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内蒙古地区3个马品种ELA-DRA*exon2的PCR-SSCP分析 被引量:3
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作者 孟青龙 李金莲 +2 位作者 石有斐 孙玉江 芒来 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2006年第5期42-44,共3页
为了检测内蒙古地区3个马品种ELA_DRA*exon2的多态性,通过PCR_SSCP技术内蒙古地区3个马品种(三河马、锡尼河马和巴尔虎马)各50匹的ELA_DRA*exon2进行检测,用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结... 为了检测内蒙古地区3个马品种ELA_DRA*exon2的多态性,通过PCR_SSCP技术内蒙古地区3个马品种(三河马、锡尼河马和巴尔虎马)各50匹的ELA_DRA*exon2进行检测,用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结果表明,150匹马中共出现6种基因型:3种纯合子分别记为AA,BB和CC型,均为3条带;3种杂合子分别记为AB,BC和AC型,均为4条带。其中A等位基因频率最高,B次之,而C只在三河马中出现。因此说三河马ELA_DRA*exon2的多态性比锡尼河马和巴尔虎马丰富。 展开更多
关键词 ELA—DRA exon2 PCR—SSCP 多态性
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中国大陆野猪SLA DRB基因exon2的序列变异分析 被引量:3
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作者 丁栋 沈菲菲 +4 位作者 张保卫 李崇奇 张晨岭 周开亚 常青 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期117-125,共9页
本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon 2序列的遗传变异分析,探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征。研究发现DRB基因exon 2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2.95倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作... 本文基于135头野猪样本中检测到的15种SLA DRB基因exon 2序列的遗传变异分析,探讨DRB基因在不同地理区域中自然选择的变化特征。研究发现DRB基因exon 2抗原结合位点的非同义替换率为同义替换率的2.95倍,表明该位点受到平衡选择的强烈作用。在系统发生分析中,在基于核苷酸序列构建的NJ树中,野猪DRB位点的15种等位基因全部聚为一枝,没有发现跨种多态现象;而在基于氨基酸序列构建的系统发生树中,野猪SLA-DRB*nnu6和人DRB基因exon 2片段聚在一起,这种氨基酸残基的高度相似可能是由于自然选择压力下产生的趋同。野猪DRB基因exon 2的序列多态性分析表明,东北野猪基因多态性低于四川野猪和华南野猪,这可能与不同气候条件和地理环境下的寄生虫等因素对SLA等位基因变异的影响存在差异有关。 展开更多
关键词 野猪 DRB exon 2 遗传变异 平衡选择 系统发生
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蒙古马与其他品种马的ELA-DRA* exon2多态性分析 被引量:1
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作者 李金莲 石有斐 +1 位作者 刘淑娟 芒来 《山东农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第3期345-350,共6页
本实验通过PCR-SSCP技术检测了三大品种6个类型共296匹马ELA-DRA* exon2的多态性。用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结果296匹马中共出现6种基因型:三种纯合子分别记为AA、BB和CC型,均为3条带... 本实验通过PCR-SSCP技术检测了三大品种6个类型共296匹马ELA-DRA* exon2的多态性。用12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将已变性的PCR扩增产物分离,并用银染法显色。结果296匹马中共出现6种基因型:三种纯合子分别记为AA、BB和CC型,均为3条带;三种杂合子分别记为AB、BC和AC型,均为4条带;且AA和AB两种基因型是所研究的各类型马的优势基因型。纯血马和三河马的PIC和He值均较高,属于高度多态,4个类型蒙古马均属于中度多态。聚类分析表明三大品种各聚一支,各类型蒙古马中锡尼河马和巴尔虎马关系较近。 展开更多
关键词 ELA-DRA* exon2 PCR-SSCP 多态性
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多脊椎蒙古羊Hoxc8 exon-1和exon-2的序列分析 被引量:2
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作者 陈琦 赵静 +1 位作者 张立岭 马月辉 《热带生物学报》 2011年第2期157-163,共7页
参考牛的Hoxc8基因序列设计引物,扩增正常蒙古羊(胸椎数13)和多脊椎蒙古羊(胸椎数14)Hoxc8的exon-1和exon-2基因,对得到的序列进行生物信息学分析。结果表明,经序列比对二者的DNA序列,除两侧个别碱基有差异外,中间序列完全一致。蒙古羊H... 参考牛的Hoxc8基因序列设计引物,扩增正常蒙古羊(胸椎数13)和多脊椎蒙古羊(胸椎数14)Hoxc8的exon-1和exon-2基因,对得到的序列进行生物信息学分析。结果表明,经序列比对二者的DNA序列,除两侧个别碱基有差异外,中间序列完全一致。蒙古羊Hoxc8的exon-1和exon-2序列分别与其他物种进行同源性比对,蒙古羊Hoxc8 exon-1与人、小鼠、大鼠、犬的同源性达到96%以上,与斑马鱼的同源性为75.8%;exon-2与大猩猩、犬、人、小鼠、大鼠的同源性达到91%以上,与斑马鱼的同源性为74%。 展开更多
关键词 多脊椎蒙古羊 序列分析 Hoxc8 exon-1 Hoxc8exon-2
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河南省汉族糖尿病肾病患者肝细胞核因子-1β基因exon2测定
5
作者 苏永 常雯雯 +3 位作者 牛红艳 汪艳芳 马书平 赵志刚 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2004年第6期1063-1065,共3页
目的 :探讨河南省汉族人群中家族性糖尿病肾病与肝细胞核因子 - 1β(HNF - 1β)基因exon2是否关联。方法 :运用聚合酶链反应 -单链构象多态性技术 (PCR -SSCP)检测 2型糖尿病患者 6 2例 ,健康献血者 82例 ,11个糖尿病家系中 5 6例糖尿... 目的 :探讨河南省汉族人群中家族性糖尿病肾病与肝细胞核因子 - 1β(HNF - 1β)基因exon2是否关联。方法 :运用聚合酶链反应 -单链构象多态性技术 (PCR -SSCP)检测 2型糖尿病患者 6 2例 ,健康献血者 82例 ,11个糖尿病家系中 5 6例糖尿病肾病患者的HNF - 1β基因exon2片段。 结果 :糖尿病肾病患者、2型糖尿病患者、健康献血者均未发现有HNF - 1β基因exon2异常条带。 结论 :HNF - 展开更多
关键词 糖尿病肾病 肝细胞核因子1β基因 exon2
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牦牛GHR exon 10-2序列SNP多态性分析 被引量:2
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作者 金鑫燕 《青海畜牧兽医杂志》 2020年第4期29-34,共6页
生长激素受体基因是泌乳性状重要候选基因,研究牦牛GHR基因SNP多态性是开展牦牛乳用性能分子标记辅助选育的重要基础。本试验对牦牛GHR基因exon 10-2片段SNP多态性检测结果表明:相对于普通牛GHR exon 10(Genebank登录号AM161140.1),本... 生长激素受体基因是泌乳性状重要候选基因,研究牦牛GHR基因SNP多态性是开展牦牛乳用性能分子标记辅助选育的重要基础。本试验对牦牛GHR基因exon 10-2片段SNP多态性检测结果表明:相对于普通牛GHR exon 10(Genebank登录号AM161140.1),本试验青海泽库高原型牦牛GHR基因exon 10-2含SNP多态位点5个,AM161140.1-10第702位T(C/C型),该碱基编码的氨基酸为半胱氨酸(C),本群体所有样本该SNP位点编码氨基酸均为精氨酸(R)。第730位A(A/G型),导致编码的氨基酸由丝氨酸(S)变成甘氨酸(G),第755位C(T/T型),该位点碱基突变并未造成氨基酸的变化,为同义突变。第810位T(C/T型),导致编码的氨基酸由脯氨酸(P)变成丝氨酸(S)。第989位T(C/C型),碱基T编码的氨基酸为酪氨酸(Y),本群体所有样本该SNP位点编码氨基酸均为组氨酸(H);相对于本试验群体,共含SNP多态位点2个(第730位A,第810位T),且2个SNP多态位点共形成3种基因型,AA/CT共1头,基因型频率为4.35%,AG/TT共7头,基因型频率为30.43%,AA/TT共15头,基因型频率为65.22%,AA/TT为该群体优势基因型。 展开更多
关键词 牦牛 GHR exon 10-2 SNP 多态性
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牦牛和普通牛DRB1*Intron1-exon2序列变异分析 被引量:3
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作者 田知利 陈杰 +5 位作者 胡江 罗玉柱 刘秀 李少斌 郭淑珍 牟永娟 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期72-79,共8页
为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料,通过检测DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异,分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP方法检测BoLA-DRB1基因... 为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料,通过检测DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异,分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP方法检测BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子部分序列多态性。DRB1基因第1内含子区检测到4处SNPs及1处插入/缺失突变,第2外显子区检测到17处SNPs,两区域均表现为高度多态;单倍型连锁分析发现21种intron 1-exon 2单倍型组型且存在单倍型连锁不平衡现象,A-A1、A-B1、B-A1和B-B1单倍型在牦牛和普通牛中频率较高;聚类分析表明,牦牛DRB1基因第2外显子区碱基序列与普通牛及山羊的同源性最高,系统进化情况与它们亲缘关系远近一致。牦牛和普通牛BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子多态性丰富,可作为牦牛和普通牛BoLADRB1的遗传标记。 展开更多
关键词 牦牛 普通牛 DRB1基因 Intron l exon 2 多态性
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JAK2 V617F, MPL W515L and JAK2 Exon 12 Mutations in Chinese Patients with Primary Myelofibrosis 被引量:3
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作者 Jun Xia Mi-ze Lu +4 位作者 Yuan-qiang Jiang Guo-hua Yang Yun Zhuang Hong-li Sun Yun-feng Shen 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 2012年第1期72-76,共5页
Objective: JAK2 V617F, MPL W515L and JAK2 exon 12 mutations are novel acquired mutations that induce constitutive cytokine-independent activation of the JAK-STAT pathway in myeloproliferative disorders (MPD). The d... Objective: JAK2 V617F, MPL W515L and JAK2 exon 12 mutations are novel acquired mutations that induce constitutive cytokine-independent activation of the JAK-STAT pathway in myeloproliferative disorders (MPD). The discovery of these mutations provides novel mechanism for activation of signal transduction in hematopoietic malignancies. This research was to investigate their prevalence in Chinese patients with primary myelofibrosis (PMF). Methods: We introduced allele-specific PCR (AS-PCR) combined with sequence analysis to simultaneously screen JAK2 V617F, MPL W515L and JAK2 exon 12 mutations in 30 patients with PMF. Results: Fifteen PMF patients (50.0%) carried JAK2 V617F mutation, and only two JAK2 V617F-negative patients (6.7%) harbored MPL W515L mutation. None had JAK2 exon 12 mutations. Furthermore, these three mutations were not detected in 50 healthy controls. Conclusion: MPL W515L and JAK2 V617F mutations existed in PMF patients but JAK2 exon 12 mutations not. JAK2 V617F and MPL W515L and mutations might contribute to the primary molecular pathogenesis in patients with PMF. 展开更多
关键词 Primary myelofibrosis JAK2 V617F MPL W515L JAK2 exon 12 mutation
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松辽黑猪FOXA 2基因第3外显子多态性及其与繁殖性状的关联分析
9
作者 张方玮 张琪 +4 位作者 张云鹏 李欣 张净搏 张树敏 于永生 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期1444-1451,共8页
【目的】分析叉头框家族转录因子A2(forkhead box A2,FOXA2)基因第3外显子多态位点在地方猪种中的遗传多样性及其与松辽黑猪繁殖性状的相关性。【方法】采集90头健康经产松辽黑猪母猪耳组织,采用直接测序法检测FOXA 2基因第3外显子SNP位... 【目的】分析叉头框家族转录因子A2(forkhead box A2,FOXA2)基因第3外显子多态位点在地方猪种中的遗传多样性及其与松辽黑猪繁殖性状的相关性。【方法】采集90头健康经产松辽黑猪母猪耳组织,采用直接测序法检测FOXA 2基因第3外显子SNP位点,利用SPSS 26.0软件分析FOXA 2基因第3外显子SNP位点多态性(基因型频率、基因频率、遗传纯合度、遗传杂合度、有效等位基因数、多态信息含量)及其与松辽黑猪母猪繁殖性状(总产仔数、产活仔数、乳头数以及仔猪初生重、3周龄重、断奶重、断奶仔猪数)的相关性。【结果】松辽黑猪FOXA 2基因第3外显子共检测出3个SNPs位点,1337 bp处SNP位点(C1337A)上发现CC、CA和AA 3种基因型;1343 bp处SNP位点(C1343G)上发现CC、CG和GG 3种基因型;1626 bp处SNP位点(C1626T)上发现CC、CT和TT 3种基因型。卡方适合性检验表明,松辽黑猪FOXA 2基因第3外显子的C1337A、C1626T位点符合哈迪-温伯格平衡状态(P>0.05),C1343G位点偏离哈迪-温伯格平衡状态(P<0.05)。多态信息含量(PIC)计算显示,C1337A、C1626T位点为中度多态(0.25<PIC<0.50),C1343G位点为高度多态(PIC>0.50)。关联分析结果表明,C1337A位点的CC基因型个体总产仔数显著高于CA基因型(P<0.05),AA基因型个体所产仔猪3周龄重、断奶重极显著高于CC、CA基因型(P<0.01);C1626T位点的CC基因型个体所产仔猪3周龄重、断奶重极显著或显著高于CT、TT基因型(P<0.01;P<0.05),CC基因型个体乳头数显著高于CT基因型个体(P<0.05)。【结论】FOXA 2基因第3外显子存在3个多态性位点,与松辽黑猪总产仔数、3周龄重、断奶重和乳头数均有显著关联性。 展开更多
关键词 松辽黑猪 FOXA 2基因 第3外显子 繁殖性状 关联分析 遗传标记
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广西巴马小型猪SLA-DQB基因外显子2的多态性研究 被引量:9
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作者 陈江伟 郭亚芬 +4 位作者 兰干球 范晶 谢丽丽 王爱德 李柏 《广西农业科学》 CAS CSCD 2010年第8期824-826,共3页
为探讨广西巴马小型猪SLA-DQB基因外显子2的多态性,以其耳组织为试验材料,经PCR扩增获得广西巴马小型猪SLA-DQB外显子2片段,片段大小为273 bp,含有1个RsaI酶切位点和5个HaeIII酶切位点,基因型分别为27bp/246 bp和84 bp/83 bp/7 bp/16 bp... 为探讨广西巴马小型猪SLA-DQB基因外显子2的多态性,以其耳组织为试验材料,经PCR扩增获得广西巴马小型猪SLA-DQB外显子2片段,片段大小为273 bp,含有1个RsaI酶切位点和5个HaeIII酶切位点,基因型分别为27bp/246 bp和84 bp/83 bp/7 bp/16 bp/29 bp/54 bp。采用PCR-RFLP对30头广西巴马小型猪SLA-DQB基因外显子2的PCR扩增产物进行多态性分析,发现广西巴马小型猪封闭群内S,LA-DQB基因外显子2无多态性位点;而克隆测序及同源性比较分析表明,广西巴马小型猪SLA-DQB基因外显子2序列与普通猪(Sus Scrofa)、人类(Homo sapiens)的同源性分别为94.1%、79.1%。 展开更多
关键词 广西巴马小型猪 SLA-DQB基因 外显子2 PCR-RFLP
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广西地区壮族2型糖尿病患者脂联素基因多态性研究 被引量:6
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作者 陈青云 苏庆建 +8 位作者 覃伟武 戴霞 罗佐杰 蒙碧辉 吴耀生 黄松 冼晶 赖璐华 覃家锦 《广西医科大学学报》 CAS 北大核心 2008年第6期821-824,共4页
目的:研究脂联素基因外显子2单核苷酸多态性(SNP)+45T→G多态性与广西地区壮族2型糖尿病(T2DM)、肥胖及胰岛素抵抗(IR)的关系。方法:运用PCR-RFLP的方法对303例无亲缘关系的广西地区壮族人群[正常糖耐量者(NGT)98例、糖耐量... 目的:研究脂联素基因外显子2单核苷酸多态性(SNP)+45T→G多态性与广西地区壮族2型糖尿病(T2DM)、肥胖及胰岛素抵抗(IR)的关系。方法:运用PCR-RFLP的方法对303例无亲缘关系的广西地区壮族人群[正常糖耐量者(NGT)98例、糖耐量减低者(IGT)108例、T2DM者97例]中检测脂联素基因外显子2的多态性。结果:广西地区壮族人群中脂联素基因+45位有SNP+45T→G存在。含脂联素基因外显子2的SNP+45GG基因型的人群BMI、FPG、PPG、FINS、HOMA-IR高于含TT基因型的人群(P〈0.05).T2DM组的含GG基因型人数高于NGT、IGT组,GG基因型比TT基因型增加了3.077倍T2DM的危险性(95%CI:1.240-7.634)。结论:脂联素基因外显子2SNP+45GG变异与肥胖、IR及T2DM相关。 展开更多
关键词 脂联素 基因多态性 外显子2 2型糖尿病
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甘肃地区绵羊MHC-DRB1基因第2外显子多态性与乳房炎的相关性分析 被引量:5
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作者 张小丽 宋晓育 +3 位作者 马小军 陈富强 张晨 张欣 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第2期221-227,共7页
为研究甘肃地区绵羊MHC-DRB1基因第2外显子基因多态性与绵羊乳房炎的相关性,采用PCR-SSCP方法检测了200只甘肃高山细毛羊和212只小尾寒羊(其中各有43只和48只乳房炎阳性)MHC-DRB1第2外显子基因多态性,分析了群体内各等位基因与绵羊乳房... 为研究甘肃地区绵羊MHC-DRB1基因第2外显子基因多态性与绵羊乳房炎的相关性,采用PCR-SSCP方法检测了200只甘肃高山细毛羊和212只小尾寒羊(其中各有43只和48只乳房炎阳性)MHC-DRB1第2外显子基因多态性,分析了群体内各等位基因与绵羊乳房炎的关联性。结果表明,两个品种绵羊群体的MHC-DRB1第2外显子共检测到13个等位基因,具有高度多态性(PIC>0.5),且偏离了哈德温伯格平衡定律(P<0.01)。两个品种绵羊乳房炎阴性和阳性个体的13个单倍型序列的差异显著性检验和相对危险值(RR值)计算发现,甘肃细毛羊中等位基因D(0.01<P<0.05,RR=0.898)与乳房炎的抗性具有相关性,F(0.01<P<0.05,RR=3.360)与乳房炎易感性具有相关性;而等位基因K(0.01<P<0.05,RR=0.030)与小尾寒羊乳房炎的抗性有相关性,F(P<0.01,RR=5.176)与小尾寒羊乳房炎的易感性具有较强相关性。 展开更多
关键词 甘肃高山细毛羊 小尾寒羊 MHC-DRB1第二外显子 PCR-SSCP 乳房炎
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牛科物种FSHβ基因外显子1和外显子2遗传特征分析 被引量:3
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作者 哈福 李大林 +4 位作者 袁跃云 吴志勇 袁峰 霍金龙 苗永旺 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期61-68,共8页
促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)对刺激动物卵泡发育和促进精子生成具有重要作用,但有关牛科物种FSH基因的群体遗传特征还不十分清楚。本文针对FSHβ基因外显子1和外显子2,采用PCR-SS-CP结合PCR产物直接测序技术对353头水牛... 促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)对刺激动物卵泡发育和促进精子生成具有重要作用,但有关牛科物种FSH基因的群体遗传特征还不十分清楚。本文针对FSHβ基因外显子1和外显子2,采用PCR-SS-CP结合PCR产物直接测序技术对353头水牛(来自11个水牛群体)、30头牦牛和30头大额牛样品进行了群体变异检测,并结合NCBI数据库中已发表的普通牛、山羊和绵羊等物种同源序列进行了群体遗传和生物信息学分析。在FSHβ基因外显子1中,水牛中发现1个核苷酸替换和1个缺失,即c.-49A>G和c.-31delG;其中,SNP-49在河流型和沼泽型水牛中均存在,等位基因c.-49A为优势等位基因,而c.-31delG只存在于沼泽型水牛中,且为杂合状态,基因频率为0.077。在牦牛外显子1中检测到c.-37G>A和c.-12T>C替换,且为连锁遗传的,而在大额牛外显子1中未检测到SNP位点。在FSHβ基因外显子2中,水牛中发现c.132G>A替换,该位点在河流型和沼泽型水牛均存在,但等位基因频率在两类水牛间不一致。在牦牛外显子2中检测到c.9C>T和c.21C>T替换,该替换也存在于普通牛中;大额牛外显子2为单态,未见SNP位点。生物信息学分析显示,在一些牛科物种FSHβ基因外显子2中发现的SNP位点均为同义替换,揭示了其序列的高度保守性。在牛科物种中,山羊和绵羊FSHβ基因第36位密码子编码氨基酸与其他物种不同,可作为区分它们的遗传标记。 展开更多
关键词 牛科物种 促卵泡激素 β-亚基基因 1 2外显子 PCR-SSCP
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绵羊DRA基因外显子2酵母表面展示库的构建及鉴定 被引量:3
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作者 许万云 王会敏 +4 位作者 汪文伦 胡梦薇 严国 李建华 高剑峰 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第3期568-576,共9页
根据绵羊DRA基因序列和酿酒酵母表面展示载体pYD1上的多克隆位点设计特异性引物,从绵羊组织中提取总RNA并逆转录,利用PCR技术扩增得到DRA基因,克隆获得762bp目的片段,并提交GenBank,登录号:KR422362。将该基因通过双酶切连接到表面展示... 根据绵羊DRA基因序列和酿酒酵母表面展示载体pYD1上的多克隆位点设计特异性引物,从绵羊组织中提取总RNA并逆转录,利用PCR技术扩增得到DRA基因,克隆获得762bp目的片段,并提交GenBank,登录号:KR422362。将该基因通过双酶切连接到表面展示载体pYD1上,成功构建了酿酒酵母表面展示重组质粒pYD1-DRA。将DRA基因外显子2两端进行基因点突变,形成新的酶切位点,继而对外显子2设计特异性引物,对绵羊大样本进行DNA池化,并将外显子2扩增产物测序,分析其多态性获得多态位点。重组质粒双酶切得到246bp具有多态性的外显子2,将其连接到经同样酶双酶切的表面展示重组突变载体pYD1-DRA-TB上,成功构建了酿酒酵母表面展示库。将其转化用于表面展示的酿酒酵母EBY100感受态细胞中,得到酵母转化子,挑取酵母菌的单克隆通过PCR扩增及序列测定证实了DRA基因库已成功整合到酿酒酵母基因组中。经半乳糖诱导后,通过免疫荧光法在荧光显微镜下检测得到DRA基因库已成功展示在酵母细胞表面。 展开更多
关键词 绵羊 DRA 外显子2 点突变 酵母表面展示库 免疫荧光法
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贵州小香羊FSHβ基因第2外显子SSCP多态性分析 被引量:2
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作者 吴飞 田兴贵 +7 位作者 杨正梅 王家鹏 杨云 朱红刚 欧德渊 罗终菊 唐静 刘若余 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2010年第12期159-160,164,共3页
为寻找与贵州小香羊繁殖力相关的分子标记提供基础数据,采用单链构象多态(SSCP)方法对在生殖中起重要作用的FSHβ基因外显子2的序列进行多态性检测,并对具有SSCP多态性的DNA片段进行测序分析。结果表明,在该特异性扩增产物中存在基因多... 为寻找与贵州小香羊繁殖力相关的分子标记提供基础数据,采用单链构象多态(SSCP)方法对在生殖中起重要作用的FSHβ基因外显子2的序列进行多态性检测,并对具有SSCP多态性的DNA片段进行测序分析。结果表明,在该特异性扩增产物中存在基因多态性,在94bp处检测到1个多态位点,该位点发生了G→A突变,出现3种基因型(AA、AB和BB)并导致编码的氨基酸由丙氨酸变为苏氨酸,A等位基因频率为62.3%,B等位基因频率为37.7%。 展开更多
关键词 贵州小香羊 FSHβ基因外显子2 PCR-SSCP 多态性
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新疆褐牛瘦素基因第2外显子多态性与肉品质性状的相关性 被引量:2
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作者 孙亚伟 加依娜古丽·吐尔逊拜 +5 位作者 张永鹏 闫向民 李宏波 王金泉 姚刚 张杨 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期174-182,共9页
探索Leptin基因多态性与新疆褐牛肉品质的相关性,旨在寻找与新疆褐牛肉品质性状相关分子标记,为新疆褐牛的选育提供分子遗传学理论依据。利用PCR-RFLP方法检测新疆褐牛Leptin基因第2外显子多态性,并分析其与肉质性状的相关性。结果表明,... 探索Leptin基因多态性与新疆褐牛肉品质的相关性,旨在寻找与新疆褐牛肉品质性状相关分子标记,为新疆褐牛的选育提供分子遗传学理论依据。利用PCR-RFLP方法检测新疆褐牛Leptin基因第2外显子多态性,并分析其与肉质性状的相关性。结果表明,Leptin基因第2外显子E2JW位点存在AA、AT和TT 3种基因型,处于中度多态,E2FB位点有CT和TT 2种基因型,处于低度多态,均为Hardy-Weinberg非平衡状态。相关分析表明:Leptin基因第2外显子E2JW位点与肌纤维直径呈正相关,且相关关系极显著(r=0.435),与胱氨酸含量正相关,且相关关系显著(r=0.410),与蛋氨酸含量呈弱负相关趋势(r=-0.308)。E2FB位点与硬脂酸含量呈正相关趋势(r=0.425)。结果提示E2JW位点有可能成为影响新疆褐牛肉品质性状的分子遗传标记位点。 展开更多
关键词 新疆褐牛 LEPTIN基因 外显子2 多态性 肉品质性状
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云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2遗传多态性分析 被引量:3
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作者 禹文海 鲁绍雄 +3 位作者 和占龙 刘红文 陆润峰 金建斌 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第10期117-121,共5页
本研究采用PCR直接测序和PCR-RFLP法研究了云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2(DQB.2)的遗传多态性,并利用DNAMAN软件分析了云南高峰牛与部分物种DQB.2相应核苷酸序列的同源性。结果发现,共检测到了17个等位基因,其中HaeⅢ酶切位点存在10种... 本研究采用PCR直接测序和PCR-RFLP法研究了云南高峰牛MHC-DQB基因外显子2(DQB.2)的遗传多态性,并利用DNAMAN软件分析了云南高峰牛与部分物种DQB.2相应核苷酸序列的同源性。结果发现,共检测到了17个等位基因,其中HaeⅢ酶切位点存在10种基因型,由A、B、C、D和E 5个复等位基因控制;RsaⅠ酶切位点存在22种基因型,由A、B、C、D、E、F、G、H、I、J和K共11个复等位基因控制;TaqⅠ酶切位点只出现了1种基因型。分析发现,云南高峰牛DQB.2基因的12、25、63、96、106、126、152、156、165、204位的碱基表现出了多态性。所分析的物种该基因片段大小相同均为270bp,云南高峰牛第224位碱基缺失及236位碱基插入现象。云南高峰牛与人、猪、马、绵羊、黄牛×瘤牛的核苷酸序列的同源性分别为81.4%、83.3%、78.1%、87.7%、86.6%。经χ2检验结果表明,HaeⅢ和TaqⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而RsaⅠ酶切位点则未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05)。 展开更多
关键词 云南高峰牛 主要组织相容性复合体(MHC) DQB基因 外显子2 遗传多态性
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荷斯坦牛Leptin基因外显子2多态性与繁殖力性状的相关性研究 被引量:5
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作者 李鹏 何举 +4 位作者 赵国丽 宫艳斌 韩元 王丽 史远刚 《中国奶牛》 2011年第6期4-7,共4页
以94头荷斯坦牛为试验材料,应用PCR-SSCP技术研究Leptin基因外显子2多态性与繁殖力的相关性。在Leptin基因外显子2的E2FB区上,经分析存在影响奶牛繁殖的多态位点,测序首次发现102nt处T突变为C。在平均产犊间隔上,AA与AT差异极显著(P<... 以94头荷斯坦牛为试验材料,应用PCR-SSCP技术研究Leptin基因外显子2多态性与繁殖力的相关性。在Leptin基因外显子2的E2FB区上,经分析存在影响奶牛繁殖的多态位点,测序首次发现102nt处T突变为C。在平均产犊间隔上,AA与AT差异极显著(P<0.01);AT与TT差异极显著(P<0.01);A为优势等位基因,可作为荷斯坦牛育种中繁殖力的分子辅助标记。 展开更多
关键词 Leptin基因外显子2 胎间隔 繁殖力 荷斯坦牛
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广西地区汉族2型糖尿病患者脂联素基因多态性研究 被引量:5
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作者 苏庆建 陈青云 《中国药师》 CAS 2014年第4期540-543,共4页
目的:研究脂联素基因外显子2单核苷酸多态性(SNP)+45T→G多态性与广西地区汉族2型糖尿病(T2DM)、肥胖及胰岛素抵抗( IR)的关系。方法:运用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性( PCR-RFLP)的方法,对313例无亲缘关系的广西地区... 目的:研究脂联素基因外显子2单核苷酸多态性(SNP)+45T→G多态性与广西地区汉族2型糖尿病(T2DM)、肥胖及胰岛素抵抗( IR)的关系。方法:运用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性( PCR-RFLP)的方法,对313例无亲缘关系的广西地区汉族人群的正常糖耐量(NGT95例)、糖耐量减低(IGT103例)和T2DM115例检测脂联素基因外显子2的多态性,并与代谢值进行相关性研究。结果:广西地区汉族人群中含脂联素基因外显子2的SNP+45GG基因型的人群高密度脂蛋白( HDL-C)水平低于TT、TG基因型的人群(P〈0.05),HOMA-IR高组的GG基因型相对于TT基因型的OR为2.876(95%CI:1.141~7.248),即GG基因型发生IR的相对危险度是TT基因型的2.876倍。结论:汉族人群中,脂联素基因SNPs+45 TT基因型的HDL-C较GG基因型频率高;GG基因型较TT基因型人群易产生IR。但汉族人群SNPs+45基因型与T2DM及肥胖无关。 展开更多
关键词 脂联素 基因多态性 外显子2 2型糖尿病
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合作猪SLA-DQA基因外显子2多态性分析 被引量:2
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作者 张国华 马小军 吕伟丽 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期91-95,共5页
旨在研究合作猪DQA基因外显子2多态性,确定其等位基因数、核苷酸多态位点、氨基酸多态位点及各个等位基因之间的遗传关系,分析其进化意义。选用PCR-SSCP对439只合作猪SLA-DQA基因外显子2的多态性进行检测;测序群体内因变异而产生的各等... 旨在研究合作猪DQA基因外显子2多态性,确定其等位基因数、核苷酸多态位点、氨基酸多态位点及各个等位基因之间的遗传关系,分析其进化意义。选用PCR-SSCP对439只合作猪SLA-DQA基因外显子2的多态性进行检测;测序群体内因变异而产生的各等位基因序列,并分析序列数据。结果显示,在合作猪SLA-DQA外显子2中发现了7个新等位基因,共18个核苷酸多态位点,10个氨基酸多态位点。合作猪SLA-DQA外显子2具有较丰富的多态性,群体内可能蕴藏着更加丰富的遗传资源;合作猪SLA-DQA外显子2基因最初可能由一个等位基因突变分化成一大类基因;合作猪SLA-DQA外显子2序列与各个猪种的SLA-DQA外显子2序列具有较高的同源性,预示着这些猪种的SLA-DQA外显子2基因最早可能来源于其分歧之前的共同祖先原始序列;新发现的7个SLA-DQA外显子2等位基因,可能由遗传关系较近的两个等位基因突变产生。 展开更多
关键词 合作猪 SLA-DQA外显子2 多态性 PCR—SSCP
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