期刊文献+
共找到15篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
牦牛生长激素受体基因exon 5序列SNP多态性分析 被引量:1
1
作者 金鑫燕 《青海畜牧兽医杂志》 2020年第3期8-11,共4页
生长激素受体基因是泌乳性状重要候选基因,本试验对牦牛GHR基因exon 5片段进行了SNP检测,该结果表明牦牛GHR基因exon 5含SNP多态位点1个,第82位T,形成C/C和C/T两种基因型,且该SNP为非同义cSNP,碱基C/T的转换导致了编码氨基酸精氨酸/半... 生长激素受体基因是泌乳性状重要候选基因,本试验对牦牛GHR基因exon 5片段进行了SNP检测,该结果表明牦牛GHR基因exon 5含SNP多态位点1个,第82位T,形成C/C和C/T两种基因型,且该SNP为非同义cSNP,碱基C/T的转换导致了编码氨基酸精氨酸/半胱氨酸的改变。 展开更多
关键词 牦牛 GHR exon5 SNP 多态性
下载PDF
绵羊DECR1基因exon 5部分序列多态性分析
2
作者 刘冬 刘桂林 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第11期132-135,共4页
试验根据GenBank登录的牛2,4-双烯-CoA还原酶1(2,4-dienoyl-CoA reductase1,DECR1)基因序列(NP_001068891)设计引物,应用PCR技术对德国美利奴绵羊、杜泊绵羊、特克塞尔绵羊DECR1基因的exon 5部分序列进行克隆测序;利用PCR-SSCP技术检测... 试验根据GenBank登录的牛2,4-双烯-CoA还原酶1(2,4-dienoyl-CoA reductase1,DECR1)基因序列(NP_001068891)设计引物,应用PCR技术对德国美利奴绵羊、杜泊绵羊、特克塞尔绵羊DECR1基因的exon 5部分序列进行克隆测序;利用PCR-SSCP技术检测了3个绵羊群体exon 5单链构象多态性(SNP),所获序列与GenBank中其他物种exon 5序列进行了同源性比较,并构建了亲缘关系聚类分析图。结果表明,绵羊DECR1基因exon 5长为137bp,3个绵羊群体中exon 5均不存在SNPs,各种动物之间DECR1基因exon 5的同源性较高,在81.02%(鸡)~97.08%(牛)之间,其中绵羊和牛同源性最高,达到97.08%;与鸡的同源性最低,为81.02%;聚类分析结果显示,绵羊首先与牛聚为一类,再分别与兔子、狗聚为一类,最后分别与人、猪聚为一类,绵羊与牛的亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远,与传统分类相一致,说明DECR1基因exon 5在动物进化过程中高度保守。 展开更多
关键词 绵羊 DECR1基因 exon 5 序列 SNP
下载PDF
黄牛与牦牛ANGPTL4 exon5多态性与生长性状的相关性 被引量:2
3
作者 马云 李荣荣 +4 位作者 白芳 黄玉凤 李亚芳 杨婷 陈宏 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期16-20,共5页
以5个地方黄牛及青海牦牛为研究对象,利用PCR-SSCP和DNA测序技术对367头黄牛与牦牛的类血管生长因子4基因的第5外显子(ANGPTL4_exon5)序列进行SNP检测,并分析该SNP与黄牛与牦牛生长性状的相关性。结果发现1个新的SNP多态位点(NC_007305:... 以5个地方黄牛及青海牦牛为研究对象,利用PCR-SSCP和DNA测序技术对367头黄牛与牦牛的类血管生长因子4基因的第5外显子(ANGPTL4_exon5)序列进行SNP检测,并分析该SNP与黄牛与牦牛生长性状的相关性。结果发现1个新的SNP多态位点(NC_007305:g.C4899T),并检测出CC、TT和CT3种基因型。黄牛和牦牛不同基因型与生长发育性状的相关分析显示,黄牛TT基因型个体的体质量(399.096±32.946)kg、体斜长(147.447±4.456)cm、胸围(175.188±5.814)cm和腹围(204.657±7.113)cm,显著大于CT基因型个体,依次为(275.636±51.266)kg、(126.470±6.933)cm、(154.031±9.047)cm、(178.911±11.069)cm,其余各项指标基因型间差异不显著。因此,该位点有可能作为黄牛生长性状辅助选择的标记之一。青海牦牛群体中没有发现与该基因座多态显著相关的性状。 展开更多
关键词 ANGPTL4基因 5外显子 黄牛 牦牛 SNP 生长发育性状
下载PDF
一种用于基因5’exons预测的新方法
4
作者 童庆 郑浩然 +1 位作者 宁岩 王煦法 《北京生物医学工程》 2007年第1期13-18,共6页
基因预测是生物信息学领域中的一个重要研究方向。本文在研究了基因局部特征的基础上,针对现有遗传算法在预测基因5’exons方面的不足,从生物免疫机制出发,构建了一种用于基因5’exons预测的免疫遗传算法。该算法利用T细胞发育过程中强... 基因预测是生物信息学领域中的一个重要研究方向。本文在研究了基因局部特征的基础上,针对现有遗传算法在预测基因5’exons方面的不足,从生物免疫机制出发,构建了一种用于基因5’exons预测的免疫遗传算法。该算法利用T细胞发育过程中强大的多样性维持机制来设计算法的选择机制,提高算法的求解性能。实验结果表明该算法提高了基因预测的精度,提供了一种可能的研究基因预测方案。 展开更多
关键词 基因预测 5'exons 遗传算法 T细胞 生物信息学
下载PDF
NOTCH3基因C260S位点突变导致CADASIL的临床和影像学特征分析
5
作者 孔秀云 代飞飞 +1 位作者 王佳伟 崔世磊 《北京医学》 CAS 2024年第5期380-384,共5页
目的探讨NOTCH3基因第5外显子C260S位点突变导致的伴有皮层下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病(cerebral autosomal dominant arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy,CADASIL)家系的临床和影像学... 目的探讨NOTCH3基因第5外显子C260S位点突变导致的伴有皮层下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病(cerebral autosomal dominant arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy,CADASIL)家系的临床和影像学特征。方法选取2021年12月首都医科大学附属北京同仁医院来自同一家庭的CADASIL患者,对所有患者进行NOTCH3基因测序,回顾性分析患者的临床表现和头颅影像学特征。复习既往文献报道的导致同一位置氨基酸改变的其他突变类型的临床及影像学特征。结果4名家庭成员中,包括先证者(46岁,女)及其两个姐姐(分别为48岁和50岁)和女儿(18岁)。先证者及其父亲、两个姐姐都有偏头痛病史,其中大姐有记忆力减退;先证者患有脑梗死及伴有视觉先兆的偏头痛;先证者女儿体健;先证者父亲因脑梗死去世。4名家庭成员均存在C260S位点的NOTCH3基因突变。既往文献无此位点突变的报道,先证者头颅MRI示右侧脑桥亚急性梗死,颞叶、脑室周围及脑干异常高信号改变,其大姐脑桥可见腔隙性梗死灶。结论NOTCH3基因第5外显子c.778T>A(p.C260S)的罕见突变导致的CADASIL发病时间早,早期会出现认知障碍。合并偏头痛的脑干梗死患者,需警惕CADASIL的可能。 展开更多
关键词 伴有皮层下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病 NOTCH3 C260S 5外显子
下载PDF
宣和猪PRKAG3基因外显子5多态性及其与肉质性状的关联 被引量:4
6
作者 胡伟 董新星 +5 位作者 张克忠 何家书 严达伟 李海莲 李明丽 鲁绍雄 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2020年第1期26-32,共7页
【目的】揭示宣和猪PRKAG3基因外显子5多态性及其与肉质性状的关联。【方法】采用PCR产物直接测序法检测了120头宣和猪PRKAG3基因外显子5区域的SNP位点,借助最小二乘模型分析了各位点不同基因型及合并基因型对6个肉质性状的影响。【结... 【目的】揭示宣和猪PRKAG3基因外显子5多态性及其与肉质性状的关联。【方法】采用PCR产物直接测序法检测了120头宣和猪PRKAG3基因外显子5区域的SNP位点,借助最小二乘模型分析了各位点不同基因型及合并基因型对6个肉质性状的影响。【结果】宣和猪PRKAG3基因外显子5区域检出3个SNP位点,包括2个同义突变位点(T579C、T580C)和1个错义突变位点(G595A),分别以TT、TT、GA基因型和T、T、G等位基因的频率最高,且都处于Hardy-Weinberg平衡状态。T579C、T580C位点的TT和TC基因型可显著提高大理石纹(P<0.05)和降低失水率(P<0.01),分别呈显著的加性效应及加性—显性效应(P<0.05或P<0.01);G595A位点的AA基因型失水率最低(P<0.05)、熟肉率最高(P<0.05),呈显著的加性效应(P<0.05);3个位点的合并基因型TTTTGG、TCTCGG和TTTTAA分别具有最高的大理石纹、pH1和最低的失水率(P<0.05或P<0.01),CCCCGG基因型的大理石纹和pH1最低、失水率最高(P<0.05或P<0.01)。【结论】研究结果进一步确认宣和猪PRKAG3基因外显子5多态性与肌肉大理石纹、pH值和失水率显著关联,T579C、T580C位点的CC基因型和G595A位点的GG基因型具有协同降低猪肉品质的效应。 展开更多
关键词 宣和猪 PRKAG3基因 外显子5 单核苷酸多态性 肉质性状
下载PDF
胃癌组织中p53基因突变及蛋白表达的研究 被引量:3
7
作者 于燕妮 陈杨 +2 位作者 胡军 方艺 樊毓 《贵州医药》 CAS 2007年第2期107-109,共3页
目的探讨胃癌组织中p53基因第5~8外显子突变率及p53蛋白的表达。方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)和银染技术,对30例胃癌石蜡包埋组织中p53基因第5~8外显子突变率进行检测;同时应用免疫组织化学Envision二步法检测... 目的探讨胃癌组织中p53基因第5~8外显子突变率及p53蛋白的表达。方法应用聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)和银染技术,对30例胃癌石蜡包埋组织中p53基因第5~8外显子突变率进行检测;同时应用免疫组织化学Envision二步法检测胃癌组织中p53的表达水平。结果30例胃癌石蜡标本中有11例发生p53基因的突变,突变率为36.67%。病理组织学观察胃癌中乳头状腺癌/管状腺癌(分化较好)16例,低分化腺癌/印戒细胞癌(分化较差)14例。p53蛋白随胃癌的分化程度降低而增加,阳性表达率递增(P<0.05)。结论胃癌组织中p53基因突变及p53蛋白高表达在胃癌的发生中有重要的作用及意义。从石蜡包埋组织中提取DNA进行分子生物学检测适用于肿瘤研究。 展开更多
关键词 胃癌 P53基因 聚合酶链反应-单链构象多态性分析 5~8外显子突变
下载PDF
MICA外显子5多态性与成人迟发自身免疫型糖尿病的相关性研究 被引量:1
8
作者 刘鹏鹰 丁洪光 +4 位作者 刘君英 李瑛 叶辉 邬磊 黄耀辉 《深圳中西医结合杂志》 2010年第1期22-24,28,共4页
目的:探讨MICA外显子5多态性与深圳成人迟发自身免疫性糖尿病(latent autoimmune diabetes in adults,LADA)的关系。方法:对21例LADA、28例2型糖尿病(T2DM)患者和31例正常人(NC)采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术和P... 目的:探讨MICA外显子5多态性与深圳成人迟发自身免疫性糖尿病(latent autoimmune diabetes in adults,LADA)的关系。方法:对21例LADA、28例2型糖尿病(T2DM)患者和31例正常人(NC)采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术和PAGE银染技术,对三组研究对象比较MICA外显子5多态性差异。结果:LADA患者A5.1等位基因频率显著高于正常对照组(35.7%vs.17.7%,=2.89,P<0.05);2型糖尿病MICA等位基因频率与正常组比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:MICA5.1等位基因与深圳市LADA易感性相关。 展开更多
关键词 MICA基因外显子5 基因多态性 成人迟发自身免疫性糖尿病
下载PDF
人类pax-5基因外显子1B的5′侧翼区碱基序列分析(英文)
9
作者 刘茂林 Mizanur Rahman +1 位作者 平林泰彦 佐佐木毅 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2002年第2期100-103,共4页
pax 5基因是B细胞生成和B细胞发育中的重要转录因子。为了更好的理解 pax 5基因表达的调节机制 ,对 pax 5基因外显子 1B的 5′侧翼区进行了分离克隆及序列测定。整段碱基序列 (6 6 71bp)分析表明 ,无TATAbox共同序列存在 ,近侧启动子包... pax 5基因是B细胞生成和B细胞发育中的重要转录因子。为了更好的理解 pax 5基因表达的调节机制 ,对 pax 5基因外显子 1B的 5′侧翼区进行了分离克隆及序列测定。整段碱基序列 (6 6 71bp)分析表明 ,无TATAbox共同序列存在 ,近侧启动子包括 3CATboxs,1SP1和 1Ebox ,上游进一步推测的调节位点显示 6LMO2 COM ,5NFAT ,2LPOLYA B ,3GATA1,2AP4 ,10MZF1,1ETS1 B ,1GATA3,1NKX2 5 ,2RORA1,1LYF1,2Ikaros2 ,2TCF11,1GATA C和 1FREAC7,并确定在序列上。因此 ,pax 5基因外显子 1B的 5′侧翼区与 pax 5表达的调节有关 。 展开更多
关键词 pax-5基因 pax-5外显子1B 5′侧翼区序列 碱基序列分析 B细胞
下载PDF
子宫内膜癌中雌激素受体亚型α第五外显子变异体的表达 被引量:1
10
作者 李奎 温宏武 廖秦平 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2005年第6期451-454,共4页
目的:探讨雌激素受体亚型α的第5外显子野生型及变异体在内膜癌中的表达以及在子宫内膜癌发生发展中的作用。方法:选取1999年10月至2003年1月行手术治疗的子宫内膜癌患者41例,以2001年11月至2003年3月接受手术的正常子宫内膜癌患者29例... 目的:探讨雌激素受体亚型α的第5外显子野生型及变异体在内膜癌中的表达以及在子宫内膜癌发生发展中的作用。方法:选取1999年10月至2003年1月行手术治疗的子宫内膜癌患者41例,以2001年11月至2003年3月接受手术的正常子宫内膜癌患者29例做为对照,进行逆转录-多聚酶链反应(RT-PCR),半定量研究雌激素受体亚型第5外显子变异体的表达。结果:内膜癌组织中雌激素受体α第5外显子变异体的表达高于正常内膜组织(P<0.05),而二者之间野生型及野生型与变异体的比值差异无显著性(P>0.05)。结论:雌激素受体α第5外显子缺失型变异体可能在内膜癌的发生和发展中起重要作用。 展开更多
关键词 子宫内膜肿瘤 受体 雌激素 第五外显子变异体
下载PDF
外显子测序技术在一个尿道下裂家系基因分析及产前诊断中的应用 被引量:1
11
作者 杨冬艳 刘俐伶 庞丽红 《中国临床新医学》 2018年第8期737-741,共5页
目的采用外显子测序(exon sequencing,ES)联合Sanger测序技术检测1个尿道下裂家系的致病基因,并对这一致病基因进行产前诊断。方法采集先证者及其父母的外周血,并提取DNA。对先证者的DNA进行性腺疾病相关基因的外显子测序找到致病基因,... 目的采用外显子测序(exon sequencing,ES)联合Sanger测序技术检测1个尿道下裂家系的致病基因,并对这一致病基因进行产前诊断。方法采集先证者及其父母的外周血,并提取DNA。对先证者的DNA进行性腺疾病相关基因的外显子测序找到致病基因,并针对该致病基因对先证者父母的DNA进行Sanger验证,明确是遗传自亲代。对先证者母亲再次妊娠的羊水标本提取DNA,采用Sanger测序对该致病基因行产前诊断。结果先证者SRD5A2(NM_000348):c.607G>A,P.(Gly203Ser)杂合突变及c.680G>A,P.(Arg227Gln)杂合突变组成的复合杂合突变。而其表型正常的母亲为SRD5A2(NM_000348):c.607G>A,P.(Gly203Ser)杂合突变;其表型正常的父亲为SRD5A2(NM_000348):c.680G>A,P.(Arg227Gln)杂合突变。先证者母亲再次妊娠产前诊断结果为SRD5A2(NM_000348):c.680G>A,P.(Arg227Gln)杂合突变。结论 ES联合Sanger测序可用于检测尿道下裂家系的致病基因及进行产前诊断。且此方法快速、准确、经济。 展开更多
关键词 尿道下裂 5α还原酶2型基因 外显子测序 Sanger测序 产前诊断
下载PDF
Molecular cloning and analysis of the partial sequence of Rhinopithecus roxellanae growth hormone gene
12
作者 徐来祥 孔繁华 华育平 《Journal of Forestry Research》 CAS CSCD 2000年第1期47-50,共4页
Growth hormone gene (GH) ofRhinopithecus roxellanae was amplified by PCR based on the sequences of the reported mammalian growth hormone gene for the first time. The amplified fragment was about 1.8 kb. It was cloned ... Growth hormone gene (GH) ofRhinopithecus roxellanae was amplified by PCR based on the sequences of the reported mammalian growth hormone gene for the first time. The amplified fragment was about 1.8 kb. It was cloned and its upper stream was sequenced. This sequencing region consists of a 5′flanking regulatory region, exon I and part of exon II, intron I of growth hormone gene. Comparing the corresponding sequences of growth hormone gene betweenRhinopithecus roxellanae and the porcine, we concluded that the homology reached 81% in the region, and there was high conservation in the 5′flanking sequence. The kinds of amino acids of exon I and exon II for about 90% were the same to those in pig. Many mutations occurred in the degenerate site of the triplet code. In the nucleotides of intron I, there were only 72% homologies with those in pig. It means that introns and 3′flanking sequence maybe play an important part in growth hormone gene regulation of the different animals. 展开更多
关键词 Rhinopithecus roxellanae Growth hormone gene PCR 5′flanking regulation region exon INTRON
下载PDF
Dravet综合征患者电压依赖性钠通道α1亚基基因5’-非翻译区外显子的遗传变异 被引量:2
13
作者 林绍鹏 龙跃生 +4 位作者 石奕武 刘晓蓉 陈俐 于关娟 廖卫平 《中华神经科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期35-38,共4页
目的筛查Dravet综合征患者的电压依赖性钠通道α1亚基(voltage—gated sodium channel α1—subunit,SCN1A)基因5’-非翻译区外显子突变位点,分析并预测其致病易患性。方法收集24例Dravet综合征患者的外周血,抽提基因组DNA,采用... 目的筛查Dravet综合征患者的电压依赖性钠通道α1亚基(voltage—gated sodium channel α1—subunit,SCN1A)基因5’-非翻译区外显子突变位点,分析并预测其致病易患性。方法收集24例Dravet综合征患者的外周血,抽提基因组DNA,采用直接测序法进行SCN1A基因5’-非翻译区外显子突变位点的筛查;用生物信息学方法分析SCN1A基因5’-非翻译区外显子变异位点邻近序列的保守性及潜在的转录因子结合元件,推测其致病易患性。结果发现位于外显子h2u上的突变位点166.642.520G〉A,先证者1为新生突变,而先证者2的突变来自临床表型正常的母亲,该突变位点在100名健康对照者中均未发现。突变位点在哺乳动物中呈中度保守(62.5%),人与其他哺乳动物之间在突变位点邻近序列的平均同源率高达88.5%;166.642.520野生型位点的序列上预测得到一种转录因子结合元件,而突变型位点的序列上预测得到两种转录因子结合元件。结论突变位点166.642.520G〉A与Dravet综合征存在一定程度的相关性,其致病机制有待于进一步实验证实。 展开更多
关键词 癫痫 肌阵挛性 神经组织蛋白质类 钠通道 5'非翻译区 外显子 变异(遗传学)
原文传递
真菌基因可变剪接可视化分析的新方法:ZOOM软件的应用扩展(英文) 被引量:2
14
作者 严俊杰 张磊 +3 位作者 谢斌 黄千慧 龙莹 谢宝贵 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期618-624,共7页
可变剪接是引起蛋白多样性的主要机制之一,而转录组reads的重新定位是获取可变剪接位点的有效方法,适合在基因组较小的真菌中应用。ZOOM软件是一款可在window系统下运行的reads可视化定位软件,被广泛用于下一代基因组测序(NGS)的reads... 可变剪接是引起蛋白多样性的主要机制之一,而转录组reads的重新定位是获取可变剪接位点的有效方法,适合在基因组较小的真菌中应用。ZOOM软件是一款可在window系统下运行的reads可视化定位软件,被广泛用于下一代基因组测序(NGS)的reads定位及单碱基多态性位点(SNP)的发掘。本文发现该软件分析可变剪接的新用途,并以禾谷镰刀菌Fusarium graminearum的4个基因为例详细描述该方法在真菌可变剪接位点识别中的应用,这些结果均获得RT-PCR的验证。 展开更多
关键词 3’端可变剪接 5’端可变剪接 内含子保留 外显子互斥 RNA-seq数据 生物信息学方法 reads定位
原文传递
Novel splicing variant of the human orphan nuclear receptor Nurr1 gene 被引量:3
15
作者 徐评议 乐卫东 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2004年第6期899-902,共4页
Background Nurr1 is a member of the nuclear receptor superfamily of transcription factors. The objective of the present study was to identify novel splicing variants of the gene in neuronal and non-neuronal tissues an... Background Nurr1 is a member of the nuclear receptor superfamily of transcription factors. The objective of the present study was to identify novel splicing variants of the gene in neuronal and non-neuronal tissues and determine their functions. Methods Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis was used to screen for Nurr1 splice variants in the adult human central nervous system (CNS) and in other tissues such as lymphocytes,and liver,muscle,and kidney cells. Functional assays of the variants were performed by measuring Nurr1 response element (NuRE) transcriptional activity in vitro . Results In this study,the authors identified a novel splicing variant of Nurr1 within exon 5,found in multiple adult human tissues,including lymphocytes,and liver,muscle,and kidney cells,but not in the brain or spinal cord. Sequencing analysis showed the variant has a 75 bp deletion between nucleotides 1402 and 1476. A functional assay of the Nurr1-c splicing variant,performed by measuring NuRE transcriptional activity in vitro,detected a 39% lower level of luciferase (LUC) activity ( P <0.05).Conclusion A novel splicing variant of Nurr1 exists in human non-neuronal tissues and functional assays suggest that the variant may act as an alternate transcription regulator. 展开更多
关键词 splicing site.exon5.Nurr1 gene
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部