携带spe B基因,spe A和spe C基因携带情况因emm基因型不同而变化,9株分离株被分成2个PFGE型别,测序比对的基因型分别为emm12和emm1。结论具有特定PFGE图谱和毒素-基因谱的分别属于emm12和emm1基因型的不同克隆的GAS菌株,引起本地区2起低年龄儿童猩红热的社区暴发。 展开更多
关键词 猩红热 暴发 毒素基因谱 脉冲场凝胶电泳 M蛋白基因分型
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基于非均匀曳力模型的CFB循环特性研究
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作者 刘洋 霍鹏举 +1 位作者 李晓宏 祁海鹰 《工程热物理学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1440-1444,共5页
为了给工业级循环流化床(CFB)煤气化反应器的运行调试提供有效的参考依据,在操作参数之一--颗粒质量循环流率Gs未知的情况下,本文采用具有宽工况普适能力的QC-EMMS非均匀曳力模型和欧拉-欧拉数值方法,模拟了提升管内的气固两相流动,准... 为了给工业级循环流化床(CFB)煤气化反应器的运行调试提供有效的参考依据,在操作参数之一--颗粒质量循环流率Gs未知的情况下,本文采用具有宽工况普适能力的QC-EMMS非均匀曳力模型和欧拉-欧拉数值方法,模拟了提升管内的气固两相流动,准确给出了该装置的循环特性,即不同流化风速下颗粒质量循环流率Gs与床存量的关系曲线,揭示了实际过程中可能存在的A类噎塞现象,以及发生噎塞前后,床内颗粒浓度分布的变化规律。研究表明,欧拉方法和QC-EMMS模型可在各类大型CFB系统运行的改进、放大和优化中发挥应有的重要作用。 展开更多
关键词 循环流化床煤气化反应器 循环特性 QC-emmS非均匀曳力模型 A类噎塞
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